单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 20241 - 20260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20241 | 2024-08-08 |
Live-seq enables temporal transcriptomic recording of single cells
2022-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05046-9
PMID:35978187
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Live-seq的单细胞转录组分析方法，该方法在RNA提取过程中保持细胞活性，从而能够将细胞的基础转录组与其后续的分子或表型行为相结合。 | Live-seq的创新之处在于它能够在不破坏细胞的情况下进行单细胞转录组分析，使得可以对同一细胞进行后续的分子或功能分析。 | NA | 开发一种新的单细胞转录组分析方法，以实现对细胞动态变化的实时记录。 | 单细胞转录组分析技术及其在细胞类型和状态分类中的应用。 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个单细胞样本，包括巨噬细胞和脂肪间充质细胞 |
| 20242 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals clonally expanded tumor-associated CD57+ CD8 T cells are enriched in the periphery of patients with metastatic urothelial cancer responding to PD-L1 blockade
2022-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004759
PMID:35981786
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了在响应PD-L1阻断的转移性尿路上皮癌患者中，克隆扩增的肿瘤相关CD57+ CD8 T细胞在外周血中富集 | 首次在转移性尿路上皮癌患者中研究了新抗原特异性CD8 T细胞的表型，并发现CD57+ CD8 T细胞的高频率与对atezolizumab的响应相关 | 研究样本量相对较小，需要在更大规模的研究中验证这些发现 | 探究转移性尿路上皮癌患者中新抗原特异性CD8 T细胞的表型，并寻找atezolizumab治疗的预测生物标志物 | 转移性尿路上皮癌患者的外周CD8 T细胞 | 免疫学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CITE-seq，T细胞受体（TCR）测序 | NA | 细胞 | 20名转移性尿路上皮癌患者，30名接受atezolizumab治疗的患者，40名接受化疗的患者，16名进行单细胞分析的患者 |
| 20243 | 2024-08-08 |
Transcriptomes of Injured Lamprey Axon Tips: Single-Cell RNA-Seq Suggests Differential Involvement of MAPK Signaling Pathways in Axon Retraction and Regeneration after Spinal Cord Injury
2022-07-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11152320
PMID:35954164
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了脊椎损伤后七鳃鳗轴突尖端的转录组，探讨了MAPK信号通路在轴突回缩和再生中的差异性作用。 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析脊椎损伤后七鳃鳗轴突尖端的转录组，揭示了MAPK信号通路在轴突再生和回缩中的差异性作用。 | 研究仅限于七鳃鳗的轴突尖端，且样本量相对较小，可能限制了结果的普遍性和广泛应用。 | 探讨脊椎损伤后轴突再生和回缩过程中MAPK信号通路的差异性作用。 | 七鳃鳗脊椎损伤后的轴突尖端。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共采集了24个轴突尖端样本，包括10个生长中的、9个静止的和5个回缩的轴突尖端。 |
| 20244 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of transcription factor regulatory networks reveals molecular basis for subtype-specific dysregulation in acute myeloid leukemia
2022-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000113
PMID:35957668
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据，全面绘制了急性髓系白血病（AML）亚型中与恶性相关的转录因子（TF）激活网络，揭示了亚型特异性失调的分子基础。 | 首次在单细胞分辨率下阐明了AML亚型中的转录因子调控网络，并揭示了亚型特异性失调的分子机制。 | NA | 揭示急性髓系白血病亚型特异性失调的分子基础，并为AML的发病机制和潜在的诊断与治疗靶点提供新的视角。 | 急性髓系白血病（AML）及其亚型的转录因子调控网络。 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自AML患者和健康捐赠者的单细胞RNA测序数据 |
| 20245 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell-type-specific diversification in human heart failure
2022-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00028-6
PMID:35959412
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核RNA测序数据的整合分析，揭示了健康和心衰患者心脏的细胞组成及其转录特征 | 首次定义了健康和心衰患者心脏的细胞组成，并识别了与年龄和心衰相关的细胞特异性转录特征 | NA | 研究心衰患者心脏的细胞和转录组景观 | 健康和心衰患者的心脏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27名健康捐赠者和18名扩张型心肌病患者 |
| 20246 | 2024-08-08 |
Advances in application of single-cell RNA sequencing in cardiovascular research
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.905151
PMID:35958408
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的应用及其最新进展 | 单细胞RNA测序技术为心血管系统的发育轨迹、表型转变和细胞互作提供了新的见解 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心血管研究领域的应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在心血管系统研究中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20247 | 2024-08-08 |
Identification of hub biomarkers of myocardial infarction by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.939972
PMID:35958412
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序、生物信息学和机器学习方法，识别心肌梗死的关键生物标志物 | 首次综合运用单细胞测序、生物信息学和机器学习三种方法研究心肌梗死中mRNA的作用 | 研究仅使用了四个RNA微阵列数据集，可能需要更多数据集以增强结果的普遍性 | 筛选心肌梗死中mRNA的表达，探究其功能，并为心肌梗死的诊断提供科学依据 | 心肌梗死中的mRNA表达及其在炎症反应中的作用 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序(SCS) | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 四个RNA微阵列数据集，包括GSE66360, GSE97320, GSE60993, 和 GSE48060 |
| 20248 | 2024-08-08 |
Defining Patient-Level Molecular Heterogeneity in Psoriasis Vulgaris Based on Single-Cell Transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.842651
PMID:35958578
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了寻常型银屑病患者层面的分子异质性 | 通过单细胞RNA测序技术，提高了对复杂组织如皮肤中分子异质性的分辨率 | NA | 确定人类疾病背后的遗传变异，为治疗开发建立目标，并帮助为个体患者定制治疗方案 | 寻常型银屑病患者的分子异质性 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从活动性病变中分离的CD45细胞 |
| 20249 | 2024-08-08 |
Ednrb -/- mice with hirschsprung disease are missing Gad2-expressing enteric neurons in the ganglionated small intestine
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.917243
PMID:35959491
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫染色，探讨了Ednrb-/-小鼠小肠中表达Gad2的神经元缺失情况及其对胃肠道功能的影响 | 首次发现Hirschsprung病小肠神经节区域中存在神经亚群的缺失，这可能解释了手术矫正后持续的胃肠道功能障碍 | NA | 探究Ednrb-/-小鼠小肠神经节区域中神经系统的异常是否导致胃肠道功能异常 | Ednrb-/-小鼠的小肠神经节细胞 | NA | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | Ednrb-/-小鼠及其野生型同窝小鼠的小肠神经节细胞 |
| 20250 | 2024-08-08 |
The Role of NR4A1 in the Pathophysiology of Osteosarcoma: A Comprehensive Bioinformatics Analysis of the Single-Cell RNA Sequencing Dataset
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.879288
PMID:35965537
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析单细胞RNA测序数据集，探讨了核受体NR4A1在骨肉瘤病理生理学中的潜在作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了NR4A1在不同类型骨肉瘤中的表达差异及其与患者生存率的关联 | 研究结果需要进一步的验证研究来确认 | 旨在进一步理解骨肉瘤组织的单细胞RNA测序数据，并探索核受体相关基因在骨肉瘤病理生理学中的作用 | 骨肉瘤组织及其核受体NR4A1的表达 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 分析了骨肉瘤组织的单细胞RNA测序数据集GSE152048，识别了11种细胞类型 |
| 20251 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals the regulative roles of cancer associated fibroblasts in tumor immune microenvironment of recurrent osteosarcoma
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.73714
PMID:35966586
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术探索复发性骨肉瘤的肿瘤微环境，特别是癌相关成纤维细胞的调控作用 | 首次揭示了癌相关成纤维细胞通过LOX调控骨肉瘤的EMT过程，为治疗复发性骨肉瘤提供了新的靶点 | 实验部分未详细描述验证相关细胞和标记物功能的实验方法 | 探究骨肉瘤的肿瘤微环境和基因表达模式，寻找有效的抗肿瘤策略 | 骨肉瘤的原发和复发组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE152048和GSE162454数据集中的样本 |
| 20252 | 2024-08-08 |
MAP4K3/GLK inhibits Treg differentiation by direct phosphorylating IKKβ and inducing IKKβ-mediated FoxO1 nuclear export and Foxp3 downregulation
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72148
PMID:35966593
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研究论文 | 本文研究了MAP4K3/GLK通过直接磷酸化IKKβ并诱导IKKβ介导的FoxO1核外排和Foxp3下调来抑制Treg分化的机制 | 发现GLK信号通过直接磷酸化并激活IKKβ，进而诱导FoxO1的磷酸化和核外排，导致Foxp3下调，从而抑制Treg分化 | NA | 探究GLK和IKKβ在Treg分化和功能中的作用及其机制 | Treg分化和功能 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用T细胞特异性GLK转基因小鼠和IKKβ条件性敲除小鼠进行研究 |
| 20253 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals changes in immune landscape in post-traumatic osteoarthritis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.938075
PMID:35967299
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了前交叉韧带断裂后小鼠膝关节中免疫细胞的动态变化 | 首次详细描述了前交叉韧带断裂后膝关节中多种免疫细胞类型及其亚型的转录组特征，特别是巨噬细胞和单核细胞的显著变化 | NA | 旨在理解创伤后骨关节炎中免疫细胞在关节退化或修复中的作用，以改进治疗策略 | 小鼠膝关节中的免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种免疫细胞类型及其亚型 |
| 20254 | 2024-08-08 |
A Study on the Radiosensitivity of Radiation-Induced Lung Injury at the Acute Phase Based on Single-Cell Transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.941976
PMID:35967301
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学探讨了放射性诱导肺损伤在急性期的辐射敏感性及其细胞微环境变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了急性期放射性诱导肺损伤中不同细胞类型的异质性和辐射敏感性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证结果 | 探讨放射性诱导肺损伤在急性期的细胞微环境变化及其对不同细胞类型的影响 | 放射性诱导肺损伤中的细胞类型及其在急性期的辐射敏感性 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18,500个单细胞转录本，涉及10种主要细胞类型 |
| 20255 | 2024-08-08 |
Monocyte biology conserved across species: Functional insights from cattle
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.889175
PMID:35967310
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研究论文 | 本文深入分析了牛单核细胞在稳态下的批量和单细胞转录组，揭示了它们的功能特化和转录相关性 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了先前未被重视的cM内部异质性，并提出intM作为cM和ncM之间的瞬态分化中间体 | NA | 探讨不同类型单核细胞的功能特化和转录相关性 | 牛的单核细胞，包括经典型、中间型和非经典型单核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20256 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive landscape in hepatocellular carcinoma revealed by single-cell sequencing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950536
PMID:35967424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了肝细胞癌（HCC）的肿瘤免疫微环境（TIME），揭示了主要免疫细胞类型的分布及其潜在机制。 | 发现了调节性T细胞（Treg）在HCC的TIME中的特异性分布，以及多个免疫检查点的过度表达和糖酵解/糖异生途径的富集。 | NA | 研究肝细胞癌的肿瘤免疫微环境，探索免疫细胞的异质性及其在形成免疫抑制环境中的潜在机制。 | 肝细胞癌的肿瘤免疫微环境中的主要免疫细胞类型。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和组织测序数据 | NA |
| 20257 | 2024-08-08 |
A robust experimental and computational analysis framework at multiple resolutions, modalities and coverages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.911873
PMID:35967449
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研究论文 | 本文构建并评估了一个集成的实验框架和分析流程，用于在全肿瘤切片水平上发现和验证潜在的配体-受体相互作用，无需组织解离 | 开发了STRISH计算方法，能够自动扫描整个组织切片，重现细胞间相互作用的全景 | 空间转录组学仍存在低表达配体-受体相互作用的误检问题，但减少了误发现 | 研究癌症免疫细胞间的通信，以促进癌症免疫治疗的发展 | 基底细胞癌和鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA原位杂交、Opal Polaris多重蛋白染色 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据 | 涉及两种癌症类型，占所有癌症病例的70%以上 |
| 20258 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Epithelial Cell Marker Genes in Predicting the Prognosis of Colorectal Cancer Patients
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/8347125
PMID:35968507
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了上皮细胞相关生物标志物在结直肠癌（CRC）中的预后价值 | 本研究首次基于单细胞RNA测序数据，构建了一个基于上皮细胞标记基因的风险评估模型，用于预测结直肠癌患者的预后 | 研究样本量较小，仅使用了四个CRC样本的数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨上皮细胞标记基因在结直肠癌预后预测中的作用 | 结直肠癌患者的预后 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox比例风险模型 | 转录组数据 | 四个CRC样本 |
| 20259 | 2024-08-08 |
Identification of Human Retinal Organoid Cell Differentiation-Related Genes via Single-Cell Sequencing Data Analysis
2022, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2022/9717599
PMID:35979045
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，识别了与人类视网膜类器官细胞分化相关的基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术识别了220个与视网膜类器官细胞分化相关的基因，并分析了这些基因在视网膜发育和视觉感知中的作用 | 本研究主要依赖于公共数据库中的单细胞RNA测序数据，可能存在样本量和数据质量的限制 | 研究人类视网膜的发育过程，识别与视网膜类器官细胞分化相关的基因 | 人类视网膜类器官的细胞分化过程及相关基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类视网膜类器官的单细胞RNA测序数据 |
| 20260 | 2024-08-08 |
A Pan-Cancer Analysis Reveals CLEC5A as a Biomarker for Cancer Immunity and Prognosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.831542
PMID:35979347
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA、GTEx等多个数据库的数据，探讨CLEC5A在多种癌症中的表达及其与免疫浸润和患者预后的关系 | 首次揭示CLEC5A在多种癌症中的表达与免疫浸润和患者预后的关联，并发现其作为潜在的癌症预后生物标志物和抗肿瘤治疗靶点 | NA | 探讨CLEC5A在癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | CLEC5A在多种癌症中的表达及其与免疫浸润、患者预后的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的样本 |