单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28786 篇文献，本页显示第 20481 - 20500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20481 | 2024-08-05 |
Hepatic TREM2+ macrophages express matrix metalloproteinases to control fibrotic scar formation
2023-03, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12616
PMID:36529983
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研究论文 | 本研究探讨了肝脏TREM2+巨噬细胞通过表达基质金属蛋白酶（MMP）来控制纤维化瘢痕形成的机制 | 首次系统地描述了肝脏巨噬细胞的异质性，特别是TREM2+巨噬细胞在肝纤维化中的作用 | 对异质性SAMac群体的表征仍不够全面，需要进一步研究 | 研究肝脏巨噬细胞在肝纤维化中的作用及其潜在治疗途径 | 主要研究TREM2+巨噬细胞及其在肝纤维化过程中的表达特征 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞转录组学 | NA | 公共数据库的单细胞转录组数据 | 人类肝硬化样本及饮食诱导的非酒精性脂肪性肝炎模型 |
| 20482 | 2024-08-05 |
Immunohistochemical characterization of bipolar cells in four distantly related avian species
2023-03, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25443
PMID:36550622
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研究论文 | 该研究系统性测试了12种抗体在鸟类视网膜中标记双极细胞的能力 | 首次提供了不同鸟类双极细胞的免疫组化标记物目录 | 部分标记物不仅标记双极细胞，还标记了其他细胞类型 | 分析各种鸟类视网膜中双极细胞的特征和标记物 | 家鸡、家鸽、普通秃鹰和欧洲知更鸟等四种远缘鸟类 | 数字病理学 | NA | 免疫组化 | NA | 视网膜样本 | 研究涉及四种鸟类的八种最适合的抗体 |
| 20483 | 2024-08-05 |
RIIβ-PKA in GABAergic Neurons of Dorsal Median Hypothalamus Governs White Adipose Browning
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205173
PMID:36529950
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研究论文 | 本研究探讨了RIIβ-PKA在背侧中间下丘脑GABA能神经元中对白色脂肪组织变褐的调控作用 | 揭示了RIIβ-PKA在背侧中间下丘脑GABA能神经元中调节白色脂肪组织变褐的机制 | 在该研究中没有直接阐明白色脂肪组织变褐是否导致了体重减少 | 研究RIIβ-PKA对白色脂肪组织变褐的影响及其在肥胖和代谢疾病治疗中的潜在应用 | 研究对象为RIIβ缺失小鼠及其在背侧中间下丘脑GABA能神经元中的表现 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序，转录组测序，电生理研究 | NA | NA | RIIβ-KO小鼠 |
| 20484 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals the chemotherapy-induced cellular reprogramming and novel therapeutic targets in relapsed/refractory acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01789-6
PMID:36543880
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析了原发性难治性或短期复发急性髓系白血病患者的骨髓样本，揭示了化疗诱导的细胞重编程及新的治疗靶点 | 发现了化疗过程中增殖性干细胞/祖细胞样细胞向静止干细胞样细胞的表型转变，并确定了CD52和LGALS1的上调 | NA | 揭示急性髓系白血病化疗耐药机制，开发新的治疗策略 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20485 | 2024-08-08 |
Identification of Cell Types and Transcriptome Landscapes of Porcine Epidemic Diarrhea Virus-Infected Porcine Small Intestine Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2101216
PMID:36548460
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研究论文 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了感染猪流行性腹泻病毒（PEDV）的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析PEDV感染的猪空肠，并鉴定了一种新的绒毛细胞标记物DNAH11 | NA | 研究PEDV感染后猪空肠不同细胞类型的反应，加深对病毒发病机制的理解 | 猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 数字病理学 | 猪病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20486 | 2024-08-05 |
Class switch toward noninflammatory, spike-specific IgG4 antibodies after repeated SARS-CoV-2 mRNA vaccination
2023-01-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade2798
PMID:36548397
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研究论文 | 该研究报道了在重复接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后，特异性IgG4抗体的增加. | 该研究发现，在第二次接种几个月后，SARS-CoV-2特异性抗体主要由非炎症性IgG4组成，并且第三次接种进一步增加了IgG4抗体的比例. | 该研究没有探讨亚型IgG4的长期免疫影响及其在不同人群中的表现. | 研究mRNA疫苗接种后特定IgG4抗体的变化及其对疫苗接种策略的影响. | 研究对象为接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的抗体反应变化. | 免疫学 | NA | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 抗体反应数据 | 在三次免疫接种后分析了与IgG4相关的B细胞频率. |
| 20487 | 2024-08-05 |
spaCI: deciphering spatial cellular communications through adaptive graph model
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac563
PMID:36545790
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的自适应图模型spaCI，用于解读细胞间的空间通信 | spaCI结合了细胞的空间位置和基因表达特征，通过注意力机制提高了细胞通信的推断能力 | 在研究中可能未能详细探讨模型的计算效率及其在其他类型数据中的适用性 | 阐明细胞间的通信机制，尤其是在复杂疾病中的作用 | 主要研究对象为小鼠皮层的seqFISH+数据和非小细胞肺癌样本的NanoString CosMx SMI数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞空间转录组学（SCST） | 自适应图模型 | 基因表达数据 | 涉及小鼠皮层和非小细胞肺癌样本的seqFISH+和NanoString CosMx SMI数据 |
| 20488 | 2024-08-05 |
Senescence atlas reveals an aged-like inflamed niche that blunts muscle regeneration
2023-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05535-x
PMID:36544018
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研究论文 | 本研究揭示衰老细胞在骨骼肌再生区中的重要性，并阐明其对再生的抑制作用 | 本研究结合单细胞转录组学和衰老细胞富集分选协议，克服了衰老细胞稀缺的技术限制，提供了在体内分离衰老细胞的技术，并定义了肌肉的衰老蓝图 | 衰老细胞的多样性可能影响研究结果的普遍性 | 旨在探讨衰老细胞如何影响肌肉再生及其相关机制 | 年轻和老鼠损伤肌肉中不同类型的衰老细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 年轻和老鼠中不同类型的损伤肌肉样本 |
| 20489 | 2024-08-05 |
scDrug: From single-cell RNA-seq to drug response prediction
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.055
PMID:36544472
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研究论文 | scDrug是一个生物信息学工作流程，用于从单细胞RNA测序数据生成细胞聚类及预测药物治疗 | 提供了一种集成工具，从单细胞RNA测序分析到药物发现的全过程 | 目前的工具可能在精准性和适用范围上存在限制 | 开发一个综合的bioinformatics工具以进行药物反应预测 | 单细胞RNA测序数据及其在肿瘤微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20490 | 2024-08-08 |
The Heterogeneity of Tumour-Associated Macrophages Contributes to the Recurrence and Outcomes of Glioblastoma Patients
2023-Jan, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-022-02081-z
PMID:36542317
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞的异质性对胶质母细胞瘤患者复发和预后的影响 | 通过单细胞RNA测序分析了复发性胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并建立了一个基于差异表达基因的预后标志物 | NA | 探究肿瘤相关巨噬细胞的异质性是否影响胶质母细胞瘤患者的复发和预后 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自医院的胶质母细胞瘤组织样本 |
| 20491 | 2024-08-08 |
Bulk RNA-seq and scRNA-seq analysis reveal an activation of immune response and compromise of secretory function in major salivary glands of obese mice
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.054
PMID:36544475
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，揭示了肥胖小鼠主要唾液腺中免疫反应的激活和分泌功能的损害 | 首次通过bulk RNA-seq和scRNA-seq技术研究肥胖对唾液腺转录组和细胞组成的影响，并首次对舌下腺的细胞类型进行单细胞RNA测序注释 | NA | 探讨肥胖对唾液腺功能的影响及其分子机制 | 肥胖小鼠的主要唾液腺 | 数字病理学 | 肥胖 | RNA-seq | NA | RNA | 肥胖小鼠的主要唾液腺样本 |
| 20492 | 2024-08-08 |
Cellular features of localized microenvironments in human meniscal degeneration: a single-cell transcriptomic study
2022-12-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79585
PMID:36548025
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法构建了健康和退化的人类半月板样本的细胞图谱，以探索半月板微环境的稳态及其在退化过程中的变化 | 研究发现了与退化相关的新型软骨细胞亚型，并提出了一个可能的退化机制模型 | NA | 揭示半月板退化的细胞机制 | 人类半月板的健康和退化样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12个健康或退化的半月板样本，来自8名患者 |
| 20493 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of immune cells in patients with acute gout
2022-12-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-25871-2
PMID:36550178
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学工具，分析了急性痛风患者血液和关节液中的免疫细胞亚群及其基因特征 | 首次详细描述了急性痛风患者血液和关节液中免疫细胞亚群的组成和相互作用 | 样本量较小，仅包括五名健康受试者和七名急性痛风患者 | 揭示痛风患者免疫细胞的分子和细胞学特征，为痛风治疗提供指导 | 急性痛风患者的血液和关节液中的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 五名健康受试者和七名急性痛风患者 |
| 20494 | 2024-08-08 |
T-cell repertoire diversity: friend or foe for protective antitumor response?
2022-Dec-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02566-0
PMID:36550555
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综述 | 本文综述了通过分析T细胞受体（TCR）库来研究自体和治疗诱导的抗肿瘤免疫反应的方法，并探讨了TCR库的多样性和克隆性与功能反应之间的关系 | 介绍了高通量下一代测序（NGS）和空间转录组学等技术突破，提供了对肿瘤免疫机制的深入见解 | 讨论了当前T细胞测序方法的优势和挑战 | 探讨TCR库的全球指标与功能反应之间的关系，以及特定TCR库对癌症患者预后或治疗反应的预测能力 | T细胞受体库的多样性和克隆性 | NA | NA | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA |
| 20495 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals core cell populations and androgen-RXFP2 axis involved in deer antler full regeneration
2022-Dec-21, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-022-00153-4
PMID:36542206
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了鹿角完全再生过程中的核心细胞群和雄激素-RXFP2轴的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了鹿角组织中的细胞组成和分子事件，并发现了雄激素-RXFP2轴在鹿角再生中的潜在作用 | 目前对鹿角组织细胞组成的详细解析仍不充分，且雄激素-RXFP2轴的具体作用机制尚需进一步研究 | 揭示鹿角完全再生过程中的细胞组成和分子机制 | 鹿角的完全再生过程及其相关细胞和分子机制 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及八种细胞类型和三种核心亚群的THY1细胞 |
| 20496 | 2024-08-08 |
Robust generation of human-chambered cardiac organoids from pluripotent stem cells for improved modelling of cardiovascular diseases
2022-12-21, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-03215-1
PMID:36544188
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研究论文 | 本文研究了从人类多能干细胞生成具有腔室结构的心脏类器官的过程，并探讨了其在心血管疾病模型中的应用 | 首次证明了心脏前体细胞数量对类器官腔室形成的重要性，并通过单细胞RNA测序揭示了心脏类器官随时间的成熟过程 | NA | 探索心脏类器官的形成机制及其在疾病模型和药物筛选中的应用 | 人类胚胎干细胞分化的心脏类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 定量PCR，单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 涉及第8天、第14天和第21天的心脏类器官样本 |
| 20497 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics highlights immunological dysregulations of monocytes in the pathobiology of COPD
2022-Dec-20, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-022-02293-2
PMID:36539833
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中巨噬细胞的免疫调节异常 | 发现了COPD中巨噬细胞在分子水平上的改变，以及这些改变如何促进COPD的发展 | NA | 探讨COPD的病理生物学机制，特别是与衰老和吸烟相关的免疫调节异常 | COPD患者和年龄分层的对照组肺组织中的66,610个细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 共分析了110,931个细胞，包括9个个体的外部公开数据 |
| 20498 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals differential cell subpopulations and distinct phenotype transition in normal and dissected ascending aorta
2022-12-19, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00584-4
PMID:36536281
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了正常和剥离升主动脉中的差异细胞亚群及独特的表型转变 | 发现了合成型血管平滑肌细胞的新标记物STEAP4，并提出了合成型血管平滑肌细胞可能通过CXCL12-CXCR4/ACKR3轴与中性粒细胞和成纤维细胞相互作用，从而恶化急性胸主动脉剥离进程的潜在机制 | NA | 研究正常和剥离升主动脉中的细胞亚群及其表型转变 | 正常和剥离升主动脉的细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括5名急性胸主动脉剥离患者和4名健康对照 |
| 20499 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptomics of cerebrospinal fluid cells in treatment-naïve multiple sclerosis
2022-Dec-19, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02667-9
PMID:36536441
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研究论文 | 本文通过整合多个多发性硬化症（MS）患者早期复发缓解型（RRMS）的脑脊液（CSF）细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，提供了一个可搜索和交互的资源，以促进多样化的可视化和分析方法。 | 本文通过整合分析验证了MS患者CSF中细胞类型的多样性和B细胞的成熟，并提供了一个易于访问的数据资源。 | 并非所有研究中的改变在所有研究中都能复制。 | 旨在通过分析CSF细胞的单细胞转录组来识别与MS相关的变化，并提供一个交互式资源以促进数据的可访问性。 | 多发性硬化症（MS）患者的脑脊液（CSF）细胞。 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个MS患者早期复发缓解型（RRMS）的CSF细胞数据集 |
| 20500 | 2024-08-08 |
Amyloid-beta and tau pathologies act synergistically to induce novel disease stage-specific microglia subtypes
2022-12-17, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00589-x
PMID:36536457
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了在阿尔茨海默病（AD）进展中，淀粉样β（Aβ）和tau病理如何协同调节小胶质细胞亚型 | 发现了由Aβ和tau病理共同诱导的新型疾病阶段特异性小胶质细胞亚型，并揭示了Siglecs作为AD进展的生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 探讨Aβ和tau病理在AD进展中对小胶质细胞亚型的调控作用 | 小胶质细胞亚型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自展示Aβ和tau病理的小鼠的小胶质细胞亚型，以及来自人类额上回（SFG）和内嗅皮层（ERC）在不同Braak阶段的数据 |