单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 20321 - 20340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20321 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals dysregulation of spinal cord cell types in a severe spinal muscular atrophy mouse model
2022-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010392
PMID:36074806
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了严重脊髓性肌肉萎缩症（SMA）小鼠模型中脊髓细胞类型的失调情况 | 首次揭示了SMA小鼠脊髓的单细胞图谱，并提供了对SMA发病机制的新见解 | NA | 探究SMA脊髓中在单细胞水平上的转录组改变 | SMA小鼠模型的脊髓细胞类型及其基因表达变化 | 数字病理学 | 脊髓性肌肉萎缩症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20322 | 2024-08-08 |
INSISTC: Incorporating network structure information for single-cell type classification
2022-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110480
PMID:36075505
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研究论文 | 本文开发了一种名为INSISTC的计算方法，用于整合基因调控网络结构信息进行单细胞类型分类 | INSISTC方法能够在进行单细胞类型分类的同时，识别特定细胞类型的基因调控机制 | NA | 旨在通过整合基因调控网络结构信息，提高单细胞类型分类的准确性 | 单细胞类型分类及特定细胞类型的基因调控机制 | 机器学习 | NA | Single-Cell RNA-Seq | NA | 基因调控网络结构信息 | NA |
| 20323 | 2024-08-08 |
Targeting autophagy in aortic aneurysm and dissection
2022-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113547
PMID:36076620
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综述 | 本文综述了自噬及其蛋白在主动脉瘤和夹层（AAD）中的作用，并探讨了针对自噬作为AAD新治疗策略的潜力 | 提出了针对自噬作为主动脉瘤和夹层的新治疗策略 | 自噬在AAD中的具体作用仍存在争议 | 探讨自噬在主动脉瘤和夹层中的作用及作为治疗策略的可能性 | 主动脉瘤和夹层 | 心血管疾病 | 主动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20324 | 2024-08-08 |
Delving into the Heterogeneity of Different Breast Cancer Subtypes and the Prognostic Models Utilizing scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq
2022-Sep-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23179936
PMID:36077333
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研究论文 | 本研究深入探讨了不同乳腺癌亚型的异质性，并利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-Seq）构建了预测模型 | 首次全面分析了不同乳腺癌亚型癌细胞的异质性，并建立了针对不同亚型的特异性预后模型 | NA | 旨在通过分析乳腺癌亚型的异质性，为乳腺癌的诊断、预后和靶向治疗提供临床意义 | 乳腺癌的不同亚型及其癌细胞的异质性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），批量RNA测序（Bulk RNA-Seq） | LASSO回归，Cox分析 | RNA序列 | 涉及三种乳腺癌亚型（三阴性乳腺癌、HER2+乳腺癌和腔内乳腺癌）的多个样本 |
| 20325 | 2024-08-08 |
Transcription Factor MAFB as a Prognostic Biomarker for the Lung Adenocarcinoma
2022-Sep-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23179945
PMID:36077342
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研究论文 | 本文通过分析单细胞测序数据和临床记录，研究了转录因子MAFB在肺腺癌中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了MAFB在肿瘤相关巨噬细胞中的特异性表达，并探讨了其在肺腺癌中的预后价值，尤其是在吸烟患者中 | 研究样本量相对较小，且仅限于日本的一个医院，可能影响结果的普遍性 | 探讨转录因子MAFB作为肺腺癌预后生物标志物的可能性 | 肺腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 120名肺腺癌患者 |
| 20326 | 2024-08-08 |
CINS: Cell Interaction Network inference from Single cell expression data
2022-09, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010468
PMID:36095011
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研究论文 | 本文介绍了CINS管道，用于从单细胞表达数据中推断细胞间相互作用网络 | CINS结合贝叶斯网络分析和基于回归的建模，能够识别不同条件下的细胞类型相互作用及其相关蛋白质，相较于先前的细胞相互作用预测方法有所改进 | NA | 确定不同条件下差异的细胞间相互作用 | 细胞类型相互作用及其相关蛋白质 | 单细胞测序 | NA | scRNA-Seq | 贝叶斯网络分析，回归模型 | 表达数据 | 疾病案例对照和衰老小鼠数据集 |
| 20327 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Survey of Cellular Heterogeneity in Human Great Saphenous Veins
2022-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11172711
PMID:36078120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，详细描述了人类大隐静脉中的细胞异质性及其表达调控机制 | 揭示了大隐静脉内皮细胞和瓣膜内皮细胞之间的功能适应性差异，以及淋巴管发育的潜在来源 | NA | 探索大隐静脉细胞成分及其表达调控，以减少静脉移植失败 | 人类大隐静脉样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个人类大隐静脉样本 |
| 20328 | 2024-08-08 |
Sex Differences in Coronary Artery Disease and Diabetes Revealed by scRNA-Seq and CITE-Seq of Human CD4+ T Cells
2022-Aug-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23179875
PMID:36077273
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和抗体测序（CITE-Seq）分析了人CD4+ T细胞在冠状动脉疾病（CAD）和糖尿病（DM）中的性别差异 | 首次结合scRNA-Seq和CITE-Seq技术，详细分析了CD4+ T细胞在CAD和DM中的性别差异及基因表达变化 | 研究样本仅限于接受心脏导管手术的61名男性和女性，可能限制了结果的普遍性 | 探讨CAD与性别和DM之间的关系 | 人CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-Seq, CITE-Seq | NA | 单细胞转录组 | 61名男性和女性的外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 20329 | 2024-08-08 |
Dosage Compensation of the X Chromosome during Sheep Testis Development Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2022-Aug-24, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani12172169
PMID:36077890
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了绵羊睾丸发育三个关键阶段的剂量补偿机制 | 首次揭示了绵羊睾丸发育过程中X染色体的剂量补偿机制，并发现了MSL1和MSL2在早期生殖细胞中的表达及其在调控哺乳动物X染色体失活和激活中的作用 | 研究仅限于绵羊睾丸发育的三个特定阶段，未涵盖所有发育阶段 | 探讨绵羊雄性生殖细胞中X染色体的调控机制 | 绵羊睾丸发育过程中的X染色体剂量补偿 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个绵羊睾丸发育阶段的数据 |
| 20330 | 2024-08-08 |
The role of tumor-infiltrating B cells in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma and its prognostic value: a bioinformatics analysis
2022-Aug, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-22-717
PMID:36092319
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了肿瘤浸润B细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其预后价值 | 本研究首次详细探讨了肿瘤浸润B细胞在肝细胞癌微环境中的作用，并验证了其与预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，未来需要更多的实验验证 | 探讨肿瘤浸润B细胞在肝细胞癌中的作用及其预后价值 | 肝细胞癌肿瘤样本中的B细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库和TCGA-LIHC数据库的多个样本 |
| 20331 | 2024-08-08 |
Identifying Transient Cells During Reprogramming via Persistent Homology
2022-07, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC48229.2022.9871358
PMID:36085927
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研究论文 | 本研究开发了一种基于持久同调的方法，用于识别在不同细胞表型之间起桥梁作用的过渡状态细胞 | 利用持久同调技术，能够识别位于不同细胞亚群边界上的过渡状态细胞 | 仅分析了代表重编程早期阶段的数据 | 开发一种方法来识别在不同细胞表型之间起桥梁作用的过渡状态细胞 | 人类成纤维细胞向诱导多能干细胞的重编程过程中的过渡状态细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 持久同调 | 时间序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 20332 | 2024-08-08 |
Gene Expression Markers of Prognostic Importance for Prostate Cancer Risk in Patients with Benign Prostate Hyperplasia
2022-07, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC48229.2022.9871422
PMID:36086411
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研究论文 | 本研究通过重新分析两个公开的单细胞RNA测序数据集，揭示了前列腺癌和良性前列腺增生细胞类型之间的基因表达差异 | 发现了791个在前列腺癌上皮细胞中上调的基因，并确定了六个在前列腺癌细胞中显著上调的标记基因 | NA | 旨在阐明前列腺癌的发展过程中细胞类型的转变，并识别出具有预后重要性的基因标记 | 前列腺癌和良性前列腺增生细胞类型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15,505个上皮细胞样本，涉及18,638个基因 |
| 20333 | 2024-08-08 |
FLT3LG and IFITM3P6 consolidate T cell activity in the bone marrow microenvironment and are prognostic factors in acute myelocytic leukemia
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.980911
PMID:36081495
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研究论文 | 本研究旨在通过分析基因表达数据，识别与急性髓细胞性白血病（AML）中T细胞功能抑制相关的关键基因，为免疫治疗提供证据 | 确定了FLT3LG和IFITM3P6作为与患者总体生存和微环境免疫活性正相关的关键基因，并揭示了FLT3-FLT3LG和IFITM3P6-miR-6748-3p-CBX7信号轴在CD4+和CD8+ T细胞激活中的作用 | NA | 寻找与T细胞耗竭和抑制相关的关键基因，为AML的免疫治疗提供证据 | 急性髓细胞性白血病（AML）中的CD4+和CD8+ T细胞 | NA | 白血病 | 基因转录组表达分析 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA和TARGET数据库的基因转录组表达数据 |
| 20334 | 2024-08-08 |
The transcription factor Zfp503 promotes the D1 MSN identity and represses the D2 MSN identity
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.948331
PMID:36081908
|
研究论文 | 本文研究了转录因子Zfp503在促进D1型中棘神经元身份和抑制D2型中棘神经元身份中的作用 | 发现了D1型中棘神经元在缺乏特定条件下会转变为D2型中棘神经元，并揭示了转录因子Zfp503通过影响侧脑室旁核祖细胞的分化来调控这一过程 | NA | 探究中棘神经元两种类型的命运决定机制 | 中棘神经元及其转录因子调控 | 神经科学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20335 | 2024-08-08 |
Knowledge structure and emerging trends in the application of deep learning in genetics research: A bibliometric analysis [2000-2021]
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.951939
PMID:36081985
|
综述 | 本文通过文献计量分析，总结了2000年至2021年间深度学习在遗传学研究中的应用知识结构和新兴趋势 | 利用CiteSpace和VOSviewer工具，识别了国家、机构、期刊、共引文献、关键词、主题演变、路径、当前特征和新兴话题 | NA | 总结标准化知识和潜在创新方法，鼓励更多研究 | 深度学习在遗传学研究中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 文献 | 分析了69,806篇参考文献和1,754篇相关论文 |
| 20336 | 2024-08-08 |
Identification of Four Biomarkers of Human Skin Aging by Comprehensive Single Cell Transcriptome, Transcriptome, and Proteomics
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.881051
PMID:36081986
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组、转录组和蛋白质组学方法，鉴定了四种与人类皮肤衰老相关的生物标志物。 | 首次结合蛋白质组学和转录组学数据，鉴定了四种与衰老相关的关键分子，并探讨了它们与衰老相关通路的关联。 | NA | 寻找能够预防衰老的生物标志物，特别是针对皮肤衰老。 | 年轻和衰老的成纤维细胞，以及衰老组织/细胞中的关键衰老相关分子。 | 数字病理学 | 皮肤老化 | Q-Exactive-MS, qPCR, 单细胞转录组 | NA | 转录组, 蛋白质组 | 包括GSE63577, GSE64553, GSE18876, GSE85358等多个数据集 |
| 20337 | 2024-08-08 |
Construction of a prognostic model related to copper dependence in breast cancer by single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.949852
PMID:36082002
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析构建了一个与乳腺癌铜依赖相关的预后模型 | 首次通过单细胞分析获得铜依赖相关基因，并构建了预后模型 | 需要进一步的研究来验证模型的长期效力和在不同人群中的适用性 | 探索铜依赖相关基因在女性乳腺癌中的临床意义 | 女性乳腺癌患者及其铜依赖相关基因 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | COX和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 训练集和测试集各一半，外部验证集包括GSE20685和GSE20711数据集 |
| 20338 | 2024-08-08 |
Enriching and Characterizing T Cell Repertoires from 3' Barcoded Single-Cell Whole Transcriptome Amplification Products
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2712-9_7
PMID:36087201
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研究论文 | 本文介绍了一种从已使用3'条形码单细胞全转录组扩增产物中富集和表征T细胞受体（TCR）转录本的方法 | 该方法能够在不改变原有3'条形码单细胞RNA测序流程的情况下，实现单细胞分辨率的TCR序列捕获 | NA | 旨在简化并扩展单细胞TCR测序数据获取的方法，同时保持单细胞分辨率 | T细胞受体（TCR）转录本 | NA | 癌症 | 3'条形码单细胞RNA测序 | NA | 转录本 | NA |
| 20339 | 2024-08-08 |
A Bioinformatic Framework for Dissecting the Dynamics of T Cells from Single-Cell Transcriptome
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2712-9_14
PMID:36087208
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARTRAC的生物信息学框架，该框架整合单细胞转录组和TCR序列作为谱系特异性标记，用于定量评估T细胞的动态特性 | 提出了一种新的生物信息学框架STARTRAC，该框架能够整合单细胞转录组和TCR序列，以定量评估T细胞的动态特性，包括克隆扩增、组织迁移和发展转变 | 目前的方法在揭示具有相同克隆型的T细胞表型差异方面存在局限性 | 定量追踪人类免疫学中T细胞的动态 | T细胞的动态特性，包括克隆扩增、组织迁移和发展转变 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20340 | 2024-08-08 |
ATAXIC: An Algorithm to Quantify Transcriptomic Perturbation Heterogeneity in Single Cancer Cells
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/4106736
PMID:36090907
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研究论文 | 本文提出了一种名为ATAXIC的算法，用于量化单个癌细胞中转录组扰动的异质性 | ATAXIC算法通过计算单个细胞中绝对z分数基因表达值的标准偏差，量化了转录组扰动的异质性水平 | NA | 研究单个癌细胞中转录组扰动的异质性，并探讨其在肿瘤生物学中的应用 | 单个癌细胞中的转录组扰动异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了八种癌症类型的单细胞RNA测序数据集 |