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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2021 | 2025-10-06 |
Multiomic spatial atlas shows deleted in malignant brain tumors 1 (DMBT1) glycoprotein is lost in colonic dysplasia
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6406
PMID:40026233
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研究论文 | 本研究通过多组学空间图谱揭示DMBT1糖蛋白在结肠发育异常中表达缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术,揭示DMBT1在炎症与发育异常结肠中的双向调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究宿主-微生物相互作用在结肠肿瘤发生过程中的机制 | 结肠发育异常组织、小鼠模型、人类样本、类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 类器官培养 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 多个小鼠模型和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2022 | 2025-10-06 |
Interleukin-11 expressed in the polyp-enriched fibroblast subset is a potential therapeutic target in Peutz-Jeghers syndrome
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6408
PMID:40070038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定Peutz-Jeghers综合征息肉中富集的成纤维细胞亚群,并发现IL-11是该疾病潜在治疗靶点 | 首次识别PJS息肉富集的隐窝顶部成纤维细胞(pCTF)亚群,并证实IL-11在成纤维细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Peutz-Jeghers综合征息肉形成的细胞机制和潜在治疗靶点 | PJS小鼠模型息肉和患者息肉样本 | 单细胞生物学 | Peutz-Jeghers综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PJS小鼠模型和患者息肉样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2023 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma†
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6420
PMID:40088426
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评论 | 本文综述了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞(CAF)异质性的最新研究进展 | 定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型(iCAF),该亚型与不良预后和肿瘤侵袭相关 | 区分CAF调控肿瘤表型中的相关性和因果关系仍面临重大挑战 | 研究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 脊索瘤肿瘤微环境中的细胞组成,特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
2024 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in chordoma progression
2025-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6369
PMID:39611243
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研究论文 | 通过多组学分析揭示炎症性癌症相关成纤维细胞在脊索瘤进展中的作用 | 首次在脊索瘤中发现并表征了炎症性癌症相关成纤维细胞(iCAF)亚群,揭示了其空间分布特征和促癌机制 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 探究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、空间分布和临床意义 | 脊索瘤患者肿瘤样本和正常髓核样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据,免疫荧光图像 | 7个肿瘤样本和4个正常髓核样本用于scRNA-seq,126例患者用于批量RNA-seq分析,116例患者用于QIF验证 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | NA |
2025 | 2025-10-06 |
Exploring the Expanded Role of Astrocytes in Primate Brain Evolution via Changes in Gene Expression
2025, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000544004
PMID:39907990
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综述 | 探讨灵长类大脑进化中星形胶质细胞基因表达变化及其功能扩展 | 聚焦灵长类特异性星形胶质细胞进化,结合新型技术研究基因表达调控机制 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 解析星形胶质细胞在灵长类大脑进化中的功能演化和分子机制 | 灵长类星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病,帕金森病 | 单细胞RNA测序,诱导多能干细胞技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2026 | 2025-10-06 |
Inflammatory Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2024-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630257
PMID:39763863
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组和单细胞转录组,揭示病毒反弹前的免疫反应特征 | 首次发现CD16单核细胞在可检测病毒反弹前显著增加并表现抗病毒基因表达特征 | 样本量有限,仅观察外周血单核细胞,未涉及组织驻留细胞 | 识别治疗中断后病毒反弹的早期信号,为延长HIV-1缓解期提供策略 | HIV-1感染者的外周血单核细胞(PBMCs)和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
2027 | 2025-10-06 |
Preclinical Models for Functional Precision Lung Cancer Research
2024-Dec-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17010022
PMID:39796653
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综述 | 本文综述了肺癌精准医学研究中临床前模型的应用与发展 | 系统比较了各类肺癌临床前模型的优劣,并强调了患者来源类器官与多组学技术结合在功能性精准肿瘤学中的新兴价值 | 体内模型成本高、耗时长且劳动密集,限制了其广泛应用 | 推动肺癌精准医疗发展,优化个体化治疗策略 | 肺癌临床前研究模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
2028 | 2025-10-06 |
Single-cell atlases reveal leaf cell-type-specific regulation of metal transporters in the hyperaccumulator Sedum alfredii under cadmium stress
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136185
PMID:39418904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了镉超富集植物东南景天叶片在镉胁迫下金属转运蛋白的细胞类型特异性调控机制 | 首次构建东南景天的全长转录组和叶片单细胞图谱,首次在单细胞水平揭示金属转运蛋白的细胞类型特异性表达模式 | 研究仅针对叶片组织,未涉及其他器官;样本数量相对有限 | 探究镉超富集植物东南景天在镉胁迫下的细胞类型特异性转录调控机制 | 东南景天(Sedum alfredii)叶片细胞 | 植物生物学 | NA | PacBio Iso-Seq全长转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组测序数据,单细胞基因表达数据 | 12,616个高质量单细胞(来自对照和镉处理样本) | PacBio | 全长转录组测序,单细胞RNA测序 | PacBio Iso-Seq | PacBio Iso-Seq技术用于生成全长转录组 |
2029 | 2025-10-06 |
PIEZO1 overexpression in hereditary hemorrhagic telangiectasia arteriovenous malformations
2024-Nov-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625696
PMID:39651206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PIEZO1过表达在遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中的关键作用 | 首次揭示PIEZO1在HHT2疾病中的过表达现象,并证明其抑制可有效减轻动静脉畸形形成 | ALK1突变体中信号改变的全谱仍不完全清楚,患者AVM形成的防治方法尚待开发 | 探究ALK1突变导致动静脉畸形的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 内皮特异性Alk1敲除小鼠视网膜和人HHT病变组织 | 单细胞测序 | 遗传性出血性毛细血管扩张症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | Alk1 KO小鼠和对照组小鼠视网膜内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2030 | 2025-10-06 |
Stratified analysis identifies HIF-2α as a therapeutic target for highly immune-infiltrated melanomas
2024-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620300
PMID:39554029
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研究论文 | 本研究通过分层分析发现HIF-2α是高度免疫浸润黑色素瘤的潜在治疗靶点 | 首次通过标准化荟萃分析揭示免疫浸润程度与ICB疗效的关系,并发现HIF-2α在特定细胞类型中的特异性表达 | 样本量相对有限,且主要基于回顾性队列分析 | 探索黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物和联合治疗新靶点 | 转移性黑色素瘤患者和临床前模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,荟萃分析 | NA | RNA测序数据,临床数据 | 516例患者(抗PD-1治疗290例,抗CTLA-4治疗175例,联合治疗51例) | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
2031 | 2025-10-06 |
Identification of gene and protein signatures associated with long-term effects of COVID-19 on the immune system after patient recovery by analyzing single-cell multi-omics data using a machine learning approach
2024-10-03, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2024.126253
PMID:39182316
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研究论文 | 通过机器学习方法分析单细胞多组学数据,识别与COVID-19康复患者免疫系统长期影响相关的基因和蛋白特征 | 首次结合五种特征排序算法和两种分类算法分析COVID-19康复患者的单细胞多组学数据,识别出特定的分子标志物 | 研究仅限于特定免疫细胞亚型,样本来源和规模未明确说明 | 研究COVID-19康复患者免疫系统的持久性改变和次级免疫反应 | COVID-19康复患者和健康对照组的免疫细胞 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞多组学测序 | LASSO, MCFS, RF, CATBoost, XGBoost, 决策树, K近邻 | 单细胞多组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 包含scRNA-seq、HTO、CITE-seq和SCT多种检测技术 |
2032 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury specific microenvironments and cellular interactions in kidney regeneration and disease
2024-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51186-z
PMID:39237549
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析小鼠肾脏缺血再灌注损伤中特定微环境的基因表达模式和细胞相互作用 | 首次应用空间转录组学揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式,并预测Clcf1-Crfl1在持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅针对小鼠肾脏缺血再灌注损伤模型,未涉及其他类型肾脏损伤或人类样本 | 解析肾脏损伤修复过程中的分子通路和细胞相互作用机制 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2033 | 2025-10-06 |
Targeting Liver Epsins Ameliorates Dyslipidemia in Atherosclerosis
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609742
PMID:39253478
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型证明肝脏epsins通过介导PCSK9触发的LDLR降解促进动脉粥样硬化 | 首次揭示肝脏epsins在PCSK9介导的LDLR降解中的关键作用,并开发纳米颗粒包裹siRNA靶向治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 阐明肝脏epsins在促进动脉粥样硬化中的作用机制 | ApoE-/-基因背景的肝特异性epsin双敲除小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,纳米颗粒递送 | NA | 基因表达数据,蛋白质水平数据 | ApoE-/-和ApoE-/-/Liver-DKO小鼠肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2034 | 2025-10-06 |
SMARCA4 Loss and Mutated β-Catenin Induce Proliferative Lesions in the Murine Embryonic Cerebellum
2024-04-10, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1605-23.2024
PMID:38383496
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探究SMARCA4缺失和β-连环蛋白突变在小鼠胚胎小脑中诱导增殖性病变的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变单独可导致严重发育表型,并与SMARCA4缺失协同诱导小脑早期祖细胞增殖性病变 | 体外培养中双突变细胞未显示致瘤潜力,提示胚胎微环境对病变发展具有重要作用 | 解析异常WNT信号和SMARCA4缺陷诱导肿瘤发生机制 | 基因工程小鼠模型(BLBP-Cre小鼠) | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | DNA甲基化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 胚胎期E13.5至E16.5的小鼠小脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2035 | 2025-10-06 |
Decoding meningioma prognosis with multi-omics: macrophage diversity, immune-CNV interplay, and novel SPP1-targeted strategies
2025-Oct, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05116-8
PMID:40522564
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研究论文 | 通过整合多组学数据对脑膜瘤进行预后分层,揭示巨噬细胞功能异质性和CNV驱动的免疫微环境差异 | 首次在脑膜瘤中整合DNA甲基化和单细胞转录组数据,识别SPP1作为巨噬细胞功能的关键调节因子 | 样本量相对有限,需要进一步验证SPP1靶向治疗的有效性 | 开发脑膜瘤预后分层系统并探索治疗靶点 | 302对配对脑膜瘤样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | DNA甲基化测序, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SCISSOR, scRank | 基因组数据, 转录组数据 | 302对配对脑膜瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
2036 | 2025-10-06 |
A prognostic gene signature and subtype-specific drug sensitivity in TNBC revealed by single-cell and bulk RNA sequencing: Insights into stemness and tumor heterogeneity
2025-Oct, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.06.007
PMID:40541706
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研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示TNBC的预后基因特征和亚型特异性药物敏感性,深入了解干性和肿瘤异质性 | 整合多组学方法识别出具有高度可塑性的癌症上皮亚群,建立了四基因预后特征,并发现与染色质重塑相关的独特分子亚型 | 研究依赖于现有数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究三阴性乳腺癌的细胞异质性和耐药机制 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk转录组学,表观基因组学,突变分析 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | GSE176078数据集和TCGA-BRCA数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
2037 | 2025-09-03 |
Corrigendum to "Identification and validation of synergistic drug strategies targeting macrophage polarization in triple-negative breast cancer via single-cell transcriptomics and deep learning" [Translational Oncology 2025 Jun 26;59:102457]
2025-Oct, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102474
PMID:40818872
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2038 | 2025-10-06 |
Fine particulate matter exacerbates asthma by activating STC2-mediated mitophagy through METTL3/YTHDF2-dependent m6A methylation
2025-Sep-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138854
PMID:40499413
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研究论文 | 本研究揭示了细颗粒物通过METTL3/YTHDF2依赖的m6A甲基化激活STC2介导的线粒体自噬加剧哮喘的分子机制 | 首次发现PM通过m6A甲基化调控STC2表达激活线粒体自噬的新机制,并验证了季节性PM暴露与METTL3/STC2血清浓度的关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅检测了血清标志物,缺乏直接机制验证 | 探究细颗粒物加剧哮喘的分子机制 | 哮喘小鼠模型和哮喘患者外周血样本 | 分子生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,分子机制研究 | NA | 基因表达数据,血清浓度数据 | 哮喘小鼠和季节性采集的哮喘患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2039 | 2025-10-06 |
TRAF3IP2-AS1 Deficiency Induces Necroptosis to Promote Pancreatic Cancer Liver Metastasis
2025-Sep-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4784
PMID:40586914
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研究论文 | 本研究揭示长链非编码RNA TRAF3IP2-AS1通过调控坏死性凋亡和免疫抑制微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现TRAF3IP2-AS1缺失通过双重机制诱导坏死性凋亡:通过竞争性结合IGF2BP2降低MLKL mRNA稳定性,同时干扰PPM1B泛素化促进RIPK3磷酸化 | 研究主要基于患者来源类器官和动物模型,临床样本验证仍需扩展 | 探究胰腺癌肝转移的分子机制和潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本、患者来源类器官、TGFβ1条件性基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、3D体外模型 | 动物模型、类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | PDAC患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2040 | 2025-10-06 |
EML4-ALK Rearrangement Creates a Distinctive Myeloid Cell-Dominant Immunosuppressive Microenvironment in Lung Cancer
2025-Sep-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0532
PMID:40627846
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研究论文 | 本研究揭示了EML4-ALK重排通过创建髓系细胞主导的免疫抑制微环境导致肺癌对免疫治疗不响应的机制 | 首次发现ALK+肺腺癌具有独特的髓系细胞主导免疫抑制微环境,并证实IL6R抑制剂可逆转该免疫抑制状态 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索ALK+肺腺癌对免疫治疗不响应的免疫学机制 | ALK阳性和阴性肺腺癌患者的肿瘤组织及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,肿瘤浸润白细胞分析 | 小鼠ALK+肺腺癌模型 | 基因表达数据,细胞计数数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |