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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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20541 | 2024-08-08 |
Molecular and subregion mechanisms of episodic memory phenotypes in temporal lobe epilepsy
2022, Brain communications
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/braincomms/fcac285
PMID:36419965
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研究论文 | 本研究通过空间定量技术分析了颞叶癫痫患者在四个与情景记忆相关的大脑区域(齿状回、CA3、CA1、新皮质)中目标蛋白质和转录本的差异表达,以探讨情景记忆障碍的分子和亚区域机制。 | 本研究首次在颞叶癫痫患者中使用空间转录组学技术,揭示了不同大脑亚区域在情景记忆障碍中的独特分子特征,并发现BDNF在CA3相关网络中作为调节认知、记忆等过程的关键枢纽。 | 研究样本量较小,仅包括16名药物难治性颞叶癫痫患者,且仅限于与海马硬化相关的病例。 | 探讨颞叶癫痫中情景记忆障碍的分子和亚区域机制。 | 颞叶癫痫患者的情景记忆障碍及其相关大脑区域的分子变化。 | 神经科学 | 癫痫 | 空间定量技术 | NA | 蛋白质和转录本数据 | 16名成年颞叶癫痫患者 |
20542 | 2024-08-08 |
The diversity of trophoblast cells and niches of placenta accreta spectrum disorders revealed by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1044198
PMID:36420138
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示了胎盘植入谱系障碍中滋养层细胞和微环境的多样性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胎盘植入谱系障碍的病理景观,并揭示了滋养层细胞与母体基质细胞之间的增强互动 | 研究主要集中在胎盘植入谱系障碍的病理机制上,未来需要进一步探索针对性的转化研究 | 深入理解胎盘植入谱系障碍的病理机制 | 胎盘植入谱系障碍中的滋养层细胞和微环境 | 数字病理学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自同一胎盘植入谱系障碍胎盘的代表性侵袭部分和正常部分 |
20543 | 2024-08-08 |
Evaluation of single-cell RNA-seq clustering algorithms on cancer tumor datasets
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.10.029
PMID:36420149
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研究论文 | 本文开发了一个框架,用于系统评估单细胞RNA测序(RNA-seq)聚类算法在癌症肿瘤数据集上的性能 | 使用一系列成熟的指标生成统一的质控得分和算法排名,并对15种不同的单细胞RNA-seq聚类算法在八个不同的癌症数据集上进行了性能评估 | NA | 评估单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 | 单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个不同的癌症数据集 |
20544 | 2024-08-08 |
Integrative analysis deciphers the heterogeneity of cancer-associated fibroblast and implications on clinical outcomes in ovarian cancers
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.025
PMID:36420154
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研究论文 | 本研究通过分析卵巢癌样本的单细胞RNA测序数据,识别出两种不同的癌症相关成纤维细胞亚型,并探讨了它们对临床结果的影响 | 首次揭示了CAF_c1亚型的特征,可作为新的预后指标和免疫治疗预测标记 | NA | 探究癌症相关成纤维细胞的异质性及其对卵巢癌患者临床结果的影响 | 卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
20545 | 2024-08-08 |
Genetic mutation and tumor microbiota determine heterogenicity of tumor immune signature: Evidence from gastric and colorectal synchronous cancers
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.947080
PMID:36420271
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研究论文 | 本文通过多组学分析,包括单细胞RNA测序、全外显子测序和微生物组测序,探讨了胃癌和结直肠癌同步原发肿瘤的肿瘤免疫特征的异质性及其决定因素。 | 首次揭示了遗传突变和肿瘤微生物组对胃癌和结直肠癌免疫微环境异质性的影响。 | NA | 阐明胃癌和结直肠癌预后和药物反应差异的决定因素。 | 胃癌和结直肠癌的同步原发肿瘤。 | 数字病理学 | 胃癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 微生物组测序 | NA | 基因组数据, 微生物组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
20546 | 2024-08-08 |
Early renal structural changes and potential biomarkers in diabetic nephropathy
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.1020443
PMID:36425298
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综述 | 本文综述了糖尿病肾病早期肾小球和肾小管结构变化及相关生物标志物的研究进展 | 详细描述了肾小球损伤标志物SMAD1和Podocalyxin,以及肾小管损伤标志物NGAL、Netrin-1和L-FABP在糖尿病肾病中的作用 | NA | 探讨糖尿病肾病早期诊断的生物标志物,以改善肾功能和延缓疾病进展 | 糖尿病肾病中的早期肾结构变化和潜在生物标志物 | NA | 糖尿病肾病 | 蛋白质组学和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | NA |
20547 | 2024-08-08 |
Highly sensitive and specific responses of shrimp gill cells to high pH stress based on single cell RNA-seq analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1031828
PMID:36425531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了虾鳃细胞对高pH应激的高度敏感和特异性反应 | 首次揭示了虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子机制,特别是柱状细胞中免疫相关基因的上调和新免疫细胞亚群的出现 | NA | 探究虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子响应机制 | 虾鳃细胞在高pH应激下的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 三种主要鳃细胞类型,包括柱状细胞、血细胞和隔膜细胞 |
20548 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals a novel inhibitory effect of ApoA4 on NAFL mediated by liver-specific subsets of myeloid cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1038401
PMID:36426356
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ApoA4通过肝脏特异性髓系细胞对NAFL的抑制作用 | 发现ApoA4通过调节特定免疫细胞亚群和相关基因表达,对NAFL具有抑制作用 | NA | 研究ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及其机制 | ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及特定免疫细胞亚群的作用 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自WT和ApoA4缺陷小鼠的肝脏免疫细胞 |
20549 | 2024-08-08 |
Signatures of EMT, immunosuppression, and inflammation in primary and recurrent human cutaneous squamous cell carcinoma at single-cell resolution
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.77528
PMID:36438481
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的动态变化,并探讨了肿瘤微环境的异质性及其与疾病进展的关系 | 首次在单细胞分辨率下研究了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中肿瘤微环境的动态变化,揭示了免疫抑制微环境和炎症特征的差异 | NA | 探究皮肤鳞状细胞癌进展的关键机制,为预防和治疗复发提供新策略 | 原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中的上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
20550 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of peripheral blood reveals anti-tumor systemic immunity induced by oncolytic virotherapy
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.74075
PMID:36438484
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析了基于HSV-2的溶瘤病毒OH2治疗后小鼠外周血的免疫反应 | 首次全面描述了溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响,揭示了OH2诱导的系统免疫重塑和激活机制 | NA | 探究溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响及其抗肿瘤机制 | 溶瘤病毒OH2治疗后的小鼠外周血样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
20551 | 2024-08-08 |
The landscape of cancer-associated fibroblasts in colorectal cancer liver metastases
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72853
PMID:36438498
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞(CAFs),揭示了CAFs的不同亚群及其在肿瘤微环境中的作用 | 本研究首次在单细胞分辨率下分析了大量结直肠癌肝转移中的CAFs,并开发了针对LTBP2的全人源抗体,为靶向治疗提供了新策略 | NA | 探究结直肠癌肝转移中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤发展中的作用 | 结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞和癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 4,397个来自六个结直肠癌肝转移样本的CAFs |
20552 | 2024-08-05 |
Comparative single-cell analysis of the adult heart and coronary vasculature
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09968-7
PMID:36401619
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学方法探讨了脊椎动物心脏和冠状血管的差异 | 整合不同物种的多种数据集,识别心脏的种特异性差异和相似性 | 数据整合可能受限于原始研究聚焦的组织类型 | 比较脊椎动物心脏的结构和功能差异 | 常见的几种脊椎动物心脏,包括猕猴、小鼠和斑马鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个物种的心脏数据集,包括猕猴、小鼠和斑马鱼 |
20553 | 2024-08-08 |
The complement receptor C3AR constitutes a novel therapeutic target in NPM1-mutated AML
2023-04-11, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007682
PMID:36383712
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研究论文 | 本文通过流式细胞术筛选和单细胞RNA测序,发现补体受体C3AR在NPM1突变的急性髓系白血病细胞中特异性表达,并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现补体受体C3AR在NPM1突变的急性髓系白血病细胞中特异性表达,并验证了其作为治疗靶点的有效性 | NA | 旨在识别NPM1突变急性髓系白血病细胞表面特异性表达的蛋白质,以开发基于抗体的治疗方法 | NPM1突变的急性髓系白血病细胞和正常骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞表面标记 | 涉及362个细胞表面标记的筛选,以及NPM1突变AML细胞和正常骨髓细胞的比较 |
20554 | 2024-08-05 |
Biomimetic nanoparticles drive the mechanism understanding of shear-wave elasticity stiffness in triple negative breast cancers to predict clinical treatment
2023-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.10.025
PMID:36382024
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研究论文 | 该研究探讨了生物仿生纳米颗粒如何驱动三阴性乳腺癌的剪切波弹性刚度机制理解,以预测临床治疗效果 | 研究首次展示了通过调节肿瘤微环境中的成纤维细胞(CAFs)功能来影响三阴性乳腺癌中的剪切波弹性刚度 | NA | 阐明三阴性乳腺癌中CAF功能与剪切波弹性刚度之间的关系 | 研究对象为三阴性乳腺癌细胞和相应的肿瘤模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | PLGA纳米颗粒 | 肿瘤模型(MDA-MB-231和E0771) | 单细胞测序 | NA |
20555 | 2024-08-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Inflammation and Antitumor Immunity
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1031
PMID:36399325
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综述 | 本文探讨了肿瘤相关成纤维细胞在炎症和抗肿瘤免疫中的角色 | 揭示了不同类型的肿瘤相关成纤维细胞(CAF)在肿瘤微环境中的功能及其在肿瘤促进性炎症和抑制免疫反应中的双重作用 | 研究主要依赖于最近的单细胞测序分析,可能缺乏更广泛的临床验证 | 探索肿瘤相关成纤维细胞在肿瘤炎症和免疫反应中的作用 | 肿瘤相关成纤维细胞及其在不同人类癌症中的表型和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
20556 | 2024-08-05 |
Dynamic cellular and molecular characteristics of spermatogenesis in the viviparous marine teleost Sebastes schlegelii†
2023-02-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac203
PMID:36401879
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研究论文 | 本研究探讨了海洋活胎鱼Sebastes schlegelii的精子发生的动态细胞和分子特征 | 该研究结合了细胞组织学和单细胞RNA测序技术,填补了关于活胎鱼精子发生动态变化的研究空白 | 本研究未提及样本的具体数量或外部验证的结果 | 揭示活胎鱼的精子发生过程中的细胞和分子动态变化 | 重点研究海洋鱼类Sebastes schlegelii的精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
20557 | 2024-08-08 |
Construction of a novel immune-related prognostic-predicting model of gastric cancer
2023-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147032
PMID:36403868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据识别出274个差异表达的免疫相关基因,并构建了一个用于预测胃癌预后的风险评分模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出胃癌中的差异表达免疫相关基因,并构建了一个新的免疫相关预后预测模型 | NA | 研究胃癌的预后预测模型 | 胃癌患者的预后 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 274个差异表达的免疫相关基因,TCGA-GC训练队列和GSE66229外部数据集 |
20558 | 2024-08-08 |
The heterogeneity of fibrosis and angiogenesis in endometriosis revealed by single-cell RNA-sequencing
2023-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2022.166602
PMID:36400338
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜在分泌期的细胞异质性 | 首次在没有激素药物干扰的情况下,通过单细胞RNA测序技术研究了异位和非异位子宫内膜的细胞异质性 | NA | 探索子宫内膜异位症中纤维化、血管生成和慢性炎症的细胞异质性 | 异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜的细胞特性 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
20559 | 2024-08-08 |
Combinatorial perturbation sequencing on single cells using microwell-based droplet random pairing
2023-Jan-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114913
PMID:36395729
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微孔滴随机配对技术的单细胞组合扰动测序方法(CP-seq),用于组合药物治疗的研究 | CP-seq技术利用寡核苷酸条码标记药物,通过微流控滴操作实现细胞与药物的随机配对,从而完成组合药物处理和细胞条码标记 | NA | 开发一种高通量且全面的组合扰动筛选技术,以减少药物抗性和疾病复发 | 单细胞的转录组和药物条码 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 微孔利用率达到83% |
20560 | 2024-08-08 |
A set-theoretic definition of cell types with an algebraic structure on gene regulatory networks and application in annotation of RNA-seq data
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.10.015
PMID:36400029
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研究论文 | 本文提出了一种基于集合论的细胞类型定义方法,并将其应用于RNA-seq数据的注释 | 开发了一种新的细胞身份表示方法,能够在不同数据集间进行比较并保留重要的生物学语义 | NA | 旨在改进RNA-seq数据的注释方法,更准确地捕捉细胞类型的普遍特征 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 集合论框架 | RNA-seq数据 | NA |