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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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20161 | 2024-08-08 |
Faecalibaculum rodentium remodels retinoic acid signaling to govern eosinophil-dependent intestinal epithelial homeostasis
2022-09-14, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2022.07.015
PMID:35985335
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研究论文 | 研究揭示了Faecalibaculum rodentium通过重塑视黄酸信号通路,调控依赖于嗜酸性粒细胞的肠道上皮稳态 | 首次阐明特定微生物成员通过改变上皮细胞周转率、隐窝增殖和主要组织相容性复合体II类表达,影响肠道上皮稳态 | NA | 探究微生物与肠道上皮细胞相互作用如何调节宿主生理,特别是在十二指肠中的作用 | 肠道上皮细胞和微生物Faecalibaculum rodentium | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无菌(GF)和不同常规微生物群组成的十二指肠上皮细胞样本 |
20162 | 2024-08-08 |
Human tau mutations in cerebral organoids induce a progressive dyshomeostasis of cholesterol
2022-09-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.07.011
PMID:35985329
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析携带V337M和R406W tau突变的人脑类器官(hCOs),发现胆固醇生物合成途径在星形胶质细胞中显著上调,表明胆固醇稳态失调可能是tau突变导致神经退行性变的早期事件 | 首次在携带tau突变的人脑类器官中揭示了胆固醇生物合成途径的早期变化,并证实了胆固醇稳态失调在tau突变相关神经退行性变中的作用 | NA | 探究tau突变在人脑类器官中引起的早期分子途径变化 | 携带V337M和R406W tau突变的人脑类器官 | 数字病理学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及携带V337M和R406W tau突变的人脑类器官及同基因对照组 |
20163 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the nuclear decoy lincRNA PIRAT as a regulator of systemic monocyte immunity during COVID-19
2022-09-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2120680119
PMID:35998224
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了在COVID-19期间,长非编码RNA PIRAT作为单核细胞中PU.1的主要反馈调节因子,调控警报素S100A8/A9的产生,这是COVID-19发病机制的关键驱动因素。 | 首次揭示了PIRAT作为核诱饵RNA,通过阻止PU.1与警报素启动子结合并促进其在幼稚单核细胞中与假基因结合,从而在COVID-19中发挥重要作用。 | NA | 研究长非编码RNA在SARS-CoV-2感染期间的系统免疫反应中的作用。 | 单核细胞中的长非编码RNA PIRAT及其在COVID-19中的作用。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
20164 | 2024-08-08 |
The heterogeneous immune landscape between lung adenocarcinoma and squamous carcinoma revealed by single-cell RNA sequencing
2022-08-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01130-8
PMID:36008393
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肺腺癌和鳞状细胞癌之间的异质性免疫景观 | 发现了新的淋巴细胞相关巨噬细胞集群SELENOP-Mφ,并证实其在两种癌症类型中的抗肿瘤作用 | NA | 深入分析非小细胞肺癌患者的免疫景观,以指导免疫治疗策略的选择和临床反应的预测 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 72,475个免疫细胞来自19名非小细胞肺癌患者的40个肿瘤和匹配的正常组织样本 |
20165 | 2024-08-08 |
Human alveolar progenitors generate dual lineage bronchioalveolar organoids
2022-08-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03828-5
PMID:36008580
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析成人肺部HTII-280/EpCAM群体,揭示了富集成人干细胞签名基因的亚群,并发现肺泡祖细胞在体外器官培养中表现出谱系可塑性,能够产生肺泡或支气管细胞类型的后代。 | 本研究首次展示了肺泡祖细胞在体外器官培养中的谱系可塑性,并揭示了Wnt通路独立调控肺泡分化的机制。 | NA | 旨在阐明肺泡上皮更新的机制,并研究肺泡祖细胞的特性。 | 成人肺部的肺泡祖细胞及其在体外器官培养中的分化能力。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成人肺部的HTII-280/EpCAM群体 |
20166 | 2024-08-08 |
scRNA-seq of gastric tumor shows complex intercellular interaction with an alternative T cell exhaustion trajectory
2022-08-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32627-z
PMID:35999201
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌中的肿瘤微环境,揭示了肿瘤相关基质细胞和免疫细胞的复杂相互作用及T细胞耗竭的替代途径 | 首次展示了胃癌中肿瘤相关基质细胞与免疫细胞的相互作用,并发现了一种新的T细胞耗竭途径 | NA | 探究胃癌肿瘤微环境的特定特征及其对肿瘤控制的影响 | 胃癌患者的肿瘤组织、配对肿瘤旁组织及血液中的细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 10名胃癌患者的166,533个细胞 |
20167 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell RNA-seq and DNA methylation reveal the effects of air pollution in patients with recurrent spontaneous abortion
2022-08-23, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-022-01327-2
PMID:35999615
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和DNA甲基化数据,探讨了空气污染对复发性自然流产患者的影响及其分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和DNA甲基化数据,揭示了空气污染通过影响IGF2BP1启动子甲基化水平导致妊娠丢失的机制 | NA | 旨在理解复发性自然流产的机制及其与空气污染暴露的关系 | 复发性自然流产患者的蜕膜组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、简化代表性重亚硫酸盐测序(RRBS) | 逻辑回归模型 | RNA-seq数据、甲基化数据 | 涉及复发性自然流产患者和人工流产个体的蜕膜组织数据 |
20168 | 2024-08-08 |
Disease-associated oligodendrocyte responses across neurodegenerative diseases
2022-08-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111189
PMID:36001972
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了阿尔茨海默病和多发性硬化症的小鼠模型中少突胶质细胞的三种不同激活状态,并探讨了这些状态在疾病过程中的作用 | 首次识别出三种不同的少突胶质细胞激活状态,并揭示了这些状态在疾病过程中的空间分布和转录特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据相对有限,且未涉及其他神经退行性疾病 | 旨在理解少突胶质细胞在神经退行性疾病中的激活状态及其对疾病进程的影响 | 少突胶质细胞在阿尔茨海默病和多发性硬化症中的激活状态 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类单核RNA-seq数据集 |
20169 | 2024-08-08 |
Pituitary adenomas evade apoptosis via noxa deregulation in Cushing's disease
2022-08-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111223
PMID:36001971
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了27594个细胞,研究了库欣病(CD)垂体腺瘤的转录组特征,并发现了一种通过选择性蛋白酶体抑制来稳定noxa并诱导凋亡的治疗方法。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了CD腺瘤细胞中noxa的异常调控,并验证了选择性蛋白酶体抑制剂bortezomib作为抗肿瘤药物的潜力。 | 研究受限于缺乏体外模型和正常人类垂体腺的控制样本。 | 研究库欣病中垂体腺瘤逃避凋亡的机制,并探索潜在的治疗方法。 | 研究对象包括25名患者的垂体腺瘤及其邻近正常腺体细胞。 | 数字病理学 | 库欣病 | 单细胞RNA测序(RNA-seq) | NA | 细胞 | 27594个细胞 |
20170 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics reveals cellular and molecular interactions governing the invasive niche of basal cell carcinoma
2022-08-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32670-w
PMID:35986012
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研究论文 | 本文通过结合单细胞和空间转录组学技术,研究了人类基底细胞癌的侵袭性微环境,定义了促进肿瘤进展的细胞贡献者 | 本文首次揭示了基底细胞癌侵袭性微环境中细胞间的相互作用及其转录重编程,展示了综合空间和单细胞多组学技术在解析癌症特异性侵袭特性及开发靶向疗法方面的潜力 | NA | 揭示基底细胞癌侵袭性微环境中的细胞和分子相互作用 | 人类基底细胞癌的侵袭性微环境 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
20171 | 2024-08-08 |
HLJ1 amplifies endotoxin-induced sepsis severity by promoting IL-12 heterodimerization in macrophages
2022-08-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76094
PMID:35983991
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研究论文 | 研究探讨了HLJ1在调节内毒素诱导的脓毒症严重程度中的作用及其分子机制 | 首次揭示了HLJ1通过促进IL-12异二聚体的形成在脓毒症中的作用,并提出了针对HLJ1的治疗潜力 | NA | 研究HLJ1在调节内毒素诱导的脓毒症中的作用及其分子机制 | HLJ1在脓毒症中的作用及其对IL-12和IFN-γ的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用HLJ1敲除小鼠和LPS处理的小鼠进行实验 |
20172 | 2024-08-08 |
Vasculogenesis in kidney organoids upon transplantation
2022-Aug-19, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-022-00237-4
PMID:35986027
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研究论文 | 研究通过鸡胚腹腔移植和单细胞RNA测序技术,诱导并研究了人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官中的血管生成 | 展示了人肾脏类器官衍生的内皮细胞在移植后重组形成有功能的毛细血管,并与宿主血管形成嵌合血管网络 | 需要进一步研究以实现在体外有意义的肾小球成熟和肾脏形态发生 | 探索人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官在移植后的血管生成及其对类器官成熟的影响 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官及其血管生成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
20173 | 2024-08-08 |
Longitudinal single-cell transcriptomics reveals distinct patterns of recurrence in acute myeloid leukemia
2022-08-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01635-4
PMID:35986270
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了急性髓系白血病(AML)复发时克隆异质性的遗传和转录水平差异 | 本研究首次揭示了即使在具有相同初始事件的患者中,AML复发时的转录组差异也与克隆组成和进化有关 | NA | 研究AML复发时的克隆异质性及其对治疗抵抗和疾病复发的潜在机制 | 急性髓系白血病(AML)的诊断(Dx)和复发(Re)样本 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个AML患者的诊断和复发样本 |
20174 | 2024-08-08 |
Tumor associated macrophages-derived exosomes facilitate hepatocellular carcinoma malignance by transferring lncMMPA to tumor cells and activating glycolysis pathway
2022-Aug-19, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02458-3
PMID:35986343
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research paper | 研究肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)衍生的外泌体通过转移lncMMPA至肝细胞癌(HCC)细胞并激活糖酵解途径促进肝细胞癌恶性进展的机制 | 首次揭示了TAMs通过外泌体传递lncMMPA至HCC细胞,进而影响M2巨噬细胞极化和糖代谢的机制 | NA | 探究肝细胞癌细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的免疫代谢相互作用的潜在机制 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和肝细胞癌(HCC)细胞 | digital pathology | 肝细胞癌 | Smart-seq based scRNA-seq, qPCR, 免疫荧光, 免疫沉淀 | NA | RNA | 使用人肝细胞癌组织中的初级TAMs进行实验,并构建小鼠异种移植模型 |
20175 | 2024-08-08 |
Urological cancer organoids, patients' avatars for precision medicine: past, present and future
2022-Aug-19, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00866-8
PMID:35986387
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综述 | 本文综述了泌尿系统癌症类器官在精准医疗中的应用,包括其历史、现状和未来发展 | 介绍了三维培养模型类器官的最新应用,如药物筛选、癌症起源调查和单细胞测序的结合 | 当前类器官研究面临标准化培养流程缺乏、培养基优化需求以及无法完全模拟体内免疫系统等瓶颈 | 总结类器官在泌尿系统癌症中的发展和应用及其面临的挑战 | 泌尿系统癌症类器官 | NA | 泌尿系统癌症 | NA | NA | NA | NA |
20176 | 2024-08-08 |
The role of tetraspanins pan-cancer
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104777
PMID:35992081
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研究论文 | 本研究分析了24个四跨膜蛋白家族基因在33种癌症类型中的表达及其与肿瘤特征的关系 | 首次全面分析了四跨膜蛋白家族基因在泛癌中的作用,并进行了多维度的研究,包括基因差异表达、免疫亚型分析、临床分析等 | NA | 探讨四跨膜蛋白在泛癌中的作用及其与肿瘤特征的关系 | 24个四跨膜蛋白家族基因及其在33种癌症类型中的表达 | 数字病理学 | 泛癌 | NA | NA | 基因表达数据 | 11,057个TCGA样本 |
20177 | 2024-08-08 |
Identification of a drug-response gene in multiple myeloma through longitudinal single-cell transcriptome sequencing
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104781
PMID:35992084
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞转录组测序分析了复发性多发性骨髓瘤患者的细胞,并识别了与药物反应相关的基因。 | 首次通过纵向单细胞转录组测序揭示了多发性骨髓瘤细胞在不同治疗阶段的亚群动态变化,并鉴定了一个新的候选药物反应基因。 | 研究仅基于单一患者的样本,可能需要更多样本以验证结果的普遍性。 | 旨在通过纵向单细胞转录组测序分析,深入理解多发性骨髓瘤细胞对药物反应的克隆动态,并识别药物反应基因。 | 复发性多发性骨髓瘤患者的骨髓瘤细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 单一患者样本 |
20178 | 2024-08-08 |
Transcriptomic heterogeneity of cultured ADSCs corresponds to embolic risk in the host
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104822
PMID:35992088
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研究论文 | 本研究通过功能性单细胞RNA测序技术,揭示了脂肪来源间充质干细胞在培养中的转录组异质性与宿主体内栓塞风险之间的关系 | 开发了一种功能性单细胞RNA测序程序,并利用基因集富集分析和监督机器学习验证了ADSCs的栓塞风险子群,同时建立了一个预测栓塞风险的数学模型 | NA | 探讨脂肪来源间充质干细胞在培养中的转录组异质性与宿主体内栓塞风险的关系 | 脂肪来源间充质干细胞 | 干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA | NA |
20179 | 2024-08-08 |
Characterization of hemocytes and hematopoietic cells of a freshwater crayfish based on single-cell transcriptome analysis
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104850
PMID:35996577
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析,研究了淡水小龙虾的血液细胞和造血细胞的特征 | 发现了先前未描述的循环中的血液细胞类型,并揭示了造血组织中具有明显前体特征的细胞群以及参与铁稳态的细胞,这些发现可能增进我们对甲壳动物及其他动物造血干细胞调控的理解 | NA | 为了更好地理解对不同病原体的免疫反应,识别具有不同功能的血液细胞亚群并了解这些细胞的形成过程 | 淡水小龙虾的血液细胞和造血细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
20180 | 2024-08-08 |
Spatially resolved transcriptomic profiling of ovarian aging in mice
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104819
PMID:35996587
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术,分析了年轻和老年小鼠卵巢的转录组图谱,揭示了卵巢衰老过程中的细胞类型特异性变化 | 本研究首次采用空间转录组学技术,详细解析了卵巢衰老过程中的细胞类型特异性转录组变化,为理解卵巢衰老的分子机制提供了新的视角 | NA | 探讨卵巢衰老的生物学机制 | 年轻和老年小鼠的卵巢 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的卵巢样本 |