单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 20541 - 20560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20541 | 2024-08-08 |
Exploring strain diversity of dominant human skin bacterial species using single-cell genome sequencing
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.955404
PMID:35992707
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组测序技术，从皮肤拭子中获取未培养皮肤细菌的全面全基因组序列，以探索人类皮肤细菌的优势种群的菌株多样性 | 单细胞测序技术在从相同皮肤拭子中恢复基因组方面表现更优，显示出比鸟枪法宏基因组测序和分箱方法多10倍的非冗余菌株基因组 | NA | 理解皮肤共生细菌群落在皮肤健康和病原体传播中的作用 | 人类个体对应的皮肤细菌菌株的遗传差异 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组 | 从八名个体（包括同居群体）中恢复了281个高质量和244个中等质量的单扩增基因组 |
| 20542 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics uncover the key ferroptosis regulators contribute to cancer progression in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.962742
PMID:36003082
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了铁死亡调控因子在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）进展中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了铁死亡途径与HNSCC发展和预后的显著关联 | NA | 探讨头颈部鳞状细胞癌与铁死亡之间的关联机制 | 5902个单细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5902个单细胞 |
| 20543 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis of the Immunological Role of PDIA5: A Potential Target for Immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.881722
PMID:36003400
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研究论文 | 本研究通过大规模生物信息学分析和实验，全面分析了PDIA5在人类癌症中的免疫浸润作用 | 首次揭示了PDIA5与免疫细胞的相互作用及其在肿瘤免疫中的作用，并证明了PDIA5沉默对癌细胞增殖、克隆形成和侵袭能力的抑制作用 | NA | 探讨PDIA5在人类癌症中的免疫学作用及其作为免疫治疗潜在靶点的可能性 | PDIA5在人类癌症中的表达及其对肿瘤免疫的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种人类癌症样本 |
| 20544 | 2024-08-08 |
Comprehensive analyses of PDHA1 that serves as a predictive biomarker for immunotherapy response in cancer
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.947372
PMID:36003495
|
研究论文 | 本研究利用TCGA、GEPIA2和cBioPortal数据库，全面分析了PDHA1在多种癌症中的表达及其与免疫治疗反应的关系 | 首次系统探讨了PDHA1在多种癌症中的功能及其调控机制，并揭示了其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 研究主要基于数据库分析，缺乏实验验证 | 探讨PDHA1在多种癌症中的表达及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | PDHA1在33种肿瘤类型中的表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤类型 |
| 20545 | 2024-08-08 |
Revealing the intratumoral heterogeneity of non-DS acute megakaryoblastic leukemia in single-cell resolution
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.915833
PMID:36003795
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了非DS急性巨核细胞白血病（AMKL）的肿瘤内异质性 | 首次建立了AMKL的单细胞转录组图谱，并揭示了其肿瘤内异质性 | NA | 探究非DS急性巨核细胞白血病的肿瘤内异质性 | 来自两名融合阳性及一名融合阳性非DS-AMKL儿童的骨髓样本 | NA | 急性巨核细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 三名儿童的骨髓样本 |
| 20546 | 2024-08-08 |
PlaqView 2.0: A comprehensive web portal for cardiovascular single-cell genomics
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.969421
PMID:36003902
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研究论文 | 本文介绍了PlaqView 2.0，一个全面的网络门户，用于心血管领域的单细胞基因组学研究 | PlaqView 2.0提供了扩展的功能和数据集，包括基因查询、元数据浏览器、细胞身份预测等新工具 | NA | 旨在为心血管领域的单细胞数据提供一个集中的存储和分析平台 | 心血管领域的单细胞数据集，包括人类主动脉瘤、基因特异性小鼠敲除和健康参考数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 包括多个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 20547 | 2024-08-08 |
Identification of Human Cell Cycle Phase Markers Based on Single-Cell RNA-Seq Data by Using Machine Learning Methods
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/2516653
PMID:36004205
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研究论文 | 本文利用机器学习方法，基于单细胞RNA测序数据，构建分类器并识别关键基因标记，用于确定人类细胞周期的阶段 | 本文提供了一种新的方法来确定细胞周期，并识别了新的潜在细胞周期相关基因 | NA | 确定细胞周期阶段，为癌症发展和靶向细胞周期药物的研究提供关键信息 | 人类细胞周期的阶段 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 分类算法 | RNA测序数据 | 大规模单细胞 |
| 20548 | 2024-08-08 |
Contribution of the Opioid System to the Antidepressant Effects of Fluoxetine
2022-12-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2022.05.030
PMID:35977861
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研究论文 | 本文探讨了阿片系统在氟西汀抗抑郁效果中的作用 | 发现阿片系统在氟西汀治疗反应中的作用，并通过基因表达分析和行为测试验证了这一发现 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究阿片系统在氟西汀抗抑郁效果中的作用机制 | 小鼠的焦虑和抑郁样行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了mu和delta阿片受体敲除小鼠进行行为测试 |
| 20549 | 2024-08-08 |
Onepot-Seq: capturing single-cell transcriptomes simultaneously in a continuous medium via transient localization of mRNA
2022-12-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac665
PMID:35953080
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Onepot-Seq的无设备方法，用于在连续流体介质中同时捕获单细胞转录组 | Onepot-Seq利用裂解后mRNA的短暂定位，无需复杂设备即可捕获单细胞转录组 | NA | 开发一种无需复杂设备的新方法，以扩大单细胞RNA测序的应用范围 | 单细胞转录组 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 混合物种实验中获得了高质量的单细胞数据 |
| 20550 | 2024-08-08 |
Preparation of Intact Nuclei for Single-Nucleus Omics Using Frozen Cell Suspensions from Mutant Embryos of Xenopus tropicalis
2022-12-01, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot107825
PMID:35953244
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研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻细胞悬液中分离高质量核的方法，用于单核转录组学分析 | 开发了一种新协议，可以从冷冻细胞悬液中分离出高质量的核，并用于单核RNA测序 | NA | 研究突变和野生型胚胎在未分化阶段的基因表达差异，以及突变对发育轨迹或先天性疾病表型的影响 | Xenopus tropicalis的突变和野生型胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 少量单个胚胎悬液 |
| 20551 | 2024-08-08 |
Characterizing the role of the immune microenvironment in multiple myeloma progression at a single-cell level
2022-11-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007217
PMID:35977111
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析骨髓细胞，研究多发性骨髓瘤进展中的免疫微环境变化 | 本文结合先前发表的数据集，识别了疾病进展中免疫细胞群的一致性变化 | 患者间细胞群的内在变异性和样本处理及分析方法的差异 | 揭示多发性骨髓瘤从前期阶段到临床阶段进展中的免疫变化，以开发基于免疫的策略 | 骨髓细胞中的免疫细胞群 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自前期阶段、意义未明的单克隆γ病、隐匿性多发性骨髓瘤和初诊多发性骨髓瘤的骨髓细胞 |
| 20552 | 2024-08-08 |
Identification of Quiescent LGR5+ Stem Cells in the Human Colon
2022-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.07.081
PMID:35963362
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因工程技术，揭示了人类结肠中静止状态的LGR5+干细胞的存在及其在损伤后再生中的作用 | 首次揭示了人类结肠中存在非分裂的LGR5+干细胞，并阐明了其在稳态和损伤后的功能 | NA | 探究人类结肠干细胞在稳态和再生过程中的行为 | 人类和鼠类结肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，基因工程 | NA | RNA | 涉及人类和鼠类的结肠上皮细胞样本 |
| 20553 | 2024-08-08 |
CTSB+ macrophage repress memory immune hub in the liver metastasis site of colorectal cancer patient revealed by multi-omics analysis
2022-10-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.06.037
PMID:35964553
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌肝转移部位中CTSB+巨噬细胞抑制记忆免疫中枢的作用。 | 发现记忆CD8 T细胞、B细胞和CTSB+巨噬细胞在肝转移部位富集，形成记忆免疫中枢，对抗肿瘤反应具有重要意义。 | NA | 识别结直肠癌肝转移的潜在免疫调节机制。 | 结直肠癌及其肝转移部位的肿瘤微环境中的关键细胞群体。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和多重免疫组织化学 | NA | 细胞 | NA |
| 20554 | 2024-08-08 |
Inhibition of Arid1a increases stem/progenitor cell-like properties of liver cancer
2022-10-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215869
PMID:35964817
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研究论文 | 本文研究了Arid1a敲除对肝癌细胞分化状态的影响，并通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了其对细胞干性和分化相关基因表达的影响。 | 首次证明了Arid1a缺失通过重塑染色质可及性，增加肝癌干细胞/祖细胞样细胞的数量，从而促进肝癌发展。 | NA | 探讨Arid1a在肝癌发病机制中的作用及其对细胞干性和分化状态的影响。 | 肝癌细胞中的Arid1a基因及其对细胞干性和分化状态的影响。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 批量RNA测序 (RNA-seq) | NA | RNA | NA |
| 20555 | 2024-08-08 |
Checkpoint Blockade-Induced Dermatitis and Colitis Are Dominated by Tissue-Resident Memory T Cells and Th1/Tc1 Cytokines
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0362
PMID:35977003
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研究论文 | 本文通过多参数免疫荧光、空间转录组学和RNA原位杂交技术分析了免疫检查点阻断疗法引起的皮肤炎和结肠炎中组织驻留记忆T细胞和Th1/Tc1细胞因子的作用 | 首次详细描述了免疫检查点阻断疗法引起的皮肤炎和结肠炎中组织驻留记忆T细胞的扩增及其与Th1/Tc1细胞因子的关联 | 研究仅限于皮肤炎和结肠炎的病例，未涵盖所有免疫相关不良事件 | 探讨免疫检查点阻断疗法引起的免疫相关不良事件的免疫学机制，以寻找新的治疗靶点 | 免疫检查点阻断疗法引起的皮肤炎和结肠炎患者组织 | 免疫学 | 皮肤炎，结肠炎 | 多参数免疫荧光，空间转录组学，RNA原位杂交 | NA | 组织样本 | 多个皮肤炎和结肠炎病例 |
| 20556 | 2024-08-08 |
TDO2+ myofibroblasts mediate immune suppression in malignant transformation of squamous cell carcinoma
2022-10-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157649
PMID:35972800
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其癌前病变和正常组织的免疫景观变化，发现TDO2+肌成纤维细胞在免疫抑制中的作用 | 首次鉴定出表达色氨酸2,3-双加氧酶（TDO2）的肌成纤维细胞亚群，并揭示其在口腔鳞状细胞癌恶性转化中的免疫抑制作用 | NA | 揭示口腔鳞状细胞癌恶性转化过程中的免疫学变化，为免疫治疗提供新靶点 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其癌前病变和正常组织的细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 131,702个细胞，来自13个OSCC癌组织、3个癌前口腔白斑样本和8个邻近正常样本 |
| 20557 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in ADAMTS15 cause a novel form of distal arthrogryposis
2022-10, Genetics in medicine : official journal of the American College of Medical Genetics
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.gim.2022.07.012
PMID:35962790
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研究论文 | 本文通过家系遗传学、外显子测序和疾病特异性面板测序，鉴定了ADAMTS15基因的双等位变异导致的一种新型远端关节弯曲症 | 发现了ADAMTS15基因的双等位变异与新型远端关节弯曲症的关联 | NA | 旨在识别一种新型远端关节弯曲症的遗传原因 | ADAMTS15基因变异及其在受影响个体中的表达模式 | NA | 远端关节弯曲症 | 外显子测序、原位杂交、RNAscope | NA | 基因组数据、单细胞测序数据 | 5名受影响个体来自4个无关联的近亲家庭 |
| 20558 | 2024-08-08 |
Early atherogenesis: new insights from new approaches
2022-10-01, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000843
PMID:35979994
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研究论文 | 本文综述了近期在理解动脉粥样硬化初始阶段的细胞和分子机制方面的概念和技术进展 | 通过单细胞RNA测序和CyTOF等无偏倚单细胞方法，深入探讨了正常内膜和动脉粥样硬化病变的细胞组成 | 关于高胆固醇血症如何启动早期炎症事件的具体细节尚未完全阐明 | 探讨动脉粥样硬化初始阶段的细胞和分子机制 | 动脉粥样硬化的初始阶段，包括内膜脂质积累、炎症和病变生长 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、CyTOF | NA | 转录组 | NA |
| 20559 | 2024-08-08 |
Construction and verification of a hypoxia-related nine-gene prognostic model in uveal melanoma based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses
2022-10, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2022.109214
PMID:35981602
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研究论文 | 本文构建并验证了一个基于单细胞和批量RNA测序分析的与缺氧相关的九基因预后模型，用于葡萄膜黑色素瘤 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据集，通过综合分析识别出47个与缺氧相关的共同差异表达基因，并建立了九基因预后模型 | NA | 研究目的是构建和验证一个与缺氧相关的九基因预后模型，以预测葡萄膜黑色素瘤患者的预后并指导个性化治疗 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其预后 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）的单细胞测序数据集和来自癌症基因组图谱（TCGA）的批量RNA测序数据集 |
| 20560 | 2024-08-08 |
Graph attention network for link prediction of gene regulations from single-cell RNA-sequencing data
2022-09-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac559
PMID:35961023
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研究论文 | 本文提出了一种基于图注意力网络的GENELink方法，用于从单细胞RNA测序数据中预测基因调控网络中的潜在相互作用 | 利用图注意力网络处理单细胞RNA测序数据，提高了在低信噪比和dropout情况下的基因调控网络重建性能 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中重建基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的转录因子与目标基因之间的潜在相互作用 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络 | 基因表达数据 | 七种单细胞RNA测序数据集，包括人类乳腺癌转移数据 |