单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 20421 - 20440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20421 | 2024-08-08 |
FastMix: a versatile data integration pipeline for cell type-specific biomarker inference
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac585
PMID:36018232
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FastMix的新型分析管道，用于计算免疫学，整合流式细胞术、bulk转录组学和临床协变量，以识别细胞类型特异性基因表达特征和生物标志物基因 | FastMix通过线性混合效应模型（LMER）解决了基因表达和流式细胞术整合分析中的'大p，小n'问题，并引入了基于矩的估计器，减少了参数估计中的偏差并提高了效率 | NA | 开发一种数据整合管道，用于分析流式细胞术和转录组学数据，结合实验变量进行生物标志物推断 | 流式细胞术和转录组学数据 | 计算免疫学 | NA | 流式细胞术，bulk转录组学 | 线性混合效应模型（LMER） | 基因表达数据，流式细胞术数据 | 涉及两个疫苗研究的实际数据 |
| 20422 | 2024-08-08 |
Sex-dependent differential transcript expression in the placenta of growth restricted infants
2022-10, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2022.08.004
PMID:36031700
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研究论文 | 研究探讨了在宫内生长受限婴儿的胎盘中，性别特异性基因表达的变化 | 首次识别了与宫内生长受限婴儿相关的403个候选转录本，其中103个显示性别特异性表达 | 研究仅基于12个胎盘样本，样本量较小 | 旨在评估宫内生长受限婴儿胎盘中性别特异性基因表达的变化 | 人类胎盘组织样本 | 基因表达 | 宫内生长受限 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胎盘样本 |
| 20423 | 2024-08-08 |
Tracking Regulatory T Cell Development in the Thymus Using Single-Cell RNA Sequencing/TCR Sequencing
2022-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200089
PMID:36038290
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和TCR测序技术，追踪小鼠胸腺中调节性T细胞（T）的发育过程 | 本研究首次详细描述了调节性T细胞在胸腺中的发育路径，并通过scRNA-Seq和TCR-Seq技术揭示了多个发育阶段和TCR库的多样性 | NA | 研究调节性T细胞在胸腺中的发育过程及其分子机制 | 小鼠胸腺中的CD4CD8双阳性胸腺细胞、CD4单阳性胸腺细胞、CD25FOXP3CD73 T前体细胞等 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、TCR测序 | NA | RNA序列 | 多种胸腺细胞亚群 |
| 20424 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome and translatome dual-omics reveals potential mechanisms of human oocyte maturation
2022-08-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32791-2
PMID:36042231
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研究论文 | 本文开发了一种单细胞转录组和翻译组双组学方法，通过T&T-seq技术分析了小鼠和人类卵母细胞成熟过程中的转录组和翻译组特征 | 首次结合转录组和翻译组双组学方法，更准确地揭示了卵母细胞成熟过程中的基因表达调控机制 | NA | 探究人类卵母细胞成熟过程中的基因表达调控机制 | 小鼠和人类卵母细胞 | 基因组学 | NA | T&T-seq | NA | 转录组和翻译组数据 | 单细胞卵母细胞样本 |
| 20425 | 2024-08-08 |
Transcriptome Analysis of Peripheral Blood Mononuclear Cells Response in Patients with Severe COVID-19 Reveals Crucial Genes Regulating Protein Ubiquitination
2022-Aug-29, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.937532
PMID:36031751
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析严重COVID-19患者和健康对照者的外周血单个核细胞，揭示了调控蛋白质泛素化的关键基因 | 发现蛋白质泛素化在严重COVID-19患者中的重要作用，并识别出关键基因簇和转录因子 | 样本量较小，仅包括4名患者和4名健康对照 | 深入理解严重COVID-19的生物学特征 | 严重COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4名严重COVID-19患者和4名健康对照 |
| 20426 | 2024-08-08 |
Accurate inference of genome-wide spatial expression with iSpatial
2022-Aug-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq0990
PMID:36026447
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research paper | 本文开发了一种名为iSpatial的新算法，通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据集，推导出整个转录组的空间模式 | iSpatial算法在预测基因表达和空间分布方面比现有方法具有更高的准确性，并减少了原始数据集中的假阳性和假阴性信号 | NA | 提供一种计算方法，以单细胞分辨率揭示整个转录组的空间组织 | 空间转录组学和单细胞RNA测序数据集 | digital pathology | NA | RNA-seq | algorithm | spatial transcriptomic data | 多个来自不同组织和技术的空间转录组数据集 |
| 20427 | 2024-08-08 |
Shared regulation and functional relevance of local gene co-expression revealed by single cell analysis
2022-08-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03831-w
PMID:36028576
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研究论文 | 本文利用单细胞数据集研究了人类细胞中基因共表达的现象，并探讨了其在单细胞层面的调控机制和功能相关性 | 首次利用单细胞数据集研究基因共表达现象，揭示了共表达基因对在单细胞层面的调控元素共享情况 | NA | 探究单细胞层面基因共表达的调控机制及其功能相关性 | 人类诱导多能干细胞（iPSCs）和淋巴母细胞系（LCLs）中的基因共表达现象 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过85个个体 |
| 20428 | 2024-08-08 |
Paracrine Factors of Stressed Peripheral Blood Mononuclear Cells Activate Proangiogenic and Anti-Proteolytic Processes in Whole Blood Cells and Protect the Endothelial Barrier
2022-Jul-30, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics14081600
PMID:36015226
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研究论文 | 研究了应激外周血单个核细胞（PBMCsec）的旁分泌因子对全血细胞和内皮屏障的保护作用 | 首次展示了PBMCsec在体外对白细胞和内皮细胞的转录组变化，并发现其具有显著的组织再生和促血管生成能力 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的临床试验来验证其治疗效果 | 探讨PBMCsec在治疗受损器官中的潜在应用 | 外周血单个核细胞的旁分泌因子及其对白细胞和内皮细胞的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自健康个体的全血样本 |
| 20429 | 2024-08-08 |
SAREV: A review on statistical analytics of single-cell RNA sequencing data
2022 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. Computational statistics
DOI:10.1002/wics.1558
PMID:36034329
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据统计分析方法的发展 | 介绍了针对单细胞RNA测序数据的高分辨率特性而开发的新的统计分析方法 | 由于篇幅限制，本综述未能涵盖所有相关方法 | 旨在为从事单细胞RNA测序统计和计算研究以及相关方法和工具的科学研究的研究人员提供参考 | 单细胞RNA测序数据的统计分析方法 | 基因组学 | NA | NGS | NA | RNA测序数据 | NA |
| 20430 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptomic analysis identifies Creb5 and CD11b-DCs as regulator of asthma exacerbations
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00556-1
PMID:36038770
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了哮喘加重的免疫调节因子，并确定了Creb5和CD11b-DCs在哮喘加重中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了Creb5和CD11b-DCs在哮喘加重中的共同调节作用 | NA | 旨在识别哮喘加重的共同免疫因子，以促进统一靶向治疗的发展 | 使用尘螨（HDM）小鼠模型，通过单细胞RNA测序分析肺部免疫细胞的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA深度测序（scRNA-seq） | NA | RNA转录组 | 使用尘螨（HDM）小鼠模型进行实验，具体样本数量未详细说明 |
| 20431 | 2024-08-08 |
scRNA-seq reveals ATPIF1 activity in control of T cell antitumor activity
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2114740
PMID:36016697
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和遗传学方法，揭示了ATP合酶抑制因子1（ATPIF1）在调控T细胞抗肿瘤活性中的作用 | 首次揭示了ATPIF1在调控T细胞免疫活性中的作用，并证明了ATPIF1缺乏会导致T细胞衰竭，从而影响肿瘤免疫 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人体中验证ATPIF1的作用 | 探讨ATPIF1在调控CD8 T细胞抗肿瘤活性中的作用及其在癌症免疫治疗中的潜在应用 | ATPIF1在T细胞中的功能及其对肿瘤免疫的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及B16黑色素瘤和Lewis肺癌模型的小鼠样本 |
| 20432 | 2024-08-08 |
The immune phenotypes and different immune escape mechanisms in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.968089
PMID:36032084
|
研究论文 | 研究结直肠癌（CRC）的免疫表型及其潜在的免疫逃逸机制 | 首次详细分类了CRC的三种不同免疫表型，并探讨了各自的免疫逃逸机制 | 研究主要基于样本数据分析，需要进一步的临床验证 | 探索结直肠癌的免疫表型及其免疫逃逸机制，为免疫治疗提供新的研究方向 | 结直肠癌样本及其免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 1802个微阵列队列样本和619个TCGA队列样本，以及447个中山医院样本和60个CRC样本的252,940个细胞 |
| 20433 | 2024-08-08 |
Fibroblasts in intestinal homeostasis, damage, and repair
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.924866
PMID:36032088
|
综述 | 本文综述了成纤维细胞在小肠稳态、损伤和修复中的作用 | 利用单细胞转录组学揭示了成纤维细胞在正常和炎症条件下的异质性，表明了不同的功能 | 对于成纤维细胞亚群的数量、术语和功能特性仍缺乏共识，且其如何调节小肠修复过程及其在炎症性肠病发病机制中的影响尚不清楚 | 旨在提供该领域最新进展的简要概述，以帮助阐明当前对成纤维细胞异质性和功能的理解，并推进我们对成纤维细胞在小肠损伤和修复中贡献的认识 | 成纤维细胞在小肠稳态、损伤和修复中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20434 | 2024-08-08 |
Prediction of prognosis, immunogenicity and efficacy of immunotherapy based on glutamine metabolism in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.960738
PMID:36032135
|
研究论文 | 本研究通过建立一个新的谷氨酰胺（Gln）代谢定量系统，预测肺癌的预后和免疫治疗效果，并分析了肿瘤微环境（TME）中的Gln代谢及其相关基因EPHB2的作用。 | 首次全面分析了谷氨酰胺代谢在肺腺癌中的作用，并建立了一个基于Gln代谢的模型来预测预后和免疫治疗效果。 | NA | 揭示谷氨酰胺代谢在肺腺癌中的作用，并为针对Gln代谢的抗肿瘤策略提供理论基础。 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的谷氨酰胺代谢。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析，转录组测序 | Cox回归和Lasso回归分析 | 基因表达数据 | 513名肺腺癌患者，73个谷氨酰胺代谢相关基因 |
| 20435 | 2024-08-08 |
CD4+ T cell activation and inflammation in NASH-related fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.967410
PMID:36032141
|
综述 | 本文综述了CD4+ T细胞在非酒精性脂肪肝病（NAFLD），特别是非酒精性脂肪性肝炎（NASH）相关肝纤维化中的激活和炎症作用 | 近期单细胞转录组分析揭示了NASH肝脏中CD4 T细胞、CD8 T细胞、γδ T细胞和TEMs的扩增 | NA | 探讨不同亚型的CD4 T细胞在NASH相关肝炎症和纤维化中的作用 | CD4+ T细胞及其亚型在NASH相关肝炎症和纤维化中的作用 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20436 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of androgen receptor status in prostate cancer with neuroendocrine differentiation
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.955166
PMID:36033483
|
研究论文 | 本研究通过免疫染色和批量及单细胞转录组分析，深入研究了神经内分泌分化前列腺癌中雄激素受体（AR）的状态 | 首次结合免疫染色和单细胞转录组分析，揭示了AR在神经内分泌分化前列腺癌中的存在及其功能 | 研究样本主要集中在去势抵抗性前列腺癌，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解神经内分泌分化前列腺癌中AR信号传导的细胞可塑性，并为治疗开发提供新见解 | 神经内分泌分化前列腺癌中的雄激素受体状态 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 免疫染色、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8194例前列腺癌病例 |
| 20437 | 2024-08-08 |
The combined prognostic model of copper-dependent to predict the prognosis of pancreatic cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.978988
PMID:36035166
|
研究论文 | 本文通过单细胞分析和CIBERSORT方法，研究了铜依赖基因及相关免疫浸润细胞在胰腺癌中的预后价值 | 本文首次提出了一种基于铜依赖基因及相关免疫浸润细胞的联合预后模型，用于预测胰腺癌的预后 | NA | 评估铜依赖基因及相关免疫浸润细胞在胰腺癌中的预后价值 | 铜依赖基因、相关免疫浸润细胞及胰腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序分析、CIBERSORT | Cox回归、LASSO方法 | 基因表达数据 | 训练队列和测试队列来自TCGA数据库，验证队列来自GSE62452数据集 |
| 20438 | 2024-08-08 |
Identification of novel key genes and potential candidate small molecule drugs in diabetic kidney disease using comprehensive bioinformatics analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.934555
PMID:36035169
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research paper | 本研究通过综合生物信息学分析，鉴定了糖尿病肾病中的新型关键基因和潜在的小分子候选药物。 | 首次揭示了糖尿病肾病患者肾脏中浸润免疫细胞的比例显著增高，并通过单细胞转录组学探索了免疫景观。 | NA | 旨在揭示糖尿病肾病中的基因表达变化，并发现关键基因，为诊断和治疗提供新的分子标记和治疗靶点。 | 糖尿病肾病患者和健康供体的肾脏样本。 | digital pathology | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学, 加权共表达网络分析 (WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络, 实时定量PCR, 免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据 | 包括健康供体、早期和晚期糖尿病肾病患者的肾脏样本 |
| 20439 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Smooth Muscle Cells Heterogeneity in Experimental Aortic Dissection
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.836593
PMID:36035191
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研究论文 | 本研究旨在阐明实验性主动脉夹层（AD）中主动脉的细胞景观，并详细阐述不同细胞类型中的平滑肌细胞（SMCs）及其功能 | 本研究首次提供了从老鼠AD组织中完整的细胞景观，并鉴定了七个核心差异表达基因（DEGs）和八种SMCs亚型 | NA | 阐明实验性主动脉夹层中主动脉的细胞景观，并详细阐述不同细胞类型中的平滑肌细胞及其功能 | 实验性主动脉夹层中的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 28周龄的雄性Apolipoprotein缺乏（ApoE）小鼠 |
| 20440 | 2024-08-08 |
Colorectal Cancer Cell Differentiation Trajectory Predicts Patient Immunotherapy Response and Prognosis
2022 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748221121382
PMID:36036380
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研究论文 | 本研究旨在探讨结直肠癌细胞的分化状态及其临床意义，并基于结直肠癌的分化相关基因预测患者的免疫反应和预后 | 本研究结合单细胞测序数据和转录组数据，开发了一种基于结直肠癌分化相关基因的分子分型和预后模型，以预测患者的免疫反应和预后 | NA | 探讨结直肠癌细胞的分化状态及其临床意义，并预测患者的免疫反应和预后 | 结直肠癌细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5种不同的细胞分化亚群和620个结直肠癌分化相关基因 |