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当前共找到 41407 篇文献，本页显示第 2021 - 2040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021 | 2026-06-17 |
Glioma microenvironment: Cellular crosstalk, immunosuppression, and novel therapeutic perspectives
2026-Jun-15, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004151
PMID:42299115
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2022 | 2026-06-17 |
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2026-Jun-12, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205397
PMID:42281473
|
研究论文 | 该研究利用高通量测序技术定义了小鼠前肢起始的发育和转录程序，鉴定出四个不同阶段，并发现一组受TBX5调控的候选早期转录靶基因 | 首次通过RNA-seq、scRNA-seq、ChIP-seq和Ribo-ITP等多种测序方法系统表征前肢起始的时序性转录程序，并鉴定出区别于其他细胞类型的前肢特征基因集，其中包含参与神经投射和细胞粘附的基因 | 未明确说明局限，但可能包括仅在小鼠胚胎中研究，以及未在功能上验证候选基因的调控机制 | 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制，特别是TBX5依赖性转录调控 | 小鼠胚胎中体壁侧板中胚层（体壁LPM）的前肢起始过程 | 数字病理学 | 不适用 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP | 不适用 | 转录组数据 | 小鼠胚胎，具体样本量未在摘要中说明 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 2023 | 2026-06-17 |
A spatial and temporal atlas of tubulin isotype gene expression during vertebrate embryonic development
2026-Jun-11, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E26-03-0116
PMID:42275208
|
研究论文 | 构建了脊椎动物胚胎发育过程中微管蛋白同型基因表达的时空图谱 | 首次在空间分辨率下描绘了脊椎动物神经嵴上皮-间充质转化过程中α-和β-微管蛋白同型基因的表达谱，并整合单细胞RNA测序数据揭示其多样性 | 需要进一步研究以确定转录模式与微管组成的关联 | 阐明脊椎动物胚胎发育过程中微管蛋白同型基因的时空表达模式 | 鸡胚中神经嵴上皮-间充质转化过程中的细胞和组织 | 数字病理学 | 不适用 | RNA-seq，单细胞RNA测序，荧光杂交链式反应 | 不适用 | 基因表达数据，图像 | 鸡胚不同发育阶段的多个组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2024 | 2026-06-17 |
Scalable hypothalamic neuron differentiation from human pluripotent stem cells suitable for modeling metabolic disorders
2026-Jun-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102958
PMID:42276059
|
研究论文 | 提出一种化学定义、可扩展的方法，从人多能干细胞分化出富含POMC细胞的下丘脑神经元，用于代谢疾病模型研究 | 开发了与机器人细胞培养平台兼容的化学定义、可扩展分化方法，通过MERFISH、RNA-Seq、ATAC-Seq等多组学验证神经元身份，并展示与代谢疾病相关的特征 | 人工神经元可能无法完全复制体内成熟下丘脑的完整多样性及长期功能 | 建立可扩展、可重复的人下丘脑神经元模型，以研究代谢疾病并支持治疗开发 | 人多能干细胞分化的下丘脑神经元（富含POMC细胞） | 数字病理学 | 代谢疾病 | RNA-Seq, ATAC-Seq, MERFISH单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质开放性数据, 图像（MERFISH） | 多个hPSC细胞系 | 10x Genomics (MERFISH), Illumina (测序) | 单细胞转录组学, 染色质可及性分析, 空间转录组学 | 10x Chromium (假设用于MERFISH), Illumina NovaSeq (假设用于测序) | MERFISH单细胞空间转录组, RNA-Seq全转录组测序, ATAC-Seq开放染色质分析 |
| 2025 | 2026-06-17 |
Prognostic value and spatial transcriptomic landscape of histopathological growth patterns in synchronous colorectal liver metastases
2026-Jun-11, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology
DOI:10.1016/j.ejso.2026.111951
PMID:42296573
|
研究论文 | 本研究验证了组织学生长模式在结直肠癌肝转移中的预后价值，并利用空间转录组学揭示了不同生长模式背后的分子机制 | 首次将空间转录组学与组织学生长模式结合，发现两种截然不同的分子适应策略（血管生成限制 vs 代谢共选），为精准风险分层和靶向治疗提供了形态-分子基础 | 样本量相对有限（182例），且仅聚焦于同时性肝转移，空间转录组学数据来源于公共数据集而非本队列 | 验证组织学生长模式在同时性结直肠癌肝转移中的预后价值并探索其空间转录组学基础 | 同时性结直肠癌肝转移患者的手术切除组织标本 | 数字病理学 | 结直肠癌肝转移 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 182例患者的手术切除标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2026 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveals differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and 2D-cultured trophoblast stem cells
2026-Jun-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10460-0
PMID:42270938
|
研究论文 | 单细胞转录组学揭示了绒毛膜和基底板细胞滋养层与二维培养滋养层干细胞之间的差异 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学系统比较了早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层（vCTB）以及基底板和绒毛膜区域CTB的转录多样性，并发现滋养层干细胞（TSC）最类似于EVT前体细胞，且TSC在体外培养过程中失去了体内初始状态标记 | 研究仅基于早期妊娠胎盘（6-14周），未涵盖更晚孕期或病理状态，且TSC系可能偏向于EVT谱系，未能完全代表所有CTB状态 | 探索早期妊娠胎盘绒毛细胞滋养层的转录多样性及其与滋养层干细胞的关系 | 早期妊娠胎盘的绒毛细胞滋养层、基底板CTB、绒毛膜CTB、以及从6-8周胎盘衍生的滋养层干细胞系 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据，空间转录组数据 | 早期（6-8周）和晚期（12-14周）妊娠第一期胎盘绒毛组织，三个滋养层干细胞系 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, GeoMx | 10x Chromium Single Cell 3', GeoMx Digital Spatial Profiler |
| 2027 | 2026-06-17 |
Translational potential of GMP-grade human umbilical cord-derived mesenchymal stem cells (UC-MSCs) in traumatic spinal cord injury: a preclinical study in rat
2026-Jun-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08373-x
PMID:42271443
|
研究论文 | 研究GMP级人脐带间充质干细胞在大鼠创伤性脊髓损伤中的治疗效果与机制 | 首次使用GMP级UC-MSCs在大鼠脊髓损伤模型中全面评估其疗效，包括高剂量（3×10⁷细胞/kg）的显著改善效果，并通过单细胞RNA测序和sRNA测序揭示其免疫调节、神经保护和抗炎机制 | 仅使用大鼠模型，缺乏临床人体试验证据；样本量相对较小（50只大鼠）；未探讨最佳给药时间窗口 | 评估GMP级人脐带间充质干细胞在创伤性脊髓损伤中的治疗潜力和作用机制 | 50只Sprague-Dawley大鼠，建立T10级脊髓损伤模型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq、sRNA测序、ELISA、免疫荧光、MRI | NA | 影像、文本、组学数据 | 50只Sprague-Dawley大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2028 | 2026-06-17 |
Aberrant STAT signaling and T cell dysregulation define a targetable pediatric sepsis endotype
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202867
PMID:42262868
|
研究论文 | 该研究通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术，在前瞻性队列中识别出儿科脓毒症的一种异常STAT信号和T细胞失调的内型 | 首次定义了由IL-6和IFN-γ驱动的儿科脓毒症T细胞功能障碍内型，并揭示JAK/STAT轴作为免疫调节治疗的潜在靶点 | 信息未明确提供 | 阐明儿科脓毒症中免疫异质性的机制并寻找可靶向治疗的内型 | 88名危重病患儿的免疫细胞和血浆样本 | 数字病理学 | 儿科脓毒症 | 血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序、磷酸流式细胞术 | 无监督聚类（对血浆细胞因子进行聚类） | 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 88名危重病患儿 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2029 | 2026-06-17 |
Single-cell spatial transcriptomics of formalin-fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202488
PMID:42262875
|
研究论文 | 利用成像型单细胞空间转录组学对福尔马林固定石蜡包埋活检组织进行分析，揭示了与结肠炎相关的细胞网络 | 首次将成像型单细胞空间转录组学应用于临床福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本，并识别出与维多珠单抗治疗反应相关的两种不同抗性原型 | 未提供 | 探究溃疡性结肠炎病理机制并识别治疗反应生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检组织 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像型单细胞空间转录组学 | 未提供 | 图像 | 包括溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Xenium | 自定义Xenium基因面板 |
| 2030 | 2026-06-17 |
Single-cell and spatial transcriptomics unveil myeloid-lymphoid cross talk and the dermal immune niche underlying palmoplantar pustulosis
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.028
PMID:41740929
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示掌跖脓疱病中髓系-淋巴系交叉对话及其皮肤免疫微环境 | 首次通过单细胞转录组与空间转录组联合分析，系统描绘PPP进展过程中的免疫动态网络，并鉴定出CCL19+真皮上层淋巴样免疫微环境及CXCL1/6/8-ACKR1信号在诱导中性粒细胞募集中的关键作用 | 样本仅来自足部病变，未涉及手掌部位；功能验证和药物预测尚需进一步实验证实 | 探究掌跖脓疱病的免疫微环境及其发病机制 | 掌跖脓疱病患者的脓疱及非脓疱足部病灶样本 | 数字病理学 | 掌跖脓疱病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 来自PPP患者的脓疱及非脓疱足部病变组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞RNA测序，10x Visium用于高分辨率空间转录组分析 |
| 2031 | 2026-06-17 |
Spatially resolved ex vivo drug response profiling in SMARCB1-deficient sinonasal carcinoma
2026-Jun, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00437-1
PMID:42070010
|
研究论文 | 结合单核RNA测序、空间转录组学和离体患者来源组织切片培养，解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性、微环境组织及治疗脆弱性，并发现mTOR抑制剂Sapanisertib能诱导肿瘤坏死并消耗特定恶性细胞亚群 | 首次为SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌建立了综合性的离体药物反应图谱，结合单核RNA测序、空间转录组学和患者来源组织切片培养，揭示了肿瘤内异质性和微环境组织，并鉴定出对mTOR抑制剂Sapanisertib敏感的恶性细胞亚群 | 研究主要基于一个指标病例，虽然补充了12例回顾性队列，但样本量仍然较小，可能无法完全代表该罕见肿瘤的多样性 | 解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性和微环境组织，并评估其治疗脆弱性 | SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的肿瘤组织和细胞 | 数字病理学 | 鼻腔鼻窦癌 | snRNAseq, 空间转录组学, 离体组织切片培养 | NA | 单核RNA测序数据, 空间转录组学数据, 组织切片培养数据 | 1例指标病例和12例回顾性队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2032 | 2026-06-17 |
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag288
PMID:42108549
|
研究论文 | anndataR 提升了单细胞转录组学中 R 和 Python 之间的互操作性 | 提供了一个原生 R 包，允许 R 用户直接读取和写入 H5AD 文件，并轻松转换为 SingleCellExperiment 或 Seurat 对象，无需依赖 Python 环境 | 仅描述了对兼容性的严格测试，未明确提及潜在的性能瓶颈或功能局限性 | 解决单细胞转录组数据在 R 和 Python 之间互操作性困难的问题 | H5AD 文件格式及 R 语言环境中的数据处理对象 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 2033 | 2026-06-17 |
CeSpGRN: inferring cell-specific gene regulatory networks from single-cell multi-omics and spatial data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag324
PMID:42225598
|
研究论文 | 提出了从单细胞多组学和空间数据推断细胞特异性基因调控网络的方法CeSpGRN | 利用核加权高斯图模型实现细胞级别的基因调控网络推断，能有效整合多组学和空间位置信息 | 未明确说明局限性，但可能对数据质量要求高且计算复杂度较大 | 开发可从单细胞RNA-seq、配对scRNA-seq与scATAC-seq或空间转录组数据中推断细胞特异性基因调控网络的方法 | 单细胞多组学和空间转录组数据中的基因调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | 核加权高斯图模型 | 基因表达、染色质可及性和空间位置数据 | 模拟数据集和多个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2034 | 2026-06-17 |
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-May-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70452
PMID:42258443
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研究论文 | 提出了一种从荷瘤小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液用于流式细胞术和单细胞RNA测序的优化方案 | 针对肿瘤形成过程中肺组织纤维化和异质性特点，优化了组织灌注、酶消化、机械解离等步骤，实现了>85%的细胞活性率，并有效分离tdTomato标记的肿瘤细胞 | 未提及 | 开发从健康及荷瘤小鼠肺组织中高效制备高活性单细胞悬液的标准化流程 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型中的健康及荷瘤肺组织 | 单细胞转录组学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 2035 | 2026-06-17 |
Machine learning-based study on Xin-Pi simultaneous treatment formula via drug nanodelivery systems regulating macrophage polarization and TEAD2/PKM2 synergistic repair strategy in myocarditis
2026-May-17, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100433
PMID:42150704
|
研究论文 | 利用机器学习与药物纳米递送系统研究心脾同治法通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2协同修复策略治疗心肌炎的分子机制 | 首次系统阐明心脾同治法结合纳米载药系统通过调控巨噬细胞M1/M2极化平衡和TEAD2/PKM2代谢重编程网络修复心肌炎损伤的分子机制，并整合机器学习、单细胞测序、空间转录组学等多维技术 | 研究仅在动物模型中进行，尚需在人类队列和临床试验中验证其临床转化可行性 | 分析心脾同治方纳米载药系统通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2信号通路治疗心肌炎的分子机制 | 心肌炎小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 蛋白质组学, 网络药理学 | 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 图像, 文本 | 心肌炎小鼠模型（具体样本数未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2036 | 2026-06-17 |
Spatiotemporal dynamics of adoptively transferred stem-like CD8+ T cells in the tumor microenvironment following vaccination
2026-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724323
PMID:42182429
|
研究论文 | 本研究开发了一种优化过继性T细胞疗法的方法，并利用空间转录组学揭示疫苗接种后干细胞样和效应CD8 T细胞在肿瘤微环境中差异介导肿瘤控制的机制 | 首次结合干细胞样CD8 T细胞过继转移与静脉疫苗接种，利用空间转录组学揭示肿瘤微环境的转录组重塑机制 | NA | 优化过继性T细胞疗法，解析干细胞样CD8 T细胞在肿瘤微环境中的空间动态调控机制 | 肿瘤特异性CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 2037 | 2026-06-17 |
Histone H3 lysine 18 lactylation-mediated SULF1 transcription promotes atherosclerosis by regulating endothelial-to-mesenchymal transition
2026-May-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag078
PMID:42126087
|
研究论文 | 该论文研究了组蛋白H3赖氨酸18乳酰化介导的SULF1转录通过调控内皮-间充质转化促进动脉粥样硬化的机制 | 揭示了氧化应激下代谢与表观遗传通过H3K18la和HDAC3的精确串扰调控SULF1转录及EndMT的新机制 | 未提及具体限制 | 探讨SULF1在氧化应激诱导的内皮-间充质转化及动脉粥样硬化中的作用机制 | 内皮细胞、动脉粥样硬化斑块、小鼠模型 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类颈动脉粥样硬化核心样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2038 | 2026-06-17 |
δ-catenin controls layer-specific transcriptional maturation of astrocytes via Zbtb20
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724361
PMID:42182221
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研究论文 | 该研究鉴定了δ-连环蛋白通过Zbtb20控制星形胶质细胞层特异性转录成熟的机制 | 首次揭示δ-连环蛋白作为黏附连接组分连接细胞间相互作用与转录调控，协调神经细胞类型转录成熟，特别是星形胶质细胞的层特异性身份建立 | 未提及具体局限性 | 研究δ-连环蛋白在哺乳动物皮层回路发育中协调神经细胞类型转录成熟的机制 | δ-连环蛋白、Zbtb20转录因子、星形胶质细胞、皮层回路 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序和空间转录组学平台 |
| 2039 | 2026-06-17 |
Integrating single-cell multi-omics and machine learning to reveal triaptosis heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00982-3
PMID:42098870
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学和机器学习，揭示透明细胞肾细胞癌中triaptosis异质性，并开发预后基因签名 | 首次在单细胞分辨率下描绘透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性景观，结合空间转录组学和机器学习构建预后模型 | 未提及具体局限性 | 探究透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者样本中的单细胞、空间转录组及大块转录组数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、大块转录组分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、大块转录组数据 | 单细胞、空间转录组和大块转录组样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2040 | 2026-06-17 |
Loss of PINK1 impairs mitophagy and accelerates ovarian aging independent of Parkin
2026-05, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示PINK1缺失通过损害线粒体自噬加速卵巢衰老，而Parkin对卵巢生理影响甚微 | 首次发现PINK1独立于Parkin调控卵巢衰老，明确了PINK1缺失导致线粒体自噬障碍和卵巢功能衰退的机制 | 研究基于小鼠模型，尚需在人类卵巢组织中验证PINK1的作用 | 探究PINK1和Parkin在卵巢生理和衰老中的具体作用 | Pink1基因敲除小鼠和Parkin基因敲除小鼠 | 机器学 | 卵巢衰老 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | Pink1敲除小鼠和Parkin敲除小鼠的卵巢组织样本 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |