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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 2001 - 2020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2001 | 2026-02-24 |
Multi-gene biomarkers reveal spatial organization and subpopulation-specific damage response in intrahepatic biliary epithelial cells
2026-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.12.705355
PMID:41727062
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群及其生物标志物，并利用杂交链式反应荧光原位杂交验证其空间定位和损伤响应 | 开发了NSForest机器学习算法识别BEC亚群的最小多基因特征，首次揭示了BEC亚群在胆管内的空间组织和同质细胞邻域的形成，并发现损伤条件下亚群特异性基因下调及增殖亚群的出现 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；体外培养系统可能无法完全模拟体内微环境 | 识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群和生物标志物，探究其空间组织和损伤响应机制 | 小鼠肝内胆管上皮细胞 | 单细胞组学 | 肝病 | scRNA-seq, 杂交链式反应荧光原位杂交 | NSForest机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠肝组织样本（包括胆管结扎和假手术对照组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2002 | 2026-02-24 |
Morphological innovation without gene co-option: the Drosophila sex comb evolved via changes in developmental tempo and energy metabolism
2026-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.13.705815
PMID:41727116
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞RNA-seq分析，揭示了果蝇性梳这一形态创新性状的进化机制，发现其并非通过基因共选择，而是通过发育速率和能量代谢的调控变化实现 | 首次证明形态创新可以不依赖新基因的共选择，而是通过发育速率和能量代谢的定量变化驱动，挑战了传统性状进化模型 | 研究仅基于果蝇性梳系统，结论在其他物种或性状中的普适性有待验证 | 探究形态创新性状的进化遗传机制 | 果蝇性梳（雄性特异性创新性状）及其前体机械感觉刚毛 | 发育生物学 | NA | 时间序列单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2003 | 2026-02-24 |
Tumor-derived Extracellular Vesicles Induce ER Stress to Drive Tolerogenic Dendritic Cell Development in the Tumor Microenvironment
2026-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705213
PMID:41727176
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤来源的细胞外囊泡通过触发未折叠蛋白反应，诱导树突状细胞向耐受性状态转变，从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次阐明了肿瘤EV通过PERK-ATF4和IRE1α-XBP1s信号轴触发UPR，进而激活SREBP2和PPAR-α转录因子，驱动树突状细胞脂质代谢重编程的完整信号通路 | 研究主要基于黑色素瘤模型，在其他肿瘤类型中的普适性有待验证；体内实验主要使用基因工程小鼠模型，人类临床样本验证不足 | 探究肿瘤微环境中肿瘤来源细胞外囊泡如何调控树突状细胞功能，并评估靶向相关通路克服免疫治疗耐药性的治疗潜力 | 树突状细胞、肿瘤来源的细胞外囊泡、CD8+ T细胞、CD4+ FoxP3+ 调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多参数流式细胞术、Western blotting、实时定量PCR、细胞代谢测定 | NA | RNA测序数据、流式细胞术数据、蛋白质印迹数据、基因表达数据 | 未明确具体样本数量，使用工程化肿瘤模型和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2004 | 2026-02-24 |
Proteomics and single-cell transcriptomics identify LRP1 as a diagnostic biomarker for atypical fibroxanthoma and pleomorphic dermal sarcoma
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703892
PMID:41727100
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析，鉴定出LRP1作为非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量蛋白质组学数据，在AFX/PDS与其他皮肤梭形细胞肿瘤的鉴别诊断中，发现了LRP1、LTBP2和NAV1在mRNA和蛋白水平均富集，并验证了LRP1具有比现有临床标志物CD10更高的诊断性能 | 研究队列规模有限，且生物标志物在更广泛人群和不同病理亚型中的验证仍需进一步研究 | 寻找用于鉴别诊断非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的临床有价值的生物标志物 | 非典型纤维黄瘤、多形性真皮肉瘤、皮肤平滑肌肉瘤、梭形细胞黑色素瘤、肉瘤样鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 包含AFX、PDS、cLMS、SCM和sSCC的队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 2005 | 2026-02-24 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal heterogeneity and key subgroups in ovarian cancer: HOXA1 identified as a potential therapeutic biomarker
2026-Feb-05, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004904
PMID:41723864
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了卵巢癌的异质性，并识别了关键细胞亚群和转录因子HOXA1作为潜在治疗生物标志物 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，从时空角度阐明卵巢癌异质性，并构建了基于SAA1⁺肿瘤细胞的风险预后模型STRS | 研究数据主要来源于GEO和TCGA数据库，可能受限于样本来源和临床信息的完整性，且未进行实验验证 | 揭示卵巢癌的异质性，识别关键细胞亚群和生物标志物，以优化诊断和治疗策略 | 卵巢癌患者样本的单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2006 | 2026-02-06 |
Subject: letter to the editor: platelet single-cell RNA sequencing
2026-Feb-04, Journal of thrombosis and thrombolysis
IF:2.3Q2
DOI:10.1007/s11239-026-03245-z
PMID:41636979
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2007 | 2026-02-24 |
Integrative metabolomic and single-cell transcriptomic analysis of recurrent condyloma acuminatum in humans
2026-Feb-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37989-8
PMID:41639275
|
研究论文 | 本研究结合代谢组学和单细胞转录组学分析，探索人类复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制 | 首次整合代谢组学和单细胞RNA测序技术，系统揭示复发性尖锐湿疣中角质形成细胞和免疫细胞的代谢失调及免疫调控状态改变 | 样本量相对有限，且为观察性研究，未进行功能验证实验 | 阐明复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制，寻找潜在的治疗靶点 | 人类复发性尖锐湿疣病变组织 | 数字病理学 | 尖锐湿疣 | 代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2008 | 2026-02-24 |
Spatiotemporal transcriptomic insights into ferroptosis and TFRC-linked immune interactions in ischemia-reperfusion acute kidney injury
2026-Feb, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00364-0
PMID:41241671
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了铁死亡相关基因在缺血再灌注急性肾损伤中的时空表达模式及其与免疫细胞（特别是巨噬细胞）的相互作用，并验证了靶向TFRC的治疗潜力 | 首次结合单细胞与空间转录组学解析AKI中铁死亡相关基因的时空分布特征，并发现TFRC与浸润巨噬细胞存在空间邻近关系，为理解铁死亡与免疫微环境的相互作用提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；空间转录组学的分辨率可能限制细胞亚型相互作用的精确解析 | 探究急性肾损伤中铁死亡相关基因的表达模式、空间分布及其与免疫细胞的相互作用，以寻找潜在治疗靶点 | 小鼠缺血再灌注急性肾损伤模型、肾小管上皮细胞 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 机器学习, 免疫荧光, 共培养实验 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2009 | 2026-02-24 |
Recruitment of CCR5+ inflammatory monocytes in pulmonary tissue contributes to acute lung injury
2026-Feb, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00371-1
PMID:41444399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了在深低温循环停搏诱导的急性肺损伤中，CCR5+炎症性单核细胞的招募及其作用机制 | 首次在DHCA诱导的ALI大鼠模型中，利用单细胞RNA测序技术识别出CCR5+单核细胞亚群的显著增加，并发现CCR5阻断剂能减轻肺损伤并抑制自噬 | 研究基于大鼠模型，结果可能无法直接外推至人类；单细胞测序样本量较小，需进一步验证 | 探究深低温循环停搏后急性肺损伤的免疫细胞机制及潜在治疗靶点 | 健康大鼠和DHCA诱导的急性肺损伤大鼠的肺组织细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 健康大鼠和DHCA大鼠的肺组织细胞（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2010 | 2026-02-24 |
Flexibility of cell fates and functions across sex determination systems revealed by comparative single-cell analyses
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.701242
PMID:41659566
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学比较分析了温度依赖性性别决定（TSD）系统与遗传性别决定（GSD）系统在脊椎动物性腺细胞类型和遗传程序上的差异 | 揭示了脊椎动物性别决定系统中细胞命运和功能的广泛可塑性，并发现支持细胞谱系在TSD系统中表达雄激素合成基因，这与哺乳动物不同 | 研究主要基于特定龟类物种，可能无法完全代表所有TSD或GSD系统的多样性 | 比较不同性别决定系统下脊椎动物性腺细胞类型和遗传程序的保守性与差异 | 龟类（温度依赖性性别决定）、小鼠（XY遗传性别决定）和鸡（ZW遗传性别决定）的性腺组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量，但涉及多个物种的性腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2011 | 2026-02-24 |
Multiplexed enrichment and tracking of lineages with CloneSweeper
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.700779
PMID:41659616
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CloneSweeper的多重谱系追踪平台，用于高效捕获和富集稀有细胞谱系，以研究治疗抵抗机制 | 开发了CloneSweeper平台，利用双功能条形码同时实现活细胞分选和单细胞RNA测序检测，能够同时富集多个稀有谱系 | 未明确说明平台在更广泛疾病模型或样本类型中的适用性限制 | 研究治疗抵抗机制，区分预存细胞状态（“启动”）与药物诱导变化（“适应”） | BRAF V600E黑色素瘤模型中的细胞谱系 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），Cas9 gRNA介导的活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及21个不同的稀有谱系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics scRNA-seq | 未指定具体产品型号，但提及用于高回收率检测 |
| 2012 | 2026-02-24 |
CytoVerse: Single-Cell AI Foundation Models in the Browser
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702554
PMID:41659670
|
研究论文 | 本文介绍了CytoVerse框架，它能在浏览器中运行单细胞RNA测序基础模型，实现无需服务器计算的大规模单细胞数据映射 | 通过ONNX部署模型、使用压缩索引（IVFPQ）在客户端搜索超过2000万个细胞参考数据，以及轻量级协议共享嵌入而不暴露原始数据，实现了浏览器端的隐私保护单细胞分析 | 未提及具体性能瓶颈或兼容性限制 | 开发一个可扩展且隐私保护的分布式单细胞分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基础模型（Foundation Models） | 单细胞基因表达数据 | 超过2000万个细胞参考数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2013 | 2026-02-24 |
Altered immune and treatment response gene expression signatures among poverty-exposed children with B-ALL
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702019
PMID:41659564
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析贫困暴露的B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）儿童患者的白血病母细胞及其微环境，揭示了其在诊断时表现出类固醇耐药和免疫细胞功能改变的转录特征 | 首次在单细胞水平上揭示了贫困暴露与B-ALL儿童患者白血病细胞类固醇耐药性及免疫微环境改变的关联 | 研究样本量有限，且机制性关联需要进一步实验验证 | 探究贫困暴露对B-ALL儿童患者治疗反应和免疫微环境的影响 | 标准风险B-ALL儿童患者（贫困暴露与非贫困暴露对比） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及贫困暴露和非贫困暴露的B-ALL儿童患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2014 | 2026-02-24 |
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s13643-026-03083-3
PMID:41612480
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系统综述、荟萃分析与生物信息学研究 | 本文通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法，评估miRNA作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力，并利用ceRNA网络和单细胞RNA测序分析验证靶基因 | 结合系统综述、荟萃分析和生物信息学方法，首次构建ceRNA网络并应用单细胞RNA测序分析miRNA靶基因在ALL中的表达模式，揭示了白血病原始细胞中靶基因表达的最一致和显著改变 | 需要大型多中心试验进一步确认miRNA的预后价值，研究结果可能受纳入研究的异质性和样本量限制 | 评估miRNA作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力，并探索其调控机制 | 急性淋巴细胞白血病患者，特别是涉及1974名患者的22项研究中的miRNA表达数据 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序、ceRNA网络分析、荟萃分析 | NA | 文本数据、基因表达数据 | 1974名患者，来自22项研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2015 | 2026-02-24 |
Sod1 trisomy causes ENS developmental defects and susceptibility to Hirschsprung disease via neuronal Ret suppression and glial remodeling
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701837
PMID:41659476
|
研究论文 | 本研究揭示了21号染色体基因SOD1剂量增加如何通过抑制神经元Ret表达和重塑胶质细胞状态，导致肠神经系统发育缺陷并增加先天性巨结肠症易感性 | 首次证明SOD1基因剂量单独增加足以扰乱肠神经系统发育，并阐明了其通过双重机制（抑制神经发生与促进胶质细胞反应性增殖）导致先天性巨结肠易感性的具体通路 | 研究基于人源化三体小鼠模型，与人类Down综合征的完整遗传背景存在差异；单细胞测序仅分析了出生后第0天的远端结肠组织 | 解析Down综合征患者先天性巨结肠症风险增高的特定染色体21基因机制 | 携带人源SOD1基因座的转基因小鼠肠神经系统细胞 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据，荧光图像数据 | 未明确样本数量（出生后第0天小鼠远端结肠组织） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2016 | 2026-02-24 |
Spatial transcriptomics reveals brain-wide circadian disruption in an Alzheimer's disease model
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701799
PMID:41659563
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑中昼夜节律转录的空间组织架构，并发现阿尔茨海默病模型中存在早期、区域特异性的昼夜节律紊乱 | 首次在大规模空间转录组学层面，绘制了健康与阿尔茨海默病模型小鼠大脑中24小时节律转录的空间分布图，揭示了区域特异性节律紊乱作为疾病早期特征 | 研究基于小鼠模型（APP23），可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性；且主要关注转录水平，未深入探讨功能机制 | 探究健康与阿尔茨海默病状态下大脑昼夜节律转录的空间组织特征及其在疾病发病机制中的作用 | 小鼠大脑（包括皮质和皮质下区域），特别是APP23阿尔茨海默病模型小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及小鼠大脑多个区域的大规模空间转录组分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2017 | 2026-02-24 |
Substantial unannotated noncoding transcripts in tumors may transcriptionally regulate cancer-related genes
2026-Jan-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02524-8
PMID:41606598
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析识别了未注释的非编码转录本（UNTs），并利用CRISPR/Cas9技术验证了它们在癌症中转录调控基因的潜力 | 首次系统性地研究了肿瘤中未注释非编码转录本（UNTs）的广泛存在及其转录调控机制，揭示了其癌症和物种特异性 | 研究仅针对四种肿瘤的细胞系和组织样本，可能无法代表所有癌症类型；UNTs的功能验证仅限于三个具体例子 | 探究肿瘤中未注释非编码转录本（UNTs）的转录调控功能及其在癌症中的作用 | 四种肿瘤的细胞系和组织样本，以及三个具体的UNTs（MSTRG.2513.6、MSTRG.4401.1、MSTRG.34636.7） | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq、scRNA-seq、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | RNA序列数据 | 四种肿瘤的细胞系和组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 2018 | 2026-02-22 |
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03896-w
PMID:41606649
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2019 | 2026-02-24 |
SAMSN1 restrains NK cell mediated anti-tumor immunity in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68661-4
PMID:41565668
|
研究论文 | 本文发现SAMSN1作为肝癌中NK细胞功能的新型免疫检查点，通过单细胞RNA测序和体内模型验证其抑制NK细胞活化和抗肿瘤免疫 | 首次识别SAMSN1为肝癌中NK细胞特异性免疫检查点，并通过NK细胞特异性敲除模型证实其功能 | 研究主要基于小鼠模型和患者单细胞数据，尚未进行临床干预试验验证靶向治疗效果 | 探究SAMSN1在肝癌微环境中对NK细胞功能的调控机制及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 肝癌患者样本、小鼠肝癌模型（Hepa1-6细胞系）中的NK细胞 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因敲除模型 | NA | 单细胞转录组数据、体内实验数据 | 肝癌患者样本（未指定具体数量）及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2020 | 2026-02-24 |
huSA: a comprehensive database for multi-dimensional resolution of bulk, single cell and spatial transcription profiles in skin diseases
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baag009
PMID:41719583
|
研究论文 | 本研究构建了一个名为人类皮肤图谱（huSA）的综合性数据库，整合了多种皮肤疾病的批量、单细胞和空间转录组数据，并提供标准化分析和交互式可视化工具 | 首次构建了一个整合17种皮肤疾病、涵盖单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多种数据类型的综合性数据库，并提供标准化的分析流程和交互式可视化平台 | 数据库目前主要整合已发表的公开数据集，可能未包含所有最新的研究数据；分析流程的标准化可能无法完全适应所有特定研究问题 | 解决皮肤疾病转录组数据缺乏有效整合和标准化分析的问题，构建一个系统性的资源平台 | 皮肤疾病相关的转录组数据 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学，批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 总计2999个样本，包括1434个scRNA-seq样本、63个空间转录组样本和1502个bulk RNA-seq样本，来自63个独立数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |