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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20121 | 2024-11-07 |
YAP induces a neonatal-like pro-renewal niche in the adult heart
2024-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00428-w
PMID:38510108
|
研究论文 | 研究探讨了YAP激活在成年心脏中诱导新生儿样再生微环境的作用 | 发现YAP激活可以重建心肌梗死后心脏的微环境,并诱导心脏再生 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类心脏中验证 | 研究YAP激活在成年心脏中的再生潜力及其微环境重建机制 | 成年表达YAP5SA的心肌细胞和心脏微环境 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠和人类心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20122 | 2024-11-07 |
Impacts of cryopreservation on phenotype and functionality of mononuclear cells in peripheral blood and ascites
2024-Feb, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2023-0136
PMID:38525442
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研究论文 | 研究了不同冷冻保存时间和额外冷冻-解冻循环对血液和腹水中单核细胞数量和功能的影响 | 首次探讨了不同冷冻保存条件对单核细胞亚型耐受性的影响 | 样本量较小,可能影响结果的普适性 | 探讨冷冻保存对单核细胞表型和功能的影响 | 血液和腹水中的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 流式细胞术,单细胞测序 | NA | 细胞 | 21份血液样本和8份腹水样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20123 | 2024-11-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals Immune Education promotes T cell survival in mice subjected to the cecal ligation and puncture sepsis model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366955
PMID:38562928
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究免疫教育对小鼠T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中存活的影响 | 首次通过单细胞RNA测序探讨了免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 仅在单一早期时间点进行了研究,未探讨长期效应 | 研究免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 小鼠脾脏T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中的反应 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组小鼠样本:对照组、免疫教育组、CLP组和免疫教育CLP组 | NA | NA | NA | NA |
| 20124 | 2024-11-07 |
Revisiting roles of mast cells and neural cells in keloid: exploring their connection to disease activity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1339336
PMID:38524141
|
研究论文 | 本文探讨了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩中的作用及其与疾病活动的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析了活动性瘢痕疙瘩、非活动性瘢痕疙瘩和成熟瘢痕样本,揭示了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩微环境中的重要作用 | 样本量较小,可能影响结果的普适性 | 阐明肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩发病机制中的作用及其与疾病活动的关系 | 瘢痕疙瘩样本中的肥大细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个活动性瘢痕疙瘩样本,4个非活动性瘢痕疙瘩样本,3个成熟瘢痕样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20125 | 2024-11-07 |
Comprehensive analysis of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in gastric adenocarcinoma: implications for prognosis and therapeutic strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451725
PMID:39478860
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义,并提出了新的治疗策略 | 本研究通过整合大规模基因组数据,利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了胃腺癌中独特的分子亚型及其与生存结果和免疫特征的关系,并提出了优于现有模型的预后模型 | NA | 探讨乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义,并提出新的治疗策略 | 胃腺癌中的乳酸化相关基因集、线粒体功能、肿瘤微环境、分子亚型、免疫细胞浸润和响应 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因组数据 | 大规模基因组数据,包括TCGA和多个GEO数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20126 | 2024-11-07 |
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis based on bioinformatics analysis and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460431
PMID:39497821
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法,识别并验证了与代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 本研究首次系统地探讨了吞噬作用与MASH之间的关系,并通过机器学习构建了有效的诊断模型 | 本研究主要基于生物信息学分析和机器学习,缺乏大规模临床样本的验证 | 识别并验证与MASH诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)及其相关的吞噬作用过程 | 机器学习 | 肝病 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20127 | 2024-11-07 |
Transcriptional Landscape of Cotton Roots in Response to Salt Stress at Single-cell Resolution
2023-Oct-27, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100740
PMID:39492159
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术系统分析了棉花根系对盐胁迫的响应 | 首次在单细胞分辨率下描绘了盐胁迫下棉花根系的转录图谱,揭示了细胞异质性和分化轨迹 | NA | 探究盐胁迫下棉花根系的分子机制 | 棉花根系在盐胁迫下的响应 | NA | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 从自然生长和不同盐处理条件下的5天龄侧根尖中获得了56,281个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20128 | 2024-11-07 |
SOX9 Modulates the Transformation of Gastric Stem Cells Through Biased Symmetric Cell Division
2023-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.01.037
PMID:36740200
|
研究论文 | 研究探讨了SOX9基因在胃干细胞通过偏向性对称细胞分裂进行恶性转化中的作用 | 提出了SOX9+SOX2+细胞在胃癌发生中的重要作用,并开发了一种新的鼠模型来研究这一过程 | 研究主要基于鼠模型和胃癌患者样本,可能无法完全反映人类胃癌的复杂性 | 研究胃干细胞在胃癌发生初期的行为,并探讨SOX9基因在这一过程中的作用 | 胃干细胞和胃癌 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 组织样本 | 鼠模型和胃癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20129 | 2024-11-07 |
Control of the Anterior Pituitary Cell Lineage Regulator POU1F1 by the Stem Cell Determinant Musashi
2021-03-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaa245
PMID:33373440
|
研究论文 | 本文研究了脂肪因子瘦素通过调节前垂体细胞系调控因子POU1F1的表达,影响能量稳态的机制 | 首次报道了干细胞标志物Musashi1对POU1F1 mRNA翻译的抑制作用,并揭示了瘦素信号通过逆转Musashi介导的POU1F1 mRNA翻译调控,协调前垂体生长激素细胞功能与代谢状态的机制 | NA | 探讨瘦素信号对前垂体细胞系调控因子POU1F1表达的调控机制 | 前垂体生长激素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 来自对照雌性小鼠的垂体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20130 | 2024-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Metabolic Stress-Dependent Activation of Cardiac Macrophages in a Model of Dyslipidemia-Induced Diastolic Dysfunction
2024-Nov-05, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了高脂饮食诱导的ApoE敲除小鼠模型中心脏细胞的表达谱,揭示了代谢应激对心脏巨噬细胞的激活作用及其在舒张功能障碍中的作用 | 首次揭示了代谢应激通过内质网应激途径直接激活心脏巨噬细胞,并提出了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂作为治疗HFpEF特定表型的潜在疗法 | NA | 探讨代谢应激对心脏炎症细胞的影响,特别是巨噬细胞,并评估钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂的潜在治疗效果 | ApoE敲除小鼠模型中的心脏细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 20131 | 2024-11-06 |
The study of Alzheimer's disease risk diagnosis based on natural killer cell marker genes in the multi-omics data
2024-Nov-03, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241295316
PMID:39497294
|
研究论文 | 研究基于自然杀伤细胞标记基因的多组学数据进行阿尔茨海默病风险诊断 | 提出了一种新的特征选择算法ADGCN,并基于17个特征基因构建了诊断模型 | NA | 识别与阿尔茨海默病相关的特征基因,构建诊断模型并探索其潜在的生物学机制 | 自然杀伤细胞标记基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | ADGCN-XGBoost | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20132 | 2024-11-06 |
Single-cell transcriptomics reveals IRF7 regulation of the tumor microenvironment in isocitrate dehydrogenase wild-type glioma
2024-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.754
PMID:39492838
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群基因表达调控网络,揭示了IRF7在IDH野生型胶质瘤微环境中的调控作用 | 首次系统地建立了IDH转录活性在胶质瘤中的单细胞水平调控机制,并绘制了相应的细胞图谱 | NA | 探讨IDH突变型和野生型胶质瘤的基因表达调控网络及其在肿瘤微环境中的作用 | IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 机器学习模型 | RNA | IDH突变型和野生型胶质瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20133 | 2024-11-06 |
Identification of immune feature genes and intercellular profiles in diabetic cardiomyopathy
2024-Oct-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v15.i10.2093
PMID:39493556
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研究论文 | 研究探讨了糖尿病心肌病(DCM)中的免疫分子机制,并基于免疫特征基因构建了诊断和预后模型 | 首次识别出Proenkephalin(Penk)和retinol binding protein 7(Rbp7)作为潜在的DCM生物标志物,并揭示了间质细胞与免疫细胞之间的异常表型转换和信号交流 | NA | 探讨糖尿病心肌病中的免疫分子机制并构建诊断和预后模型 | 糖尿病心肌病患者的免疫特征基因和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序(RNA-seq)、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹技术 | 机器学习 | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 验证队列中的样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 20134 | 2024-11-06 |
Single-cell genomics details the maturation block in BCP-ALL and identifies therapeutic vulnerabilities in DUX4-r cases
2024-09-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021705
PMID:38968149
|
研究论文 | 本文利用多模态单细胞测序技术,详细描述了B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)的成熟阻滞现象,并识别了DUX4重排(DUX4-r)亚型的治疗脆弱性 | 首次通过多模态单细胞测序技术,详细描绘了不同BCP-ALL亚型的转录组、表观遗传和免疫表型特征,并发现了DUX4-r亚型的多谱系启动和PI3K/AKT信号通路的激活 | 研究样本仅限于23例儿童BCP-ALL病例,可能无法完全代表所有BCP-ALL患者的情况 | 揭示BCP-ALL的生物学特性和治疗脆弱性,为开发新的治疗策略提供依据 | B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)及其DUX4重排(DUX4-r)亚型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 转录组、表观遗传和免疫表型数据 | 23例儿童BCP-ALL病例 | NA | NA | NA | NA |
| 20135 | 2024-11-06 |
Upregulated expression of ubiquitin ligase TRIM21 promotes PKM2 nuclear translocation and astrocyte activation in experimental autoimmune encephalomyelitis
2024-Sep-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98181
PMID:39264698
|
研究论文 | 研究揭示了泛素连接酶TRIM21通过促进PKM2核转位和星形胶质细胞活化在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用 | 首次揭示了TRIM21通过泛素化介导的机制调控PKM2核转位,从而影响星形胶质细胞活化和神经炎症 | NA | 探讨代谢重编程在星形胶质细胞活化中的作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中的星形胶质细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠及小鼠原代星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20136 | 2024-11-06 |
Integrative single-cell chromatin and transcriptome analysis of human plasma cell differentiation
2024-08-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023237
PMID:38643512
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞染色质和转录组分析,揭示了人类浆细胞分化的时空表观遗传和转录程序 | 本文首次将单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)结合,解析了浆细胞分化的轨迹,并识别了关键的转录因子 | 本文主要依赖于体外培养系统,可能无法完全反映体内浆细胞分化的复杂性 | 揭示驱动浆细胞分化早期阶段的时空表观遗传和转录程序 | 人类浆细胞分化过程中的表观遗传和转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | NA | 单细胞数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 20137 | 2024-11-06 |
Identification of estrogen response-associated STRA6+ granulosa cells within high-grade serous ovarian carcinoma by single-cell sequencing
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27790
PMID:38509903
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了高级别浆液性卵巢癌中的细胞异质性,并识别出与雌激素反应相关的STRA6+颗粒细胞 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中发现STRA6+颗粒细胞,并揭示其通过雌激素反应促进肿瘤生长的潜力 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据,未涉及其他类型的实验验证 | 揭示高级别浆液性卵巢癌中的细胞异质性,并探索潜在的治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌中的细胞亚群及其生物学功能 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 高级别浆液性卵巢癌的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 20138 | 2024-11-06 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.07.583985
PMID:38559249
|
研究论文 | 本文应用单细胞RNA测序技术分析了5名健康育龄女性子宫内膜和子宫肌层的细胞异质性和动态变化 | 本文构建了一个包含超过167,000个细胞的正常子宫细胞图谱,并提出了一个包含39个子类型的共识注释系统 | 本文仅分析了健康育龄女性的子宫细胞,未涉及其他年龄段或疾病状态 | 研究健康育龄女性子宫的细胞异质性和动态变化 | 子宫内膜和子宫肌层的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名健康育龄女性 | NA | NA | NA | NA |
| 20139 | 2024-11-06 |
In situ tissue profile of rat trigeminal nerve in trigeminal neuralgia using spatial transcriptome sequencing
2024-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001110
PMID:38270619
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研究论文 | 本研究通过空间转录组测序技术分析了三叉神经痛大鼠模型中三叉神经组织的细胞间相互作用 | 揭示了三叉神经节对施万细胞脱髓鞘和再髓鞘化反应的影响机制,并发现了新的重要靶基因和调控通路 | NA | 探讨三叉神经痛中不同类型细胞间的相互作用,特别是脱髓鞘对三叉神经节的影响及其内在机制 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织 | NA | 三叉神经痛 | 空间转录组测序 | NA | 基因表达矩阵 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20140 | 2024-11-06 |
Integrative analysis of COL6A3 in lupus nephritis: insights from single-cell transcriptomics and proteomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309447
PMID:38855105
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和蛋白质组学分析,揭示了COL6A3在狼疮性肾炎中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析,揭示了COL6A3在狼疮性肾炎中的显著上调及其在关键信号通路中的重要作用 | 样本量较小,可能影响结果的普适性 | 识别狼疮性肾炎相关的新型生物标志物和治疗靶点,以改善患者的治疗效果和预后 | 狼疮性肾炎患者和健康对照组的单细胞表达数据及蛋白质组学数据 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 狼疮性肾炎患者21例,健康对照组3例,狼疮性肾炎患者9例,无狼疮性肾炎的系统性红斑狼疮患者11例 | NA | NA | NA | NA |