单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 20201 - 20220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20201 | 2024-08-08 |
Highly sensitive single-cell chromatin accessibility assay and transcriptome coassay with METATAC
2022-10-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2206450119
PMID:36161934
|
研究论文 | 本文介绍了一种高灵敏度的单细胞染色质可及性检测方法METATAC及其与转录组共检测技术 | METATAC方法能够检测大量单细胞中的可及位点，并与自动化兼容，同时与高灵敏度单细胞RNA测序方法MALBAC-DT结合，开发了联合ATAC-RNA检测技术M2C-seq | NA | 提高单细胞染色质可及性和转录组检测的灵敏度和效率 | 单细胞染色质可及性和基因表达的关系 | 单细胞组学 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞, 早期小鼠胚胎细胞 |
| 20202 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq analysis identifies ferroptotic chondrocyte cluster and reveals TRPV1 as an anti-ferroptotic target in osteoarthritis
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104258
PMID:36137413
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别出铁死亡性软骨细胞簇，并揭示TRPV1作为抗铁死亡靶点在骨关节炎中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析识别出骨关节炎中铁死亡性软骨细胞簇，并发现TRPV1作为抗铁死亡的新靶点 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨软骨细胞铁死亡在骨关节炎发病机制中的作用及其分子特征和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17,638个软骨细胞 |
| 20203 | 2024-08-08 |
Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals tissue architecture in esophageal squamous cell carcinoma
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104281
PMID:36162205
|
研究论文 | 本研究通过整合基于微阵列的空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了食管鳞状细胞癌中的组织结构 | 首次通过多模态交叉分析整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，精确注释了肿瘤和间质区域的细胞组成 | 研究样本仅来自三位食管鳞状细胞癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 揭示食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中不同细胞亚群的空间景观及其潜在的细胞间交流 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 三位食管鳞状细胞癌患者的组织样本 |
| 20204 | 2024-08-08 |
Unique Cell Subpopulations and Disease Progression Markers in Canines with Atopic Dermatitis
2022-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200304
PMID:36165204
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在犬类特应性皮炎模型中探索健康皮肤与特应性皮炎皮肤之间的分子和细胞差异 | 首次在犬类特应性皮炎模型中发现γδ T细胞的富集，以及特应性皮炎中显著的-阳性成纤维细胞亚群，这些可能与皮肤炎症有关 | NA | 揭示特应性皮炎在分子和细胞层面的差异，并寻找可能的疾病进展标志物 | 犬类特应性皮炎的皮肤细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 20205 | 2024-08-08 |
Loss of apelin blocks the emergence of sprouting angiogenesis in experimental tumors
2022-10, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200616RR
PMID:36165236
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研究论文 | 研究探讨了apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用，特别是在VEGF信号抑制后的影响 | 发现apelin的缺失可以延缓肿瘤生长并减少血管密度，为抗血管生成治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 识别VEGF途径抑制后的替代促血管生成途径，以开发更有效的抗血管生成疗法 | apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的Lewis肺腺癌1和B16F10黑色素瘤 |
| 20206 | 2024-08-08 |
Recent developments in application of single-cell RNA sequencing in the tumour immune microenvironment and cancer therapy
2022-09-26, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-022-00414-y
PMID:36154923
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肿瘤免疫微环境（TIME）及其在癌症治疗中应用的最新进展 | 介绍了scRNA-seq在TIME中发现的新的细胞类型和细胞簇，如癌症相关成纤维细胞（CAFs）、T细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和树突状细胞（DCs），并提出了基于TIME细胞相互作用的潜在治疗干预措施 | NA | 探讨scRNA-seq在肿瘤免疫微环境和癌症治疗中的应用 | 肿瘤免疫微环境（TIME）中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 20207 | 2024-08-08 |
TIGIT is the central player in T-cell suppression associated with CAR T-cell relapse in mantle cell lymphoma
2022-09-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01655-0
PMID:36163179
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重细胞因子分析，探讨了在套细胞淋巴瘤（MCL）中使用brexucabtagene autoleucel（BA）的CAR T细胞疗法后复发的机制，发现TIGIT在T细胞抑制和BA复发中起核心作用。 | 首次揭示了TIGIT在套细胞淋巴瘤中CAR T细胞疗法后复发中的关键作用，并指出肿瘤细胞获得TIGIT表达是MCL特有的现象，未在其他CAR T治疗的疾病中报道。 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的淋巴瘤，可能限制了结果的普遍性。 | 探究CAR T细胞疗法在套细胞淋巴瘤中复发的机制，并寻找可能的治疗靶点。 | 套细胞淋巴瘤患者在接受brexucabtagene autoleucel（BA）CAR T细胞疗法后的复发机制。 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，多重细胞因子分析 | NA | RNA序列，细胞因子 | 39个纵向收集的样本来自15名患者，80个连续样本来自20名患者 |
| 20208 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic atlas of the human ciliary body
2022-Sep-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04559-w
PMID:36163311
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了人类睫状体的细胞和分子组分综合图谱，并分析了其相互作用 | 首次揭示了人类睫状体的单细胞分子分类，并发现了可能参与青光眼和葡萄膜炎发病机制的细胞间相互作用 | 研究样本仅来自3名人类捐赠者，可能存在样本量不足的问题 | 研究人类睫状体的细胞和分子组成及其在生理和病理条件下的功能 | 人类睫状体的细胞类型和基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 14,563个睫状体细胞来自3名人类捐赠者 |
| 20209 | 2024-08-08 |
Microenvironment components and spatially resolved single-cell transcriptome atlas of breast cancer metastatic axillary lymph nodes
2022-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2022131
PMID:36148946
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学，探讨了乳腺癌转移性腋窝淋巴结的转录组特征及其空间组织 | 首次在腋窝淋巴结肿瘤微环境中整合scRNA-seq和空间转录组学，提供了深入研究乳腺癌淋巴结转移的系统方法 | NA | 探讨乳腺癌细胞对淋巴结微环境成分和空间转录组图谱的影响 | 乳腺癌转移性腋窝淋巴结的转录组特征及其空间组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 六个手术切除的淋巴结样本及一个阳性淋巴结 |
| 20210 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals that cancer-associated fibroblasts stimulate oral squamous cell carcinoma invasion via the TGF-β/Smad pathway
2022-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2022132
PMID:36148955
|
研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过TGF-β/Smad途径促进口腔鳞状细胞癌（OSCC）侵袭的机制 | 首次发现CAFs是TGF-β1的主要来源，并通过TGF-β1/Smad途径促进OSCC侵袭 | 研究仅限于14个OSCC肿瘤样本，可能无法完全代表所有OSCC病例 | 探讨CAFs与口腔鳞状细胞癌侵袭之间的关系及其分子机制 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 14个OSCC肿瘤样本 |
| 20211 | 2024-08-08 |
Correction to: Integrating spatial transcriptomics with single-cell transcriptomics reveals a spatiotemporal gene landscape of the human developing kidney
2022-Sep-25, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00878-4
PMID:36155632
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20212 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome analysis of CNS immune cells reveals CXCL16/CXCR6 as maintenance factors for tissue-resident T cells that drive synapse elimination
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01111-0
PMID:36153630
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠WNV恢复后前脑中的免疫细胞，揭示了CXCL16/CXCR6作为维持组织驻留T细胞并驱动突触消除的关键因子。 | 首次识别并验证了CXCL16/CXCR6在维持WNV特异性CD8 TRM细胞中的作用，并揭示了其在微胶质激活和持续突触消除中的重要性。 | NA | 探讨RNA病毒感染后中枢神经系统中T细胞与微胶质细胞相互作用的信号机制。 | 小鼠WNV恢复后的前脑免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 20213 | 2024-08-08 |
Comparative profiling of single-cell transcriptome reveals heterogeneity of tumor microenvironment between solid and acinar lung adenocarcinoma
2022-09-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03620-3
PMID:36138435
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序数据比较分析，揭示了实体型和腺泡型肺腺癌肿瘤微环境的异质性 | 发现了实体型肺腺癌肿瘤微环境中缺氧和酸性环境最为严重，并识别出可能的治疗靶点MTHFD2 | NA | 旨在通过单细胞水平的研究，揭示不同组织学亚型肺腺癌的肿瘤微环境特征，以发现潜在的治疗靶点和联合治疗策略 | 肺腺癌的不同组织学亚型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个肺腺癌样本，包括独立免疫组化验证队列 |
| 20214 | 2024-08-08 |
Chromatin organizer SATB1 controls the cell identity of CD4+ CD8+ double-positive thymocytes by regulating the activity of super-enhancers
2022-09-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33333-6
PMID:36138028
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研究论文 | 本文探讨了染色质组织因子SATB1通过调控超级增强子的活性，控制CD4+ CD8+双阳性胸腺细胞的细胞身份 | 首次揭示了SATB1在染色质结构层面全局调控双阳性胸腺细胞超级增强子的作用，从而促进双阳性细胞身份的建立 | NA | 探索SATB1在双阳性胸腺细胞中调控基因表达的机制 | CD4+ CD8+双阳性胸腺细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, Hi-C | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20215 | 2024-08-08 |
Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data to Construct a Prognostic Model of Membrane Tension-Related Genes for Colon Cancer
2022-Sep-19, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10091562
PMID:36146640
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于膜张力相关基因的结肠癌预后模型 | 开发了一个新的4-MTRG标志物，用于预测结肠癌患者的临床结果，并发现TIMP1可能是结肠癌进展的敏感调节因子 | NA | 旨在从膜张力相关基因中识别结肠癌的预后标志物，并探讨其在疾病中的意义 | 结肠癌患者的预后标志物 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归 | RNA测序数据 | 从TCGA数据库获取的批量RNA测序数据，以及单细胞RNA测序数据 |
| 20216 | 2024-08-08 |
Drepmel-A Multi-Omics Melanoma Drug Repurposing Resource for Prioritizing Drug Combinations and Understanding Tumor Microenvironment
2022-09-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11182894
PMID:36139469
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research paper | 本文开发了一个名为DRepMel的Shiny应用程序，用于基于多组学药物再利用计算方法，从两组独立患者队列的全外显子和RNA测序数据中，为黑色素瘤患者提供合理的联合治疗预测 | DRepMel不仅提供了强大的预测资源，还利用黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据，识别了潜在的治疗对肿瘤微环境的影响 | NA | 开发一个全面的计算资源，用于定义合理的联合治疗方案 | 黑色素瘤患者及其治疗方案 | digital pathology | 黑色素瘤 | 全外显子测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两组独立患者队列 |
| 20217 | 2024-08-08 |
Understanding Mammalian Hair Follicle Ecosystems by Single-Cell RNA Sequencing
2022-Sep-14, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani12182409
PMID:36139270
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术在毛囊发育中主要细胞类型的研究进展，特别强调了单细胞技术发现的新毛囊亚群 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了毛囊细胞的新亚群，提供了对毛囊功能的多样化见解 | 讨论了单细胞RNA测序观察中的问题及其当前解决方案 | 重新认识各种组织和器官，特别是毛囊的细胞异质性 | 毛囊及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 20218 | 2024-08-08 |
Loss of Serpina1 in Mice Leads to Altered Gene Expression in Inflammatory and Metabolic Pathways
2022-Sep-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810425
PMID:36142337
|
研究论文 | 研究Serpina1基因在老鼠中的缺失对炎症和代谢途径基因表达的影响 | 首次探讨了Serpina1基因敲除对老鼠肝脏中炎症、脂质代谢和胆固醇代谢相关基因表达的影响 | 研究仅限于老鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨Serpina1基因敲除对肝脏基因表达的影响及其在人类治疗中的潜在应用 | Serpina1基因敲除的老鼠肝脏 | NA | 慢性肝病，慢性阻塞性肺病 | RNA测序 | NA | RNA | 年龄和性别匹配的C57BL/6野生型和Serpina1敲除老鼠，年龄8至14周 |
| 20219 | 2024-08-08 |
An Innovative Approach to Tissue Processing and Cell Sorting of Fixed Cells for Subsequent Single-Cell RNA Sequencing
2022-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810233
PMID:36142141
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研究论文 | 本文开发了一种新的组织处理和固定细胞分选方法，用于后续的单细胞RNA测序 | 提出了一种新的组织处理和细胞固定方法，该方法兼容FACS分选和后续的单细胞RNA测序，且不影响结果质量 | 目前处理、染色和保存新鲜细胞的方法非常有限，且需要昂贵的细胞分选设备 | 开发一种方法，允许细胞在固定和储存后进行FACS分选，用于单细胞RNA测序，而不影响结果质量 | 胰腺导管腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用小鼠胰腺癌模型Pan02进行评估 |
| 20220 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: A cutting edge tool in molecular medical research
2022-Sep, Medical journal, Armed Forces India
DOI:10.1016/j.mjafi.2022.08.006
PMID:36147383
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在分子医学研究中的应用及其对疾病相关细胞的时空分析 | 单细胞测序技术通过分析单个细胞而非整个组织，提供了更深入的时空分析，增强了数据的精确性 | 该技术产生大量数据，需要特定的处理和定制的生物信息学分析 | 阐明健康和疾病中的细胞间遗传、表观遗传、转录组和蛋白质组异质性 | 单细胞测序技术及其在医学研究中的应用 | 分子医学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA序列、RNA序列、miRNA、表观遗传修饰DNA或染色质DNA | 大量单细胞 |