单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20521 - 20540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20521 | 2024-08-08 |
Vascular Regulation by Super Enhancer-Derived LINC00607
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.881916
PMID:35837599
|
研究论文 | 研究探讨了超级增强子衍生的长非编码RNA LINC00607在人动脉内皮细胞中的表达及其对糖尿病条件下血管细胞基因调控网络的影响 | 首次展示了LINC00607在糖尿病患者动脉中的高表达，并证明了其通过c-Myc转录因子调控内皮细胞和血管平滑肌细胞的转录组 | NA | 研究LINC00607在血管细胞中的功能及其在糖尿病等疾病中的作用 | 人动脉内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康和糖尿病捐赠者的人动脉样本 |
| 20522 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Between Immune Cells and Altered Vascular Smooth Muscle Cell Phenotypes in Aortic Aneurysm From Single-Cell Transcriptome Data
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.936287
PMID:35837612
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据分析，揭示了主动脉瘤中免疫细胞与血管平滑肌细胞（VSMC）之间的细胞间通讯及其在主动脉瘤发展中的作用 | 首次详细分析了主动脉瘤中免疫细胞与VSMC之间的细胞间通讯网络，并识别了关键的信号通路和配体-受体对 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及实验验证所有识别的信号通路和配体-受体对 | 探讨主动脉瘤中VSMC表型转换的驱动因素及其在疾病中的作用 | 主动脉瘤中的免疫细胞和VSMC | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8个主动脉瘤样本和3个正常主动脉样本，共42,611个细胞 |
| 20523 | 2024-08-08 |
T Cells With Activated STAT4 Drive the High-Risk Rejection State to Renal Allograft Failure After Kidney Transplantation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.895762
PMID:35844542
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研究论文 | 本研究利用统一流形近似和投影及莱顿算法分析2611个公开的肾移植微阵列数据集，揭示了六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，通过构建基因调控网络，发现激活的STAT4作为核心转录因子与移植肾功能和预后密切相关。 | 本研究首次揭示了肾移植后的六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，为精确诊断肾移植排斥进展提供了新策略。 | NA | 研究肾移植后排斥状态的分子机制，以提高排斥反应的诊断和治疗水平。 | 肾移植排斥状态及其相关基因和细胞群。 | NA | 肾移植 | 微阵列数据分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2611个微阵列数据集 |
| 20524 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Upregulation of Immune Cell Crosstalk in Relapsed Pediatric Ependymoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.903246
PMID:35844565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童复发性室管膜瘤中免疫细胞间相互作用的增强 | 采用了一种新的轨迹评分方法来揭示与不良生存结果相关的细胞组成，并识别了复发和原发样本之间的潜在细胞间通信特征 | NA | 研究儿童室管膜瘤的肿瘤内异质性及其对生存结果的影响 | 儿童室管膜瘤的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20525 | 2024-08-08 |
Mapping the Tumor Microenvironment in TNBC and Deep Exploration for M1 Macrophages-Associated Prognostic Genes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923481
PMID:35844580
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，探索了三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和M1巨噬细胞相关的预后基因 | 发现了与M1巨噬细胞密切相关的三个标记基因IFI35、PSMB9和SAMD9L，其中IFI35与巨噬细胞激活、趋化性和迁移正相关，且高表达IFI35的患者预后更好 | NA | 研究TNBC的肿瘤微环境和M1巨噬细胞相关的预后基因 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和M1巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用了公共数据库和本研究队列的数据 |
| 20526 | 2024-08-08 |
Ferroptosis and Autophagy-Related Genes in the Pathogenesis of Ischemic Cardiomyopathy
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.906753
PMID:35845045
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研究论文 | 研究探讨了铁死亡和自噬相关基因在缺血性心肌病发病机制中的作用 | 通过分析GSE116250数据集，识别了与铁死亡和自噬相关的差异表达基因（DEGs），并预测了这些基因与关键miRNAs、转录因子和药物的相互作用 | 研究仅在MI小鼠模型中验证了部分关键基因，未来需在更多样本和临床试验中进一步验证 | 旨在探索可能影响心肌梗死进展的铁死亡和自噬相关差异表达基因 | 铁死亡和自噬相关基因在心肌梗死中的作用及其潜在治疗靶点 | NA | 心血管疾病 | qPCR分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | MI小鼠模型 |
| 20527 | 2024-08-08 |
D3K: The Dissimilarity-Density-Dynamic Radius K-means Clustering Algorithm for scRNA-Seq Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.912711
PMID:35846121
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研究论文 | 本文提出了一种名为D3K的新型聚类算法，用于处理单细胞RNA测序数据 | D3K算法引入了动态半径参数，根据数据特性灵活调整有效半径，并通过数据集的相异密度、候选簇的平均对比度和相异度计算权重，以获取高质量的初始中心点 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的聚类效果 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | K-means | 数据集 | NA |
| 20528 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular and Transcriptional Changes Associated With Traumatic Brain Injury
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.861428
PMID:35846152
|
研究论文 | 本研究通过重新分析小鼠海马体的单细胞RNA测序数据，揭示了创伤性脑损伤（TBI）相关的细胞和转录变化 | 首次在单细胞水平上详细描述了TBI后的细胞和转录变化，包括发现TBI特异性的ependymal亚群C0和神经元系统的变化 | 研究基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 揭示创伤性脑损伤后的细胞和转录变化，探索潜在的治疗靶点 | 小鼠海马体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20529 | 2024-08-08 |
Genetic and Epigenetic Regulation of Brain Organoids
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.948818
PMID:35846370
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综述 | 本文综述了脑类器官领域的最新知识和技术，以及其在疾病模型和临床前研究中的当前和潜在应用 | 脑类器官模拟人类大脑的发育、成熟、信号生成和功能，为神经学研究提供了独特的优势 | NA | 揭示神经发育机制和神经疾病发病机制 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因转录数据 | NA |
| 20530 | 2024-08-08 |
Embryonic Programs in Cancer and Metastasis-Insights From the Mammary Gland
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.938625
PMID:35846378
|
综述 | 本文综述了胚胎发育机制在鼠乳腺发育中的关键作用，并探讨了这些机制在乳腺或乳腺癌发生和转移中的作用 | 本文揭示了胚胎发育途径在肿瘤发生和转移中的重新激活或失调，为癌症的诊断和治疗提供了新的视角 | NA | 探讨胚胎发育机制在癌症和转移中的作用，并寻找新的治疗靶点和策略 | 鼠乳腺发育中的基因和信号通路成分，以及这些成分在乳腺癌发生和转移中的作用 | NA | 乳腺癌 | NA | NA | NA | NA |
| 20531 | 2024-08-08 |
The Shape of μ-How Morphological Analyses Shape the Study of Microglia
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.942462
PMID:35846562
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综述 | 本文综述了微胶质细胞形态学分析方法，探讨了每种方法的优缺点，并强调了形态学分析在理解中枢神经系统中微胶质细胞功能方面的重要贡献 | 提倡未来研究中使用无偏见的自动化形态重建方法，以利用微胶质细胞所处细胞结构中嵌入的有价值信息 | 尽管高通量方法在其他类型的分析中变得普遍，但形态重建的标准尚未建立 | 探讨微胶质细胞形态学分析方法，并强调其在理解微胶质细胞功能中的作用 | 微胶质细胞的形态学分析方法及其在中枢神经系统中的功能 | NA | 神经发育疾病，神经退行性疾病，神经炎症 | NA | NA | NA | NA |
| 20532 | 2024-08-08 |
TBX3 regulates the transcription of VEGFA to promote osteoblasts proliferation and microvascular regeneration
2022, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.13722
PMID:35846885
|
研究论文 | 研究探讨了TBX3在调节VEGFA表达以促进成骨细胞增殖和微血管再生中的作用 | 首次揭示了TBX3通过调节VEGFA表达促进成骨细胞增殖和微血管再生的机制 | NA | 研究成骨细胞微血管再生的机制 | TBX3在成骨细胞和血管化中的作用 | NA | NA | scRNA-seq, pySCENIC, qRT-PCR, 蛋白质印迹, CCK-8细胞增殖试验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类骨膜来源细胞(hPDCs) |
| 20533 | 2024-08-08 |
ORIGINS: A protein network-based approach to quantify cell pluripotency from scRNA-seq data
2022, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2022.101778
PMID:35855951
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研究论文 | 本文提出了一种基于蛋白质互作网络的方法，用于从单细胞RNA测序数据中量化细胞多能性 | 该方法使用与分化过程相关的蛋白质-蛋白质互作网络作为骨架，结合基因表达矩阵计算分化活性得分，从而量化每个细胞的多能性 | NA | 开发一种计算工具，用于从单细胞转录组数据中量化细胞多能性 | 单细胞转录组数据中的细胞多能性 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达矩阵 | 四个健康人数据集：乳腺、结肠、造血和肺 |
| 20534 | 2024-08-08 |
Single-cell entropy network detects the activity of immune cells based on ribosomal protein genes
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.056
PMID:35860411
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研究论文 | 开发了一种名为单细胞熵网络（SCEN）的新计算方法，用于分析单细胞RNA-seq数据，以发现免疫细胞的新异质性并识别现有细胞类型 | 提出了基于基因共表达网络的关联熵（AE）概念，用于衡量单个基因与所有其他基因在单细胞分辨率下的关联强度 | NA | 研究免疫细胞的异质性和多样性，特别是疾病状态下免疫细胞的变化 | 免疫细胞的活性及其在健康/疾病状态下的变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞熵网络（SCEN） | 基因表达数据 | 使用了公共数据集进行分析 |
| 20535 | 2024-08-08 |
The Cellular and Molecular Landscape of Synchronous Pediatric Sialoblastoma and Hepatoblastoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.893206
PMID:35860547
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研究论文 | 本文报道了一例6个月大婴儿同时患有腮腺胚细胞瘤（SBL）和肝母细胞瘤（HB）的病例，并通过全外显子测序（WES）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了肿瘤的细胞和分子特征。 | 首次详细描述了同时发生的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤的细胞和分子特征，并揭示了化疗后肿瘤细胞的成熟变化。 | 病例数量有限，研究结果可能不适用于所有同时发生的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤病例。 | 揭示同时发生的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤的细胞异质性和化疗后的适应性变化。 | 腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤的细胞和分子特征。 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 全外显子测序（WES），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 一例6个月大婴儿的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤组织样本 |
| 20536 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of Immune-Related Long Non-Coding RNA Signature for Predicting Immunotherapeutic Response and Prognosis in NSCLC Patients Treated With Immunotherapy
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.899925
PMID:35860577
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研究论文 | 本研究通过转录组数据识别并验证了与免疫治疗反应和非小细胞肺癌（NSCLC）患者预后相关的免疫相关长非编码RNA（lncRNA）特征。 | 首次识别并验证了39个与免疫治疗反应相关的lncRNA，其中38个被功能注释，并构建了一个新的四lncRNA特征来预测免疫治疗反应和预后。 | NA | 识别并验证与免疫治疗反应和NSCLC患者预后相关的免疫相关lncRNA特征。 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者的免疫治疗反应和预后。 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析 | LASSO和多元Cox分析 | 转录组数据 | 7,693个新的lncRNA被识别，涉及NSCLC和黑色素瘤患者的四个独立数据集。 |
| 20537 | 2024-08-08 |
Patient Derived Organoids Confirm That PI3K/AKT Signalling Is an Escape Pathway for Radioresistance and a Target for Therapy in Rectal Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.920444
PMID:35860583
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研究论文 | 本研究使用患者来源的类器官模型，探讨了直肠癌对化学放疗抵抗的机制，并验证了PI3K/AKT信号通路作为治疗靶点的有效性 | 首次通过患者来源的类器官模型和单细胞测序技术，证实了PI3K/AKT/mTOR通路在直肠癌放疗抵抗中的作用，并测试了双PI3K/mTOR抑制剂在提高癌细胞对放疗敏感性方面的效果 | 研究主要集中在实验室模型上，需要进一步的临床试验来验证这些发现 | 理解直肠癌对化学放疗抵抗的机制，并探索新的治疗策略 | 直肠癌患者来源的类器官模型 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞测序，CRISPR-Cas9 | NA | 转录组数据 | 涉及多个患者来源的类器官模型和结直肠癌细胞系HCT116 |
| 20538 | 2024-08-08 |
Benchmarking Single-Cell mRNA-Sequencing Technologies Uncovers Differences in Sensitivity and Reproducibility in Cell Types With Low RNA Content
2021-12-15, Journal of biomolecular techniques : JBT
DOI:10.7171/3fc1f5fe.dbeabb2a
PMID:35837268
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研究论文 | 本文通过比较SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS)与Smart-seq2和Smart-seq3等方法，评估了单细胞mRNA测序技术的灵敏度和可重复性 | SSsc PLUS在便利性、灵敏度、基因识别和可重复性方面优于其他全长方法，并兼容自动化平台 | NA | 评估单细胞mRNA测序技术的灵敏度和可重复性 | 单细胞mRNA测序技术 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
| 20539 | 2024-08-08 |
Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Platforms and Methods
2021-12-15, Journal of biomolecular techniques : JBT
DOI:10.7171/3fc1f5fe.3eccea01
PMID:35837267
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研究论文 | 本文比较了基于微流控、基于平板和基于液滴的单细胞RNA测序技术在多个平台上的应用 | 本文首次全面比较了不同单细胞RNA测序平台和技术，包括Fluidigm C1、WaferGen iCell8、10x Genomics Chromium Controller和Illumina/BioRad ddSEQ | 本文主要关注技术比较，未涉及临床应用或其他生物学验证 | 展示用于分析单个细胞中超低量RNA的RNA测序方法 | SUM149PT细胞在组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A处理和未处理条件下的单细胞RNA测序数据 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个单细胞RNA测序平台，具体细胞数量未详细说明 |
| 20540 | 2024-08-08 |
Prediction of cellular targets in diabetic kidney diseases with single-cell transcriptomic analysis of db/db mouse kidneys
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-022-00685-z
PMID:35809207
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析db/db小鼠肾脏，预测糖尿病肾病中的细胞靶点 | 首次在单细胞分辨率下分析db/db小鼠肾脏的转录组图谱，揭示肾细胞与免疫细胞间的通信 | NA | 揭示糖尿病肾病的分子机制，以开发更有效的治疗方法 | db/db小鼠肾脏中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | db/db小鼠肾脏样本 |