单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27271 篇文献，本页显示第 20361 - 20380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20361 | 2024-08-08 |
Distinct Inflammatory Macrophage Populations Sequentially Infiltrate Bone-to-Tendon Interface Tissue After Anterior Cruciate Ligament (ACL) Reconstruction Surgery in Mice
2022-Jul, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10635
PMID:35866148
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序、流式细胞术和转录组学方法，分析了小鼠前交叉韧带重建手术后骨-腱界面组织中巨噬细胞的功能表型 | 发现了新的“手术诱导”高度炎症性CD9+ IL1+巨噬细胞群体，该群体表达与中性粒细胞相关的基因，并在手术后1天达到峰值，随后逐渐转变为更趋向于稳态的表型 | NA | 探讨巨噬细胞在肌肉骨骼组织手术修复后的愈合过程中的作用 | 小鼠前交叉韧带重建手术后的骨-腱界面组织中的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠前交叉韧带重建模型 |
| 20362 | 2024-08-08 |
Integrative analysis of omics summary data reveals putative mechanisms linked to different cell populations in systemic lupus erythematosus
2022-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110435
PMID:35878812
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研究论文 | 本文通过综合分析系统性红斑狼疮（SLE）的组学总结数据，揭示了与不同细胞群体相关的潜在机制。 | 本文提出了一种基于GWAS位点的单细胞水平基因和调控元件优先级分析范式，并识别了SLE的两种中介模式：转录中介模型和表观遗传中介模型。 | NA | 揭示系统性红斑狼疮在不同细胞群体中的发病机制。 | 系统性红斑狼疮的基因和表观遗传调控机制。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | GWAS, eQTL, LD, mQTL | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 20363 | 2024-08-08 |
Overview of Transcriptomic Research on Type 2 Diabetes: Challenges and Perspectives
2022-06-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13071176
PMID:35885959
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综述 | 本文综述了使用表达阵列、RNA测序和单细胞测序进行的2型糖尿病转录组研究，并强调了相关的新发现和挑战 | 介绍了RNA测序和单细胞技术在转录组研究中的应用，这些新技术为发现新的生物标志物提供了可能 | 标准遗传方法无法完全解释2型糖尿病的遗传因素 | 探讨转录组分析在发现2型糖尿病及其并发症风险群体中的新生物标志物的作用 | 2型糖尿病及其微血管和大血管并发症 | NA | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20364 | 2024-08-08 |
Microfluidics Facilitates the Development of Single-Cell RNA Sequencing
2022-Jun-24, Biosensors
DOI:10.3390/bios12070450
PMID:35884253
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展历程及其在微流控技术中的应用 | 微流控技术在scRNA-seq中的应用极大地提高了测序通量 | 未提及具体限制 | 探讨微流控技术在促进scRNA-seq技术发展中的作用及未来方向 | 单细胞RNA测序技术 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 20365 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Cerebrospinal Fluid as an Advanced Form of Liquid Biopsy for Neurological Disorders
2022-Jun-22, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12070812
PMID:35884620
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review | 本文综述了利用脑脊液中单细胞RNA测序技术作为液体活检方法，用于中枢神经系统肿瘤和非肿瘤疾病的诊断和监测 | 单细胞测序能提供罕见细胞群的新见解，揭示单细胞分辨率下的基因表达异质性，有助于理解疾病病理和治疗 | NA | 探讨单细胞RNA测序在脑脊液中的应用，以提高神经系统疾病的诊断和监测能力 | 中枢神经系统肿瘤和非肿瘤疾病患者的脑脊液细胞 | digital pathology | neurological disorder | single-cell RNA sequencing | NA | cell | NA |
| 20366 | 2024-08-08 |
Analysis of Melanoma Gene Expression Signatures at the Single-Cell Level Uncovers 45-Gene Signature Related to Prognosis
2022-Jun-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10071478
PMID:35884783
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研究论文 | 本文通过基因表达特征分类和Cox回归分析，在单细胞水平上生物学特征化黑色素瘤细胞，并构建了与黑色素瘤预后相关的基因特征 | 本文首次在单细胞水平上识别出与黑色素瘤预后相关的45基因特征（MPS_45），并验证了其在多个数据集中的预后预测能力 | NA | 建立精确的黑色素瘤预后相关基因特征 | 黑色素瘤细胞的基因表达特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq, RNA-seq | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤数据集，包括TCGA-SKCM、GSE65904、GSE19234和GSE53118 |
| 20367 | 2024-08-08 |
The Dynamic Nature of Human Dermal Fibroblasts Is Defined by Marked Variation in the Gene Expression of Specific Cytoskeletal Markers
2022-Jun-22, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12070935
PMID:35888024
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术研究人皮肤成纤维细胞的基因表达，并根据其遗传特征分离成纤维细胞亚群 | 首次报道了人皮肤成纤维细胞中特定基因的差异表达，这些基因可能有助于其在体内外的动态变化 | 尚未明确这些亚型成纤维细胞的特性是否能预测其来源或具有功能后果 | 研究人皮肤成纤维细胞的异质性和不同亚群的存在 | 人皮肤成纤维细胞及其亚群的基因表达 | NA | NA | 单细胞转录组学 (10X Genomics) | NA | 基因表达数据 | 成人皮肤样本和新生儿皮肤样本 |
| 20368 | 2024-08-08 |
Identification of COVID-19-Associated DNA Methylation Variations by Integrating Methylation Array and scRNA-Seq Data at Cell-Type Resolution
2022-06-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13071109
PMID:35885892
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研究论文 | 本文通过整合甲基化阵列和单细胞RNA测序数据，探索了COVID-19患者在细胞类型水平上的DNA甲基化变异 | 开发了一种分析流程，将大量组织的知识转移到单细胞水平，发现了COVID-19患者全血中甲基化变异的显著细胞类型特异性 | NA | 理解COVID-19患者中由DNA甲基化调节的特定免疫反应细胞类型 | COVID-19患者的DNA甲基化变异 | 数字病理学 | COVID-19 | 甲基化测序 | NA | 甲基化数据 | NA |
| 20369 | 2024-08-08 |
Integration of Bulk RNA Sequencing and Single-Cell RNA Sequencing to Reveal Uveal Melanoma Tumor Heterogeneity and Cells Related to Survival
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.898925
PMID:35865532
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，揭示了葡萄膜黑色素瘤的肿瘤异质性及其与生存相关的细胞类型 | 本研究首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，全面分析了葡萄膜黑色素瘤的免疫亚型及其免疫特征，并通过伪时间轨迹分析和SCENIC分析探索了细胞分化轨迹和单细胞转录因子调控网络 | NA | 探索葡萄膜黑色素瘤的肿瘤异质性 | 葡萄膜黑色素瘤的肿瘤异质性和与生存相关的细胞类型 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 11,988个细胞来自6个葡萄膜黑色素瘤样本 |
| 20370 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals New Immune Disorder Complexities in Hypersplenism
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.921900
PMID:35865544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了脾功能亢进（HS）组织中的细胞转录组特征 | 首次揭示了HS中B细胞的缺失及其在HS合并肝细胞癌（HS-HCC）中的存在，并发现了HS中CD74-COPA和CD94-HLA-E的上调 | NA | 探索脾功能亢进的遗传特征 | 脾功能亢进组织及其对照组织的细胞转录组 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 43,037个细胞，来自四个HS组织和一个对照组织 |
| 20371 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Mesenchymal Stem Cells in Cavernous Hemangioma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.916045
PMID:35865633
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了海绵状血管瘤中的细胞异质性，发现大量胚胎间充质干细胞，并提出海绵状血管瘤可能起源于胚胎间充质干细胞 | 首次在海绵状血管瘤中发现大量胚胎间充质干细胞，并揭示了这些细胞在免疫反应中的作用 | NA | 探究海绵状血管瘤的起源及其相关的细胞类型和分子机制 | 海绵状血管瘤中的细胞类型和分子机制 | 数字病理学 | 血管畸形 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 20372 | 2024-08-08 |
From single-omics to interactomics: How can ligand-induced perturbations modulate single-cell phenotypes?
2022, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2022.05.006
PMID:35871896
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研究论文 | 本文探讨了从单组学到相互作用组学的发展，以及配体诱导的扰动如何调节单细胞表型 | 介绍了单细胞转录组学数据与其他组学数据（如蛋白质组学和表观基因组学数据）的整合，以阐明细胞水平的扰动效应和机制 | 文章提到当前计算工具和算法的局限性，以及大量数据处理的挑战 | 旨在通过单细胞组学数据和计算工具，提高对药物研究和开发的认识 | 研究对象包括单细胞表型、药物治疗对生物系统的影响以及相关的计算工具和算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学数据、蛋白质组学数据、表观基因组学数据 | NA |
| 20373 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Yields Insights in the Evolution of Foot-and-Mouth Disease Virus Persistent Infection
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.940906
PMID:35873170
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，探讨了口蹄疫病毒（FMDV）持续感染细胞系的细胞异质性及其机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示口蹄疫病毒持续感染的形成机制，并首次应用伪时间轨迹分析于口蹄疫病毒持续感染细胞系 | NA | 阐明口蹄疫病毒持续感染细胞系的细胞异质性机制 | 口蹄疫病毒持续感染细胞系 | 数字病理学 | 口蹄疫 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | BHK-Op细胞系 |
| 20374 | 2024-08-08 |
A Novel Artificial Neural Network Prognostic Model Based on a Cancer-Associated Fibroblast Activation Score System in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.927041
PMID:35874676
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研究论文 | 本文构建了一种基于癌症相关成纤维细胞激活评分系统的新型人工神经网络预测模型，用于肝细胞癌的预后评估 | 本文创新性地利用12个癌症相关成纤维细胞相关基因构建了人工神经网络模型，并通过功能、突变、免疫和临床分析揭示了模型的信息 | NA | 识别肝细胞癌进展机制并预测患者预后 | 肝细胞癌患者及其癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组和配体-受体相互作用分析 | 人工神经网络（ANN） | 基因表达数据 | 数据来自The Cancer Genome Atlas、International Cancer Genome Consortium和Gene Expression Omnibus数据库 |
| 20375 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis From Multicenter Studies Identifies a WGCNA-Derived Cancer-Associated Fibroblast Signature for Ovarian Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.951582
PMID:35874760
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研究论文 | 本研究通过多中心研究的综合分析，利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）鉴定了与卵巢癌相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）特征。 | 首次通过多中心研究的综合分析，利用WGCNA方法鉴定了与卵巢癌相关的CAF特征，并构建了预后标志物。 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证。 | 旨在鉴定与卵巢癌高发病率和死亡率相关的CAF预后基因。 | 卵巢癌患者的癌症相关成纤维细胞及其预后基因。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 机器学习 | 基因表达数据 | 2742名患者 |
| 20376 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Distinct Tumor Microenvironment of Different Components of Lung Adenocarcinoma Featured as Mixed Ground-Glass Opacity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.903513
PMID:35874770
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了混合磨玻璃影特征的肺腺癌中不同成分的肿瘤微环境差异 | 首次通过单细胞测序技术，详细分析了混合磨玻璃影肺腺癌中固体成分和磨玻璃成分的细胞组成和转录组特征 | 研究样本仅限于三名患者的六对成分，可能限制了结果的普遍性 | 探究混合磨玻璃影特征的肺腺癌中不同成分的肿瘤微环境差异及其机制 | 混合磨玻璃影肺腺癌的固体成分和磨玻璃成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 19,391个单细胞数据，来自三名患者的六对成分 |
| 20377 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Immune Cells Reveal Diversity and Exhaustion Signatures in Non-Small-Cell Lung Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.854724
PMID:35874785
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了非小细胞肺癌患者肿瘤、正常组织和血液中的CD45免疫细胞，揭示了免疫细胞的多样性和耗竭特征。 | 本文首次识别出三种具有免疫抑制作用的免疫细胞簇，包括耗竭的CD8 T细胞、具有促炎M2表型的肿瘤相关巨噬细胞和具有肿瘤促进特性的调节性B细胞。 | NA | 旨在理解肿瘤微环境中免疫细胞表型，以解释和预测非小细胞肺癌的进展及其对免疫治疗的反应。 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤、正常组织和血液中的CD45免疫细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20378 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Pathogenic Relevance of Intracranial Atherosclerosis in Blood Blister-Like Aneurysms
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.927125
PMID:35874788
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了颅内非分支部位血泡样动脉瘤（BBA）与颅内动脉粥样硬化的致病相关性 | 首次通过单细胞RNA测序技术研究BBA的转录组景观，揭示了其与颅内动脉粥样硬化的致病相关性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的颅内动脉瘤类型 | 探究颅内血泡样动脉瘤的转录组景观及其与颅内动脉粥样硬化的潜在致病机制 | 颅内血泡样动脉瘤和囊状颅内动脉瘤的细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat-based pipeline | 细胞 | 12,245个细胞来自1个BBA和2个囊状颅内动脉瘤，以及10个BBA和30个颅内动脉瘤用于病理验证 |
| 20379 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Difference in Human Normal and Degenerative Nucleus Pulposus Tissue Profiles and Cellular Interactions
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.910626
PMID:35874809
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序技术，比较了人类正常和退变髓核细胞的表达谱，揭示了两者在细胞类型和功能上的差异 | 首次在椎间盘组织单细胞转录组测序研究中发现并鉴定了表达疼痛炎症基因的软骨细胞4和钙化软骨细胞5 | NA | 阐明人类正常和退变髓核细胞的转录组差异表达谱，探索其细胞异质性及功能 | 人类正常髓核细胞（NNP）和退变髓核细胞（DNP） | 数字病理学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两组样本，分别包含正常和退变的髓核细胞 |
| 20380 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing for Analyzing the Intestinal Tract in Healthy and Diseased Individuals
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.915654
PMID:35874838
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在健康和患病个体肠道分析中的应用 | scRNA-seq技术能够揭示在整体水平上难以观察到的罕见和中间细胞状态 | NA | 探讨scRNA-seq在识别新的细胞亚型和状态、目标以及解释肠道疾病分子机制中的应用 | 肠道中的不同细胞系及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |