单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 20181 - 20200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20181 | 2024-08-08 |
Reduced cell invasion may be a characteristic of placental defects in pregnant women of advanced maternal age at single-cell level
2022 Sept 15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2101024
PMID:36111571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外穿透实验，探讨了高龄产妇胎盘中滋养细胞侵袭能力下降的机制 | 首次在高龄产妇胎盘中发现滋养细胞侵袭能力下降，并鉴定了与侵袭相关的差异表达基因SERPINE1 | 样本量较小，需要进一步扩大样本验证结果 | 探究高龄产妇胎盘缺陷的细胞机制 | 高龄产妇的胎盘组织和滋养细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了27,607个细胞，包括来自4名高龄产妇和对照组的胎盘组织，以及来自6名孕妇的滋养细胞 |
| 20182 | 2024-08-08 |
Personalized neoantigen vaccine combined with PD-1 blockade increases CD8+ tissue-resident memory T-cell infiltration in preclinical hepatocellular carcinoma models
2022-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004389
PMID:36113894
|
研究论文 | 本研究探讨了个性化新抗原疫苗与PD-1阻断剂联合使用在肝细胞癌模型中增加CD8+组织驻留记忆T细胞浸润的效果及其机制 | 首次详细研究了个性化新抗原疫苗与PD-1阻断剂联合使用在肝细胞癌中的协同作用及其分子机制 | NA | 开发一种临床可用的联合治疗策略，并探索其在肝细胞癌中的潜在抗肿瘤机制 | 肝细胞癌模型中的免疫反应和协同机制 | NA | 肝细胞癌 | 新抗原筛选，单细胞RNA测序，四聚体流式细胞术，免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据，免疫荧光图像 | 使用小鼠原位肝细胞癌模型和患者来源的细胞进行研究 |
| 20183 | 2024-08-08 |
SPROUT: spectral sparsification helps restore the spatial structure at single-cell resolution
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac069
PMID:36128423
|
研究论文 | 本文开发了一个名为SPROUT的软件包，用于从转录组数据中重建单细胞分辨率的空间结构，通过减少伪配体-受体亲和力来实现 | SPROUT通过部分相关性、光谱图稀疏化和空间坐标细化来减少细胞间亲和矩阵中的伪亲和力，并将估计的相互作用嵌入到低维空间中，以恢复细胞间结构 | NA | 重建单细胞分辨率的空间结构 | 单细胞转录组数据中的空间结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 光谱图稀疏化 | 转录组数据 | 在小鼠海马体和人类器官肿瘤微环境数据集中，形状Pearson相关性范围从0.91到0.97；在人类发育心脏数据集和肿瘤微环境数据集中，细胞类型接近相关性分别为0.68和0.89 |
| 20184 | 2024-08-08 |
Analyzing network diversity of cell-cell interactions in COVID-19 using single-cell transcriptomics
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.948508
PMID:36105110
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析了COVID-19中细胞间相互作用网络的多样性 | 本文首次在群体层面比较了不同疾病状态下的细胞间相互作用网络，而不仅仅是单个样本间的直接比较 | NA | 揭示不同疾病状态下细胞间相互作用网络的生物学特征 | COVID-19患者的细胞间相互作用网络 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 20185 | 2024-08-08 |
Classification of pyroptosis patterns and construction of a novel prognostic model for prostate cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.1003594
PMID:36105400
|
研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，构建了一个新的与细胞焦亡相关的预后模型，用于预测前列腺癌患者的复发风险 | 首次基于批量和单细胞RNA测序数据构建了与细胞焦亡相关的预后模型，用于前列腺癌患者的复发风险预测 | NA | 开发一种新的与细胞焦亡相关的预后模型，以提高前列腺癌复发预测的准确性 | 前列腺癌患者的批量和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 多个在线数据库中的前列腺癌患者数据 |
| 20186 | 2024-08-08 |
Systematic identification of cancer-associated-fibroblast-derived genes in patients with colorectal cancer based on single-cell sequencing and transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.988246
PMID:36105798
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和转录组学方法，系统识别了结直肠癌患者中癌症相关成纤维细胞（CAFs）来源的基因 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了结直肠癌中成纤维细胞的亚群及其在肿瘤微环境中的作用 | 研究仅限于结直肠癌患者，结果的普遍性和其他类型癌症的适用性有待验证 | 探讨癌症相关成纤维细胞在结直肠癌发生发展中的作用机制 | 结直肠癌患者的癌症相关成纤维细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | lasso回归分析 | 基因表达数据 | 结直肠癌患者的成纤维细胞亚群 |
| 20187 | 2024-08-08 |
Single-cell gene expression analysis of cryopreserved equine bronchoalveolar cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.929922
PMID:36105804
|
研究论文 | 本研究使用单细胞mRNA测序技术（scRNA-seq）分析了冷冻保存的马支气管肺泡灌洗液（BALF）细胞的转录组特征 | 首次在马中检测到与单核细胞-淋巴细胞复合体一致的转录组特征，并发现了先前未探索的T细胞和巨噬细胞亚群 | NA | 探索马支气管肺泡灌洗液的细胞组成，并深入分析主要免疫细胞群体的组成 | 冷冻保存的马支气管肺泡灌洗液细胞 | 数字病理学 | 马哮喘 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 4,631个细胞来自三匹处于缓解期的哮喘马 |
| 20188 | 2024-08-08 |
Primitive genotypic characteristics in umbilical cord neutrophils identified by single-cell transcriptome profiling and functional prediction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.970909
PMID:36105817
|
研究论文 | 本研究首次通过单细胞转录组测序分析了新生儿脐带血和健康成人中的中性粒细胞，发现了六个具有不同标记基因和功能的亚群 | 首次揭示了新生儿脐带血中中性粒细胞的异质性和功能多样性，并发现了新的中性粒细胞亚群 | NA | 探究新生儿脐带血中中性粒细胞的功能和异质性 | 新生儿脐带血和健康成人的中性粒细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生儿脐带血和健康成人的中性粒细胞样本 |
| 20189 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of the prognosis and immunological role of AKAP12: A potential biomarker for resistance to anti-VEGF inhibitors
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.943006
PMID:36110213
|
研究论文 | 本研究系统分析了A-kinase anchor protein 12 (AKAP12)与抗VEGF抑制剂敏感性、临床预后、DNA甲基化、蛋白质磷酸化和免疫细胞浸润在多种癌症中的关联 | 首次全面探讨了AKAP12在多种癌症中的作用及其作为抗VEGF抑制剂耐药性生物标志物的潜力 | NA | 探讨AKAP12在多种癌症中的作用及其作为抗VEGF抑制剂耐药性生物标志物的潜力 | AKAP12在多种癌症中的表达、功能及其与抗VEGF抑制剂耐药性的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 生物信息学工具 | NA | 基因表达数据 | 涉及卵巢癌、胶质瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌等多种癌症类型 |
| 20190 | 2024-08-08 |
The imbalance between Type 17 T-cells and regulatory immune cell subsets in psoriasis vulgaris
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1005115
PMID:36110854
|
研究论文 | 本文探讨了寻常型银屑病中17型T细胞与调节性免疫细胞亚群之间的不平衡 | 利用单细胞RNA测序技术研究皮肤中免疫细胞亚群的新技术，提供了比较17型T细胞亚群转录组差异的机会 | NA | 研究寻常型银屑病中免疫细胞亚群的不平衡及其对疾病发展的影响 | 寻常型银屑病中的17型T细胞和调节性T细胞亚群 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 20191 | 2024-08-08 |
A novel necroptosis-related gene signature for predict prognosis of glioma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.984712
PMID:36111134
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，建立了一种与坏死性凋亡相关基因特征，用于预测胶质瘤患者的预后 | 首次揭示了坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的作用，并建立了一个新的基因特征模型用于预测胶质瘤的预后 | NA | 研究坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的作用，并开发一个预测胶质瘤患者预后的基因特征模型 | 胶质瘤患者的预后预测 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个胶质瘤细胞系和人类星形胶质细胞 |
| 20192 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of gene expression in the substantia nigra pars compacta of a pesticide-induced mouse model of Parkinson's disease
2022-Jan-01, Translational neuroscience
IF:1.8Q4
DOI:10.1515/tnsci-2022-0237
PMID:36117858
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析了农药诱导的帕金森病小鼠模型中黑质致密部的基因表达 | 研究强调了支持细胞在农药诱导的帕金森病中的重要性，并重新关注这些细胞在疾病中的作用，而不仅仅是神经元 | NA | 阐明农药暴露导致帕金森病的机制 | C57BL/6J小鼠的黑质致密部细胞 | digital pathology | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20193 | 2024-08-08 |
High-throughput sequencing unravels the cell heterogeneity of cerebrospinal fluid in the bacterial meningitis of children
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.872832
PMID:36119025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组测序，揭示了儿童细菌性脑膜炎中脑脊液细胞的异质性及其在疾病进展中的动态变化 | 发现了两种新型细胞亚型：FFAR2TNFAIP6中性粒细胞和THBS1IL1B单核细胞，并揭示了它们与脑脊液炎症反应强度的正相关性 | NA | 深入探索儿童细菌性脑膜炎进展中脑脊液细胞的特征，为急性中枢神经系统感染中的免疫细胞作用提供新见解 | 儿童细菌性脑膜炎患者的脑脊液样本 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个细菌性脑膜炎患者在疾病进展不同阶段的脑脊液样本 |
| 20194 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics reveals the activated retinal microglia with intracellular metabolic reprogramming contributes to inflammation in STZ-induced early diabetic retinopathy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.942768
PMID:36119084
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和多组学分析，揭示了链脲佐菌素诱导的早期糖尿病视网膜病变中，激活的视网膜小胶质细胞通过细胞内代谢重编程促进炎症的机制。 | 首次识别出在糖尿病视网膜病变中，具有代谢途径改变的小胶质细胞是IL-1β的主要来源，并通过多组学分析揭示了这些细胞的代谢特征。 | NA | 探究糖尿病视网膜病变中，视网膜特异性细胞类型产生促炎细胞因子的机制。 | 链脲佐菌素诱导的糖尿病视网膜病变小鼠模型中的小胶质细胞。 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序, 代谢组学, 脂质组学, RNA分析 | NA | 细胞样本 | 代表糖尿病视网膜病变微环境的微胶质细胞系样本 |
| 20195 | 2024-08-08 |
MS4A6A is a new prognostic biomarker produced by macrophages in glioma patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.865020
PMID:36119086
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研究论文 | 本文研究了MS4A6A在胶质瘤中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了MS4A6A在胶质瘤生物学和预后中的作用，并通过蛋白质相互作用网络和单细胞RNA测序分析了其表达特征 | NA | 探讨MS4A6A在胶质瘤中的作用及其作为预后生物标志物的可能性 | MS4A6A在胶质瘤中的表达及其与临床结果的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集（CGGA1, CGGA2, TCGA, Rembrandt, Gravendeel）中的胶质瘤样本 |
| 20196 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of the adaptive immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.964976
PMID:36119105
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术在分析SARS-CoV-2感染和疫苗接种后适应性免疫反应中的应用 | 利用单细胞多组学技术深入研究SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的免疫反应机制 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的适应性免疫反应，为疫苗和治疗策略的开发提供支持 | SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的适应性免疫反应，包括T细胞和B细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞多组学技术，包括流式细胞术、单细胞转录组学、单细胞TCR和BCR分析 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 20197 | 2024-08-08 |
Identification of a novel histone phosphorylation prognostic signature in hepatocellular carcinoma based on bulk and single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.965445
PMID:36120466
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研究论文 | 本研究构建了与肝细胞癌（HCC）预后相关的组蛋白磷酸化调控（HPR）基因签名，并探讨了HPR基因是否能预测HCC患者的总体生存 | 首次构建了与HCC预后相关的组蛋白磷酸化调控基因签名，并验证了其在预测HCC患者生存中的作用 | NA | 探讨组蛋白磷酸化调控基因在肝细胞癌中的预后价值 | 肝细胞癌患者及其组蛋白磷酸化调控基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox回归分析，Lasso回归分析 | RNA测序数据 | 使用TCGA、ICGC和GEO数据库中的差异表达基因数据，以及从Gene Expression Omnibus（GEO）下载的HCC单细胞RNA测序数据 |
| 20198 | 2024-08-08 |
Systematic Characterization of Expression Patterns and Immunocorrelations of Formin-Like Genes in Breast Cancer
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/8577821
PMID:36124068
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研究论文 | 本文系统分析了乳腺癌中formin-like基因（FMNL）的表达模式及其与免疫相关性 | 首次全面阐述了FMNL基因在乳腺癌中的表达模式及其在临床应用中的可变预后意义 | NA | 研究FMNL基因在乳腺癌中的表达及其与免疫浸润的关系 | 乳腺癌组织中的FMNL基因表达及其与免疫细胞浸润的相关性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学（IHC） | NA | mRNA | NA |
| 20199 | 2024-08-08 |
RAB20 deficiency promotes the development of silicosis via NLRP3 inflammasome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.967299
PMID:36131930
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析硅肺病患者的支气管肺泡灌洗液，发现RAB20缺乏与硅肺病的发展密切相关，并通过小鼠模型验证了RAB20缺失加剧硅晶体诱导的肺间质纤维化和呼吸功能障碍，主要通过NLRP3炎症小体的激活和IL-1β的释放。 | 首次揭示了RAB20在硅肺病发病机制中的关键作用，为理解环境刺激介导的先天免疫提供了新的分子见解。 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在人体中进一步验证。 | 探究RAB20在硅肺病发病机制中的作用及其分子机制。 | 硅肺病患者和小鼠模型的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 包括硅肺病患者和未发病矿工的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 20200 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome landscape and antigen receptor dynamic during SARS-CoV-2 vaccination
2023-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2022.08.020
PMID:36097543
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研究论文 | 本研究系统地描绘了接种前后单细胞转录组、TCR和BCR表达谱，并分析了COVID-19患者的TCR序列 | 首次详细描述了接种SARS-CoV-2疫苗后的单细胞分子免疫反应，并发现了特定的克隆CD8 T细胞群 | NA | 揭示SARS-CoV-2疫苗接种和感染期间的详细免疫反应 | 接种疫苗的候选者的单细胞转录组、TCR和BCR表达谱，以及COVID-19患者的TCR序列 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |