单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 20321 - 20340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20321 | 2024-08-04 |
A comparative atlas of single-cell chromatin accessibility in the human brain
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf7044
PMID:37824643
|
研究论文 | 本文探讨了人脑中单细胞的染色质可及性及其对神经精神障碍的影响 | 通过snATAC-seq技术，揭示了107种不同细胞类型及其在基因组中使用的候选顺式调控DNA元素 | 研究仅限于三名成年人的样本，可能影响结果的普遍性 | 研究人脑中细胞身份和功能的调控程序 | 分析来自三名成人的42个脑区的111万个细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | snATAC-seq | 深度学习模型 | 细胞数据 | 3名成年人的42个脑区，合计111万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20322 | 2024-08-07 |
Protein arginine N-methyltransferase 4 (PRMT4) contributes to lymphopenia in experimental sepsis
2023-04, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thoraxjnl-2021-217526
PMID:35354645
|
研究论文 | 本文研究了蛋白质精氨酸N-甲基转移酶4（PRMT4）在实验性脓毒症中对淋巴细胞减少的作用 | 发现了PRMT4在脓毒症患者和实验模型中系统性升高，并揭示了其在淋巴细胞凋亡中的关键作用 | NA | 探讨PRMT4在脓毒症中对淋巴细胞减少的影响及其机制 | PRMT4在脓毒症患者和实验模型中的表达及其对淋巴细胞和单核细胞的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及脓毒症患者的人体样本以及细胞和动物脓毒症模型 | NA | NA | NA | NA |
| 20323 | 2024-08-04 |
LINE-1 retrotransposon expression in cancerous, epithelial and neuronal cells revealed by 5' single-cell RNA-Seq
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad049
PMID:36744437
|
研究论文 | 本研究开发了一种新方法以测量癌细胞、上皮细胞和神经细胞中LINE-1逆转录子表达 | 提出了5' scL1seq方法，能够在成千上万的单细胞中测量LINE-1的表达，并发现了人类上皮细胞和小鼠海马神经元中的LINE-1表达 | 缺乏对LINE-1在健康与疾病中作用的全面理解 | 准确理解LINE-1在不同细胞中的表达及其与衰老相关疾病的联系 | 癌细胞、上皮细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 5'单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 成千上万的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20324 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境，揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用，扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20325 | 2024-08-07 |
An interactive single cell web portal identifies gene and cell networks in COVID-19 host responses
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103115
PMID:34522848
|
研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据，开发了一个交互式单细胞网络门户ToppCell，用于探索和比较细胞特征，以发现新的基因和细胞网络。 | 本文创新性地开发了一个交互式网络门户ToppCell，允许用户探索和比较不同条件下的单细胞转录组数据，从而发现新的基因和细胞网络。 | NA | 开发一个数据挖掘工具，使用户能够比较和探索细胞特征，以获得洞察并发展新的假设。 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 基因表达数据 | 多个COVID-19和其他对照条件的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20326 | 2024-08-07 |
Single-dose intranasal vaccination elicits systemic and mucosal immunity against SARS-CoV-2
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103037
PMID:34462731
|
研究论文 | 本文报道了一种鼻内单剂次亚单位疫苗的开发，该疫苗使用冻干刺突蛋白和脂质体STING激动剂作为佐剂，能够诱导系统性中和抗体、肺和鼻腔中的IgA以及肺部T细胞反应。 | 该疫苗能够在鼻相关淋巴组织中以类似生发中心的方式协调激活T/B细胞反应，确认其作为诱导持久免疫的诱导位点的作用。 | NA | 验证针对SARS-CoV-2的疫苗平台的更广泛应用。 | SARS-CoV-2病毒的免疫反应。 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 20327 | 2024-08-07 |
Sample processing and single cell RNA-sequencing of peripheral blood immune cells from COVID-19 patients
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100582
PMID:34002169
|
研究论文 | 本文描述了从COVID-19患者的外周血单核细胞（PBMCs）中进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）的样本处理和分析协议 | 提出了针对COVID-19患者PBMCs样本的采集、处理和分析的新方法 | 血液样本可能含有传染性病毒，免疫细胞亚型的识别可能困难，分析结果的生物学解释复杂 | 深入评估COVID-19患者免疫细胞的转录变化 | COVID-19患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20328 | 2024-08-07 |
Dynamics of B cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in patients with different severities of COVID-19
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109173
PMID:33991510
|
研究论文 | 研究分析了不同严重程度的COVID-19患者B细胞受体（BCR）库的动态变化及交叉反应性反应的出现 | 首次详细描述了COVID-19患者BCR库的特征，并识别出与疾病严重程度相关的差异性BCR特征 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者BCR库的特征及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的B细胞受体库 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20329 | 2024-08-07 |
Divergent and self-reactive immune responses in the CNS of COVID-19 patients with neurological symptoms
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100288
PMID:33969321
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞因子分析，探讨了COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的免疫反应机制 | 发现了COVID-19患者中枢神经系统中特定区域的T细胞和B细胞活化，以及与自体免疫相关的抗体反应 | NA | 揭示COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的生物学基础 | COVID-19患者的脑脊液和血液 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20330 | 2024-08-07 |
Systems biological assessment of human immunity to BNT162b2 mRNA vaccination
2021-Apr-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-438662/v1
PMID:34013244
|
研究论文 | 本研究采用系统生物学方法，全面分析了56名健康志愿者接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗后的先天和适应性免疫反应 | 首次详细描述了mRNA疫苗接种后免疫系统的反应，包括中和抗体的产生和免疫细胞的激活 | 研究样本仅限于56名健康志愿者，可能无法完全代表所有人群的免疫反应 | 探讨mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫反应 | 56名接种了辉瑞-BioNTech mRNA疫苗的健康志愿者的免疫反应 | 疫苗学 | COVID-19 | 系统生物学方法 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 56名健康志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 20331 | 2024-08-07 |
Multi-cohort analysis of host immune response identifies conserved protective and detrimental modules associated with severity across viruses
2021-04-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.03.002
PMID:33765435
|
研究论文 | 本研究通过分析多个队列中宿主免疫反应，识别出与病毒感染严重程度相关的保守保护性和有害模块 | 本研究首次整合了大量血液转录组和单细胞RNA测序数据，揭示了不同病毒感染下宿主反应的共性和差异 | 研究主要集中在血液样本，可能无法全面反映所有组织中的宿主反应 | 探索不同病毒感染下宿主免疫反应与疾病严重程度的关系 | 16种病毒感染的患者血液转录组和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4,780个血液转录组样本和702,970个免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20332 | 2024-08-07 |
Dynamics of B-cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in COVID-19 patients with different disease severity
2021-Apr-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.07.13.20153114
PMID:32699862
|
研究论文 | 本文通过高通量测序技术研究了COVID-19患者在感染期间B细胞受体（BCR）库的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | 首次详细描述了COVID-19患者中B细胞反应的特征，并发现了对SARS-CoV-1和SARS-CoV-2具有交叉反应性的BCR | 研究样本量较小，仅涉及19名患者 | 探究COVID-19患者B细胞库的动态变化及其与疾病严重程度的关联 | COVID-19患者的B细胞库及其对SARS-CoV-2的反应 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20333 | 2024-08-07 |
Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19
2021-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.02.20.431155
PMID:33619488
|
研究论文 | 研究分析了35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者的鼻咽样本，通过单细胞RNA测序揭示了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化及其对病毒病理的影响。 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化过程，并揭示了细胞类型多样性和异质性对病毒复制的影响。 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的疾病状态和年龄组，可能影响结果的普遍性。 | 探讨SARS-CoV-2感染对上呼吸道上皮细胞的影响及其在COVID-19严重程度中的作用。 | COVID-19患者的鼻咽样本和非COVID-19患者的鼻咽样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20334 | 2024-08-07 |
Diversified transcriptional responses of myeloid and glial cells in spinal cord injury shaped by HDAC3 activity
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd8811
PMID:33637528
|
research paper | 本研究结合骨髓特异性转录组学和单细胞RNA测序，揭示了脊髓损伤后激活的微胶质细胞和巨噬细胞的共同核心及时间上独特的基因程序 | 发现了脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的多样化转录反应，并揭示了HDAC3在这些过程中的广泛影响 | NA | 探究脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的转录反应及HDAC3的作用 | 脊髓损伤后的微胶质细胞和巨噬细胞 | digital pathology | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20335 | 2024-08-07 |
Targeted Single-Cell RNA and DNA Sequencing With Fluorescence-Activated Droplet Merger
2020-11-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03059
PMID:33049138
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光激活液滴合并技术进行靶向单细胞RNA和DNA测序的新方法 | 该方法通过选择性地合并细胞与试剂，实现酶促反应，无需物理隔离细胞，简化了单细胞工作流程 | NA | 旨在解决在分析异质性细胞群时，稀有细胞类型数据代表性不足的问题 | 特定细胞亚群的单细胞转录组和基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和DNA测序 | NA | RNA和DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20336 | 2024-08-07 |
m6A RNA methylation impacts fate choices during skin morphogenesis
2020-08-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.56980
PMID:32845239
|
研究论文 | 研究m6A RNA甲基化在皮肤形态发生中的作用及其对细胞命运选择的影响 | 揭示了m6A修饰在编码序列中与增强翻译的相关性，特别是在关键形态发生信号通路中的作用 | NA | 探讨m6A RNA甲基化的功能及其在皮肤胚胎发生中的生理重要性 | 小鼠皮肤胚胎发生过程中的m6A RNA甲基化 | NA | NA | 单细胞转录组学和生物信息学 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20337 | 2024-08-07 |
Self-Reporting Transposons Enable Simultaneous Readout of Gene Expression and Transcription Factor Binding in Single Cells
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.037
PMID:32710817
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞呼叫卡（scCC）的新技术，利用自报告转座子（SRTs）在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点（TFBS） | 首次实现了在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点，为研究细胞异质性和转录因子生物学提供了新方法 | NA | 开发一种新技术，能够在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点 | 单细胞中的基因表达和转录因子结合位点 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA | 多个转录因子和K562细胞，以及小鼠大脑皮层的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20338 | 2024-08-04 |
Increased heterogeneity in expression of genes associated with cancer progression and drug resistance
2024-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101879
PMID:38262110
|
研究论文 | 本文探讨了与癌症进展及药物耐受性相关的基因表达噪声的增加。 | 通过单细胞RNA测序数据，识别出37个在肺腺癌患者癌症进展过程中表现出表达噪声增加趋势的基因，揭示了线粒体在异质性生成中的重要作用。 | 该研究对实际癌症患者的表达噪声变化的探讨仍然不足，具体机制尚需进一步研究。 | 分析癌症进展过程中基因表达噪声的变化，以揭示肿瘤内部异质性的生成机制。 | 研究对象为不同阶段的肺腺癌患者的基因表达噪声。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同阶段的肺腺癌患者的单细胞 RNA 数据 | NA | NA | NA | NA |
| 20339 | 2024-08-07 |
The role of tertiary lymphoid structure and B cells in nasopharyngeal carcinoma: Based on bioinformatics and experimental verification
2024-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101885
PMID:38295746
|
研究论文 | 本研究探讨了鼻咽癌中三级淋巴结构（TLS）和浸润B细胞的转录组特征及预后作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了鼻咽癌中不同B细胞亚群的转录特征，并验证了B细胞和TLS作为鼻咽癌患者生存预后标志物的可能性 | NA | 探究鼻咽癌中浸润B细胞和TLS的转录组特征及其临床相关性 | 鼻咽癌患者的转录组数据和临床样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 88名鼻咽癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20340 | 2024-08-07 |
Newcastle disease virus infection remodels plasma phospholipid metabolism in chickens
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108962
PMID:38322989
|
研究论文 | 本文研究了新城疫病毒感染对鸡血浆磷脂代谢网络的影响 | 首次揭示了新城疫病毒感染如何重塑鸡血浆磷脂代谢网络 | NA | 探讨新城疫病毒感染对鸡血浆代谢网络的影响 | 鸡血浆磷脂代谢网络及肺组织细胞 | NA | 新城疫 | 代谢组学和脂质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 代谢数据，RNA序列数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |