单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20541 - 20560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20541 | 2024-08-08 |
Cerebral organoids containing an AUTS2 missense variant model microcephaly
2023-01-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awac244
PMID:35802027
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研究论文 | 本文利用人脑类器官模型研究了携带AUTS2基因错义变异的患者的神经病理生理机制 | 使用CRISPR-Cas9基因编辑技术纠正变异并展示了受损的类器官生长和神经前体细胞增殖缺陷的恢复，以及通过单细胞RNA测序揭示了AUTS2在人皮质发育中神经前体细胞的新作用 | NA | 研究AUTS2基因变异引起的神经发育障碍的分子机制 | 携带AUTS2基因错义变异的患者的脑类器官 | NA | 神经发育障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | 类器官，RNA | 单个患者 |
| 20542 | 2024-08-08 |
The role of toll-like receptors (TLRs) in pan-cancer
2022-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2022.2095664
PMID:35801728
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研究论文 | 本研究分析了Toll样受体（TLRs）在泛癌数据集中的mRNA水平表达及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | 本研究通过多组学分析，揭示了TLRs作为癌症发生和进展的生物标志物、潜在的抗肿瘤治疗靶点以及预后生物标志物的可能性 | NA | 分析TLRs在泛癌数据集中的临床重要性及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | TLRs在泛癌数据集中的表达及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | NA | 泛癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA | NA |
| 20543 | 2024-08-08 |
Diet triggers specific responses of hypothalamic astrocytes in time and region dependent manner
2022-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24237
PMID:35802021
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研究论文 | 本研究探讨了高脂肪高糖饮食对下丘脑弓状核（ARC）星形胶质细胞的分子响应，特别是它们在不同时间点的转录组和蛋白质组变化 | 通过单细胞测序和多组学分析，揭示了高脂肪高糖饮食对下丘脑星形胶质细胞的时间和细胞特异性转录组响应，以及空间和分子特征的变化 | NA | 研究高热量饮食对下丘脑星形胶质细胞的分子响应及其时空变化 | 下丘脑弓状核的星形胶质细胞 | NA | NA | RNA测序，蛋白质组学，单细胞测序 | NA | RNA序列，蛋白质数据 | 具体样本数量未明确提及 |
| 20544 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome atlas reveals developmental trajectories and a novel metabolic pathway of catechin esters in tea leaves
2022-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13891
PMID:35810348
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研究论文 | 本文通过建立快速原生质体分离方法，研究了16,977个单细胞的转录组，揭示了茶树叶中儿茶素酯的发育轨迹和新陈代谢途径。 | 首次报道了木本作物叶片的单细胞转录组图谱，并发现了植物中儿茶素酯的新陈代谢途径。 | NA | 揭示茶树叶中儿茶素酯的形成机制及其在不同细胞类型中的分布。 | 茶树的1st和3rd叶片的单细胞转录组。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16,977个单细胞 |
| 20545 | 2024-08-08 |
Determinants of Dental Pulp Stem Cell Heterogeneity
2022-Oct, Journal of endodontics
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.joen.2022.06.013
PMID:35809811
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综述 | 本文综述了影响牙髓干细胞再生特性的异质性决定因素 | 单细胞RNA测序有望阐明牙髓干细胞的异质性，并有助于建立标准化技术 | 临床应用中缺乏一致和可靠的结果可能是由于牙髓干细胞群体的异质性 | 提供关于牙髓干细胞异质性决定因素的叙述性综述 | 牙髓干细胞的异质性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 20546 | 2024-08-08 |
A systematic evaluation of the computational tools for ligand-receptor-based cell-cell interaction inference
2022-09-16, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac019
PMID:35822343
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研究论文 | 本文系统评估了用于推断基于配体-受体细胞间相互作用的计算工具 | 本文填补了关于当前基于配体-受体的细胞间相互作用预测工具在公共单细胞RNA测序数据集上的性能和运行结果的研究空白 | NA | 评估和比较用于预测基于配体-受体的细胞间相互作用的计算工具的性能 | 九种最新的基于配体-受体的细胞间相互作用预测计算工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA | 15个经过充分研究的scRNA-Seq样本，对应约10万个单细胞在不同实验条件下的数据 |
| 20547 | 2024-08-08 |
Isolation of mouse ovarian follicles for single-cell RNA-seq and in vitro culture
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101537
PMID:35830306
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研究论文 | 本文提供了一种结合单细胞基因组学和功能实验的方案，用于研究卵泡发育的逐步过程 | 该方案能够分离不同发育阶段的鼠卵巢卵泡，进行单细胞RNA测序和体外培养，从而解析和验证指导卵泡发育的关键分子事件 | NA | 研究卵泡发育的逐步过程 | 鼠卵巢卵泡 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同发育阶段的鼠卵巢卵泡 |
| 20548 | 2024-08-08 |
Anti-GD2 Antibodies Conjugated to IL15 and IL21 Mediate Potent Antitumor Cytotoxicity against Neuroblastoma
2022-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-0717
PMID:35802683
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研究论文 | 本文研究了通过将IL15和IL21与hu14.18抗体结合，增强其对神经母细胞瘤的抗肿瘤细胞毒性作用 | 开发了两种新的免疫细胞因子（IC），通过将IL15和IL21与hu14.18抗体结合，提高了对神经母细胞瘤的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性（ADCC） | NA | 比较hu14.18-IL15和-IL21与hu14.18-IL2在诱导神经母细胞瘤ADCC能力上的差异 | 神经母细胞瘤细胞系和移植瘤模型 | NA | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用了T细胞缺陷的小鼠和免疫活性小鼠进行实验 |
| 20549 | 2024-08-08 |
Ets21C sustains a pro-regenerative transcriptional program in blastema cells of Drosophila imaginal discs
2022-08-08, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.06.040
PMID:35820420
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研究论文 | 研究探讨了果蝇成虫盘细胞在损伤后通过局部增殖再生缺失部分的过程中，Ets21C转录因子如何维持再生特异性的转录程序 | 发现Ets21C转录因子在再生过程中调控特定基因表达网络，且这种机制可能被肿瘤利用以促进异常生长 | NA | 探究再生过程中基因调控网络的再激活与再生特异性转录程序的激活程度 | 果蝇成虫盘细胞及其再生过程中的基因表达 | 再生生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及再生翅盘中的两种特定细胞群Blastema1和Blastema2 |
| 20550 | 2024-08-08 |
Cell plasticity in regeneration in the stomach and beyond
2022-08, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2022.101948
PMID:35809361
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research paper | 本文探讨了胃及其他器官在稳态和损伤后利用细胞可塑性程序招募祖细胞进行组织再生的机制 | 揭示了细胞可塑性在组织再生中的普遍性和重要性，以及其在病理过程中的潜在作用 | NA | 研究正常干细胞分化与可塑性在稳态和损伤后的相互作用，以及再生程序的共同特征 | 胃上皮细胞及其他器官的细胞可塑性和再生机制 | NA | NA | 细胞系追踪技术、类器官培养、单细胞RNA测序分析 | NA | NA | NA |
| 20551 | 2024-08-08 |
Heterogeneity analysis of astrocytes following spinal cord injury at single-cell resolution
2022-08, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200463R
PMID:35816276
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠脊髓损伤后不同时间点的星形胶质细胞转录组特征 | 揭示了六种转录上不同的星形胶质细胞状态，并分析了这些亚型在脊髓损伤后的动态演变过程 | NA | 旨在阐明星形胶质细胞在脊髓损伤后的异质性及其动态变化 | 星形胶质细胞在脊髓损伤后的亚型及其转录组特征 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后不同时间点的组织样本 |
| 20552 | 2024-08-08 |
Propensity score matching enables batch-effect-corrected imputation in single-cell RNA-seq analysis
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac275
PMID:35821114
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研究论文 | 本文提出了一种新的倾向评分匹配方法（scPSM），用于单细胞RNA测序数据中同时去除批次效应、填补缺失值和降噪 | scPSM方法结合了因果推断的思想，通过从深度测序批次中借用信息并进行加权平均，实现了在全基因表达空间内的批次效应校正、缺失值填补和数据降噪 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应和缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 倾向评分匹配 | 基因表达数据 | 涉及多种真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 20553 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of keratoconus corneas revealed aberrant transcriptional signatures and implicated mechanical stretch as a trigger for keratoconus pathogenesis
2022-Jul-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00397-z
PMID:35821117
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了圆锥角膜患者和健康个体的中央角膜细胞，揭示了疾病进展中每种细胞类型的作用 | 发现了圆锥角膜基质细胞中的两个潜在新型标记物CTSD和CTSK，以及YAP1和TEAD1水平的升高，并揭示了机械拉伸在圆锥角膜进展中的作用 | NA | 深入理解圆锥角膜发病机制，为诊断和潜在干预提供见解 | 圆锥角膜患者和健康个体的中央角膜细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 39,214个细胞 |
| 20554 | 2024-08-08 |
Ductal keratin 15+ luminal progenitors in normal breast exhibit a basal-like breast cancer transcriptomic signature
2022-Jul-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-022-00444-8
PMID:35821504
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研究论文 | 本文通过结合显微镜下采集的乳房缩小手术中的类器官和单细胞mRNA测序（scRNA-seq），研究了正常乳腺管腔上皮祖细胞与基底样乳腺癌之间的转录组特征关系 | 首次通过空间映射和基因表达谱比较，揭示了正常乳腺管腔祖细胞与基底样乳腺癌之间的强相关性 | NA | 探讨正常乳腺管腔上皮祖细胞与基底样乳腺癌的细胞起源和转录组特征 | 正常乳腺管腔上皮祖细胞和基底样乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自乳房缩小手术的类器官和通过FACS排序的管腔上皮细胞 |
| 20555 | 2024-08-08 |
Mesenchymal-epithelial interaction regulates gastrointestinal tract development in mouse embryos
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111053
PMID:35830795
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，构建了小鼠胚胎期E9.5至E15.5胃和肠的时空转录组图谱 | 识别了多个亚群，包括Lox胃间质、Aldh1a3小肠间质和Adamdec1大肠间质，并揭示了上皮和间质细胞的区域化和异质性 | NA | 探究胚胎期小鼠胃和肠发育的细胞和分子变化机制 | 小鼠胚胎期胃和肠的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎期E9.5至E15.5的胃和肠样本 |
| 20556 | 2024-08-08 |
A guiding role of the Arabidopsis circadian clock in cell differentiation revealed by time-series single-cell RNA sequencing
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111059
PMID:35830805
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研究论文 | 本文通过时间序列单细胞RNA测序，揭示了拟南芥生物钟在细胞分化中的指导作用 | 利用高细胞命运可塑性的植物细胞进行单细胞RNA测序，开发了PeakMatch方法分析细胞分化过程，发现时钟基因表达变化先于细胞分化 | NA | 探究生物钟是否调控细胞分化 | 拟南芥的细胞分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20557 | 2024-08-08 |
A human adipose tissue cell-type transcriptome atlas
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111046
PMID:35830816
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研究论文 | 本研究通过未分选的人体脂肪组织RNA-seq数据，解析了细胞类型特异性转录组图谱 | 本研究提供了一种利用批量RNA-seq数据来分析细胞类型特异性转录组的可访问方法 | NA | 定义细胞类型特异性基因并解析其在人体脂肪组织中的表达 | 人体脂肪组织的细胞类型特异性转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 527个内脏脂肪组织样本和646个皮下脂肪组织样本 |
| 20558 | 2024-08-08 |
Lymphocyte subsets in Atlantic cod (Gadus morhua) interrogated by single-cell sequencing
2022-07-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03645-w
PMID:35821077
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了大西洋鳕鱼（Gadus morhua）脾脏中的淋巴细胞异质性 | 首次描述了大西洋鳕鱼中的五种T细胞亚群和八种B细胞亚群，并提出了B细胞的分化轨迹 | NA | 进一步阐明因缺乏CD4阳性T淋巴细胞而引发的免疫适应性 | 大西洋鳕鱼（Gadus morhua）的淋巴细胞亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20559 | 2024-08-08 |
Increased H3K27 trimethylation contributes to cone survival in a mouse model of cone dystrophy
2022-Jul-10, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04436-6
PMID:35810394
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研究论文 | 本研究使用Pde6c小鼠模型，探讨了组蛋白去甲基化酶抑制剂GSK-J4对锥细胞生存的潜在治疗益处 | 首次研究了GSK-J4对锥细胞生存的影响，并发现其通过调节甲基化和乙酰化之间的相互作用，对受遗传性视网膜疾病影响的锥细胞有积极响应 | NA | 探讨GSK-J4对锥细胞生存的影响及其在遗传性视网膜疾病治疗中的潜在应用 | Pde6c小鼠模型中的锥细胞 | 遗传性视网膜疾病 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20560 | 2024-08-08 |
Innate immune regulation in HIV latency models
2022-07-08, Retrovirology
IF:2.7Q3
DOI:10.1186/s12977-022-00599-z
PMID:35804422
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研究论文 | 本文评估了在多种T细胞模型中，HIV潜伏期内的先天免疫和IFN反应 | 发现了潜伏感染的T细胞系在先天免疫激活或类型1 IFN治疗下未能诱导特定的干扰素刺激基因（ISGs） | NA | 研究HIV潜伏期内的先天免疫调控机制 | HIV潜伏模型中的T细胞 | NA | HIV感染 | RNA测序 | NA | RNA | 包括已建立的潜伏细胞系、Jurkat细胞以及ART抑制的初级CD4+ T细胞模型 |