单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 20521 - 20540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20521 | 2024-08-08 |
Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveal Malignant Epithelial Cell Heterogeneity and Prognosis Signatures in Gastric Carcinoma
2022-08-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11162550
PMID:36010627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了胃癌恶性上皮细胞的异质性及其预后标志物 | 首次建立了全面的单细胞转录组图谱，以识别胃癌恶性上皮细胞的异质性，并结合单细胞和批量RNA测序数据生成和验证了预后标志物 | NA | 旨在理解胃癌的异质性，以促进准确的诊断和预后 | 胃癌的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共分析了来自9名患者的49,994个细胞，包括配对的原发肿瘤和正常组织 |
| 20522 | 2024-08-08 |
High IGKC-Expressing Intratumoral Plasma Cells Predict Response to Immune Checkpoint Blockade
2022-Aug-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23169124
PMID:36012390
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研究论文 | 本研究探讨了基底肿瘤微环境（TME）的组成，特别是高表达IGKC的肿瘤内浆细胞，在预测免疫检查点阻断（ICB）治疗反应和预后中的作用。 | 本研究揭示了基底肿瘤内高表达IGKC的浆细胞在ICB治疗中的重要作用，这一发现超越了T淋巴细胞的作用，为该领域带来了突破性的认识。 | 本研究的局限性在于缺乏强有力的生物标志物来预测ICB治疗的反应。 | 研究目的是探讨基底肿瘤微环境的组成，以预测免疫检查点阻断治疗的反应和预后。 | 研究对象包括肿瘤微环境中的浆细胞、T细胞受体（TCR）、B细胞受体（BCR）和人类白细胞抗原（HLA）。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、多光谱免疫荧光、机器学习 | 机器学习预测算法 | RNA序列数据 | 八个接受ICB治疗的转移性黑色素瘤队列 |
| 20523 | 2024-08-08 |
Dissecting Molecular Heterogeneity of Circulating Tumor Cells (CTCs) from Metastatic Breast Cancer Patients through Copy Number Aberration (CNA) and Single Nucleotide Variant (SNV) Single Cell Analysis
2022-Aug-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14163925
PMID:36010918
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了转移性乳腺癌患者循环肿瘤细胞（CTCs）的异质性 | 本文通过单细胞分析揭示了CTCs的独特突变特征及其与共同起源的分子痕迹，并识别了与抗性相关的异常 | 需要进一步阐明由相似CTCs组成的群体的转化意义 | 探索转移性乳腺癌患者循环肿瘤细胞的异质性 | 转移性乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 多个转移性乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 |
| 20524 | 2024-08-08 |
Multiscale Methods for Signal Selection in Single-Cell Data
2022-Aug-13, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24081116
PMID:36010781
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研究论文 | 本文提出三种基于拓扑学的数学方法，用于单细胞数据中的无监督特征选择，考虑离散和连续的转录模式 | 提出的方法能够在多个尺度上同时考虑离散和连续的转录模式，并通过谱分解的拉普拉斯图、多尺度拉普拉斯分数和持久性瑞利商等技术进行信号或基因的排序 | NA | 开发新的数学方法以更好地分析单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 谱分解的拉普拉斯图、多尺度拉普拉斯分数、持久性瑞利商 | NA | 转录组数据 | 已发表的单细胞转录组数据集 |
| 20525 | 2024-08-08 |
Laser Microdissection-Mediated Isolation of Butterfly Wing Tissue for Spatial Transcriptomics
2022-Aug-11, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps5040067
PMID:36005768
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研究论文 | 本文介绍了一种激光显微切割技术，用于从蝴蝶幼虫和蛹翅组织中提取总RNA，并进行空间转录组学分析 | 该技术无需石蜡包埋或使用切片机，提供了无偏倚的基因表达发现和空间信息 | NA | 研究蝴蝶翅发育过程中特定区域的转录组 | 蝴蝶幼虫和蛹翅组织 | NA | NA | 激光显微切割 | NA | RNA | NA |
| 20526 | 2024-08-08 |
DNA methylome and single-cell transcriptome analyses reveal CDA as a potential druggable target for ALK inhibitor-resistant lung cancer therapy
2022-08, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00836-7
PMID:35999456
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研究论文 | 本研究通过体外模型和全基因组DNA甲基化分析结合单细胞RNA测序，揭示了胞苷脱氨酶（CDA）作为ALK抑制剂耐药性肺癌潜在药物靶点的可能性 | 首次发现CDA在ALK抑制剂耐药的非小细胞肺癌中低甲基化和上调，并验证了通过靶向CDA代谢的核苷类似物治疗耐药性的新策略 | 研究主要基于体外模型，需要进一步的临床试验验证 | 探索克服ALK抑制剂耐药性的新治疗策略 | ALK融合阳性非小细胞肺癌及其对ALK抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组DNA甲基化分析，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 20527 | 2024-08-08 |
Snail-regulated exosomal microRNA-21 suppresses NLRP3 inflammasome activity to enhance cisplatin resistance
2022-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004832
PMID:36002186
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研究论文 | 本文研究了Snail调控的外泌体微小RNA-21通过抑制NLRP3炎症小体活性来增强顺铂耐药性的机制。 | 揭示了上皮-间质转化（EMT）介导的耐药机制，超越了癌症干细胞的调节，通过调节治疗后炎症小体活性来影响肿瘤微环境（TME）的动态重塑。 | NA | 探讨非遗传适应介导的耐药策略，特别是炎症小体在癌症治疗中的动态响应。 | 肿瘤来源的外泌体、NLRP3炎症小体活性、微小RNA-21的传递及其在体内的影响。 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | RNA测序、单细胞RNA测序、纳米粒子跟踪分析、透射电子显微镜 | NA | RNA | 使用了人类单核细胞THP细胞和鼠口腔癌MTCQ1细胞，以及C57BLJ/6J、BALB/C和C57BL/6J小鼠模型，还包括头颈部癌症患者样本。 |
| 20528 | 2024-08-08 |
The Rabep1-Mediated Endocytosis and Activation of Trypsinogen to Promote Pancreatic Stellate Cell Activation
2022-07-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12081063
PMID:36008957
|
研究论文 | 本研究探讨了Rabep1介导的内吞作用如何激活胰蛋白酶原，从而促进胰腺星状细胞的激活 | 发现了胰蛋白酶原通过胰腺腺泡细胞与胰腺星状细胞之间的交流，被胰腺星状细胞内吞并由Rabep1基因激活的新机制 | NA | 阐明慢性胰腺炎的发病机制，特别是胰蛋白酶原激活在其中的作用 | 胰蛋白酶原在慢性胰腺炎和正常组织中的定位与表达，以及其在胰腺星状细胞中的作用 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 免疫荧光，微阵列，单细胞RNA测序（scRNA-seq），Western blotting，流式细胞术 | NA | 组织样本，细胞 | 慢性胰腺炎和正常组织的临床样本，胰腺星状细胞 |
| 20529 | 2024-08-08 |
scGENA: A Single-Cell Gene Coexpression Network Analysis Framework for Clustering Cell Types and Revealing Biological Mechanisms
2022-Jul-30, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering9080353
PMID:36004879
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGENA的新框架，用于基于单细胞RNA测序数据的基因共表达网络分析，以聚类细胞类型并揭示生物学机制 | scGENA提供了一个集成的流程，涵盖了数据探索、质量控制、归一化、插补和降维等预处理步骤，以及基因共表达网络分析的下游处理 | NA | 构建一个综合的分析流程，用于单细胞RNA测序数据的基因共表达网络分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和生物学机制 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 基因共表达网络 | 基因表达数据 | 1600个细胞和39,851个基因 |
| 20530 | 2024-08-08 |
ACUTE AND SUSTAINED ALTERATIONS TO THE BONE MARROW IMMUNE MICROENVIRONMENT FOLLOWING POLYMICROBIAL INFECTION
2022-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000001951
PMID:35984760
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了多微生物感染后骨髓免疫微环境的急性及持续性改变 | 首次全面分析了脓毒症引起的免疫细胞景观内的转录变化 | 研究仅限于Friend白血病病毒B小鼠模型，可能限制了结果的普遍性 | 探讨多微生物感染后骨髓免疫微环境的急性及持续性改变 | 骨髓中的免疫细胞 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3402个单细胞样本 |
| 20531 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of the potential cuproptosis-related biomarker LIAS that regulates prognosis and immunotherapy of pan-cancers
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.952129
PMID:35982953
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研究论文 | 本研究通过多种生物信息学平台分析了LIAS在泛癌中的表达水平及其与预后的关系，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次全面分析了LIAS在多种癌症中的表达与预后关系，并探讨了其在免疫治疗中的预测价值 | NA | 探索LIAS在泛癌中的表达水平及其对预后和免疫治疗的影响 | LIAS在不同癌症中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症类型 |
| 20532 | 2024-08-08 |
Bioinformatics analysis and experimental verification of the prognostic and biological significance mediated by fatty acid metabolism related genes for hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.972744
PMID:35982956
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了脂肪酸代谢相关基因在肝细胞癌中的预后和生物学意义 | 本研究首次发现并验证了一个新的脂肪酸代谢相关预后模型，为肝细胞癌的治疗和预防提供了潜在策略 | NA | 旨在发现脂肪酸代谢相关风险特征，并为肝细胞癌患者的预后预测制定更好的模型 | 肝细胞癌患者的mRNA表达数据和临床参数 | 生物信息学 | 肝癌 | 共识聚类、单因素和多因素Cox回归分析、单样本GSEA算法、qRT-PCR、Western blotting和单细胞转录组学 | NA | mRNA表达数据 | 使用TCGA数据库收集的肝细胞癌患者数据，并在ICGC数据集中进行验证 |
| 20533 | 2024-08-08 |
Dynamically upregulated mast cell CPA3 patterns in chronic obstructive pulmonary disease and idiopathic pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.924244
PMID:35983043
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研究论文 | 本研究通过基于组织学的方法，定量分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）和特发性肺纤维化（IPF）患者肺部肥大细胞CPA3表达的动态变化及其空间分布 | 首次揭示了COPD和IPF患者肺部肥大细胞CPA3表达的动态变化及其与免疫病理改变和肺功能的关系 | NA | 探讨肥大细胞特异性金属蛋白酶CPA3在肺部疾病中的表达模式及其与疾病发展的关系 | COPD和IPF患者的肺部肥大细胞CPA3表达 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病，特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA，蛋白质 | 控制组和COPD及IPF患者的肺部样本 |
| 20534 | 2024-08-08 |
Increased proportion of follicular helper T cells is associated with B cell activation and disease severity in IgA nephropathy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.901465
PMID:35983053
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研究论文 | 本文研究了IgA肾病中CD4T细胞亚群的变化及其在B细胞激活和疾病进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化染色揭示了IgA肾病患者中Th2、Th17和Tfh细胞比例的增加，以及Tfh细胞与B细胞之间的细胞间相互作用 | NA | 探讨IgA肾病中CD4T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 | IgA肾病患者中的CD4T细胞和B细胞 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化染色 | NA | 细胞 | IgA肾病患者和健康对照组 |
| 20535 | 2024-08-08 |
Heterozygosity and homozygosity regions affect reproductive success and the loss of reproduction: A case study with litter traits in pigs
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.07.039
PMID:35983229
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研究论文 | 本研究探讨了杂合子区域（ROHet）和纯合子区域（ROH）对中国本土猪种繁殖成功率和繁殖损失的影响 | 首次深入研究了ROHet和ROH对哺乳动物繁殖成功率和繁殖损失的影响，并发现了一系列与繁殖性能相关的新候选基因 | 研究仅限于特定的中国本土猪种和其他五个猪种，可能需要进一步扩大样本范围以验证结果的普遍性 | 揭示ROHet和ROH对哺乳动物繁殖性能的影响，并识别相关的候选基因 | 中国本土猪种（如金华猪、淳安猪、龙游黑猪和嵊县花猪）及其他五个猪种的基因组 | 遗传学 | NA | 关联分析、线性模型、转录组关联研究、单细胞RNA测序 | 线性模型 | 基因组数据、转录组数据 | 涉及四个中国本土猪种和五个其他猪种 |
| 20536 | 2024-08-08 |
Gut Epithelial Inositol Polyphosphate Multikinase Alleviates Experimental Colitis via Governing Tuft Cell Homeostasis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.08.004
PMID:35988719
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研究论文 | 研究肠道上皮细胞中的肌醇多磷酸多激酶（IPMK）如何通过调控簇细胞稳态减轻实验性结肠炎 | 首次探讨了IPMK在肠道上皮细胞中的功能，特别是其对簇细胞稳态的影响及其在结肠炎中的作用 | NA | 探究IPMK在肠道上皮细胞中的功能意义 | 肠道上皮细胞和簇细胞 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序 | NA | RNA | IPMKΔIEC小鼠 |
| 20537 | 2024-08-08 |
Fibroblasts: Immunomodulatory factors in refractory diabetic wound healing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.918223
PMID:35990622
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研究论文 | 本文探讨了纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的免疫调节作用 | 通过单细胞RNA测序技术，发现纤维母细胞不仅是伤口愈合中的关键细胞，还能作为免疫哨兵细胞，监测免疫反应的激活和调节以及与损伤相关的分子模式 | NA | 探讨纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的潜在作用 | 糖尿病患者的伤口愈合过程及纤维母细胞的功能 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20538 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct immunology profiles in human keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.940645
PMID:35990663
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地捕获了瘢痕瘤的细胞组成，并发现了瘢痕瘤与邻近正常组织中大多数细胞类型的显著差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了瘢痕瘤的免疫学特征，并揭示了瘢痕瘤中以巨噬细胞为中心的细胞通讯调控网络 | NA | 揭示瘢痕瘤的免疫学特征及其形成机制 | 瘢痕瘤及其邻近正常组织的细胞组成和免疫学特征 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12对瘢痕瘤和邻近正常组织样本 |
| 20539 | 2024-08-08 |
Optimization of cancer immunotherapy through pyroptosis: A pyroptosis-related signature predicts survival benefit and potential synergy for immunotherapy in glioma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.961933
PMID:35990696
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研究论文 | 本研究旨在建立一个与细胞焦亡相关的综合特征，并探讨其在胶质瘤中的潜在临床应用 | 首次系统研究了细胞焦亡在胶质瘤进展和肿瘤微环境重塑中的作用，并建立了一个与细胞焦亡相关的风险特征 | NA | 探索细胞焦亡在胶质瘤中的作用及其在免疫治疗中的潜在应用 | 胶质瘤患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 脑瘤 | 实时定量PCR，免疫组化染色，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA胶质瘤队列和CGGA胶质瘤队列 |
| 20540 | 2024-08-08 |
Characterizing the role of SLC3A2 in the molecular landscape and immune microenvironment across human tumors
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.961410
PMID:35992269
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研究论文 | 本研究探讨了SLC3A2在人类肿瘤分子景观和免疫微环境中的作用 | 首次系统阐述了SLC3A2在癌症患者生存和潜在免疫治疗反应中的作用 | 目前研究中关于SLC3A2调节抗肿瘤免疫的分子机制尚未完全阐明 | 揭示SLC3A2在癌症患者生存和免疫治疗反应中的作用 | SLC3A2在不同肿瘤类型中的表达及其对患者预后和免疫微环境的影响 | 数字病理学 | NA | 转录组测序、单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 转录组数据、单细胞数据、组织图像 | 涉及多种癌症类型，包括低级别胶质瘤和急性髓系白血病，以及食管癌细胞系ESO51 |