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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 20361 - 20380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20361 | 2024-08-07 |
Development and Validation of a Novel Nomogram Integrated with Hypoxic and Lactate Metabolic Characteristics for Prognosis Prediction in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S446313
PMID:38333220
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种新型诺模图，该诺模图整合了缺氧和乳酸代谢特征，用于预测肝细胞癌的预后 | 本研究创新性地构建了一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型（HLPM），并开发了一个整合HLPM和临床特征的诺模图，用于肝细胞癌的预后预测 | NA | 旨在构建一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型，以评估肝细胞癌患者的生存和治疗反应，并开发一个整合这些特征的诺模图用于预后预测 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图 | 组织样本 | 14对组织样本和单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20362 | 2024-08-04 |
CD4+ T cells are homeostatic regulators during Mtb reinfection
2023-Dec-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.20.572669
PMID:38187598
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研究论文 | 该文研究了CD4+ T细胞在Mtb再感染期间的调节作用 | 研究表明CD4 T细胞在再感染环境中通过减少肺部炎症和调节CD8 T细胞活性来提供长期的保护作用 | 目前对再感染后肺部细胞环境的变化了解仍然有限 | 探讨CD4 T细胞在Mtb再感染中的作用及其对疾病严重性的影响 | 采用非人灵长类动物的再感染模型观察CD4 T细胞对保护反应的影响 | 免疫学 | 结核病 | PET-CT、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 临床和微生物学数据 | 非人灵长类动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 20363 | 2024-08-07 |
Single-cell morphological and transcriptome analysis unveil inhibitors of polyploid giant breast cancer cells in vitro
2023-12-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05674-5
PMID:38129519
|
研究论文 | 本文通过单细胞形态学和转录组分析，识别了抑制体外多倍体巨型乳腺癌细胞的化合物 | 建立了高吞吐量和精确度的单细胞形态学分析流程，并结合scRNA-Seq技术，揭示了乳腺癌多倍体巨型细胞的细胞周期、代谢和铁死亡敏感性的变化 | NA | 发现有效的抗多倍体巨型癌细胞化合物 | 多倍体巨型乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20364 | 2024-08-04 |
A neuronal coping mechanism linking stress-induced anxiety to motivation for reward
2023-12-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh9620
PMID:38055830
|
研究论文 | 这篇文章展示了急性压力如何通过激活小鼠的GABA能神经元影响焦虑和奖励动机。 | 研究揭示了应激、焦虑与动机之间的神经基础，并首次探索IPN GABA能神经元在应激应对机制中的作用。 | 研究主要在小鼠模型中进行，是否适用于其他物种尚不明确。 | 本研究旨在揭示压力如何通过神经机制影响焦虑和奖励动机。 | 本研究的对象为小鼠，特别是研究其GABA能神经元的活动。 | 神经科学 | 焦虑症 | 光遗传学，单细胞测序，光纤光度测定 | NA | 生物体实验数据 | 使用多个小鼠进行实验，具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 20365 | 2024-08-04 |
Spatial gene expression in the adult rat patellar tendon
2023-Dec, Matrix biology plus
DOI:10.1016/j.mbplus.2023.100138
PMID:38124714
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研究论文 | 本研究探讨了成年大鼠髌腱的空间基因表达特征 | 发现了一个新的空间调控基因(AABR07000398.1)，其功能尚不明确 | 仅使用了两份雄性大鼠髌腱样本，样本量较小 | 确定髌腱的基因表达谱及其空间分布 | 雄性大鼠的髌腱样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 2个雄性大鼠髌腱样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20366 | 2024-08-04 |
Semi-reference based cell type deconvolution with application to human metastatic cancers
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad109
PMID:38143958
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研究论文 | 本研究介绍了一种新颖的解卷积方法SECRET，用于从大规模RNA-seq数据中准确估计细胞类型比例 | SECRET方法允许在参考数据中未代表的细胞类型情况下灵活选择参考数据，并且在合成数据上表现出优越的准确性 | 未提及具体的限制信息 | 研究如何从大规模RNA-seq数据中提取细胞类型特异性信息 | 研究以人类转移性癌症为对象 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20367 | 2024-08-07 |
Connecting single-cell transcriptomes to projectomes in mouse visual cortex
2023-Nov-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.25.568393
PMID:38168270
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研究论文 | 本文通过收集小鼠视觉皮层兴奋性神经元的Patch-seq和全脑形态学数据集，定义了16种综合形态-电-转录组（MET）类型，并重建了300个神经元的完整形态，通过多步骤分类器统一两个数据集，研究了转录组变异与形态学和电生理表型的关系，并预测了个体神经元的投射目标。 | 本文创新性地将单细胞转录组数据与全脑形态学数据相结合，通过多步骤分类器统一数据集，建立了小鼠视觉皮层兴奋性神经元的综合分类系统，并揭示了细胞类型特异性的跨半球投射。 | NA | 研究小鼠视觉皮层兴奋性神经元的综合形态-电-转录组类型，并预测其投射目标。 | 小鼠视觉皮层兴奋性神经元的转录组、形态学和电生理特性。 | 数字病理学 | NA | Patch-seq | 多步骤分类器 | 转录组数据、形态学数据 | 300个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 20368 | 2024-08-04 |
Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy Targeting Epithelial Cell Adhesion Molecule in Gastric Cancer: Mechanisms of Tumor Resistance
2023-Nov-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15235552
PMID:38067255
|
研究论文 | 该研究开发了一种针对上皮细胞粘附因子（EpCAM）的嵌合抗原受体（CAR）T细胞，用于治疗胃癌，并探讨肿瘤如何逃逸免疫监视及对CAR T细胞疗法的抗性机制 | 首次通过全身CAR T细胞成像和单细胞多组学分析揭示了肿瘤与肿瘤浸润淋巴细胞之间复杂的相互作用 | 研究主要集中在胃癌模型，结果可能不完全适用于其他癌症类型 | 揭示肿瘤逃逸免疫监视和发展抗性机制的精确机制 | 胃癌模型中肿瘤细胞和肿瘤浸润的淋巴细胞 | 数字病理 | 胃癌 | CAR T细胞成像、单细胞多组学分析 | NA | 图像、转录组数据 | 在胃癌模型中分析的CD8和CD4 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20369 | 2024-08-04 |
scReadSim: a single-cell RNA-seq and ATAC-seq read simulator
2023-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43162-w
PMID:37980428
|
研究论文 | 本文介绍了scReadSim，这是一种用于生成单细胞RNA-seq和ATAC-seq测序序列的模拟器 | scReadSim能够根据用户指定的真实值生成合成测序读取，填补了真数据模拟的空白 | 未提及特定的限制 | 开发一款能生成真实数据模拟的单细胞RNA-seq和ATAC-seq读取模拟器 | 针对单细胞RNA-seq和ATAC-seq的读取模拟 | 数字病理学 | NA | NA | NA | FASTQ或BAM文件的合成测序读取 | 未提及具体样本大小 | NA | NA | NA | NA |
| 20370 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of glial cells from the mouse amygdala under opioid dependent and withdrawal states
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108166
PMID:37915593
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠杏仁核中，药物依赖和戒断状态下胶质细胞的转录变化。 | 首次在小鼠杏仁核中进行药物依赖和戒断状态下的单细胞RNA测序，揭示了关键生物过程的显著差异。 | NA | 探究药物使用障碍导致依赖的过程中，杏仁核内各细胞类型的转录变化。 | 小鼠杏仁核中的胶质细胞。 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 20371 | 2024-08-07 |
MUC1-C integrates aerobic glycolysis with suppression of oxidative phosphorylation in triple-negative breast cancer stem cells
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108168
PMID:37915591
|
研究论文 | 本研究探讨了MUC1-C蛋白在三阴性乳腺癌干细胞中整合糖酵解途径激活与抑制氧化磷酸化的作用 | 首次揭示了MUC1-C通过下调线粒体转录因子A和诱导线粒体转录终止因子3来抑制线粒体DNA基因表达，从而影响乳腺癌干细胞的自我更新和氧化还原平衡 | NA | 研究MUC1-C蛋白在三阴性乳腺癌干细胞中的功能及其对糖酵解和氧化磷酸化的调控作用 | 三阴性乳腺癌干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 富集的三阴性乳腺癌干细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 20372 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of murine ankle joints over time reveals distinct transcriptional changes following Borrelia burgdorferi infection
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108217
PMID:37953958
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，追踪了感染伯氏疏螺旋体的小鼠踝关节在不同时间点的转录变化。 | 首次详细描述了感染伯氏疏螺旋体后，小鼠踝关节中巨噬细胞、T细胞、滑膜细胞和成纤维细胞的基因表达变化，并预测了细胞间的相互作用。 | NA | 旨在理解伯氏疏螺旋体感染过程中，小鼠踝关节的细胞和转录变化。 | 感染伯氏疏螺旋体的小鼠踝关节。 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | C57BL/6小鼠的踝关节样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20373 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Differentiates the Effects of p53 Mutation and p53 Loss on Cell Compositions of Oncogenic Kras-Driven Pancreatic Cancer
2023-11-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12222614
PMID:37998349
|
研究论文 | 本研究通过跨数据集的单细胞RNA测序分析，比较了KP和KP小鼠模型中胰腺肿瘤微环境的细胞组成和转录组表型 | 首次系统比较了p53突变和p53缺失对致癌KRAS驱动的胰腺癌肿瘤微环境的影响 | NA | 研究p53突变和p53缺失对致癌KRAS驱动的胰腺癌进展的影响 | 胰腺癌肿瘤微环境的细胞组成和转录组表型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及KP和KP小鼠模型中的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 20374 | 2024-08-07 |
Skeletal muscle regeneration failure in ischemic-damaged limbs is associated with pro-inflammatory macrophages and premature differentiation of satellite cells
2023-11-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01250-y
PMID:37950327
|
研究论文 | 本研究探讨了慢性肢体威胁性缺血（CLTI）中骨骼肌再生受损的细胞和转录组水平病理变化，以及细胞间信号传导途径 | 首次提供了CLTI患者和CLTI小鼠模型骨骼肌的单细胞转录组图谱 | NA | 阐明慢性肢体威胁性缺血中骨骼肌再生受损的机制 | 人类组织样本和CLTI小鼠模型的骨骼肌 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | CLTI患者和CLTI小鼠模型的骨骼肌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20375 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals unique gene expression changes in different brain regions after sleep deprivation
2023-11-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42751-z
PMID:37925446
|
研究论文 | 这篇文章探讨了睡眠剥夺后不同脑区的基因表达变化 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了睡眠剥夺对小鼠脑内不同区域基因表达的影响，并开发了新的生物信息学工具 | 研究仅在雄性小鼠身上进行，未考虑性别差异的影响 | 研究睡眠剥夺对不同脑区基因表达的影响 | 雄性小鼠的各个脑区 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20376 | 2024-08-07 |
Moving closer towards a comprehensive view of tumor biology and microarchitecture using spatial transcriptomics
2023-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42960-6
PMID:37919364
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20377 | 2024-08-04 |
Hidden Markov random field models for cell-type assignment of spatially resolved transcriptomics
2023-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad641
PMID:37944045
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于空间分辨转录组数据细胞类型分配的统计模型SPAN | SPAN模型结合了隐藏马尔可夫随机场和混合模型，有效利用了已定义的标记基因及空间信息 | 本文未提及具体的局限性 | 研究空间分辨转录组数据中的细胞类型注释方法 | 空间分辨转录组数据的细胞或斑点 | 数字病理学 | NA | 统计建模 | 隐藏马尔可夫随机场模型 | 转录组数据 | 通过广泛的模拟和真实数据实验验证了SPAN模型的有效性 | NA | NA | NA | NA |
| 20378 | 2024-08-04 |
scDiffCom: a tool for differential analysis of cell-cell interactions provides a mouse atlas of aging changes in intercellular communication
2023-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00514-x
PMID:37919434
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研究论文 | 本文介绍了一个工具scDiffCom，用于分析细胞间相互作用在老龄化过程中的变化 | 提出了一个新工具scDiffCom，结合了5000个配体-受体相互作用，用于差异细胞间通讯分析 | 目前的数据集仅限于小鼠，可能无法外推至其他物种 | 定量分析细胞间通讯在老龄化过程中的变化 | 23种小鼠组织的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 58个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20379 | 2024-08-04 |
Ancestry-specific regulatory and disease architectures are likely due to cell-type-specific gene-by-environment interactions
2023-Oct-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.20.23297214
PMID:37905038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq数据，分析了东亚和欧洲血缘个体的基因表达差异，探讨了这些差异对疾病变异的影响 | 首次通过单细胞层面的分析阐明了血缘特异的基因表达和疾病变异之间的相互作用 | 研究仅限于少数血缘背景，需要更多样本来验证结果 | 研究血缘特异性基因与环境交互对疾病变异的影响 | 21名东亚血缘和23名欧洲血缘个体的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 复杂性疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 细胞数据 | 44个个体的172K单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20380 | 2024-08-04 |
Sibling chimerism among microglia in marmosets
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.16.562516
PMID:37904944
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研究论文 | 本研究分析了在绒猴中微胶质细胞的兄弟嵌合现象 | 揭示了绒猴中微胶质细胞的兄弟来源嵌合性是由血液来源细胞引起的，且这种现象在不同脑区之间存在显著变异 | 只分析了特定几种组织和动物，可能限制了结果的普适性 | 研究兄弟嵌合对绒猴中微胶质细胞的影响及其与局部环境的关系 | 绒猴的血液、肝脏、肾脏和多个脑区的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多只绒猴的多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |