单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20541 - 20560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20541 | 2024-08-08 |
Impact of single-cell RNA sequencing on understanding immune regulation
2022-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17493
PMID:35906816
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在免疫相关生理状态、调控机制和疾病中的应用 | scRNA-seq技术揭示了以前未报告的细胞类型或状态，为疾病治疗和生物过程提供了新的启示 | 讨论了scRNA-seq在免疫调控中的机遇和挑战 | 深入理解细胞异质性及其对细胞发育和功能的重要性 | 单细胞RNA测序技术及其在免疫细胞异质性和疾病发病机制中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 20542 | 2024-08-08 |
SMGR: a joint statistical method for integrative analysis of single-cell multi-omics data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac056
PMID:35910046
|
研究论文 | 本文开发了一种名为SMGR的新方法，用于从不同样本的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）数据中检测一致的功能性调控信号和目标基因 | SMGR方法利用广义线性回归模型识别一致表达基因和峰的潜在表示，从而识别共调控程序并阐明调控机制 | NA | 旨在解决单细胞多组学数据整合分析中的挑战，提高分析的准确性 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序数据 | 基因组学 | 急性混合表型白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | 广义线性回归模型 | 单细胞多组学数据 | 不同样本的数据 |
| 20543 | 2024-08-08 |
Gruffi: an algorithm for computational removal of stressed cells from brain organoid transcriptomic datasets
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2022111118
PMID:35919947
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Gruffi的算法，用于从脑类器官转录组数据集中计算去除应激细胞 | 开发了一种新的计算算法Gruffi，通过粒度功能过滤来无偏地识别和去除应激细胞 | NA | 研究脑类器官中的细胞应激问题，并开发方法去除这些应激细胞以改善发育轨迹的划分 | 脑类器官和胎儿的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约190,000个细胞 |
| 20544 | 2024-08-08 |
Intratracheally administered LNA gapmer antisense oligonucleotides induce robust gene silencing in mouse lung fibroblasts
2022-08-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac630
PMID:35920332
|
研究论文 | 研究通过三种不同方法评估了LNA gapmer反义寡核苷酸在肺纤维细胞中的基因沉默效果 | 首次应用单细胞RNA测序（scRNA-seq）评估寡核苷酸治疗药物的疗效 | 缺乏适当的分析方法来确定反义寡核苷酸在每种细胞类型中的有效性 | 研究反义寡核苷酸在肺部不同细胞类型中的基因沉默效果 | 肺纤维细胞和内皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 20545 | 2024-08-08 |
SUMO Modification of Histone Demethylase KDM4A in Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus-Induced Primary Effusion Lymphoma
2022-08-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00755-22
PMID:35914074
|
研究论文 | 本文研究了Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染引起的原发性渗出性淋巴瘤（PEL）中组蛋白去甲基酶KDM4A的SUMO化修饰及其对细胞存活、迁移和血管生成的影响 | 发现KDM4A的SUMO化修饰在KSHV激活和PEL细胞存活中起关键作用，并确定了IL-10作为KDM4A的新下游靶点 | 需要进一步研究KDM4A作为治疗PEL的潜在靶点的具体机制和疗效 | 探讨KDM4A的SUMO化修饰在KSHV诱导的PEL中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | KDM4A的SUMO化修饰及其对PEL细胞存活、迁移和血管生成的影响 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | ChIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个PEL细胞样本 |
| 20546 | 2024-08-08 |
Biogeographic and disease-specific alterations in epidermal lipid composition and single-cell analysis of acral keratinocytes
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159762
PMID:35900871
|
研究论文 | 本文通过靶向脂质组学分析和单细胞RNA测序，研究了人体表皮脂质在12个不同解剖部位的生物地理变化以及肢端角质形成细胞的基因表达。 | 首次揭示了肢端皮肤中EOS酰基神经酰胺及其合成相关基因的低表达，以及与角质细胞保留增加相关的基因表达变化，并构建了用于银屑病诊断的2-分析物模型。 | NA | 探讨表皮脂质组成在不同身体部位的生物地理变化及其与疾病特异性改变的关系。 | 人体表皮脂质和肢端角质形成细胞的基因表达。 | 数字病理学 | 银屑病 | 靶向脂质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 脂质组学数据，基因表达数据 | 12个不同解剖部位的表皮脂质样本，肢端和非肢端部位的角质形成细胞 |
| 20547 | 2024-08-08 |
Systematic exploration of dynamic splicing networks reveals conserved multistage regulators of neurogenesis
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.036
PMID:35914530
|
研究论文 | 本文通过筛选策略识别控制哺乳动物神经发生中动态剪接事件的因子，揭示了神经发生过程中剪接程序的调控机制 | 发现了先前未知的神经发生调控因子Rbm38和Puf60，并阐明了它们通过特定外显子调控剪接模式的机制 | NA | 探索神经发生过程中动态剪接网络的调控因子 | 哺乳动物神经发生中的动态剪接事件及其调控因子 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及胚胎干细胞和不同阶段的鼠神经发生 |
| 20548 | 2024-08-08 |
Elevated Myl9 reflects the Myl9-containing microthrombi in SARS-CoV-2-induced lung exudative vasculitis and predicts COVID-19 severity
2022-08-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2203437119
PMID:35895716
|
研究论文 | 本研究通过结合场发射扫描电子显微镜和能量色散X射线光谱分析法对尸检肺样本进行组织学分析，以及对外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序，探讨了COVID-19中血管炎和免疫血栓形成的病理机制 | 发现SARS-CoV-2在肺血管中积累，导致渗出性血管炎，并伴随出现表达血小板反应蛋白-1的非典型单核细胞和形成含有肌球蛋白轻链9（Myl9）的微血栓 | NA | 探讨COVID-19中血管炎和免疫血栓形成的病理机制 | COVID-19患者的肺部病理和免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和血液样本 | NA |
| 20549 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing depicts the local cell landscape in thyroid-associated ophthalmopathy
2022-08-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100699
PMID:35896115
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了甲状腺相关眼病（TAO）患者眼眶结缔组织中细胞成分的转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了TAO中局部细胞景观，包括RASD1表达的脂纤维母细胞、ACKR1内皮细胞和脂肪组织巨噬细胞在炎症和脂肪生成中的作用，以及CD8CD57细胞毒性T淋巴细胞在干扰素-γ产生中的作用 | NA | 旨在识别甲状腺相关眼病（TAO）中导致病理过程的局部细胞变化 | 甲状腺相关眼病（TAO）患者眼眶结缔组织中的细胞成分 | 数字病理学 | 甲状腺相关眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 未具体说明样本数量 |
| 20550 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Neutrophil as Orchestrator during β-Glucan-Induced Trained Immunity in a Teleost Fish
2022-08-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200225
PMID:35896333
|
研究论文 | 本研究在鲆鱼中建立了一个训练免疫激活模型，并通过单细胞RNA测序分析了中性粒细胞在β-葡聚糖诱导的训练免疫中的作用 | 首次揭示了硬骨鱼类中中性粒细胞作为训练免疫的调控者，并阐明了IL-1R信号通路在训练免疫诱导中的关键作用 | NA | 探究硬骨鱼类中训练免疫相关的免疫细胞及其分子机制 | 鲆鱼中的中性粒细胞和训练免疫 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个先天性和适应性免疫细胞群，以及两个血液细胞群 |
| 20551 | 2024-08-08 |
Lung fibroblasts facilitate pre-metastatic niche formation by remodeling the local immune microenvironment
2022-08-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.07.001
PMID:35908547
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，发现肺成纤维细胞通过表达环氧合酶2（COX-2）重塑肺部免疫微环境，促进乳腺癌转移前生态位的形成 | 首次揭示了肺成纤维细胞在乳腺癌转移前生态位形成中的关键作用，并证明了通过遗传或药物手段抑制COX-2活性可以逆转肺部免疫抑制状态，减少乳腺癌肺转移 | NA | 探究肺成纤维细胞在乳腺癌转移前生态位形成中的作用及机制 | 肺成纤维细胞、树突状细胞、单核细胞等肺部免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、免疫细胞图像 | 多个乳腺癌模型中的肺部组织样本 |
| 20552 | 2024-08-08 |
Tumor-polarized GPX3+ AT2 lung epithelial cells promote premetastatic niche formation
2022-08-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2201899119
PMID:35914155
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术，发现肿瘤极化的GPX3+ AT2肺上皮细胞在促进肺转移前微环境形成中的作用 | 首次揭示了肿瘤极化的GPX3 AT2细胞在促进肺转移前微环境形成中的作用，并阐明了其分子机制 | NA | 研究肺转移前微环境形成的细胞和分子成分 | 肺上皮细胞中的GPX3+ AT2细胞及其在肺转移前微环境形成中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 20553 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial mapping Identify cell types and signaling Networks in the human ureter
2022-08-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.07.004
PMID:35914526
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序、空间基因表达和免疫荧光技术，定义并空间映射了人类输尿管中的细胞群体，重点关注基质细胞和尿路上皮细胞，并分析了sonic hedgehog（SHH）信号通路在成年干细胞维持中的重要性。 | 首次通过单细胞和空间映射技术详细描述了人类输尿管的细胞类型和信号网络，并验证了SHH信号通路在输尿管组织稳态中的作用。 | NA | 深入理解输尿管组织再生的结构、细胞异质性和信号通路，为组织工程提供治疗策略。 | 人类输尿管的细胞群体和信号网络。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间基因表达、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20554 | 2024-08-08 |
Glioblastoma hijacks neuronal mechanisms for brain invasion
2022-08-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.06.054
PMID:35914528
|
研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤如何利用神经机制进行脑部侵袭 | 首次揭示了胶质母细胞瘤细胞通过接收神经元输入并模仿神经迁移机制进行脑部侵袭的机制 | NA | 探讨胶质母细胞瘤细胞如何利用神经机制进行脑部侵袭 | 胶质母细胞瘤细胞及其与神经元的关系 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 包括小鼠模型和人类疾病样本 |
| 20555 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals differences among iNKT cells colonizing peripheral organs and identifies Klf2 as a key gene for iNKT emigration
2022-Aug-02, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00432-z
PMID:35915069
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了不同外周器官中不变自然杀伤T细胞（iNKT细胞）的差异，并揭示了Klf2转录因子在iNKT细胞迁移和分化中的关键作用 | 首次揭示了iNKT细胞在外周器官中的表型和功能差异，并发现了Klf2在iNKT细胞迁移和分化中的重要作用 | NA | 探究iNKT细胞在外周器官中的分布差异及其迁移机制 | iNKT细胞在外周器官中的表型和功能差异，以及Klf2在iNKT细胞迁移和分化中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自肝脏、脾脏和淋巴结的iNKT细胞 |
| 20556 | 2024-08-08 |
Identification of the immune subtype of ovarian cancer patients by integrated analyses of transcriptome and single-cell sequencing data
2022-08-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-17645-7
PMID:35918500
|
研究论文 | 本研究通过综合分析转录组和单细胞测序数据，构建了基于M1和M2巨噬细胞的巨噬细胞风险评分（MRS）和基于与MRS相关的预后基因的基因风险评分（GRS），以识别卵巢癌患者的免疫亚型 | 本研究首次构建了MRS和GRS模型，用于识别具有更好总体生存率和炎症性免疫微环境的卵巢癌免疫亚型，并探讨了M1和M2巨噬细胞通过与CD8 T细胞的信号交流影响卵巢癌预后的可能性 | NA | 旨在通过综合分析转录组和单细胞测序数据，识别卵巢癌患者的免疫亚型，并探讨其对免疫检查点抑制剂的敏感性 | 卵巢癌患者的免疫亚型及其对免疫治疗的响应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20557 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of staged oocytes and somatic cells reveal novel regulators of follicle activation
2022-08-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-22-0053
PMID:35899878
|
研究论文 | 本文描述了一种从原始卵泡中分离单个卵母细胞和体细胞的方法，并鉴定了驱动其激活的信号 | 开发了一种新的方法来收集和研究原始卵泡及其相关卵母细胞和体细胞，通过单细胞RNA测序揭示了卵母细胞和体细胞从原始到初级卵泡阶段过渡过程中的分子特征 | NA | 研究卵巢卵泡发育过程中的调控机制 | 原始卵泡中的卵母细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生小鼠卵巢中的原始卵泡及其相关卵母细胞和体细胞 |
| 20558 | 2024-08-08 |
Evolution of multiple omics approaches to define pathophysiology of pediatric acute respiratory distress syndrome
2022-08-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77405
PMID:35913450
|
研究论文 | 本文综述了多组学技术在儿科急性呼吸窘迫综合征（PARDS）病理生理机制研究中的应用 | 引入了单细胞RNA测序（scRNA-seq）等新型分析方法，以更全面、无偏见地评估跨组织和细胞类型的病理生理机制 | 组学研究在儿童中的应用相对较少，且缺乏跨多种组织类型的分析 | 探索PARDS的分子机制，以期发现靶向治疗 | 儿科急性呼吸窘迫综合征（PARDS）的病理生理机制 | 组学 | 儿科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | NA |
| 20559 | 2024-08-08 |
Screening of cell-virus, cell-cell, gene-gene crosstalk among animal kingdom at single cell resolution
2022-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.886
PMID:35917402
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了20个物种的多组织样本，并与公共资源整合，以探索病毒受体分布，揭示了从爬行动物到人类的基本细胞间和基因间交叉对话。 | 首次在单细胞分辨率下研究了动物界的细胞-病毒、细胞-细胞、基因-基因交叉对话，并构建了动物界的单细胞图谱。 | NA | 旨在揭示严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的宿主范围和组织嗜性，以预防跨物种传播。 | 研究对象包括20个物种的多组织样本，以及45个涵盖26个物种的公共数据集。 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 20个物种的多组织样本，共30个数据集；整合45个公共数据集，涵盖26个物种。 |
| 20560 | 2024-08-08 |
The impact of neoadjuvant chemotherapy on the tumor microenvironment in advanced high-grade serous carcinoma
2022-Jul-30, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-022-00419-1
PMID:35907904
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了新辅助化疗（NACT）前后高级浆液性输卵管癌的肿瘤微环境变化 | 首次展示了NACT前后肿瘤微环境中恶性上皮细胞的高度异质性，并揭示了主要耐药克隆的存在及其与不良临床预后的关联 | 仅基于单一病例的样本，可能限制了研究结果的普遍性 | 探讨新辅助化疗对高级浆液性癌肿瘤微环境的影响及耐药机制 | 高级浆液性卵巢、输卵管或腹膜癌 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 共分析了32,079个单细胞，其中17,249个来自NACT前的肿瘤组织样本，14,830个来自NACT后的肿瘤组织样本 |