单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 20321 - 20340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20321 | 2024-08-08 |
Full-Length Spatial Transcriptomics Reveals the Unexplored Isoform Diversity of the Myocardium Post-MI
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.912572
PMID:35937994
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研究论文 | 本文介绍了单细胞纳米孔空间转录组学（scNaST）软件套件，用于分析来自第二代和第三代测序的空间基因表达，生成组织微环境的近单细胞转录组全景图。 | 首次使用scNaST软件套件结合Visium空间平台，成功分析了心肌梗死后小鼠心脏的完整转录组，并识别了未被充分研究的转录本多样性。 | NA | 探索心肌梗死后心肌组织中未被充分研究的转录本多样性。 | 心肌梗死后小鼠心脏的四个短轴切片。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞纳米孔空间转录组学（scNaST） | NA | 转录组数据 | 19,794个转录本 |
| 20322 | 2024-08-08 |
8-Gene signature related to CD8+ T cell infiltration by integrating single-cell and bulk RNA-sequencing in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.938611
PMID:35938006
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，在头颈鳞状细胞癌中建立与CD8+ T细胞浸润相关的8基因分子特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据的整合，识别出与头颈鳞状细胞癌中CD8+ T细胞浸润相关的8基因特征，为免疫治疗提供了新的生物标志物 | NA | 旨在为头颈鳞状细胞癌建立与CD8+ T细胞浸润相关的分子特征，以作为癌症免疫治疗的生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌中的CD8+ T细胞浸润及相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析(WGCNA), LASSO-Cox分析 | NA | RNA测序数据 | 215个差异表达的免疫相关基因，其中45个与头颈鳞状细胞癌的总体生存相关，基于8个基因建立风险模型 |
| 20323 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of CRIP1 Expression in Acute Myeloid Leukemia
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.923568
PMID:35938037
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因表达数据分析了t(8;21)急性髓系白血病患者的免疫和调控网络，并验证了CRIP1表达与甲基化状态的关系 | 首次全面分析了CRIP1在急性髓系白血病中的表达及其对免疫相关通路的影响 | 研究仅限于t(8;21)急性髓系白血病患者，可能不适用于所有AML患者 | 探讨CRIP1在急性髓系白血病中的表达调控及其对治疗策略的影响 | 急性髓系白血病患者的CRIP1表达及其免疫调控网络 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立队列，分别来自GSE37642和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据集 |
| 20324 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals male germ cells and Sertoli cells developmental patterns in dairy goats
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.944325
PMID:35938151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了奶山羊中雄性生殖细胞和Sertoli细胞的发育模式 | 首次系统地研究了奶山羊中雄性生殖细胞和Sertoli细胞的发育模式，并识别了与关键发育事件相关的基因 | NA | 旨在识别与奶山羊雄性生殖细胞和Sertoli细胞关键发育事件相关的基因 | 奶山羊的雄性生殖细胞和Sertoli细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 25,373个细胞来自45天（青春期前）、90天（青春期）和180天（青春期后）的奶山羊睾丸 |
| 20325 | 2024-08-08 |
Reconstruction of the Global Polarity of an Early Spider Embryo by Single-Cell and Single-Nucleus Transcriptome Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.933220
PMID:35938158
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研究论文 | 本文通过单细胞和单核转录组分析，重建了早期蜘蛛胚胎的全球极性 | 应用单细胞RNA测序技术，成功检测到与胚层和一些瞬态细胞状态相对应的3种细胞群体，并展示了这些数据资源在全基因组范围内搜索空间调控表达基因的应用潜力 | 文中未明确提及具体限制 | 研究早期蜘蛛胚胎中基于极性的细胞状态多样性的生成和发展 | 早期蜘蛛胚胎的细胞极性和细胞状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约2000个细胞 |
| 20326 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Proliferative Phase Endometrium: Systems Analysis of Cell-Cell Communication Network Using CellChat
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.919731
PMID:35938159
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析人类增殖期子宫内膜细胞间的相互作用网络 | 首次详细描绘了增殖期子宫内膜细胞间的相互作用网络，并验证了与子宫内膜生长高度相关的信号通路 | NA | 深入理解子宫内膜细胞间的通信机制 | 人类增殖期子宫内膜细胞及其相互作用 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | CellChat | 转录组 | 33,240个初级子宫内膜细胞 |
| 20327 | 2024-08-08 |
A single cell survey of the microbial impacts on the mouse small intestinal epithelium
2022 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2022.2108281
PMID:35939622
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了无菌和特定病原体无菌小鼠的小肠上皮细胞，以研究微生物与上皮细胞之间的相互作用。 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了微生物对小肠上皮细胞的转录和细胞影响，特别是微生物如何通过调节代谢基因表达和mTOR信号通路来影响上皮细胞。 | 研究仅限于无菌和特定病原体无菌小鼠模型，可能无法完全代表所有微生物对小肠上皮细胞的影响。 | 探讨微生物与小肠上皮细胞之间的动态关系及其对生理炎症和耐受性的影响。 | 小肠上皮细胞及其与肠道微生物的相互作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无菌和特定病原体无菌小鼠的小肠上皮细胞 |
| 20328 | 2024-08-08 |
Preparation of acute midbrain slices containing the superior colliculus and periaqueductal Gray for patch-clamp recordings
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0271832
PMID:35951507
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研究论文 | 本文提供了一种实用的指南，用于制备包含上丘和导水管周围灰质的年轻成年小鼠中脑冠状切片，以进行电生理实验 | 介绍了两种不同的溶液及其各自的孵育策略，以及两种脑提取的替代程序 | NA | 研究中脑神经元的电生理特性 | 年轻成年小鼠的中脑切片 | NA | NA | 膜片钳记录 | NA | 切片 | 野生型小鼠以及经过基因修饰或病毒转染的小鼠 |
| 20329 | 2024-08-05 |
A Bayesian multivariate mixture model for high throughput spatial transcriptomics
2023-09, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13727
PMID:35895854
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研究论文 | 本文开发了一种基于贝叶斯的多变量有限混合模型SPRUCE，以识别高通量空间转录组数据中的细胞亚群 | 提出了利用多变量偏态正态分布的贝叶斯空间多变量有限混合模型，并结合了Pólya-Gamma数据增强和空间随机效应 | 依赖于模拟研究来证明忽视偏斜性或空间相关性在HST数据中的推断效应 | 识别组织样本中细胞的亚群以支持生物研究 | 高通量空间转录组数据中的细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 高通量空间转录组技术 | 多变量有限混合模型 | 基因表达数据 | 使用公开的人脑和乳腺癌HST数据集 |
| 20330 | 2024-08-08 |
Cross-platform analysis reveals cellular and molecular landscape of glioblastoma invasion
2023-03-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac186
PMID:35901838
|
研究论文 | 本研究通过综合分析组织学和单细胞RNA测序数据，揭示了胶质母细胞瘤侵袭的细胞和分子景观 | 发现了CRYAB和CD44在侵袭性胶质母细胞瘤中的高度共表达，并证实了它们对肿瘤侵袭性的贡献 | NA | 改善胶质母细胞瘤的治疗，特别是针对肿瘤侵袭性这一疾病特征 | 胶质母细胞瘤的侵袭性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织学样本和RNA测序数据 | 10名胶质母细胞瘤患者 |
| 20331 | 2024-08-05 |
Integration of Computational Analysis and Spatial Transcriptomics in Single-cell Studies
2023-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.06.006
PMID:35901961
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review | 本文回顾了单细胞转录组学和空间转录组学的技术特点以及计算数据分析的核心概念 | 强调了数据整合方法的应用挑战和研究结果的生物学背景解读 | 缺乏针对具体细胞类型或疾病的详细实例分析 | 探讨单细胞转录组学和空间转录组学在健康和疾病中的基本生物学问题 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 20332 | 2024-08-08 |
A Fc-VEGF chimeric fusion enhances PD-L1 immunotherapy via inducing immune reprogramming and infiltration in the immunosuppressive tumor microenvironment
2023-Feb, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03255-9
PMID:35895109
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研究论文 | 本文研究了Fc-VEGF嵌合抗体药物通过诱导免疫重编程和浸润来增强PD-L1免疫疗法在免疫抑制性肿瘤微环境中的效果 | Fc-VEGF嵌合抗体药物通过血管正常化和肿瘤微环境重编程，增强了免疫细胞的浸润，并抑制了M2巨噬细胞的分化和血管生成相关因子的分泌 | NA | 探索Fc-VEGF嵌合抗体药物如何通过血管正常化和肿瘤微环境重编程来增强免疫疗法的效果 | Fc-VEGF嵌合抗体药物在肿瘤微环境中的作用机制及其对免疫细胞浸润的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20333 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of peripheral CD8+ T cell responses in patients receiving checkpoint blockade immunotherapy for cancer
2023-Feb, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03263-9
PMID:35907015
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合T细胞受体测序技术，分析了接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中CD8+ T细胞的反应 | 首次详细描述了免疫检查点抑制剂治疗前后，患者外周血中CD8+ T细胞的转录组变化，并发现这些变化与患者的生存期相关 | 研究样本量较小，且结果在更大规模患者群体中的预测能力有待验证 | 探讨免疫检查点抑制剂治疗对癌症患者外周血中CD8+ T细胞反应的影响及其与临床疗效的关系 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53名癌症患者 |
| 20334 | 2024-08-08 |
Granulocytic myeloid-derived suppressor cells to prevent and treat murine immune-mediated bone marrow failure
2023-01-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007254
PMID:35895513
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研究论文 | 研究粒细胞样髓源性抑制细胞（G-MDSCs）在预防和治疗小鼠免疫介导的骨髓衰竭中的作用 | 首次探讨了G-MDSCs在免疫性再生障碍性贫血（AA）中的作用，并展示了其在MHC匹配的小鼠模型中的治疗效果 | 研究结果显示G-MDSCs的治疗效果依赖于免疫背景，MHC不匹配的模型中效果不佳 | 探讨G-MDSCs在免疫介导的骨髓衰竭中的作用及其治疗潜力 | 粒细胞样髓源性抑制细胞（G-MDSCs）在免疫性再生障碍性贫血（AA）和骨髓衰竭（BMF）小鼠模型中的作用 | 免疫学 | 骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了MHC匹配的C.B10 BMF小鼠和MHC不匹配的CByB6F1 AA模型小鼠 |
| 20335 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in the context of neuropathic pain: progress, challenges, and prospects
2023-01, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2022.07.004
PMID:35902034
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经病理性疼痛研究中的应用、挑战和前景 | scRNA-seq技术能够无偏差、高通量和高分辨率地分析与神经病理性疼痛相关的细胞转录组，有助于深入理解疼痛机制并实现个性化疼痛管理 | scRNA-seq在神经病理性疼痛领域的应用相对较新，且主要基于动物模型，需要更多关注转化医学研究 | 探索神经病理性疼痛的机制，以改善临床上对疼痛的诊断、治疗和管理 | 神经病理性疼痛及其相关细胞的转录组 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 20336 | 2024-08-08 |
Clonal germinal center B cells function as a niche for T-cell lymphoma
2022-11-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015451
PMID:35921527
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研究论文 | 研究使用小鼠模型和人类样本，探讨了TET2突变免疫细胞如何促进血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的发展 | 首次揭示了TET2突变免疫细胞作为AITL发展的生态位，并通过单细胞RNA测序和计算机网络分析，识别了CD40-CD40LG轴在GCB细胞和肿瘤细胞集群交互中的潜在作用 | NA | 探究TET2突变免疫细胞在AITL发展中的机制 | 小鼠模型和人类AITL样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 超过50,000个细胞 |
| 20337 | 2024-08-08 |
Analyzing the gene regulatory network in hepatitis B patients by single-cell ATAC sequencing
2022-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-022-06310-z
PMID:35902485
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC测序分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，以揭示其病理生理机制 | 首次使用单细胞ATAC测序技术分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，为理解疾病发展提供了新的视角 | NA | 旨在通过分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，揭示其病理生理机制 | 慢性乙型肝炎患者的基因调控网络 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 8016个细胞 |
| 20338 | 2024-08-08 |
The scINSIGHT Package for Integrating Single-Cell RNA-Seq Data from Different Biological Conditions
2022-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0244
PMID:35920848
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研究论文 | 介绍了一种名为scINSIGHT的新型单细胞RNA测序数据整合方法及其R包的使用 | scINSIGHT基于一种新颖的非负矩阵分解模型，能够学习不同生物或实验条件下样本中的共同和条件特异性基因模块 | NA | 改进多单细胞样本的整合，识别细胞身份和不同细胞类型或条件下的活跃生物过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个单细胞样本 |
| 20339 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Dynamic Cardiac Transition Program from ADCs Induced by Leukemia Inhibitory Factor
2022-10-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac048
PMID:35896368
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了白血病抑制因子（LIF）诱导的脂肪来源细胞（ADCs）向心肌细胞转变过程中的细胞异质性和动态变化 | 本研究首次揭示了ADCs在LIF诱导下进入心肌生成程序时的不同亚群反应，以及ADCs向心肌细胞转变的时间依赖性和Nrf2信号通路的瞬时变化 | NA | 探索ADCs的异质性和LIF诱导的ADCs向心肌细胞转变的细胞动力学 | 脂肪来源细胞（ADCs）及其在LIF诱导下的心肌细胞转变过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 39,432个单细胞 |
| 20340 | 2024-08-08 |
Cluster-independent marker feature identification from single-cell omics data using SEMITONES
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac639
PMID:35909238
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEMITONES的方法，用于从单细胞组学数据中进行无聚类标记特征识别 | SEMITONES是一种无聚类标记识别方法，不依赖细胞的聚类分配，适用于发育数据等复杂情况 | NA | 开发一种无需细胞聚类的新方法，用于从单细胞组学数据中识别细胞身份标记 | 人类造血系统的单细胞数据以及空间转录组数据 | 单细胞组学 | NA | SEMITONES | NA | 单细胞数据 | 使用了多个模拟和精选的数据集进行验证 |