单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20101 - 20120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20101 | 2024-08-08 |
Heterogeneity in NK Cell Subpopulations May Be Involved in Kidney Cancer Metastasis
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/6378567
PMID:36046723
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分离出自然杀伤（NK）细胞亚群，并探讨其在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）转移中的作用 | 首次揭示了NK细胞亚群NK(EGR1)和NK(CAPG)与肾癌转移的密切关系 | NA | 研究肾癌免疫微环境和免疫细胞异质性，以改善肾癌治疗效果 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的NK细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20102 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of neuroblastoma identifies chemoresistance-associated genes and pathways
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.031
PMID:36051886
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了神经母细胞瘤中与化疗耐药相关的基因和通路 | 首次揭示了化疗耐药神经母细胞瘤细胞的双向能力，即肾上腺素能向间充质转化 | NA | 探讨神经母细胞瘤中肿瘤内异质性与治疗耐药性的关联 | 神经母细胞瘤细胞及其对依托泊苷和顺铂的耐药性 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 498个肿瘤样本 |
| 20103 | 2024-08-08 |
Bioinformatics analysis of potential pathogenesis and risk genes of immunoinflammation-promoted renal injury in severe COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950076
PMID:36052061
|
研究论文 | 本研究通过整合166个COVID-19患者的外周血转录组数据，利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）和短时序表达挖掘（STEM）分析，识别与严重COVID-19相关的肾损伤关键基因，并探讨其潜在的免疫炎症机制。 | 本研究首次在严重COVID-19患者中识别出一组与肾损伤进展相关的关键基因，并通过蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和单细胞测序分析，深入探讨了这些基因在免疫细胞中的分布及其在肾损伤中的作用机制。 | 本研究主要基于转录组数据进行分析，未来需要更多的实验验证来支持这些发现，并进一步探讨这些基因在COVID-19肾损伤中的具体作用机制。 | 探讨严重COVID-19中免疫炎症促进肾损伤的病理机制，并识别相关的风险基因。 | 严重COVID-19患者的肾损伤及其相关的免疫炎症机制。 | 生物信息学 | COVID-19 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），短时序表达挖掘（STEM）分析，蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析，单细胞测序 | 随机森林，Nomogram模型 | 转录组数据，单细胞测序数据 | 166个COVID-19患者的外周血样本 |
| 20104 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals the potential risk of anti-mesothelin CAR T Cell therapy toxicity to different organs in humans
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.807915
PMID:36059490
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了来自人类主要生理系统的数据，评估了抗间皮素CAR-T细胞疗法对不同器官的潜在毒性风险 | 首次利用scRNA-seq数据对不同器官在抗间皮素CAR-T细胞疗法中的毒性风险进行分级 | NA | 评估抗间皮素CAR-T细胞疗法对不同器官的潜在毒性风险 | 人类主要生理系统的器官，包括呼吸、心血管、消化和泌尿系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多个器官的细胞样本 |
| 20105 | 2024-08-08 |
Research progress on application of single-cell TCR/BCR sequencing technology to the tumor immune microenvironment, autoimmune diseases, and infectious diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.969808
PMID:36059506
|
研究论文 | 本文总结了单细胞TCR/BCR测序技术在肿瘤免疫微环境、自身免疫疾病、传染病、免疫治疗和慢性炎症疾病中的应用进展 | 单细胞TCR/BCR测序技术能够克服细胞异质性问题，提供新的方法和视角，深入分析细胞群体中个体细胞的行为和机制及其与机体的关系 | 讨论了该技术的不足和未来应用的前景 | 探讨单细胞TCR/BCR测序技术在多种疾病中的应用及其未来发展 | 肿瘤免疫微环境、自身免疫疾病、传染病、免疫治疗和慢性炎症疾病 | 生物技术 | NA | 单细胞TCR/BCR测序 | NA | 基因表达和免疫组学数据 | 大量单细胞 |
| 20106 | 2024-08-08 |
Identification and verification of YBX3 and its regulatory gene HEIH as an oncogenic system: A multidimensional analysis in colon cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.957865
PMID:36059530
|
研究论文 | 本研究探讨了YBX3基因及其调控的lncRNA HEIH在结肠癌中的致病作用及其对肿瘤进展的影响 | 首次揭示了YBX3及其调控基因HEIH在多种癌症中的致病作用，特别是在结肠癌中的免疫逃逸机制 | 研究主要集中在结肠癌，可能需要进一步研究其在其他癌症类型中的作用 | 研究YBX3及其调控基因HEIH在癌症中的致病作用及其对肿瘤进展的影响 | YBX3基因及其调控的lncRNA HEIH在结肠癌中的作用 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA pull-down, 质谱(MS), 组织微阵列(TMA), qPCR, 蛋白质印迹(western blotting) | NA | RNA | 93名患者, 12名不同临床病理阶段的患者 |
| 20107 | 2024-08-08 |
Profiling mouse cochlear cell maturation using 10× Genomics single-cell transcriptomics
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.962106
PMID:36060279
|
研究论文 | 本研究利用10x Genomics单细胞转录组测序技术，分析了幼年和成熟小鼠耳蜗细胞在发育过程中的转录组动态变化 | 首次在单细胞水平上揭示了内毛细胞和外毛细胞在不同发育阶段的成熟高峰期，并鉴定了在耳蜗毛细胞和螺旋神经节神经元成熟过程中表达的长非编码RNA基因 | NA | 研究小鼠耳蜗细胞在发育过程中的转录组动态变化 | 幼年和成熟小鼠的耳蜗细胞 | 数字病理学 | NA | 10x Genomics单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 幼年和成熟小鼠的耳蜗细胞 |
| 20108 | 2024-08-08 |
A Cell Differentiation Trajectory-Related Signature for Predicting the Prognosis of Lung Adenocarcinoma
2022, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2022/3483498
PMID:36072012
|
研究论文 | 本文筛选与细胞分化轨迹相关的基因，并构建了一个用于预测肺腺癌（LUAD）预后的细胞分化轨迹相关特征 | 构建了一个基于细胞分化轨迹相关基因的预后特征，并开发了一个具有高预测性能和准确性的诺模图 | NA | 筛选细胞分化轨迹相关基因并构建预后特征，以预测肺腺癌的预后 | 肺腺癌（LUAD）的预后预测 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的LUAD单细胞mRNA表达谱和TCGA-LUAD转录组数据 |
| 20109 | 2024-08-08 |
Novel insight on marker genes and pathogenic peripheral neutrophil subtypes in acute pancreatitis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.964622
PMID:36072587
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法，分析了急性胰腺炎患者外周血细胞的表达数据，并验证了两个功能基因模块及特定基因作为严重胰腺炎的预测因子。同时，通过结合批量测序和单细胞测序数据，识别了COVID-19诱导的急性胰腺炎中关键的中性粒细胞亚型。 | 首次全面分析了急性胰腺炎患者外周血的基因表达模式，并识别了与COVID-19相关的关键中性粒细胞亚型。 | NA | 旨在深入了解急性胰腺炎的分子机制，并探索COVID-19诱导的急性胰腺炎的预测因子。 | 急性胰腺炎患者的外周血细胞及COVID-19患者的测序数据。 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 机器学习方法、批量测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 本地患者的具体样本数量未明确提及 |
| 20110 | 2024-08-08 |
The development and function of CD11c+ atypical B cells - insights from single cell analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.979060
PMID:36072594
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究CD11c+非典型B细胞（ABCs）的发育和功能 | 单细胞RNA测序技术使得在不同免疫环境下准确识别ABCs成为可能，并揭示了ABCs是一种高度保守的记忆B细胞谱系 | ABCs的正常功能仍不明确 | 探讨ABCs的发育和功能 | CD11c+非典型B细胞（ABCs） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 20111 | 2024-08-08 |
Clustering CITE-seq data with a canonical correlation-based deep learning method
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.977968
PMID:36072672
|
研究论文 | 本文提出了一种基于典型相关分析的深度学习方法scCTClust，用于聚类CITE-seq数据，该方法通过两个特定组学的神经网络提取组学数据中的聚类信息，并采用深度典型相关方法找到两个组学的最大相关表示，最后利用一种新颖的分散聚类方法对两个组学的潜在表示的线性组合进行聚类 | 本文创新性地提出了一种适用于多组学数据特别是CITE-seq数据的聚类方法scCTClust，该方法能够克服CITE-seq数据噪声大、维度高和稀疏性强的特点，并通过深度典型相关方法找到两个组学的最大相关表示 | NA | 克服CITE-seq数据噪声大、维度高和稀疏性强的问题，找到适合聚类的组合表示 | CITE-seq数据 | 机器学习 | NA | CITE-seq | 神经网络 | 多组学数据 | NA |
| 20112 | 2024-08-08 |
The aryl hydrocarbon receptor directs the differentiation of murine progenitor blastomeres
2023-08, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-022-09755-9
PMID:36029422
|
research paper | 本文通过单细胞RNA测序研究了早期胚胎发育阶段中芳香烃受体（AHR）对胚胎细胞分化的影响 | 首次揭示了AHR在胚胎发育早期作为分化调控因子的作用 | NA | 探讨AHR在哺乳动物胚胎发育中的调控作用及其对胚胎细胞分化的影响 | 早期胚胎发育阶段的2细胞、4细胞和8细胞胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 20113 | 2024-08-05 |
FOXP4 promotes proliferation of human spermatogonial stem cells
2023 May-Jun, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202254
PMID:36018067
|
研究论文 | 本文研究了FOXP4在促进人类生精干细胞增殖中的作用 | 揭示了FOXP4在调节人类生精干细胞自我更新和分化中的关键作用 | 该研究主要集中在单细胞测序数据分析，缺乏更多体内实验验证 | 探讨人类生精干细胞的调控机制 | 人类生精干细胞及其在生殖中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 人类睾丸组织的单细胞测序数据 |
| 20114 | 2024-08-08 |
Lung epithelial and myeloid innate immunity in influenza-associated or COVID-19-associated pulmonary aspergillosis: an observational study
2022-12, The Lancet. Respiratory medicine
DOI:10.1016/S2213-2600(22)00259-4
PMID:36029799
|
研究论文 | 本研究探讨了流感相关性肺曲霉病（IAPA）和COVID-19相关性肺曲霉病（CAPA）患者中肺上皮和髓系先天免疫的作用。 | 首次详细分析了IAPA和CAPA患者中肺上皮和髓系先天免疫的基因表达和蛋白质水平，揭示了抗真菌免疫的三重缺陷。 | 研究样本量有限，且仅限于特定时间段内入住ICU的患者，可能影响结果的普遍性。 | 探索IAPA和CAPA患者中肺上皮和髓系先天免疫的作用及其病理生理机制。 | IAPA和CAPA患者的肺上皮和髓系先天免疫。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | nCounter基因表达分析、蛋白质分析、RNAScope、GeoMx空间转录组学 | NA | 生物样本 | 166名符合条件的患者，其中40名患有IAPA，52名患有流感但无曲霉病，33名患有CAPA，41名患有COVID-19但无曲霉病。 |
| 20115 | 2024-08-08 |
The CELLO trial: Protocol of a planned phase 4 study to assess the efficacy of Ocrelizumab in patients with radiologically isolated syndrome
2022-Dec, Multiple sclerosis and related disorders
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.msard.2022.104143
PMID:36031693
|
研究论文 | 本文描述了CELLO临床试验的方案，该试验旨在评估ocrelizumab在放射学孤立综合征（RIS）患者中的疗效。 | 本研究首次在RIS患者中评估ocrelizumab的疗效，并探索与自身免疫相关的生物标志物及免疫恢复情况。 | NA | 研究旨在评估ocrelizumab在RIS患者中的疗效，并识别与自身免疫和免疫恢复相关的生物标志物。 | 放射学孤立综合征（RIS）患者。 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物标志物 | 100名参与者 |
| 20116 | 2024-08-08 |
Cryobanking of Human Distal Lung Epithelial Cells for Preservation of Their Phenotypic and Functional Characteristics
2022-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0507MA
PMID:36036918
|
研究论文 | 本文详细介绍了一种用于保存人远端肺上皮细胞表型和功能特性的低温保存方法 | 该方法能够有效保存远端气体交换区域的功能性上皮细胞类型，这在以往的技术中是缺乏的 | NA | 研究目的是开发一种能够长期保存人远端肺组织细胞功能和分子表型的方法 | 研究对象包括人远端肺上皮细胞及其表型和功能特性 | 数字病理学 | 肺疾病 | 流式细胞术，上皮类器官形成效率分析，单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 包括来自人肺组织的细胞 |
| 20117 | 2024-08-08 |
Single-cell phenotypic profiling to identify a set of immune cell protein biomarkers for relapsed and refractory diffuse large B cell lymphoma: A single-center study
2022-12, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MA0822-720RR
PMID:36040107
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，从复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的18份诊断性外周血单个核细胞样本中，鉴定和验证了mRNA和蛋白质水平的免疫细胞标志物。 | 开发了一套新的复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤的诊断标志物，通过单细胞分辨率的检测方法，提供了精确的标志物，有助于克服肿瘤间和肿瘤内的异质性。 | NA | 鉴定复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤的免疫细胞标志物，并验证其在诊断中的应用。 | 复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的免疫细胞标志物。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | 18份复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的外周血单个核细胞样本，以及5份健康志愿者的外周血单个核细胞样本。 |
| 20118 | 2024-08-08 |
UNIFAN: A Tool for Unsupervised Single-Cell Clustering and Annotation
2022-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0251
PMID:36036832
|
研究论文 | UNIFAN 是一种用于单细胞 RNA 测序数据（scRNA-seq）的无监督细胞类型注释工具 | UNIFAN 利用通路和生物过程信息进行细胞聚类和注释 | NA | 开发和介绍 UNIFAN 工具的安装和使用步骤 | 单细胞 RNA 测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) | NA | 表达数据 | NA |
| 20119 | 2024-08-08 |
FastMix: a versatile data integration pipeline for cell type-specific biomarker inference
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac585
PMID:36018232
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FastMix的新型分析管道，用于计算免疫学，整合流式细胞术、bulk转录组学和临床协变量，以识别细胞类型特异性基因表达特征和生物标志物基因 | FastMix通过线性混合效应模型（LMER）解决了基因表达和流式细胞术整合分析中的'大p，小n'问题，并引入了基于矩的估计器，减少了参数估计中的偏差并提高了效率 | NA | 开发一种数据整合管道，用于分析流式细胞术和转录组学数据，结合实验变量进行生物标志物推断 | 流式细胞术和转录组学数据 | 计算免疫学 | NA | 流式细胞术，bulk转录组学 | 线性混合效应模型（LMER） | 基因表达数据，流式细胞术数据 | 涉及两个疫苗研究的实际数据 |
| 20120 | 2024-08-08 |
Sex-dependent differential transcript expression in the placenta of growth restricted infants
2022-10, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2022.08.004
PMID:36031700
|
研究论文 | 研究探讨了在宫内生长受限婴儿的胎盘中，性别特异性基因表达的变化 | 首次识别了与宫内生长受限婴儿相关的403个候选转录本，其中103个显示性别特异性表达 | 研究仅基于12个胎盘样本，样本量较小 | 旨在评估宫内生长受限婴儿胎盘中性别特异性基因表达的变化 | 人类胎盘组织样本 | 基因表达 | 宫内生长受限 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胎盘样本 |