单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2021 - 2040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021 | 2025-10-06 |
Differential Contributions of Fibroblast Subpopulations to Intercellular Communication in Eosinophilic Esophagitis
2024-Jun-21, Biology
DOI:10.3390/biology13070461
PMID:39056656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析嗜酸性粒细胞性食管炎中成纤维细胞亚群的异质性及其在细胞间通讯中的作用 | 首次在EoE中鉴定出至少两个功能不同的成纤维细胞亚群F_A和F_B，并揭示F_B亚群通过ECM-受体信号在细胞通讯中起主导作用 | 研究基于公开数据库数据，样本来源有限；IL13处理的成纤维细胞培养模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明嗜酸性粒细胞性食管炎中成纤维细胞亚群的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | 嗜酸性粒细胞性食管炎患者的食管活检组织样本和IL13处理的成纤维细胞培养物 | 单细胞生物学 | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据库GSE201153中的EoE食管活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2022 | 2025-10-06 |
Human Motor Neurons Elicit Pathological Hallmarks of ALS and Reveal Potential Biomarkers of the Disease in Response to Prolonged IFNγ Exposure
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1787-23.2024
PMID:38413232
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研究论文 | 本研究通过长期干扰素-γ处理人源诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元，揭示了ALS病理特征并发现潜在生物标志物 | 首次证明IFNγ暴露可直接导致TDP-43细胞质聚集和p53通路激活，无需遗传突变或神经胶质细胞参与 | 研究基于体外细胞模型，未在完整生物体系统中验证 | 探究干扰素-γ在肌萎缩侧索硬化发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 人源诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元 | 神经退行性疾病研究 | 肌萎缩侧索硬化 | 单细胞转录组分析，电生理功能检测 | NA | 转录组数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2023 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Rohon-Beard Neurons Implicates Fgf Signaling in Axon Maintenance and Cell Survival
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1600-23.2024
PMID:38423763
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼Rohon-Beard神经元，揭示其分为三个亚类并发现Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统鉴定斑马鱼Rohon-Beard神经元的分子亚型，并发现Fgf信号通路在感觉神经元维持中的新功能 | 研究主要聚焦斑马鱼幼虫期神经元，成年期神经元的特性尚未探索 | 阐明斑马鱼Rohon-Beard感觉神经元的分子特征和功能调控机制 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | 单细胞转录组学 | 周围神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫Rohon-Beard神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2024 | 2025-10-06 |
Discovery of optimal cell type classification marker genes from single cell RNA sequencing data
2024, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-024-00015-2
PMID:40893796
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研究论文 | 介绍NS-Forest v4.0算法及其Python包，用于从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 开发了随机森林机器学习算法NS-Forest v4.0，引入On-Target Fraction指标量化标记基因特异性，在紧密相关细胞类型中识别具有更高特异性的标记基因组合 | NA | 从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 包含数百万细胞的大规模单细胞RNA测序图谱数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2025 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of Rohon-Beard neurons implicates Fgf signaling in axon maintenance and cell survival
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.26.554953
PMID:37693470
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼Rohon-Beard神经元，揭示其分为三个亚类并发现Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统鉴定斑马鱼Rohon-Beard神经元的三个分子亚类，并发现Fgf信号通路对其轴突维持和细胞存活的调控机制 | 研究主要聚焦斑马鱼幼虫期神经元，未验证在成年个体或其他物种中的普适性 | 探究斑马鱼外周感觉神经元的分子分类及其发育调控机制 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2026 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing on the Nanopore platform with ScNapBar
2021-Jun-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.078154.120
PMID:33906975
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研究论文 | 提出ScNapBar软件解决Nanopore平台单细胞转录组测序中细胞条形码分配准确性问题 | 开发了混合测序方法结合Nanopore和Illumina平台优势，通过UMI或朴素贝叶斯概率方法提高细胞条形码分配准确性 | 未明确说明样本规模和技术适用范围 | 解决单细胞全长RNA测序中细胞条形码分配的技术挑战 | 单细胞转录组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，长读长测序，混合测序 | 朴素贝叶斯 | 测序数据 | NA | Oxford Nanopore, Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，长读长测序 | Nanopore平台，Illumina平台，10x Chromium | Nanopore长读长测序平台与10x Chromium单细胞测序平台整合 |
| 2027 | 2025-10-06 |
Retinoic acid signaling is critical during the totipotency window in early mammalian development
2021-06, Nature structural & molecular biology
IF:12.5Q1
DOI:10.1038/s41594-021-00590-w
PMID:34045724
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研究论文 | 本研究通过小分子筛选发现视黄酸信号通路是调控哺乳动物早期发育全能性的关键机制 | 首次发现视黄酸信号通路在胚胎全能性细胞调控中的核心作用，并利用单细胞RNA-seq揭示细胞重编程的转录动态 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型，尚未在人类系统中验证 | 探索调控哺乳动物早期发育全能性阶段的关键信号通路 | 小鼠胚胎干细胞和2细胞样细胞(2CLCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，小分子筛选 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2028 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2025-Sep-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和分子治疗策略 | 整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接技术系统解析骨髓瘤微环境 | 未明确说明样本规模和临床验证阶段 | 探索多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用以发现治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接 | Seurat聚类分析, GSVA, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2029 | 2025-10-06 |
Multiparametric Profiling of Circulating Immune Cells Identifies an Expansion of CD25high Switched Memory B Cells in Osteoarthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43186
PMID:40229860
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研究论文 | 通过多参数分析循环免疫细胞，发现骨关节炎患者中CD25高表达转换记忆B细胞扩增 | 首次在单细胞分辨率下识别骨关节炎相关的循环免疫细胞特征，发现CD25hiCXCR5hiCD27+IgD-转换记忆B细胞亚群扩增 | 样本量有限（21名健康供体，17名OA患者，10名DMT患者），需要更大规模研究验证 | 识别骨关节炎的潜在细胞生物标志物 | 外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞分析 | 骨关节炎 | 飞行时间质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质表达数据，单细胞转录组数据 | 48个样本（21健康供体，17OA患者，10DMT患者） | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 29标记物面板的飞行时间质谱流式细胞术 |
| 2030 | 2025-10-06 |
Multiomic spatial atlas shows deleted in malignant brain tumors 1 (DMBT1) glycoprotein is lost in colonic dysplasia
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6406
PMID:40026233
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研究论文 | 本研究通过多组学空间图谱揭示DMBT1糖蛋白在结肠发育异常中表达缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术，揭示DMBT1在炎症与发育异常结肠中的双向调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究宿主-微生物相互作用在结肠肿瘤发生过程中的机制 | 结肠发育异常组织、小鼠模型、人类样本、类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 类器官培养 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 多个小鼠模型和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2031 | 2025-10-06 |
Interleukin-11 expressed in the polyp-enriched fibroblast subset is a potential therapeutic target in Peutz-Jeghers syndrome
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6408
PMID:40070038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定Peutz-Jeghers综合征息肉中富集的成纤维细胞亚群，并发现IL-11是该疾病潜在治疗靶点 | 首次识别PJS息肉富集的隐窝顶部成纤维细胞(pCTF)亚群，并证实IL-11在成纤维细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Peutz-Jeghers综合征息肉形成的细胞机制和潜在治疗靶点 | PJS小鼠模型息肉和患者息肉样本 | 单细胞生物学 | Peutz-Jeghers综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PJS小鼠模型和患者息肉样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2032 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma†
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6420
PMID:40088426
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评论 | 本文综述了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞（CAF）异质性的最新研究进展 | 定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型（iCAF），该亚型与不良预后和肿瘤侵袭相关 | 区分CAF调控肿瘤表型中的相关性和因果关系仍面临重大挑战 | 研究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 脊索瘤肿瘤微环境中的细胞组成，特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2033 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in chordoma progression
2025-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6369
PMID:39611243
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研究论文 | 通过多组学分析揭示炎症性癌症相关成纤维细胞在脊索瘤进展中的作用 | 首次在脊索瘤中发现并表征了炎症性癌症相关成纤维细胞(iCAF)亚群，揭示了其空间分布特征和促癌机制 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、空间分布和临床意义 | 脊索瘤患者肿瘤样本和正常髓核样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据,免疫荧光图像 | 7个肿瘤样本和4个正常髓核样本用于scRNA-seq，126例患者用于批量RNA-seq分析，116例患者用于QIF验证 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | NA |
| 2034 | 2025-10-06 |
Exploring the Expanded Role of Astrocytes in Primate Brain Evolution via Changes in Gene Expression
2025, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000544004
PMID:39907990
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综述 | 探讨灵长类大脑进化中星形胶质细胞基因表达变化及其功能扩展 | 聚焦灵长类特异性星形胶质细胞进化，结合新型技术研究基因表达调控机制 | 主要基于现有文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 解析星形胶质细胞在灵长类大脑进化中的功能演化和分子机制 | 灵长类星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病,帕金森病 | 单细胞RNA测序,诱导多能干细胞技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2035 | 2025-10-06 |
Inflammatory Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2024-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630257
PMID:39763863
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组和单细胞转录组，揭示病毒反弹前的免疫反应特征 | 首次发现CD16单核细胞在可检测病毒反弹前显著增加并表现抗病毒基因表达特征 | 样本量有限，仅观察外周血单核细胞，未涉及组织驻留细胞 | 识别治疗中断后病毒反弹的早期信号，为延长HIV-1缓解期提供策略 | HIV-1感染者的外周血单核细胞(PBMCs)和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2036 | 2025-10-06 |
Preclinical Models for Functional Precision Lung Cancer Research
2024-Dec-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17010022
PMID:39796653
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综述 | 本文综述了肺癌精准医学研究中临床前模型的应用与发展 | 系统比较了各类肺癌临床前模型的优劣，并强调了患者来源类器官与多组学技术结合在功能性精准肿瘤学中的新兴价值 | 体内模型成本高、耗时长且劳动密集，限制了其广泛应用 | 推动肺癌精准医疗发展，优化个体化治疗策略 | 肺癌临床前研究模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2037 | 2025-10-06 |
Single-cell atlases reveal leaf cell-type-specific regulation of metal transporters in the hyperaccumulator Sedum alfredii under cadmium stress
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136185
PMID:39418904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了镉超富集植物东南景天叶片在镉胁迫下金属转运蛋白的细胞类型特异性调控机制 | 首次构建东南景天的全长转录组和叶片单细胞图谱，首次在单细胞水平揭示金属转运蛋白的细胞类型特异性表达模式 | 研究仅针对叶片组织，未涉及其他器官；样本数量相对有限 | 探究镉超富集植物东南景天在镉胁迫下的细胞类型特异性转录调控机制 | 东南景天（Sedum alfredii）叶片细胞 | 植物生物学 | NA | PacBio Iso-Seq全长转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组测序数据，单细胞基因表达数据 | 12,616个高质量单细胞（来自对照和镉处理样本） | PacBio | 全长转录组测序，单细胞RNA测序 | PacBio Iso-Seq | PacBio Iso-Seq技术用于生成全长转录组 |
| 2038 | 2025-10-06 |
PIEZO1 overexpression in hereditary hemorrhagic telangiectasia arteriovenous malformations
2024-Nov-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625696
PMID:39651206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PIEZO1过表达在遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中的关键作用 | 首次揭示PIEZO1在HHT2疾病中的过表达现象，并证明其抑制可有效减轻动静脉畸形形成 | ALK1突变体中信号改变的全谱仍不完全清楚，患者AVM形成的防治方法尚待开发 | 探究ALK1突变导致动静脉畸形的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 内皮特异性Alk1敲除小鼠视网膜和人HHT病变组织 | 单细胞测序 | 遗传性出血性毛细血管扩张症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | Alk1 KO小鼠和对照组小鼠视网膜内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2039 | 2025-10-06 |
Stratified analysis identifies HIF-2α as a therapeutic target for highly immune-infiltrated melanomas
2024-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620300
PMID:39554029
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研究论文 | 本研究通过分层分析发现HIF-2α是高度免疫浸润黑色素瘤的潜在治疗靶点 | 首次通过标准化荟萃分析揭示免疫浸润程度与ICB疗效的关系，并发现HIF-2α在特定细胞类型中的特异性表达 | 样本量相对有限，且主要基于回顾性队列分析 | 探索黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物和联合治疗新靶点 | 转移性黑色素瘤患者和临床前模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，荟萃分析 | NA | RNA测序数据，临床数据 | 516例患者（抗PD-1治疗290例，抗CTLA-4治疗175例，联合治疗51例） | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 2040 | 2025-10-06 |
Identification of gene and protein signatures associated with long-term effects of COVID-19 on the immune system after patient recovery by analyzing single-cell multi-omics data using a machine learning approach
2024-10-03, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2024.126253
PMID:39182316
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研究论文 | 通过机器学习方法分析单细胞多组学数据，识别与COVID-19康复患者免疫系统长期影响相关的基因和蛋白特征 | 首次结合五种特征排序算法和两种分类算法分析COVID-19康复患者的单细胞多组学数据，识别出特定的分子标志物 | 研究仅限于特定免疫细胞亚型，样本来源和规模未明确说明 | 研究COVID-19康复患者免疫系统的持久性改变和次级免疫反应 | COVID-19康复患者和健康对照组的免疫细胞 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞多组学测序 | LASSO, MCFS, RF, CATBoost, XGBoost, 决策树, K近邻 | 单细胞多组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 包含scRNA-seq、HTO、CITE-seq和SCT多种检测技术 |