单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29104 篇文献，本页显示第 20481 - 20500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20481 | 2024-08-08 |
Identification and validation of a muscle failure index to predict prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma through integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1057088
PMID:36733390
|
研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，识别并验证了一个肌肉衰竭指数（MFI），用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 提出了一种基于肌肉衰竭相关基因的新评分系统MFI，并验证了其在预测肺腺癌预后和免疫治疗敏感性中的作用 | NA | 研究肌肉衰竭相关基因在肺腺癌发生中的作用，并构建一个可靠的MFI模型以指导临床决策 | 肺腺癌组织和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | RNA测序数据 | 包括早期、晚期和脑转移的肺腺癌组织及正常肺组织 |
| 20482 | 2024-08-08 |
High-fiber-diet-related metabolites improve neurodegenerative symptoms in patients with obesity with diabetes mellitus by modulating the hippocampal-hypothalamic endocrine axis
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.1026904
PMID:36733447
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研究论文 | 本研究通过转录组和代谢组分析，探讨了高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 本研究首次通过分子对接分析，发现与高纤维饮食相关的代谢标志物醋酰氨基苯甲酸与SPEG蛋白具有最强的结合亲和力，可能通过靶向SPEG蛋白改善肥胖患者的糖尿病和神经退行性疾病 | NA | 探讨高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 高纤维饮食相关的代谢物、糖尿病前期痴呆的血液甲基化谱、阿尔茨海默病患者海马样本的单细胞测序数据 | NA | 糖尿病、神经退行性疾病 | 转录组分析、代谢组分析、单细胞测序、分子对接 | PCA、AutoDock | 基因表达矩阵、甲基化谱、单细胞测序数据 | 24个与高纤维饮食、T2DM和AD相关的标记基因 |
| 20483 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals cellular heterogeneity from deep fascia in patients with acute compartment syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1062479
PMID:36741388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了急性腔隙综合征患者深层筋膜中的特定高应力腔隙亚群和免疫细胞及成纤维细胞亚群的变化 | 样本量较小，仅包括6名患者 | 探究急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞 | 数字病理学 | 急性腔隙综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名患者（高应力组3名，正常应力组3名） |
| 20484 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of myeloid cells in HPV+ tonsillar cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087843
PMID:36741389
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞组成 | 揭示了HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的四种树突状细胞系和两种巨噬细胞极化过程，以及它们的成熟序列特征 | NA | 探究HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的起源和动态变化，并识别可用于评估患者预后的髓系生物标志物 | HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞 | 数字病理学 | 扁桃体癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用26重流式细胞术验证了大部分单细胞RNA-seq集群 |
| 20485 | 2024-08-08 |
Multimodal human thymic profiling reveals trajectories and cellular milieu for T agonist selection
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1092028
PMID:36741401
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研究论文 | 本文通过多模态人类胸腺分析，揭示了T细胞受体(TCRs)阳性选择过程中的细胞命运和细胞微环境 | 首次使用CITE-seq和空间转录组学技术对小儿人类胸腺进行分析，揭示了胸腺细胞在TCR信号传导标记物表达后的发育轨迹和时间诱导模式 | NA | 研究胸腺细胞发育、选择和谱系选择过程中的空间背景和细胞间相互作用 | 胸腺细胞和其发育过程中的细胞微环境 | 免疫学 | NA | CITE-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小儿人类胸腺样本 |
| 20486 | 2024-08-05 |
MHA, an interactive website for scRNA-seq data of male genitourinary development and disease
2023-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13402
PMID:36710661
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研究论文 | 本研究介绍了一个关于男性生殖系统的单细胞测序数据的互动网站MHA | MHA是第一个专注于男性生殖学和男性生殖的单细胞数据库网站，提供了独特的单细胞测序资源和可访问的工具 | 该研究依赖于已发表的研究数据，可能存在数据质量和完整性的问题 | 旨在为男性生殖系统的单细胞测序数据提供一个共享平台 | 男性特定组织和器官的单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 57个样本（人类和小鼠） |
| 20487 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics for profiling the tropism of viral vectors in tissues
2023-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01648-w
PMID:36702899
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研究论文 | 该研究开发了一种超灵敏的空间转录组测序方法，用于在完整组织中分析病毒载体的细胞亚型嗜性 | 文章提出了一种结合水凝胶组织清洁、信号增强和多重标记的新方法USeqFISH，能够高通量、高清晰度地分析内源性和病毒RNA | 尚未提及具体的局限性 | 研究工程化腺相关病毒载体在哺乳动物组织中传导特性 | 研究六种系统腺相关病毒（AAV）在小鼠大脑不同区域的转导和细胞亚型嗜性 | 数字病理 | NA | USeqFISH | NA | RNA | 六种系统AAV在小鼠脑部的多个区域 |
| 20488 | 2024-08-08 |
Comparing the adult and pre-pubertal testis: Metabolic transitions and the change in the spermatogonial stem cell metabolic microenvironment
2023-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13397
PMID:36690000
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综述 | 本文综述了生精干细胞在维持和分化过程中的代谢需求，并强调了Sertoli细胞和干细胞微环境成熟对生精干细胞代谢需求在发育过程中的潜在影响 | 提出了生精干细胞成熟的新定义，并根据代谢变化对其进行了修正 | NA | 深入理解生精干细胞的代谢需求及其调控机制，以改善其在实验室中的培养 | 生精干细胞的代谢需求及其在发育过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20489 | 2024-08-08 |
Growth Hormone Promotes Oocyte Maturation In Vitro by Protecting Mitochondrial Function and Reducing Apoptosis
2023-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-01147-y
PMID:36694082
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素（GH）在体外成熟（IVM）中对卵母细胞成熟的影响及其机制 | 首次详细阐述了GH通过保护线粒体功能和减少细胞凋亡来促进卵母细胞体外成熟的具体机制 | NA | 研究GH对卵母细胞体外成熟的影响及其机制 | 卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | GH组和对照组的卵母细胞 |
| 20490 | 2024-08-05 |
Metabolic heterogeneity in early-stage lung adenocarcinoma revealed by RNA-seq and scRNA-seq
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03082-z
PMID:36692643
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研究论文 | 本研究揭示了早期肺腺癌中的代谢异质性 | 通过RNA-seq和单细胞RNA-seq识别了代谢相关的亚型，为肺腺癌的预后和治疗提供了潜在生物标志物 | 研究主要依赖于TCGA和GEO的数据，可能存在数据源的局限性 | 探讨肺腺癌的代谢重编程及其对预后的影响 | 研究对象为肺腺癌样本，尤其关注其代谢相关的亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | TCGA数据集中肺腺癌样本的数量未具体说明 |
| 20491 | 2024-08-08 |
Bioinformatic analysis of single-cell RNA sequencing dataset dissects cellular heterogeneity of triple-negative breast cancer in transcriptional profile, splicing event and crosstalk network
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03083-y
PMID:36692641
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，全面探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）不同亚型上皮细胞的转录组特征、可变剪接事件及上皮与非上皮细胞间的相互作用 | 发现管腔前体亚型表现出最复杂的基因调控网络和剪接事件，并揭示了hnRNPs在管腔前体亚型中对可变剪接事件的负调控作用，以及NOTCH4在TNBC中的关键作用和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌的细胞异质性及其调控网络 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的细胞异质性及其调控网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20492 | 2024-08-05 |
Identification of a tumour immune barrier in the HCC microenvironment that determines the efficacy of immunotherapy
2023-04, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.01.011
PMID:36708811
|
研究论文 | 本文探讨了肝细胞癌（HCC）微环境中肿瘤免疫屏障的特定结构及其对免疫治疗效果的影响 | 中国首次识别了肿瘤免疫屏障（TIB）结构及其在肿瘤微环境中的作用，揭示其限制免疫细胞浸润的机制 | 研究主要集中在TME中的特定结构，可能未涵盖所有影响免疫疗效的因素 | 研究肝细胞癌（HCC）中肿瘤微环境结构对免疫治疗效果的影响 | 肝细胞癌患者接受抗PD-1治疗的特定肿瘤微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | NA | NA |
| 20493 | 2024-08-05 |
Stromal regulation of the intestinal barrier
2023-04, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.01.006
PMID:36708806
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review | 本文回顾了间充质细胞在维持肠道屏障中的新兴作用 | 探讨了间充质细胞在肠道发育和稳态中的关键组织者角色 | 对某些机制的理解仍然不完整 | 研究肠道屏障的发育和维持机制 | 间充质细胞及其在肠道中的作用 | NA | 肠道炎症疾病 | 谱系追踪、Cre基因缺失、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 20494 | 2024-08-08 |
Complexities of mammalian transcriptome revealed by targeted RNA enrichment techniques
2023-04, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.12.004
PMID:36681580
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综述 | 本文综述了靶向RNA富集技术在揭示哺乳动物转录组复杂性方面的应用和影响 | 展示了大量未被发现的转录本和复杂的转录模式，揭示了细胞类型特异性转录本的存在 | NA | 探讨靶向RNA富集技术在发现新转录本和理解人类基因组及转录组复杂性方面的应用 | 人类转录组和基因组 | 基因组学 | NA | 靶向RNA富集技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20495 | 2024-08-08 |
Pathological consequences of DNA damage in the kidney
2023-04, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-022-00671-z
PMID:36702905
|
研究论文 | 本文探讨了肾脏中DNA损伤的病理后果及其对肾脏疾病的影响 | 报道了肾脏纤毛病与DNA损伤反应之间的意外联系，并利用肾脏类器官和单细胞RNA测序技术深入研究了特定肾脏细胞类型对DNA损伤的反应 | NA | 研究DNA损伤在肾脏中的病理后果及其对肾脏疾病的影响 | 肾脏中的DNA损伤及其对急性与慢性肾脏损伤、肾细胞癌的影响 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20496 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of pyroptosis-related gene signatures for glioblastoma immune microenvironment and target therapy
2023-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13376
PMID:36681858
|
研究论文 | 本研究分析了与焦亡相关的基因特征在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用及靶向治疗的潜力 | 首次探讨了焦亡与胶质母细胞瘤亚型及免疫环境的关系，并利用机器学习算法筛选出潜在治疗化合物 | 研究仅基于73个胶质母细胞瘤样本，样本量相对较小 | 探讨焦亡在胶质母细胞瘤进展与免疫反应中的角色 | 73个胶质母细胞瘤样本，具体分类为不同亚型 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq，机器学习算法 | 无 | 样本数据 | 73个胶质母细胞瘤样本 |
| 20497 | 2024-08-08 |
The power of combined spatial transcriptomics and genome wide association studies (GWAS) approaches to heritable prostate cancer
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-023-00724-3
PMID:36692634
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20498 | 2024-08-08 |
Peripheral blood mononuclear cell tissue factor (F3 gene) transcript levels and circulating extracellular vesicles are elevated in severe coronavirus 2019 (COVID-19) disease
2023-03, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2022.11.033
PMID:36696180
|
研究论文 | 研究探讨了严重COVID-19患者中外周血单个核细胞的组织因子（F3基因）转录水平及循环中的细胞外囊泡的升高情况 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染导致系统性组织因子（F3）转录水平升高及循环细胞外囊泡的增加，这些可能与疾病相关的凝血、血栓形成及相关的死亡率有关 | NA | 探究COVID-19疾病中过度凝血的机制 | COVID-19患者的血液样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 独立队列的COVID-19患者 |
| 20499 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals homogeneous transcriptome patterns and low variance in a suspension CHO-K1 and an adherent HEK293FT cell line in culture conditions
2023-Feb-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2023.01.006
PMID:36708997
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研究论文 | 本研究使用全长覆盖的单细胞RNA测序技术，比较了悬浮CHO-K1和贴壁HEK293FT细胞在标准化和均质培养条件下的转录组多样性 | 首次详细分析了在标准化培养条件下，悬浮CHO-K1和贴壁HEK293FT细胞的单细胞转录组模式和变异 | 研究主要集中在细胞周期对转录组变异的影响，未深入探讨其他潜在的环境因素 | 探究重组哺乳动物宿主细胞系在工业生产治疗性蛋白质中的转录组多样性和变异机制 | 悬浮CHO-K1和贴壁HEK293FT细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 四个96孔板的CHO-K1单细胞 |
| 20500 | 2024-08-08 |
The Transcriptional Response to Lung-Targeting Lipid Nanoparticles in Vivo
2023-02-08, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.2c04479
PMID:36701517
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研究论文 | 研究了带电脂质纳米粒子（LNPs）在肺部递送mRNA时的转录反应 | 首次详细研究了带电LNPs在肺部递送mRNA时的生物学反应，并使用单细胞RNA测序技术进行了转录组分析 | 研究仅限于特定的137种LNPs和19种细胞类型，可能无法完全代表所有LNPs的反应 | 评估带电LNPs在肺部递送mRNA时的细胞反应差异 | 137种LNPs和19种细胞类型 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 835条潜在通路中，27条在肺部上调，其中19条与RNA或蛋白质代谢相关 |