单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20481 - 20500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20481 | 2024-08-08 |
Spatiotemporal dynamics of macrophage heterogeneity and a potential function of Trem2hi macrophages in infarcted hearts
2022-08-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32284-2
PMID:35933399
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，探讨了心肌梗死后小鼠模型中免疫细胞的时空动态变化及其在心衰治疗中的潜在作用 | 首次揭示了心肌梗死后不同阶段免疫细胞的组成变化，特别是Trem2高表达巨噬细胞的功能 | 需要进一步研究Trem2信号通路的调控因子以开发新的治疗策略 | 识别心肌梗死后炎症细胞的精确时间依赖性组成，为心衰治疗提供新的生物标志物和治疗方法 | 心肌梗死后小鼠模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 20482 | 2024-08-08 |
Temporal profiling of the breast tumour microenvironment reveals collagen XII as a driver of metastasis
2022-08-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32255-7
PMID:35933466
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研究论文 | 本研究通过时间蛋白质组学分析去细胞化的肿瘤，探讨了乳腺癌进展过程中基质组的变化，并揭示了胶原蛋白XII在调节胶原蛋白I组织和促进肿瘤转移中的关键作用 | 本研究首次揭示了胶原蛋白XII在乳腺癌转移中的作用，并通过结合蛋白质组学和单细胞转录组学，以及遗传操作模型，深入探讨了其机制 | NA | 探讨乳腺癌进展过程中肿瘤微环境的变化，特别是基质组和细胞外基质的作用 | 乳腺癌肿瘤微环境中的基质组和细胞外基质 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
| 20483 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome and cell type-specific molecular pathways of human non-alcoholic steatohepatitis
2022-08-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-16754-7
PMID:35931712
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序技术，分析非酒精性脂肪性肝炎（NASH）患者的细胞类型特异性转录特征，以增进对该疾病的理解 | 本研究首次提供了NASH病理学的全面单细胞分析，描述了19,627个单细胞转录组，并发现NASH相关巨噬细胞的概念可以通过肝脏巨噬亚群的上调来解释 | NA | 研究非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的细胞类型特异性转录特征 | NASH患者的肝脏活检样本 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 10名NASH患者和160名非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者及24名正常肝脏组织对照 |
| 20484 | 2024-08-08 |
BASS: multi-scale and multi-sample analysis enables accurate cell type clustering and spatial domain detection in spatial transcriptomic studies
2022-08-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02734-7
PMID:35927760
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BASS的计算方法，该方法通过多尺度和多样本分析，实现了单细胞分辨率的空间转录组学研究中的细胞类型聚类和空间域检测 | BASS在单细胞尺度进行细胞类型聚类，并在组织区域尺度进行空间域检测，这两项任务在贝叶斯分层建模框架内同时进行 | NA | 开发一种能够进行多尺度和多样本分析的计算方法，以提高空间转录组学研究中的准确性 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 贝叶斯分层建模 | 贝叶斯分层模型 | 转录组数据 | 涉及三个数据集 |
| 20485 | 2024-08-08 |
Fate mapping of hematopoietic stem cells reveals two pathways of native thrombopoiesis
2022-08-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31914-z
PMID:35922411
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研究论文 | 本文通过计算整合命运图谱、有丝分裂追踪和单细胞RNA测序实验方法，揭示了造血干细胞（HSCs）产生细胞谱系的原生途径及其生理调控机制 | 发现了血栓形成的两条不同途径，并阐明了血栓生成素信号增强对短途径的差异化加速作用 | NA | 揭示造血干细胞的生理分化通量图谱及原生血栓形成的两条功能性不同途径 | 造血干细胞及其产生的细胞谱系 | NA | NA | 命运图谱、有丝分裂追踪、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单细胞 |
| 20486 | 2024-08-08 |
Medulloblastoma group 3 and 4 tumors comprise a clinically and biologically significant expression continuum reflecting human cerebellar development
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111162
PMID:35926460
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了髓母细胞瘤第3组和第4组的转录连续性，并发现这种连续性与人类胎儿小脑发育中的转录细胞类型连续性相似 | 首次展示了髓母细胞瘤第3组和第4组在转录水平上的连续性，并将其与人类胎儿小脑发育的转录连续性相联系 | NA | 探讨髓母细胞瘤第3组和第4组的转录连续性及其与人类胎儿小脑发育的关系 | 髓母细胞瘤第3组和第4组的转录特征及其与人类胎儿小脑发育的关联 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序 | NA | RNA序列 | 大型且良好注释的髓母细胞瘤样本 |
| 20487 | 2024-08-08 |
Wound healing in aged skin exhibits systems-level alterations in cellular composition and cell-cell communication
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111155
PMID:35926463
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了年轻和老年皮肤在稳态和伤口愈合过程中的细胞组成和细胞间通讯的系统级变化 | 首次全面揭示了老年皮肤伤口愈合过程中细胞组成、动力学和分子特征的主要变化，以及细胞间通讯的系统级差异 | NA | 深入理解老年皮肤伤口愈合过程中的细胞和分子变化 | 年轻和老年皮肤在稳态和伤口愈合过程中的细胞类型和细胞间通讯 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 年轻和老年皮肤样本 |
| 20488 | 2024-08-08 |
CRISPR-Cas9-mediated gene editing of the BCL11A enhancer for pediatric β0/β0 transfusion-dependent β-thalassemia
2022-08, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01906-z
PMID:35922667
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研究论文 | 本研究报道了使用CRISPR-Cas9技术编辑BCL11A增强子治疗儿童输血依赖型β地中海贫血的初步结果 | 首次在临床试验中使用CRISPR-Cas9技术编辑BCL11A增强子，以诱导γ球蛋白表达，从而治疗β地中海贫血 | 研究样本量较小，仅涉及两名患者，需要更大规模的研究来验证其安全性和有效性 | 评估基因编辑治疗在儿童输血依赖型β地中海贫血中的安全性和有效性 | 两名患有最严重类型输血依赖型β地中海贫血的儿童 | 基因编辑 | 地中海贫血 | CRISPR-Cas9 | NA | 骨髓细胞、外周血单个核细胞 | 两名儿童 |
| 20489 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of Plasmodium vivax sporozoites reveals stage- and species-specific transcriptomic signatures
2022-08, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010633
PMID:35926062
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了9,947个P. vivax子孢子的转录组，揭示了其在蚊子唾液腺中的不同发育状态和物种特异性基因表达模式 | 首次在单细胞分辨率下分析P. vivax子孢子的转录组，揭示了其与P. falciparum在基因使用模式上的异同 | NA | 探索P. vivax子孢子的转录组特征及其在疟疾传播中的作用 | P. vivax子孢子的转录组 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9,947个P. vivax子孢子 |
| 20490 | 2024-08-08 |
A root phloem pole cell atlas reveals common transcriptional states in protophloem-adjacent cells
2022-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-022-01178-y
PMID:35927456
|
研究论文 | 本文利用第二代单细胞测序技术，对根部的韧皮部极细胞进行高分辨率转录组分析，揭示了原生韧皮部筛分子（PSE）邻近细胞系的发育轨迹和基因调控网络的相似性 | 本文采用第二代单细胞测序技术，对根部韧皮部极细胞进行高分辨率分析，揭示了PSE邻近细胞系的共同转录状态和发育轨迹 | NA | 研究根部韧皮部极细胞的转录组特征及其在根发育中的功能 | 根部韧皮部极细胞及其邻近细胞系的转录组和发育轨迹 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 20491 | 2024-08-08 |
Transcriptome Analysis Reveals Hub Genes Regulating Autophagy in Patients With Severe COVID-19
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.908826
PMID:35923698
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了严重COVID-19患者的外周血单个核细胞（PBMCs），揭示了调控自噬的关键基因 | 首次通过RNA测序和基因表达分析，识别出在严重COVID-19中特异性表达的差异表达基因（DEGs），并发现这些基因与自噬过程显著相关 | 研究样本量较小，仅包括四名严重COVID-19患者、四名轻度COVID-19患者和四名健康对照 | 深入了解严重COVID-19的生物学特征和发病机制，并开发新的治疗策略 | 严重COVID-19患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序（RNA-Seq） | NA | RNA | 12名参与者（4名严重COVID-19患者，4名轻度COVID-19患者，4名健康对照） |
| 20492 | 2024-08-08 |
IL-17A Increases Doxorubicin Efficacy in Triple Negative Breast Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.928474
PMID:35924165
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研究论文 | 本研究探讨了IL-17A在三阴性乳腺癌中增强多柔比星疗效的作用 | 首次发现γδ T细胞衍生的IL-17A在敏感肿瘤微环境中高度丰富，并能直接增加TNBC细胞对多柔比星的敏感性 | NA | 研究IL-17A在三阴性乳腺癌中对多柔比星化疗效果的影响 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境中的T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用4T1同源小鼠模型进行实验 |
| 20493 | 2024-08-08 |
Integrative Analyses Identify Potential Key Genes and Calcium-Signaling Pathway in Familial Atrioventricular Nodal Reentrant Tachycardia Using Whole-Exome Sequencing
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.910826
PMID:35924220
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序技术，分析了家族性房室结折返性心动过速患者的基因突变情况，并识别了潜在的关键基因和钙信号通路 | 首次报道了家族性房室结折返性心动过速的疾病相关基因，并揭示了钙信号通路在该疾病发生中的核心作用 | 研究样本仅限于20名患者和100名对照组，可能需要更大样本量以验证结果 | 探究家族性房室结折返性心动过速的遗传贡献 | 家族性房室结折返性心动过速患者及其基因突变 | 遗传学 | 心血管疾病 | 全外显子测序 | NA | 基因序列 | 20名患者和100名对照组 |
| 20494 | 2024-08-08 |
FGL2-MCOLN3-Autophagy Axis-Triggered Neutrophil Extracellular Traps Exacerbate Liver Injury in Fulminant Viral Hepatitis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.07.014
PMID:35926777
|
研究论文 | 本文研究了中性粒细胞外陷阱（NETs）在暴发性病毒性肝炎（FVH）发病机制中的作用及机制 | 发现了FGL2-mucolipin 3-自噬轴调控NETs形成，为FVH治疗提供了新策略 | NA | 探究NETs在FVH发病机制中的作用及调控机制 | 暴发性病毒性肝炎（FVH） | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序，全转录组测序 | NA | RNA | 使用了感染或未感染小鼠的肝脏白细胞，以及HBV相关急性肝损伤患者的肝脏、血浆和外周中性粒细胞 |
| 20495 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics as a Novel Approach to Redefine Electrical Stimulation Safety
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.937923
PMID:35928007
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术评估大脑对电刺激的生物学反应，并探索其对电刺激安全性的潜在影响 | 首次使用空间转录组学技术来评估电刺激对大脑的生物学影响，并与传统的组织损伤指标进行直接比较 | 研究仅限于大鼠视觉皮层，且使用特定的电极类型和刺激参数 | 探索电刺激对大脑的生理效应，并重新定义电刺激的安全标准 | 大鼠视觉皮层对电刺激的生物学反应 | 分子生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达 | 使用碳纤维超微电极阵列和微线电极阵列进行电刺激，刺激参数在报告的组织损伤阈值之上和之下 |
| 20496 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of the Expression and Prognosis for Tripartite Motif-Containing Genes in Breast Cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.876325
PMID:35928444
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研究论文 | 本研究综合分析了三重基序含基因（TRIMs）在乳腺癌中的表达模式及其预后价值 | 首次全面分析了TRIMs在乳腺癌中的表达及其预后意义，并发现TRIMs在非肿瘤细胞中的表达及其在乳腺癌微环境中的作用 | 研究主要基于数据集和软件分析，未进行体内外实验验证 | 探讨TRIMs在乳腺癌中的表达模式及其预后价值 | 三重基序含基因（TRIMs）在乳腺癌中的表达及其预后影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集和独立队列 |
| 20497 | 2024-08-08 |
Upregulation of CCNB2 and Its Perspective Mechanisms in Cerebral Ischemic Stroke and All Subtypes of Lung Cancer: A Comprehensive Study
2022, Frontiers in integrative neuroscience
IF:2.6Q3
DOI:10.3389/fnint.2022.854540
PMID:35928585
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研究论文 | 本研究收集了103个与肺癌症和脑缺血性中风相关的CCNB2表达的高通量数据集，分析了CCNB2在这些疾病中的上调表达及其潜在机制 | 通过多尺度嵌入基因共表达网络分析（MEGENA）和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析，揭示了CCNB2在肺癌症和脑缺血性中风中的关键作用及其参与的生物过程 | NA | 探讨CCNB2在肺癌症和脑缺血性中风中的上调表达及其潜在机制 | 肺癌症和脑缺血性中风 | 数字病理学 | 肺癌症，脑缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 103个高通量数据集 |
| 20498 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Killing Mechanisms of Antitumor Cytotoxic CD4+ TCR-T Cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.939940
PMID:35928827
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗肿瘤细胞毒性CD4+ TCR-T细胞的杀伤机制 | 首次全面揭示了CD4 TCR-T细胞的细胞毒性机制，并发现其与CD8 TCR-T细胞在杀伤途径上的共同点和独特特征 | NA | 探索CD4 TCR-T细胞的抗肿瘤效果及其杀伤机制 | CD4 TCR-T细胞和CD8 TCR-T细胞的杀伤机制 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞V(D)J测序技术 | NA | RNA序列 | NA |
| 20499 | 2024-08-08 |
A Detailed Overview About the Single-Cell Analyses of Solid Tumors Focusing on Colorectal Cancer
2022, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2022.1610342
PMID:35928965
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在结直肠癌研究中的应用及其对肿瘤异质性的深入解析 | 介绍了单细胞测序技术如何实现对肿瘤异质性、肿瘤微环境及其相互作用的详细描述 | 讨论了传统研究方法的局限性 | 强调单细胞分析在肿瘤研究中的重要性 | 结直肠癌的肿瘤异质性及其微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 20500 | 2024-08-08 |
Manipulation of single cells via a Stereo Acoustic Streaming Tunnel (SteAST)
2022, Microsystems & nanoengineering
IF:7.3Q1
DOI:10.1038/s41378-022-00424-9
PMID:35935274
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研究论文 | 本文介绍了一种通过立体声学流隧道（SteAST）操纵单细胞的多功能微系统 | 该系统利用超高频体声波触发并由微通道高度限制的立体声学流，实现了单细胞的3D重建、集群分离、选择性捕获/释放、原位分析及与条形码凝胶珠的配对 | NA | 开发一种用于观察、预处理和分析单细胞的虚拟隧道，以应用于不同的单细胞研究 | 单细胞及其集群的异质性和行为 | 生物技术 | NA | 立体声学流技术 | NA | 细胞 | 未具体说明 |