单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 20341 - 20360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20341 | 2024-08-08 |
Tyrosine Kinase Inhibition Alters Intratumoral CD8+ T-cell Subtype Composition and Activity
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-1039
PMID:35917579
|
研究论文 | 研究酪氨酸激酶抑制剂（TKI）对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响 | 发现TKI与IL15超激动剂（IL15SA）联合使用可恢复肿瘤内效应CD8+ T细胞功能和CD8+ T细胞内PI3K信号传导，从而增强肿瘤破坏 | 尽管联合使用TKI和免疫检查点阻断（ICB）在晚期GIST中取得了一定效果，但治疗效果仍然有限 | 探讨TKI对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响，并评估联合治疗策略的效果 | 胃肠间质瘤（GIST）中的CD8+ T细胞亚型和活性 | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 使用了基因工程小鼠模型和人类GIST样本 |
| 20342 | 2024-08-08 |
Constitutive programmed death ligand 1 expression protects gastric G-cells from Helicobacter pylori-induced inflammation
2022-Oct, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.12917
PMID:35899973
|
研究论文 | 研究胃肠道化生（GIM）患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | 发现G-细胞在幽门螺杆菌感染期间通过PD-L1表达得到保护，而GIM本身不表达PD-L1 | NA | 探究GIM患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | GIM患者的组织样本 | NA | 胃肠道疾病 | 免疫组织化学染色，多重免疫荧光染色，单细胞测序 | NA | 组织样本 | 来自已知GIM患者的一组样本 |
| 20343 | 2024-08-08 |
Research strategies for single-cell transcriptome analysis in plant leaves
2022-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15927
PMID:35904970
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在植物叶片研究中的进展，并探讨了相关的分析方法及当前研究中遇到的困难和问题 | NA | 植物单细胞研究面临细胞分离、细胞类型注释、细胞功能分析和细胞间通信网络等挑战，且缺乏可靠稳定的分析方法和标准 | 总结植物叶片中单细胞转录组分析的研究进展，并探讨未来的发展方向 | 植物叶片的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 20344 | 2024-08-08 |
Ontogenetic rules for the molecular diversification of hypothalamic neurons
2022-10, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-022-00615-3
PMID:35906427
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、小鼠遗传学和内分泌学研究，描述了下丘脑发育的关键阶段，包括局部神经发生、谷氨酸能神经元的直接终末分化、GABA能神经元和GABA能细胞衍生多巴胺细胞的过渡级联、局部神经元迁移的波次以及神经肽和激素的顺序富集。 | 本文利用分子指纹技术，提供了前所未有的数据量和深度，以区分甚至预测多种神经元模式的突触和内分泌能力、连接性和刺激选择性。 | NA | 研究下丘脑神经元的分子多样化和发育分离的分子规则。 | 下丘脑的神经元及其在发育过程中的分子多样化和终末分化。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种神经元亚型 |
| 20345 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing: Unravelling the Bone One Cell at a Time
2022-10, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-022-00735-w
PMID:35915289
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综述 | 本文综述了使用单细胞RNA测序和新兴的空间RNA测序技术在骨骼研究中的最新发现 | 单细胞RNA测序揭示了骨骼细胞谱系中新的和转录上不同的细胞集群，空间转录组学方法提供了不同细胞群的定位信息 | NA | 总结近期使用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术在骨骼研究中的发现，描述不同骨骼驻留细胞类型及其分子程序 | 骨骼中的不同细胞类型及其分子程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20346 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of fractional CO2 laser efficiency in treating a mouse model of alopecia
2022-10, Lasers in surgery and medicine
IF:2.2Q2
DOI:10.1002/lsm.23590
PMID:35916125
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了分次二氧化碳激光治疗小鼠模型脱发的分子和细胞机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了激光照射后皮肤中细胞群及其基因表达的变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证其效果 | 探究分次二氧化碳激光治疗脱发的有效条件及其分子和细胞机制 | 小鼠模型的脱发治疗 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型的皮肤样本 |
| 20347 | 2024-08-08 |
GLOBE: a contrastive learning-based framework for integrating single-cell transcriptome datasets
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac311
PMID:35901449
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的单细胞转录组数据集整合框架GLOBE，该框架通过定义自适应平移变换和使用硬度感知与一致性感知的损失函数来去除批次效应，并支持多样化的下游分析 | GLOBE框架通过自适应平移变换和硬度感知与一致性感知的损失函数，提高了批次效应去除的稳定性和表示对齐的一致性 | NA | 开发一种改进的基于对比学习的批次效应校正框架，以整合来自多个来源的单细胞转录组数据集 | 单细胞转录组数据集的批次效应去除 | 生物信息学 | NA | 对比学习 | 对比学习框架 | 转录组数据 | 广泛的数据集，包括两个发育中的小鼠新皮质数据集 |
| 20348 | 2024-08-08 |
GE-Impute: graph embedding-based imputation for single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac313
PMID:35901457
|
研究论文 | 提出了一种基于图嵌入的神经网络模型GE-Impute，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | GE-Impute通过学习每个细胞的神经图表示并重建细胞间相似性网络，从而更准确地填补缺失值 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据的可靠性和生物学解释性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图嵌入神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 20349 | 2024-08-08 |
Learning discriminative and structural samples for rare cell types with deep generative model
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac317
PMID:35914950
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研究论文 | 本文提出了一种新的深度生成模型scLDS2，用于利用少量细胞样本准确估计不同细胞的分布，通过对抗学习区分稀有和非稀有细胞类型 | scLDS2模型通过生成稀疏的假样本并学习细胞间的关系，增强了样本的可解释性，并将细胞类型的识别问题转化为分类问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型识别的挑战 | 稀有细胞类型的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成模型 | 基因表达数据 | 20个数据集 |
| 20350 | 2024-08-08 |
SECEDO: SNV-based subclone detection using ultra-low coverage single-cell DNA sequencing
2022-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac510
PMID:35900151
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单核苷酸变异（SNV）的超低覆盖率单细胞DNA测序数据进行亚克隆检测的新方法SECEDO | SECEDO利用贝叶斯过滤方法和读取重叠与相位技术，有效地对肿瘤细胞进行聚类，相较于现有技术，在超低覆盖率数据上显著提高了SNV检测的敏感性和准确性 | NA | 开发一种新的方法来基于SNV对肿瘤细胞进行聚类，以更全面地了解肿瘤内异质性 | 肿瘤细胞的亚克隆结构 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序 | 贝叶斯过滤方法 | DNA序列数据 | 合成数据集包含7250个细胞和八个肿瘤亚克隆，真实数据集每个包含约2000个细胞 |
| 20351 | 2024-08-08 |
Lysosomal acid lipase, CSF1R, and PD-L1 determine functions of CD11c+ myeloid-derived suppressor cells
2022-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156623
PMID:35917184
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研究论文 | 研究探讨了溶酶体酸性脂肪酶（LAL）、集落刺激因子1受体（CSF1R）和程序性死亡配体1（PD-L1）在CD11c+髓源性抑制细胞中的作用 | 通过单细胞RNA测序和药理学阻断方法，揭示了LAL缺陷小鼠中CD11c+细胞的代谢转变及其对T细胞抑制和肿瘤生长的影响 | NA | 探究LAL、CSF1R和PD-L1在CD11c+髓源性抑制细胞功能中的作用及其对免疫抑制和肿瘤生长的影响 | CD11c+髓源性抑制细胞、LAL缺陷小鼠、非小细胞肺癌患者 | NA | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LAL缺陷小鼠和非小细胞肺癌患者的样本 |
| 20352 | 2024-08-08 |
Function of normal oral mucosa revealed by single-cell RNA sequencing
2022-09, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.30307
PMID:35894175
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了正常口腔黏膜细胞的功能和相互作用 | 首次通过单细胞转录组测序技术绘制了正常口腔黏膜细胞的全面图谱，并发现了具有高表达主要组织相容性复合体II类分子的上皮细胞亚群、CD8 GZMK T细胞亚群和两种活化的巨噬细胞 | NA | 探讨正常口腔黏膜细胞的功能和相互作用 | 正常口腔黏膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26,398个细胞来自三例正常口腔黏膜 |
| 20353 | 2024-08-08 |
Schwann cell precursors: a hub of neural crest development
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2022111955
PMID:35894449
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研究论文 | 本文通过综合单细胞RNA测序分析，揭示了施万细胞前体（SCPs）与神经嵴细胞（NCCs）之间的临时“枢纽”状态，这种状态在SCPs和NCCs中普遍存在 | 发现了SCPs与晚期迁移的NCCs之间显著的相似性，并提出了这种状态在成年组织再生和肿瘤发生中的潜在作用 | SCPs的异质性和发育潜能仍不完全清楚 | 探讨SCPs在神经嵴发育中的作用及其潜在的生物学意义 | 施万细胞前体（SCPs）及其在神经嵴发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 20354 | 2024-08-08 |
Circular RNAs: novel regulators of resistance to systemic treatments in breast cancer
2022-Sep, Neoplasma
IF:2.0Q3
DOI:10.4149/neo_2022_220611N619
PMID:35900318
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综述 | 本文综述了循环RNA（circRNAs）在乳腺癌系统治疗耐药性中的作用机制 | 探讨了circRNAs作为乳腺癌耐药性的主要调节因子的作用，并提出了circRNAs作为潜在的生物标志物和治疗靶点的可能性 | 目前关于circRNAs在乳腺癌耐药性中作用的研究报告较少 | 探讨circRNAs在乳腺癌系统治疗耐药性中的作用机制，以改善乳腺癌患者的预后 | 乳腺癌的系统治疗耐药性及其相关机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和肿瘤活检样本 |
| 20355 | 2024-08-08 |
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152673
PMID:35900794
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研究论文 | 研究通过mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型，探讨了骨髓中IL-6信号传导在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的作用 | 首次揭示了IL-6在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用，并证明了阻断IL-6信号传导对治疗高风险骨髓增生异常综合征的临床意义 | NA | 探讨骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的机制，特别是与衰老微环境相关的机制 | mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型及高风险骨髓增生异常综合征患者 | NA | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | mDia1/miR-146a双敲除小鼠及高风险骨髓增生异常综合征患者 |
| 20356 | 2024-08-08 |
Neutrophils, functions beyond host defense
2022-09, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2022.104579
PMID:35901576
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综述 | 本文综述了中性粒细胞在宿主防御之外的多功能性 | 利用单细胞测序等前沿技术揭示了中性粒细胞在稳态和炎症条件下的复杂性和可塑性 | NA | 探讨中性粒细胞在疾病和稳态环境下的异质性和功能 | 中性粒细胞及其与其他免疫细胞的相互作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 20357 | 2024-08-08 |
Impact of single-cell RNA sequencing on understanding immune regulation
2022-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17493
PMID:35906816
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在免疫相关生理状态、调控机制和疾病中的应用 | scRNA-seq技术揭示了以前未报告的细胞类型或状态，为疾病治疗和生物过程提供了新的启示 | 讨论了scRNA-seq在免疫调控中的机遇和挑战 | 深入理解细胞异质性及其对细胞发育和功能的重要性 | 单细胞RNA测序技术及其在免疫细胞异质性和疾病发病机制中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 20358 | 2024-08-08 |
SMGR: a joint statistical method for integrative analysis of single-cell multi-omics data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac056
PMID:35910046
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研究论文 | 本文开发了一种名为SMGR的新方法，用于从不同样本的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）数据中检测一致的功能性调控信号和目标基因 | SMGR方法利用广义线性回归模型识别一致表达基因和峰的潜在表示，从而识别共调控程序并阐明调控机制 | NA | 旨在解决单细胞多组学数据整合分析中的挑战，提高分析的准确性 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序数据 | 基因组学 | 急性混合表型白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | 广义线性回归模型 | 单细胞多组学数据 | 不同样本的数据 |
| 20359 | 2024-08-08 |
Gruffi: an algorithm for computational removal of stressed cells from brain organoid transcriptomic datasets
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2022111118
PMID:35919947
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Gruffi的算法，用于从脑类器官转录组数据集中计算去除应激细胞 | 开发了一种新的计算算法Gruffi，通过粒度功能过滤来无偏地识别和去除应激细胞 | NA | 研究脑类器官中的细胞应激问题，并开发方法去除这些应激细胞以改善发育轨迹的划分 | 脑类器官和胎儿的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约190,000个细胞 |
| 20360 | 2024-08-08 |
Intratracheally administered LNA gapmer antisense oligonucleotides induce robust gene silencing in mouse lung fibroblasts
2022-08-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac630
PMID:35920332
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研究论文 | 研究通过三种不同方法评估了LNA gapmer反义寡核苷酸在肺纤维细胞中的基因沉默效果 | 首次应用单细胞RNA测序（scRNA-seq）评估寡核苷酸治疗药物的疗效 | 缺乏适当的分析方法来确定反义寡核苷酸在每种细胞类型中的有效性 | 研究反义寡核苷酸在肺部不同细胞类型中的基因沉默效果 | 肺纤维细胞和内皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |