单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28534 篇文献，本页显示第 20501 - 20520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20501 | 2024-08-05 |
Immune landscape of viral cancers: Insights from single-cell sequencing
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28348
PMID:36436921
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综述 | 本文总结了病毒相关癌症中单细胞测序的免疫浸润和抗肿瘤反应的关键发现 | 通过单细胞测序方法深入分析了病毒引起的肿瘤免疫微环境的变化 | 未提及具体的实验数据和样本分析 | 探索病毒性感染对肿瘤免疫微环境的影响及其为癌症治疗提供的新靶点 | 病毒相关癌症的免疫浸润和抗肿瘤反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 20502 | 2024-08-08 |
Molecular profiles of single circulating tumor cells from early breast cancer patients with different lymph node statuses
2023-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.14728
PMID:36408679
|
研究论文 | 本研究利用免疫磁性纳米球捕获早期乳腺癌患者的循环肿瘤细胞（CTCs），并通过提出的bead-dd-seq方法进行单细胞RNA测序，分析CTCs的分子特征及其与淋巴结转移状态的关系 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了早期乳腺癌CTCs的分子特征，并发现了与淋巴结转移状态显著相关的两种CTCs亚型 | 研究样本量较小，仅涉及八名早期乳腺癌患者，可能影响结果的普遍性 | 解析早期乳腺癌患者循环肿瘤细胞的分子特征，以深入理解乳腺癌转移机制 | 早期乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 八名早期乳腺癌患者 |
| 20503 | 2024-08-08 |
Getting sweeter: new evidence for glucose transporters in specific cell types of the airway?
2023-01-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00140.2022
PMID:36409177
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在气道上皮细胞中葡萄糖转运体表达研究中的应用 | 强调了不同细胞类型中葡萄糖转运体表达的差异及其在细胞代谢和免疫功能中的作用 | 分析的研究数量有限，并非所有研究都报道了完整的葡萄糖转运体范围，且新鲜分离的细胞与体外培养的细胞之间存在差异 | 探讨气道上皮细胞中葡萄糖转运体的表达及其功能 | 气道上皮细胞中的葡萄糖转运体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 20504 | 2024-08-08 |
GeoWaVe: geometric median clustering with weighted voting for ensemble clustering of cytometry data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac751
PMID:36413065
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研究论文 | 本文介绍了一种基于几何中位数聚类和加权投票的集成聚类方法GeoWaVe，用于细胞学数据的聚类分析 | GeoWaVe方法在处理高维质谱和流式细胞学数据时表现优于图集成聚类方法，提供了一种更稳健和可重复的细胞学数据分析、可视化和解释方法 | 目前缺乏专门为细胞学数据分析设计的共识聚类算法 | 旨在克服聚类算法选择对结果的显著影响，通过共识方法直接解决不同算法之间的竞争效应 | 高维质谱和流式细胞学数据 | 生物信息学 | NA | 集成聚类 | 几何中位数聚类 | 细胞学数据 | 不同数据集 |
| 20505 | 2024-08-08 |
Dissociation of Cerebellar Granule Neuron Progenitors for Culture, FACS, Transcriptomics, and Molecular Biology
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_1
PMID:36418720
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研究论文 | 本文介绍了从小鼠和人类早期新生儿期分离小脑颗粒神经元前体细胞（CGNPs）的方法，并探讨了这些细胞在细胞培养、蛋白质提取、流式细胞术、代谢组分析和单细胞分辨率转录组分析中的应用。 | 本文提供了一种分离CGNPs的方法，这些细胞具有一致的、良好表征的增殖和分化时间模式，便于分析。 | NA | 研究大脑生长与神经前体细胞增殖动力学的关系，并探索这些特定细胞的分子、遗传和功能特性。 | 小脑颗粒神经元前体细胞（CGNPs） | 分子生物学 | NA | 流式细胞术（FACS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 从小鼠和人类新生儿期大脑中采集的CGNPs |
| 20506 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [I]: Single-Cell Droplet Encapsulation, mRNA Capture, and cDNA Synthesis
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_8
PMID:36418727
|
研究论文 | 本文描述了一种基于Drop-Seq方法的单细胞RNA测序技术，用于小头症研究 | 采用纳米级液滴物理分离细胞并同时引入细胞特异性DNA条形码，提高了样本处理的高通量 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在小头症研究中的应用 | 小头症样本组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 最少150,000个细胞，最多可捕获5000个单细胞转录本 |
| 20507 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [III]: Computational Analysis of scRNA-seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_10
PMID:36418729
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研究论文 | 本文专注于单细胞转录组分析（scRNA-seq）数据的计算分析，特别是从Drop-Seq平台生成的大规模scRNA-seq数据中解析生物信号 | 利用scRNA-seq技术同时探索数千个单细胞的基因表达模式 | NA | 解析从大规模scRNA-seq数据中提取的生物信号 | 单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
| 20508 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [IV]: Dirichlet Regression for Single-Cell Population Differences
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_11
PMID:36418730
|
研究论文 | 本文介绍了使用Dirichlet回归分析单细胞RNA测序数据中细胞组成的差异 | 首次采用Dirichlet回归方法比较不同条件下细胞组成的差异 | 仅限于分析多个生物学重复样本的情况 | 研究微头症中单细胞RNA测序数据的细胞组成变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群差异 | 生物信息学 | 微头症 | scRNA-seq | Dirichlet回归 | 单细胞RNA测序数据 | 多个生物学重复样本（三个或更多） |
| 20509 | 2024-08-08 |
High-level of intratumoral GITR+ CD4 T cells associate with poor prognosis in gastric cancer
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105529
PMID:36419848
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了胃癌患者中GITR+ CD4 T细胞的表达模式及其与预后的关系 | 揭示了GITR+ CD4 T细胞在胃癌中的免疫抑制作用及其与预后的关联，并发现Treg细胞中GITR蛋白的分布受微环境影响 | NA | 探讨GITR在胃癌中的表达模式及其对预后的影响 | 胃癌患者的GITR+ CD4 T细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20510 | 2024-08-08 |
Expression and regulatory characteristics of peripheral blood immune cells in primary Sjögren's syndrome patients using single-cell transcriptomic
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105509
PMID:36425764
|
研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学技术分析了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞的免疫细胞亚群表达及调控特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞中CD14单核细胞的转录因子表达及目标基因调控情况，并提出了基于表达的CD56CD16 NK细胞分类系统 | 研究样本量较小，仅包括三名患者和三名健康对照 | 探讨原发性干燥综合征患者外周血免疫细胞亚群的表达及调控特性 | 原发性干燥综合征患者及健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 68,500个外周血单个核细胞，来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康对照 |
| 20511 | 2024-08-08 |
Neuronal cell types, projections, and spatial organization of the central amygdala
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105497
PMID:36425768
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学和远距离投射映射，对中央杏仁核（CEA）的细胞类型进行了“自下而上”的理解 | 本文识别了两种在先前研究中未被解决的主要细胞类型，并揭示了与表达相关的新型CEA子域 | NA | 研究中央杏仁核的细胞类型、投射和空间组织 | 中央杏仁核的细胞类型和电路 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涵盖了所有CEA神经元的三分之一 |
| 20512 | 2024-08-08 |
High precision, high throughput generation of droplets containing single cells
2022-12-06, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00841f
PMID:36416090
|
研究论文 | 本文介绍了一种简单的被动微流控系统，能够高效地生成包含单细胞的液滴，具有极高的吞吐量和极低的错误率 | 该技术克服了单细胞封装过程中的随机性问题，显著提高了效率和吞吐量，并增强了组合液滴实验的可预测性 | NA | 开发一种高精度、高吞吐量的单细胞液滴生成技术 | 单细胞封装技术及其在单细胞测序、稀有细胞分离、免疫学或癌症生物学中的多细胞/珠研究中的应用 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | 每分钟生成超过22,000个单细胞加载的液滴 |
| 20513 | 2024-08-08 |
The kidney-more than the sum of its cellular parts
2022-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.08.032
PMID:36411017
|
研究论文 | 本文探讨了肾脏作为一个复杂器官，其细胞间相互作用对生理和病理生理的影响，并利用单细胞测序技术和空间转录组学等方法来解析这些相互作用 | 利用单细胞测序技术和空间转录组学等先进技术，解析肾脏细胞间复杂的生理和病理生理相互作用，并发现新的生物标志物和治疗选项 | NA | 解析肾脏细胞间相互作用的复杂生理和病理生理机制 | 肾脏及其细胞间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20514 | 2024-08-08 |
Urinary single-cell transcriptomics: a promising noninvasive method for assessing acute kidney injury
2022-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.09.006
PMID:36411018
|
研究论文 | 探讨利用尿液单细胞RNA测序评估人类急性肾损伤的可行性 | 提出了一种新的非侵入性方法——尿液单细胞RNA测序，用于评估急性肾损伤，可能发现新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索非侵入性方法获取肾脏内部信息，以理解急性肾损伤的机制 | 急性肾损伤患者尿液中的单细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 20515 | 2024-08-08 |
Empagliflozin reduces kidney fibrosis and improves kidney function by alternative macrophage activation in rats with 5/6-nephrectomy
2022-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113947
PMID:36411661
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了SGLT2抑制剂empagliflozin在5/6肾切除大鼠模型中对肾脏纤维化和肾功能的改善作用及其机制。 | 首次揭示了empagliflozin通过抑制CD206+CD68+ M2巨噬细胞极化，靶向mTOR和自噬途径，以及减弱CD8+效应T细胞的炎症信号，来改善肾脏功能和形态。 | NA | 探讨empagliflozin在5/6肾切除大鼠中改善肾脏功能和减少纤维化的机制。 | 5/6肾切除大鼠的肾脏细胞。 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个5/6肾切除大鼠的肾脏样本 |
| 20516 | 2024-08-08 |
A single-cell human islet interactome atlas identifies disrupted autocrine and paracrine communications in type 2 diabetes
2022-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac084
PMID:36415826
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学数据分析，构建了人类胰岛互作图谱，并探讨了其在2型糖尿病中的变化 | 首次构建了人类胰岛互作图谱模型，识别了2型糖尿病中失调的自分泌和旁分泌通信 | NA | 研究胰岛细胞间的协同通信，并探讨其在2型糖尿病中的变化 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的胰岛细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 3046个细胞，分为7种细胞类型 |
| 20517 | 2024-08-08 |
Impacts of neoadjuvant chemoradiotherapy on the immune landscape of esophageal squamous cell carcinoma
2022-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104371
PMID:36434949
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了新辅助化疗放疗对食管鳞状细胞癌免疫微环境的影响 | 首次全面描绘了新辅助化疗放疗相关的免疫变化，为理解食管鳞状细胞癌对新辅助化疗放疗的免疫机制提供了深入见解 | NA | 探究新辅助化疗放疗对食管鳞状细胞癌肿瘤免疫微环境的影响 | 食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗放疗前后的免疫微环境变化 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 8名男性患者的8个新辅助化疗放疗前样本和7个新辅助化疗放疗后样本 |
| 20518 | 2024-08-08 |
CTLA-4 on thymic epithelial cells complements Aire for T cell central tolerance
2022-11-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2215474119
PMID:36409920
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研究论文 | 研究发现在髓质胸腺上皮细胞（mTECs）中表达的共抑制受体细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4（CTLA-4）对T细胞中枢耐受的建立起到补充Aire因子的作用 | 发现CTLA-4在mTECs中的表达对T细胞中枢耐受的建立起到补充Aire因子的作用 | 研究中未发现CTLA-4缺失的胸腺上皮细胞小鼠有主要免疫缺陷，但存在轻微的炎症水平增加和部分Foxp3CD4调节T细胞生成缺陷 | 探讨CTLA-4在胸腺上皮细胞中对T细胞中枢耐受的作用 | 髓质胸腺上皮细胞（mTECs）和CTLA-4的表达 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | CTLA-4缺失的胸腺上皮细胞小鼠 |
| 20519 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing data analysis reveals a highly correlated triphasic transcriptional response to SARS-CoV-2 infection
2022-11-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04253-4
PMID:36435849
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了SARS-CoV-2感染后的人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官的转录反应 | 揭示了SARS-CoV-2感染后转录反应的非线性模式，包括初始和最终的下调阶段以及中间的上调阶段 | NA | 研究SARS-CoV-2感染后的转录反应机制 | 人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数千个细胞 |
| 20520 | 2024-08-08 |
Identification of molecular classification and gene signature for predicting prognosis and immunotherapy response in HNSCC using cell differentiation trajectories
2022-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-24533-7
PMID:36437265
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研究论文 | 本文旨在探讨细胞分化轨迹在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的临床意义，通过共识聚类分析识别不同的分子亚型，并基于分化相关基因（DRGs）开发预测HNSCC患者预后的风险模型。 | 本文通过细胞分化轨迹识别了不同的分子亚型，并构建了一个基于差异表达预后DRGs的新型签名，能够预测患者的预后和免疫治疗反应。 | NA | 探索细胞分化轨迹在HNSCC中的临床意义，并开发预测患者预后和免疫治疗反应的分子分类和基因签名。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者及其分子亚型和预后预测。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），共识聚类分析，加权相关网络分析（WGCNA），Cox回归分析 | NA | RNA序列数据 | NA |