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当前共找到 34287 篇文献，本页显示第 2021 - 2040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021 | 2025-11-24 |
NF-κB p65 mediated lnc-Traf3ip2 exacerbates renal fibrosis in diabetic kidney disease
2025-Nov, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02515-1
PMID:40471299
|
研究论文 | 本研究探讨了NF-κB p65介导的长链非编码RNA lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用机制 | 首次发现lnc-Traf3ip2在肾小球系膜细胞中高表达并通过NF-κB p65转录调控参与糖尿病肾病纤维化过程 | 样本量相对有限（小鼠n=35，患者n=40），且主要聚焦于系膜细胞的纤维化机制 | 探究lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用及分子机制 | 糖尿病肾病小鼠模型、db/db小鼠、人血浆样本、肾小球系膜细胞 | 分子生物学 | 糖尿病肾病 | scRNA-seq, RNA-seq, qRT-PCR, western blot, 免疫荧光, 双荧光素酶报告基因检测, ChIP | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 小鼠共38只（db/db 3只+对照3只+DKD小鼠35只），DKD患者40例 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 2022 | 2025-11-24 |
SemiLT: A Multianchor Transfer Learning Method for Cross-Modality Cell Label Annotation from scRNA-seq to scATAC-seq
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507846
PMID:40898317
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研究论文 | 提出一种多锚点迁移学习方法SemiLT，用于从scRNA-seq到scATAC-seq的跨模态细胞标签注释 | 首次考虑scRNA-seq和scATAC-seq之间的时序差异，通过多锚点迁移学习方法解决模态间批次效应问题 | NA | 提高从scRNA-seq到scATAC-seq的细胞类型注释准确性 | 单细胞测序数据，包括人类骨髓造血数据集和外周血单个核细胞(PBMC)数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | 迁移学习, 多锚点学习 | 单细胞测序数据 | 多个数据集(包括人类骨髓造血数据集和PBMC数据集) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2023 | 2025-11-24 |
Tracking clonal evolution during treatment in ovarian cancer using cell-free DNA
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09580-0
PMID:41034582
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研究论文 | 本研究开发了CloneSeq-SV方法，通过追踪克隆特异性基因组结构变异监测卵巢癌治疗过程中的克隆演化 | 结合单细胞全基因组测序和时间序列cfDNA靶向测序，利用肿瘤克隆特异性结构变异作为高灵敏度内源性标志物 | 样本量相对有限（18例患者），需要进一步验证 | 研究高级别浆液性卵巢癌治疗过程中药物耐药性的克隆演化机制 | 18例高级别浆液性卵巢癌患者从诊断到复发的多年期样本 | 癌症基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序,靶向深度测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据,转录组数据,细胞游离DNA | 18例HGSOC患者 | NA | 单细胞全基因组测序,靶向测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2024 | 2025-11-19 |
Single-cell transcriptomics reveal circulating skin-homing CLA+ CTSW+ cytotoxic CD4+ T cells contribute to relapse of psoriasis
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70518
PMID:41249858
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2025 | 2025-11-24 |
Spatiotemporal mapping reveals Ccl8hi macrophages as key drivers of testicular inflammaging
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70527
PMID:41251087
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研究论文 | 本研究通过时空多组学方法揭示了Ccl8hi巨噬细胞是睾丸炎性衰老的关键驱动因子 | 首次通过空间转录组学和FACS富集的单细胞RNA测序系统解析睾丸巨噬细胞在衰老过程中的异质性，并鉴定出CCL8作为保守的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究睾丸巨噬细胞在睾丸衰老过程中的异质性及其在炎性衰老中的作用机制 | 小鼠和人类睾丸组织中的巨噬细胞 | 空间转录组学 | 男性生殖系统衰老 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光分析,器官型培养 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 | 3月龄小鼠及老年小鼠睾丸组织，包含人类睾丸样本验证 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2026 | 2025-11-24 |
A parabrachial hub for need-state control of enduring pain
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09602-x
PMID:41062698
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学等技术发现臂旁核Y1R神经元群是控制持续性疼痛的内源性镇痛枢纽 | 首次揭示臂旁核中表达神经肽Y受体的Y1R神经元群作为疼痛调控枢纽，并发现饥饿、口渴等生理需求状态可通过NPY抑制这些神经元来缓解持续性疼痛 | NA | 探索持续性疼痛的中枢调控机制 | 臂旁核Y1R神经元 | 神经科学 | 慢性疼痛 | 空间转录组学, 神经操作, 活动记录, 计算建模 | NA | 基因表达数据, 神经活动数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2027 | 2025-11-24 |
NK Cell-Derived Small Extracellular Vesicles Armed With CLDN4-Targeting Peptides Potentiate Radiotherapy in Gastric Cancer
2025-Nov, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70200
PMID:41252335
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向CLDN4的NK细胞来源小细胞外囊泡纳米治疗平台，可增强胃癌放疗效果 | 首次将NK细胞来源的小细胞外囊泡与CLDN4靶向肽结合，创建具有放射增敏作用的新型纳米治疗平台 | 研究主要基于患者来源类器官模型，尚未进行大规模临床验证 | 开发针对胃癌的靶向治疗系统以增强放疗效果 | 胃癌细胞、患者来源类器官模型和类器官来源异种移植模型 | 癌症治疗 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、多模态成像 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、影像数据 | 多个单细胞RNA测序数据集和患者来源类器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2028 | 2025-11-24 |
SURF: A Self-Supervised Deep Learning Method for Reference-Free Deconvolution in Spatial Transcriptomics
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505456
PMID:40859416
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研究论文 | 提出一种名为SURF的无参考解卷积工具，通过自监督深度学习整合高维基因数据分析，用于空间转录组学的细胞类型解析 | 首次将自监督深度学习与高维基因数据分析相结合，无需匹配单细胞参考数据即可有效建模非线性基因相互作用和利用spot关系 | 未明确说明计算资源需求和运行时间，也未讨论对极稀疏数据的处理能力 | 开发无需参考数据的空间转录组解卷积方法，实现细胞水平的组织微环境分析 | 空间转录组数据，包括合成数据集、真实数据集以及人类结直肠肝转移瘤数据 | 空间转录组学 | 结直肠癌肝转移 | 空间转录组学，自监督深度学习 | 深度学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2029 | 2025-11-24 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals That Hmga2 Regulates Neuroinflammation and Retinal Function by Modulating Müller Cell Autophagy Through PI3K/AKT Signaling Following MCAO-Induced Retinal Ischemia
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502534
PMID:40884260
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Hmga2通过PI3K/AKT信号通路调节Müller细胞自噬在视网膜缺血中的神经炎症和视网膜功能调控机制 | 发现了一个新的表达Hmga2的Müller细胞亚群，并开发了基于Müller细胞膜和脂质体的混合纳米颗粒递送系统siRNA-Hmga2@LMM | MCAO诱导的视网膜缺血模型中Müller细胞的具体作用机制仍不完全清楚 | 探究视网膜缺血中Müller细胞的作用机制及治疗靶点 | 视网膜细胞，特别是Müller细胞 | 单细胞组学 | 视网膜缺血 | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2030 | 2025-11-24 |
BACE2-Induced Aberrant Lymphatic Network Aggravates the Local Inflammation in Arteriovenous Fistulas With Hyperphosphatemia
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509632
PMID:40884245
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了高磷血症通过BACE2介导的VEGFR3裂解破坏动静脉瘘淋巴网络，从而加剧局部炎症的机制 | 首次发现动静脉瘘中存在由Pi16Vegfc纤维祖细胞促进的淋巴网络作为炎症外排通道，并阐明高磷血症通过SP1/BACE2/VEGFR3裂解途径破坏该网络的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究慢性肾脏病条件下动静脉瘘局部炎症加剧的机制 | 人类和小鼠的动静脉瘘组织 | 空间转录组学 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5/6肾切除C57BL/6小鼠模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2031 | 2025-11-24 |
Succinic Acid-Induced Macrophage Endocytosis Promotes Extracellular Vesicle-Based Integrin Beta1 Transfer Accelerating Fibroblast Activation and Sepsis-Associated Pulmonary Fibrosis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507411
PMID:40898357
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研究论文 | 本研究揭示了琥珀酸通过促进巨噬细胞内吞作用释放促纤维化细胞外囊泡，并通过转移整合素β1激活成纤维细胞，从而加速脓毒症相关肺纤维化的新机制 | 首次发现琥珀酸诱导的巨噬细胞内吞作用促进细胞外囊泡介导的整合素β1转移，揭示了巨噬细胞-成纤维细胞通讯的新机制 | NA | 探究脓毒症相关肺纤维化的发病机制 | 巨噬细胞和成纤维细胞 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫荧光, 电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2032 | 2025-11-24 |
SciSt: single-cell reference-informed spatial gene expression prediction from pathological images
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf613
PMID:41263940
|
研究论文 | 开发了一种从病理图像预测空间基因表达的深度学习框架SciSt | 通过整合病理特征与生物学信息初始基因表达，采用结合细胞分割和单细胞参考数据的加权策略 | NA | 从组织病理图像预测空间基因表达，实现形态学与基因表达的跨模态转换 | 临床H&E染色图像和空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌,肝癌 | 深度学习 | 深度学习框架 | 图像,基因表达数据 | 三个基准数据集和TCGA-BRCA、TCGA-LIHC队列 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2033 | 2025-11-24 |
Single-cell profiles delineate immune cell remodeling and enhanced tumor-fibroblast interaction of hepatoblastoma after chemotherapy
2025-Oct-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102401
PMID:41038160
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了化疗后肝母细胞瘤免疫细胞重塑及肿瘤-成纤维细胞相互作用增强的机制 | 首次在肝母细胞瘤中整合单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学、多重免疫荧光和患者来源异种移植模型，全面解析化疗后肿瘤微环境变化 | 样本量相对有限（32个肿瘤），且为观察性研究，需要进一步功能验证 | 阐明化疗对肝母细胞瘤肿瘤微环境的影响及化疗耐药机制 | 肝母细胞瘤患者肿瘤组织（化疗前后） | 单细胞生物学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，批量转录组学，多重免疫荧光，患者来源异种移植 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，批量转录组数据，免疫荧光图像 | 32个肝母细胞瘤肿瘤（化疗前后配对样本） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 2034 | 2025-11-24 |
A Systematic Review on the Role of the Stria Vascularis in Menière's Disease Pathogenesis
2025-Oct, Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO
DOI:10.1007/s10162-025-01006-y
PMID:40987969
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系统综述 | 本文系统综述了血管纹在梅尼埃病发病机制中的作用，重点分析了血管纹细胞类型中表达的基因及其与疾病病理生理学的联系 | 首次系统性地整合了血管纹三种细胞类型（边缘细胞、中间细胞、基底细胞）中表达的基因，并揭示了它们在梅尼埃病免疫反应中的潜在作用机制 | 纳入研究数量有限（130项），其中人类研究仅26项，主要依赖动物模型数据，可能限制结果对人类疾病的直接适用性 | 评估血管纹基因表达与梅尼埃病病理生理学的关联 | 血管纹细胞类型（边缘细胞、中间细胞、基底细胞）和间隙连接蛋白 | 系统综述 | 梅尼埃病 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 国际小鼠表型联盟数据 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 130项研究（26项人类研究，101项动物研究，3项人-动物研究） | NA | 单细胞RNA测序, 多组学研究 | NA | NA |
| 2035 | 2025-11-24 |
Reduced intestinal GLP-1 + cell numbers are associated with an inflammation-related epithelial metabolic signature
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.05.641577
PMID:41040310
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研究论文 | 本研究探讨肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与炎症相关上皮代谢特征的关系 | 首次系统证明GLP-1+细胞在肠道炎症中普遍减少，并揭示其与线粒体功能障碍和代谢重编程的因果关系 | 主要依赖动物模型，人类数据来自公共数据库，需要进一步临床验证 | 阐明肠内分泌细胞在肠道炎症中的作用机制 | 小鼠模型、克罗恩病患者黏膜活检、肠道类器官 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，转录组分析，器官培养 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 4种小鼠炎症模型和克罗恩病患者活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2036 | 2025-11-24 |
Deciphering the combinatorial expression pattern and genetic regulatory mechanisms of Beats and Sides in the olfactory circuits of Drosophila
2025-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.31.657193
PMID:40502011
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转基因驱动线探索果蝇嗅觉电路中Beat和Side基因家族的组合表达模式及其调控机制 | 首次系统揭示果蝇嗅觉神经元中Beat和Side基因的类别特异性组合表达模式，并发现其在昆虫进化中的保守性 | 干扰Beat-IIa-Side-IV相互作用未在研究的两个肾小球中产生显著错误靶向，功能验证有限 | 解析果蝇嗅觉电路中细胞表面蛋白基因家族的组合表达模式及其遗传调控机制 | 果蝇的嗅觉受体神经元(ORNs)和投射神经元(PNs) | 神经科学 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因陷阱转基因技术 | NA | 基因表达数据, 转基因成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2037 | 2025-11-24 |
SCAN-ACT: adoptive T cell therapy target discovery through single-cell transcriptomics
2025-Aug-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01514-9
PMID:40814001
|
研究论文 | 开发了一个名为SCAN-ACT的计算流程，通过单细胞转录组学和多组学数据发现和优先排序用于过继性T细胞疗法的靶点 | 首次开发了整合单细胞RNA测序和多组学数据的计算流程，能够同时提名CAR-T和TCR-T细胞治疗的靶点，包括单特异性靶点、双特异性靶点对和肽-MHC靶点 | NA | 加速实体瘤过继性T细胞疗法的靶点发现 | 软组织肉瘤和胶质母细胞瘤 | 生物信息学 | 软组织肉瘤,胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | 计算分析流程 | 单细胞转录组数据,多组学数据 | 986,749个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学 | NA | NA |
| 2038 | 2025-11-24 |
Spatial transcriptomics defines the cell-specific RNA landscape of equine dorsal root ganglia
2025-Jul, Veterinary pathology
IF:2.3Q1
DOI:10.1177/03009858241312623
PMID:39916473
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术绘制了马背根神经节细胞特异性RNA图谱 | 首次将人类细胞标记物成功应用于马背根神经节的空间转录组分析，并验证了其在马组织中的适用性 | 研究仅针对健康成年马匹，尚未应用于疾病状态 | 定义健康成年马背根神经节的空间转录组景观 | 马背根神经节组织 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 数字空间分析 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | GeoMx数字空间分析平台 |
| 2039 | 2025-11-24 |
Combining Machine Learning and Multiplexed, In Situ Profiling to Engineer Cell Type and Behavioral Specificity
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660790
PMID:40667316
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研究论文 | 开发结合机器学习和多重原位分析的端到端平台，用于加速脊髓背角增强子发现 | 整合机器学习引导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选，实现空间分辨的多重增强子分析 | 增强子发现成功率较低，存在物种特异性差异，AAV多重化面临挑战 | 开发精确控制神经回路的技术，加速细胞靶向工具发现和基因治疗发展 | 小鼠脊髓背角神经元亚型、少突胶质细胞、运动神经元 | 机器学习 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 机器学习、染色质可及性分析、空间平行报告基因检测 | 机器学习模型 | 染色质可及性数据、空间表达数据 | 27个增强子-AAV文库在小鼠体内测试 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | ESCargoT平台整合机器学习引导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选 |
| 2040 | 2025-11-24 |
Scalable spatial transcriptomics through computational array reconstruction
2025-Apr-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02612-0
PMID:40181168
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研究论文 | 本文提出一种无需成像的空间转录组学方法，通过分子扩散和降维技术重建空间条形码位置 | 开发了不依赖成像设备的空间转录组学技术，利用计算重建实现厘米级组织的空间基因表达图谱 | 方法依赖于分子扩散模型和计算重建的准确性，需通过真实成像数据验证 | 提高空间转录组学的可及性和通量，实现大规模组织研究 | 组织样本的空间基因表达数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，分子扩散建模，降维分析 | 计算重建模型 | 基因表达数据，空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |