单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2021	2025-03-22	New Window Into Hepatitis B in Africa: Liver Sampling Combined With Single-Cell Omics Enables Deep and Longitudinal Assessment of Intrahepatic Immunity in Zambia 2024-Nov-15, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiae054 PMID:38332750	研究论文	本文介绍了在赞比亚卢萨卡进行的肝脏细针穿刺活检（FNAB）研究，结合单细胞组学技术，深入评估了慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染患者的肝内免疫情况	首次在非洲地区将肝脏细针穿刺活检与单细胞RNA测序技术结合，用于评估HBV感染患者的肝内免疫反应	样本量相对较小，且仅在一个地区进行，可能无法完全代表整个非洲的HBV感染情况	深入了解非洲地区HBV感染的免疫学特征，为治愈策略提供信息	未接受过治疗的慢性HBV感染成人患者，包括有和无HIV共感染的患者，以及急性HBV感染患者	数字病理学	乙型肝炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	117例入组样本和47例纵向随访样本
2022	2025-03-22	Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans 2024-07-31, Bioscience reports IF:3.8Q2 DOI:10.1042/BSR20240768 PMID:38904098	研究论文	本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和免疫定位技术，对小鼠、大鼠和人类肾脏中的内皮素系统进行了全面分析	首次结合scRNA-seq和免疫定位技术，跨物种（小鼠、大鼠、人类）和性别分析肾脏内皮素系统的表达特征	商业抗体无法在所有物种中有效工作，RNA表达水平并不总是与蛋白质水平相关，需采用多种方法以确保研究的严谨性和可重复性	表征肾脏内皮素系统的表达特征，探讨其在慢性肾病病理生理和进展中的作用	小鼠、大鼠和人类肾脏样本	生物医学	慢性肾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫定位	NA	RNA测序数据、免疫定位数据	正常人类活检样本（两性）、啮齿动物肾脏样本
2023	2025-03-22	Heart failure promotes multimorbidity through innate immune memory 2024-05-24, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.ade3814 PMID:38787963	研究论文	本文探讨了心力衰竭（HF）如何通过造血干细胞（HSCs）的改变促进多发病，并揭示了其机制	研究发现HF通过改变HSCs的表观基因组，影响其生成促炎性巨噬细胞的能力，从而驱动反复的HF事件和相关并发症	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	揭示心力衰竭与多发病之间的病理相互作用机制	心力衰竭小鼠模型及其造血干细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），全局染色质可及性分析	小鼠模型	基因表达数据，染色质可及性数据	小鼠骨髓移植实验
2024	2025-03-22	Gene networks and systems biology in Alzheimer's disease: Insights from multi-omics approaches 2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association DOI:10.1002/alz.13790 PMID:38534018	综述	本文综述了阿尔茨海默病（AD）领域中的基因网络和系统生物学研究，探讨了多组学方法的应用及其发现	本文强调了单细胞组学和空间组学技术在AD研究中的应用，提供了对基因调控网络的全面研究	本文主要集中于技术应用的综述，未涉及具体实验数据或模型验证	探讨阿尔茨海默病的基因网络和系统生物学研究	阿尔茨海默病	系统生物学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、表观基因组学、空间组学	NA	RNA转录本、染色质状态	NA
2025	2025-03-22	Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment 2024-Mar-20, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011 PMID:38401539	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪了癌症细胞在长期和连续治疗中的抗性克隆，揭示了克隆间基因表达状态的差异如何影响对后续治疗的反应	结合单细胞RNA测序和条形码技术，首次系统地追踪了抗性克隆在长期和连续治疗中的命运，并识别了预测克隆存活的基因表达状态	研究主要基于实验室环境下的细胞模型，未涉及体内肿瘤微环境的复杂性	探究癌症细胞克隆间基因表达差异如何影响对连续或长期治疗的反应，并寻找预测克隆存活的基因表达状态	癌症细胞及其抗性克隆	癌症生物学	癌症	单细胞RNA测序，条形码技术	NA	单细胞RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个抗性克隆的追踪和分析
2026	2025-03-22	Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology 2024-Mar, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07187-5 PMID:38509377	研究论文	本文识别了一种表观遗传控制的记忆性星形胶质细胞亚群，该亚群在再次刺激时表现出加剧的促炎反应	发现了由代谢酶ATP-柠檬酸裂解酶（ACLY）控制的星形胶质细胞记忆机制，该机制通过产生乙酰辅酶A（acetyl-CoA）并由组蛋白乙酰转移酶p300控制染色质可及性	研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型，人类星形胶质细胞的研究仅限于体外实验	探讨星形胶质细胞亚群在神经系统疾病中的病理作用及其表观遗传记忆机制	星形胶质细胞亚群	神经科学	多发性硬化症	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、染色质免疫共沉淀测序、核酸检测和测序、CRISPR-Cas9基因扰动	NA	单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据	急性及慢性EAE模型、人类星形胶质细胞体外培养
2027	2025-03-22	Response to tumor-infiltrating lymphocyte adoptive therapy is associated with preexisting CD8+ T-myeloid cell networks in melanoma 2024-02-02, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adg7995 PMID:38306416	研究论文	本文研究了肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）过继细胞疗法（ACT）在转移性黑色素瘤患者中的疗效，并探讨了肿瘤微环境（TME）中的细胞状态及其相互作用	通过纵向样本分析，发现ACT响应者具有更高的基础肿瘤细胞内在免疫原性和突变负担，并揭示了响应者中丰富的基线肿瘤内和基质肿瘤反应性T细胞网络与激活的髓系细胞群	样本量较小，仅涉及13名患者，可能影响结果的普遍性	探索TIL-ACT疗法在转移性黑色素瘤患者中的疗效机制，并寻找潜在的生物标志物以改善患者选择和指导ACT临床试验设计	转移性黑色素瘤患者	肿瘤免疫学	黑色素瘤	bulk和单细胞RNA测序、全外显子测序、空间蛋白质组分析	NA	RNA测序数据、蛋白质组数据	13名转移性黑色素瘤患者
2028	2025-03-22	A single-cell atlas of IL-23 inhibition in cutaneous psoriasis distinguishes clinical response 2024-01-26, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adi2848 PMID:38277466	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术，研究了IL-23信号阻断治疗在皮肤银屑病中的临床反应机制	揭示了IL-23阻断治疗在临床反应良好和反应不佳患者中的不同机制，并发现了一种不可逆的免疫状态	研究样本量有限，且未涉及长期治疗效果的观察	探讨IL-23信号阻断治疗在皮肤银屑病中的临床反应机制	银屑病患者的皮肤免疫细胞	单细胞转录组学	银屑病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	银屑病患者的皮肤免疫细胞样本
2029	2025-03-22	Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response 2024-01-12, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930 PMID:38215193	研究论文	本文研究了胸腺再生机制，特别是通过ILC2介导的2型免疫反应中胸腺绒毛细胞和成纤维细胞的作用	揭示了胸腺绒毛细胞和成纤维细胞通过激活2型免疫反应在胸腺再生中的新角色	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探讨胸腺再生的机制，特别是非T细胞的胸腺造血细胞的作用	小鼠胸腺细胞，特别是ILC2、胸腺绒毛细胞和成纤维细胞	免疫学	NA	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型
2030	2025-03-22	Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche 2024-01-05, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152 PMID:38181095	研究论文	本文探讨了皮肤中调节性T细胞（Treg）在维持毛囊干细胞（HFSC）生态位免疫特权中的作用	开发了一种技术，将基因重组限制在皮肤中的调节性T细胞，揭示了皮肤Treg通过高亲和力IL-2受体表达在细胞外方式中保护HFSC生态位的机制	研究主要集中在皮肤中的Treg，未涉及其他非淋巴器官中的免疫耐受机制	研究皮肤中调节性T细胞在维持毛囊干细胞生态位免疫特权中的作用	皮肤中的调节性T细胞和毛囊干细胞生态位	免疫学	脱发症	基因重组技术、空间转录组学	NA	基因表达数据、空间转录组数据	NA
2031	2025-03-22	Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0298133 PMID:38363768	研究论文	本研究探讨了clusterin (CLU)在调控von Willebrand因子(VWF)中的作用，特别是在von Willebrand病(VWD)中的影响	首次通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析识别CLU作为VWF的潜在调控因子，并使用siRNA和CRISPR-Cas9技术在人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)中进行验证	研究未发现CLU敲低对Weibel-Palade小体(WPBs)的数量或大小有显著影响，且未探讨CLU在其他类型细胞中的作用	研究CLU在VWF调控中的作用，特别是在VWD中的机制	人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)	分子生物学	von Willebrand病	siRNA, CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据, 蛋白质水平数据	人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)
2032	2025-03-22	Early human lung immune cell development and its role in epithelial cell fate 2023-12-15, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adf9988 PMID:38100545	研究论文	本文研究了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育及其对上皮细胞命运的影响	首次系统性地描述了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育过程，并探讨了免疫细胞在肺上皮细胞成熟中的作用	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序，体内实验的证据尚不充分	探讨人类肺发育过程中免疫细胞的作用及其对上皮细胞命运的影响	人类胚胎和胎儿肺免疫细胞及上皮细胞	发育生物学	NA	scRNA-seq, smFISH, 免疫组织化学	NA	单细胞RNA测序数据, 图像数据	人类胚胎和胎儿肺组织样本
2033	2025-03-22	p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression 2023-Jul, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06253-8 PMID:37468633	研究论文	本文探讨了p53在肺腺癌（LUAD）抑制中的作用，特别是通过调控肺泡1型（AT1）细胞分化来抑制LUAD的发展	揭示了p53通过调控细胞状态，特别是促进AT1细胞分化来抑制LUAD的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类LUAD中的具体机制仍需进一步验证	研究p53在肺腺癌（LUAD）抑制中的具体机制	肺腺癌（LUAD）细胞和小鼠模型	癌症研究	肺癌	RNA测序、ATAC测序、单细胞转录组分析	小鼠模型	基因表达数据、染色质重塑数据	使用表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠模型
2034	2025-03-22	Ornithine decarboxylase supports ILC3 responses in infectious and autoimmune colitis through positive regulation of IL-22 transcription 2022-Nov-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2214900119 PMID:36279426	研究论文	本文研究了第3组先天淋巴细胞（ILC3s）在感染性和自身免疫性结肠炎中通过正调控IL-22转录的机制	揭示了ILC3s通过多胺生物合成途径增强IL-22产生的新机制，并发现鸟氨酸脱羧酶（ODC1）在这一过程中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨ILC3s在感染性和自身免疫性结肠炎中的代谢适应及其对IL-22产生的影响	第3组先天淋巴细胞（ILC3s）	免疫学	结肠炎	单细胞RNA测序和代谢组学分析	NA	RNA测序数据和代谢组数据	小鼠模型
2035	2025-03-21	Single-cell RNA sequencing-guided engineering of mitochondrial therapies for intervertebral disc degeneration by regulating mtDNA/SPARC-STING signaling 2025-Jun, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.036 PMID:40104024	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据指导，开发了一种针对椎间盘退变的仿生疗法，并在动物模型中进行了验证	提出了线粒体移植作为一种新的治疗策略，并设计了具有抗氧化和抗炎活性的生物活性大分子，增强了治疗效果	研究主要基于动物模型，尚未在人类临床试验中验证其安全性和有效性	开发针对椎间盘退变的新型治疗方法	人类髓核组织和动物模型	数字病理	椎间盘退变	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	人类髓核组织和动物模型
2036	2025-03-21	Double-target magnetic stimulation attenuates oligodendrocyte apoptosis and oxidative stress impairment after spinal cord injury via GAP43 2025-Apr, The spine journal : official journal of the North American Spine Society DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.025 PMID:39701305	研究论文	本研究评估了双靶点（大脑和脊髓）磁刺激（DTMS）治疗对脊髓损伤（SCI）大鼠的功能恢复和神经回路改善的影响，并探讨了DTMS对胶质细胞调节的作用	揭示了DTMS通过调节GAP43在少突胶质细胞中的抗凋亡和抗氧化应激作用，促进少突胶质细胞的分支和成熟以及轴突再生，从而改善SCI后的神经回路功能	研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证	评估DTMS对脊髓损伤后功能恢复和神经回路改善的影响，并探讨其作用机制	脊髓损伤模型大鼠	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序、透射电子显微镜、Western blotting、免疫荧光染色、TUNEL染色、Annexin V-FITC凋亡试剂盒、脂质ROS试剂盒	NA	行为评估数据、组织染色数据、单细胞RNA测序数据	脊髓损伤模型大鼠
2037	2025-03-21	Effect of tumor microenvironment in pancreatic cancer on the loss of β-cell mass: implications for type 3c diabetes 2025-Apr, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1 DOI:10.1007/s00535-024-02204-w PMID:39760782	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境（TME）与β细胞质量减少之间的复杂相互作用，进一步阐明了3c型糖尿病（T3cDM）发病机制	通过单细胞RNA测序分析PDAC TME，揭示了肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞与内分泌细胞的相互作用，以及内分泌细胞中凋亡途径的激活	研究主要基于PDAC患者的样本，可能不适用于其他类型的胰腺癌或糖尿病	探讨PDAC TME对β细胞质量减少的影响及其在T3cDM发病中的作用	胰腺导管腺癌（PDAC）患者的肿瘤微环境（TME）和β细胞	肿瘤生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序、TUNEL染色、RT-qPCR、CCK8检测	NA	RNA测序数据、病理学数据	来自供体的正常胰腺组织、非糖尿病（NDM）和T3cDM患者的副肿瘤组织
2038	2025-03-21	Trends in Research of Odontogenic Keratocyst and Ameloblastoma 2025-Apr, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241282256 PMID:39876078	综述	本文综述了牙源性角化囊肿（OKC）和成釉细胞瘤（AM）研究的最新进展和趋势	利用单细胞和空间组学技术深入理解OKC和AM的肿瘤微环境和细胞异质性，以及3D培养技术在AM亚型分析中的应用	尽管AM已有可靠的临床前模型，但OKC的可靠体外和体内模型仍然稀缺	探讨OKC和AM的生物学行为机制及其潜在治疗靶点	牙源性角化囊肿（OKC）和成釉细胞瘤（AM）	数字病理学	口腔颌面部疾病	单细胞组学、空间转录组学、3D培养技术、人工智能（机器学习和深度学习）	NA	NA	NA
2039	2025-03-21	SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis 2025-Apr, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331 PMID:40023001	研究论文	本研究探讨了SPRY1在皮肤老化中的作用，特别是其对巨噬细胞M1极化的影响，并探索其作为缓解皮肤老化和黑色素瘤治疗靶点的潜力	首次揭示了SPRY1在皮肤老化中的关键作用，特别是通过促进巨噬细胞M1极化加速皮肤老化，并发现其在黑色素瘤中的表达与患者生存率相关	研究主要基于体外实验，缺乏体内验证，未来需要进一步探索其调控网络	研究SPRY1在皮肤老化中的功能及其作为治疗靶点的潜力	RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞	生物信息学	黑色素瘤	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、基因转染、CCK-8实验、qRT-PCR、ROS和SOD活性测量	NA	基因表达数据、细胞实验数据	GTEx和GEO数据库中的数据集，以及RAW264.7和NIH/3T3细胞系
2040	2025-03-21	Islet single-cell transcriptomic profiling during obesity-induced beta cell expansion in female mice 2025-Mar-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112031 PMID:40104055	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术研究了肥胖诱导的雌性小鼠胰岛β细胞扩增过程中的分子机制	揭示了Xbp1和Myc在缓解未折叠蛋白反应（UPR）和刺激β细胞增殖中的协调转录机制	研究仅限于雌性小鼠，未涉及雄性小鼠或其他物种	探索肥胖诱导的β细胞增殖的分子机制，以寻找新的治疗靶点	雌性小鼠的胰岛β细胞	单细胞转录组学	糖尿病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	雌性KO小鼠的胰岛β细胞