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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20101 | 2024-08-07 |
Inhibition of the renin-angiotensin system causes concentric hypertrophy of renal arterioles in mice and humans
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154337
PMID:34762601
|
研究论文 | 研究通过使用携带荧光细胞谱系示踪剂的小鼠、单细胞RNA测序以及在人和小鼠中长期抑制肾素-血管紧张素系统(RAS),发现肾素缺失或RAS抑制导致肾内动脉和 arterioles 向心性增厚 | 首次揭示了肾素细胞的多克隆扩张和转化,从经典内分泌表型转变为基质分泌表型,导致血管疾病 | 需要对人类进行前瞻性形态学研究,以确定广泛使用RAS抑制剂导致的肾血管损伤程度 | 探讨肾素-血管紧张素系统抑制对肾血管结构的影响 | 小鼠和人类的肾内动脉和 arterioles | NA | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20102 | 2024-08-07 |
Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2907-3
PMID:33184512
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研究论文 | 本研究使用Patch-seq技术结合膜片钳记录、生物素染色和单细胞RNA测序,分析了成年小鼠初级运动皮层中超过1,300个神经元的转录组和形态电生理特性 | 首次在同一组细胞中同时研究了神经元的转录组和形态电生理多样性,揭示了神经元类型在皮层中并非总是形成离散实体,而是在家族级别上形成连续且相关的转录组和形态电生理景观 | 研究仅限于成年小鼠的初级运动皮层,可能需要进一步研究其他脑区和不同发育阶段的神经元类型 | 探讨神经元类型的转录组和形态电生理多样性及其在皮层中的组织方式 | 成年小鼠初级运动皮层中的神经元 | 神经科学 | NA | Patch-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过1,300个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 20103 | 2024-08-07 |
A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03950-0
PMID:34616075
|
研究论文 | 本文报道了通过BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN)生成的哺乳动物初级运动皮层的多模态细胞普查和图谱 | 研究首次整合了单细胞转录组、染色质可及性、DNA甲基化图谱、空间解析的单细胞转录组、形态学和电生理特性以及细胞分辨率的输入-输出映射,并通过跨模态计算分析进行整合 | NA | 推进对大脑细胞类型组织的集体知识和理解 | 哺乳动物初级运动皮层的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、DNA甲基化分析、空间解析的单细胞转录组学 | 跨模态计算分析 | 转录组、染色质可及性、DNA甲基化、形态学和电生理数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20104 | 2024-08-07 |
Dysbalance of ACE2 levels - a possible cause for severe COVID-19 outcome in COPD
2021-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.224
PMID:33978304
|
研究论文 | 研究探讨了慢性阻塞性肺病(COPD)患者中ACE2及其相关辅助因子的表达水平,以及这些变化如何影响SARS-CoV-2感染的风险 | 首次揭示了COPD患者肺组织中ACE2和TMPRSS2表达增加,同时循环sACE2水平降低,这些变化可能增加COPD患者对SARS-CoV-2感染的易感性 | 研究未涉及这些变化与肺部血流动力学变化之间的关联 | 探究COPD患者中ACE2及其相关辅助因子的表达变化及其对SARS-CoV-2感染的影响 | COPD、特发性肺动脉高压(IPAH)和肺纤维化(PF)患者的肺组织样本及健康对照组样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 定量PCR、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | COPD患者28例,IPAH患者10例,PF患者10例,健康对照组10例 | NA | NA | NA | NA |
| 20105 | 2024-08-07 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
|
研究论文 | 研究通过开发一种新的肽激动剂,探讨了蛋白酶活化受体3(PAR3)在痛觉中的作用 | 开发了一种脂质连接的PAR3激动剂C660,该激动剂能特异性地激活PAR3并引起DRG和三叉神经元中的钙反应 | NA | 更好地理解PAR3在外周感觉神经系统中的潜在功能 | PAR3在痛觉中的作用及其与其他PARs的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | G蛋白偶联受体(GPCRs) | RNA序列数据 | 使用了野生型和PAR3敲除的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 20106 | 2024-08-07 |
The alx3 gene shapes the zebrafish neurocranium by regulating frontonasal neural crest cell differentiation timing
2021-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197483
PMID:33741714
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,揭示了alx3基因在调控前鼻神经嵴细胞分化时间和细胞形态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术,详细定义了颅神经嵴细胞的不同群体,并发现Alx转录因子基因家族在前鼻神经嵴细胞中的富集 | NA | 深入理解控制发育时序的基因如何塑造颅面骨骼元素 | alx3基因在前鼻神经嵴细胞分化中的作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20107 | 2024-08-07 |
Comprehensive single-cell sequencing reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of nasopharyngeal carcinoma
2021-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21795-z
PMID:33750785
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态和肿瘤特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞群及其亚群,并揭示了其对患者预后和治疗结果的影响 | 研究仅基于14名患者的样本,可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 深入理解鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态,以促进癌症诊断、治疗和预后 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞及其亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66,627个细胞来自14名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20108 | 2024-08-07 |
Quantitative single-cell interactomes in normal and virus-infected mouse lungs
2020-06-26, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.044404
PMID:32461220
|
研究论文 | 本文介绍了一种定量直观算法和优化实验方案,用于构建和比较正常与感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞间的相互作用网络。 | 提出了一种新的定量直观算法,结合优化的实验协议,使不具有高级编程技能的实验室科学家也能适应。 | 算法和方法的通用性需要在其他器官和人类样本中进一步验证。 | 解析哺乳动物器官中通过配体-受体相互作用进行的细胞间信号传递,特别是在病毒感染情况下的变化。 | 正常和感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 定量直观算法 | RNA序列数据 | 每种细胞类型至少90个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20109 | 2024-08-07 |
Clonally expanded CD8 T cells patrol the cerebrospinal fluid in Alzheimer's disease
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1895-7
PMID:31915375
|
研究论文 | 本研究通过综合分析多个队列,揭示了阿尔茨海默病中血液和脑脊液的适应性免疫变化,并发现了克隆扩增的CD8 T细胞在脑脊液中的存在 | 首次发现阿尔茨海默病患者脑脊液中存在克隆扩增的CD8 T细胞,并证实这些细胞对Epstein-Barr病毒抗原具有特异性 | NA | 探究阿尔茨海默病中适应性免疫反应的贡献 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞和脑脊液中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 机器学习 | 细胞 | 多个队列的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20110 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of estrogen- and endocrine-disrupting chemical-induced reorganization of mouse mammary gland
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0618-9
PMID:31701034
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研究论文 | 本研究使用手术绝经(卵巢切除)小鼠模型,分析了17β-雌二醇(E2)和多溴联苯醚(PBDEs)对乳腺组织的影响,并通过单细胞RNA测序(scRNAseq)揭示了E2和PBDEs对乳腺细胞基因表达的调控作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了E2和PBDEs对乳腺细胞基因表达的调控作用,并发现了PBDEs促进E2-AREG-EGFR-M2巨噬细胞途径 | NA | 探究绝经后雌激素和内分泌干扰化学物质对小鼠乳腺组织的重组影响 | 小鼠乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 手术绝经(卵巢切除)小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 20111 | 2024-08-07 |
Genome organization and DNA accessibility control antigenic variation in trypanosomes
2018-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0619-8
PMID:30333624
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研究论文 | 本文研究了布氏锥虫中基因组组织和DNA可及性控制抗原变异的现象 | 首次在布氏锥虫中识别了连接全局基因组结构、局部染色质构象和抗原变异的分子机制,即组蛋白变异体 | 研究受限于抗原基因阵列的高度重复性和杂合性,这阻碍了许多病原体的完整基因组组装 | 探讨基因组结构在抗原变异中的作用 | 布氏锥虫的抗原基因阵列及其基因组结构 | 基因组学 | 寄生虫病 | 长读长测序技术、染色体构象捕获(Hi-C) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20112 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析剖析了银屑病的严重程度与细胞生态系统的关系 | 首次通过空间转录组学揭示了健康皮肤和炎症皮肤之间免疫微环境的显著差异 | 尚未深入探讨银屑病对其他系统性疾病的影响 | 研究银屑病的细胞组学及其在不同严重程度下的差异 | 25个健康、活跃病变和临床未涉及的皮肤活检样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 25个皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20113 | 2024-08-07 |
Trajectory reconstruction identifies dysregulation of perinatal maturation programs in pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112330
PMID:37014753
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)重建轨迹,识别了多能干细胞衍生的心肌细胞(PSC-CMs)中胎儿成熟程序的失调 | 首次通过单细胞RNA测序技术,比较了体内外心肌细胞成熟过程的差异,并识别了跨物种间在PSC-CMs中持续失调的转录因子网络 | 多能干细胞衍生的心肌细胞未能达到完全功能成熟 | 探究多能干细胞衍生的心肌细胞成熟过程中的机制差异,并寻找改善其临床应用的方法 | 多能干细胞衍生的心肌细胞及其成熟过程 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 广泛采样了先前难以分离的胎儿期时间段的鼠体内心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20114 | 2024-08-07 |
SwarnSeq: An improved statistical approach for differential expression analysis of single-cell RNA-seq data
2021-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.02.014
PMID:33662531
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SwarnSeq的改进统计方法,用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | SwarnSeq方法在模型中考虑了单细胞RNA测序数据中的分子捕获过程,这是现有差异表达方法中较少考虑的 | NA | 开发一种改进的差异表达分析方法,以解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 10个不同的真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20115 | 2024-08-04 |
Applications of single‑cell omics and spatial transcriptomics technologies in gastric cancer (Review)
2024-Apr, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14285
PMID:38406595
|
综述 | 本文综述了单细胞组学和空间转录组学技术在胃癌研究中的应用与进展 | 综述了单细胞组学和ST技术在胃癌分子特征及肿瘤异质性研究中的独特见解 | 缺乏大规模临床数据验证应用效果的讨论 | 探讨单细胞组学和ST技术对胃癌研究的影响 | 单细胞组学和空间转录组学在胃癌中的具体应用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20116 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell sequencing identified a prognostic model based on the macrophage and lipid metabolism related signatures for osteosarcoma patients
2024-Feb-29, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26091
PMID:38404899
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研究论文 | 本研究利用大规模和单细胞测序技术,探讨了与巨噬细胞和脂质代谢相关的预后模型在骨肉瘤患者中的应用 | 创新地建立了一个基于巨噬细胞和脂质代谢的风险模型,为骨肉瘤患者的化疗效果提供了新的预测工具 | 未提及具体的样本量和外部验证的有效性 | 研究巨噬细胞的分化状态与骨肉瘤化疗效果间的关系 | 骨肉瘤患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 大规模和单细胞测序 | 风险模型 | 基因相关数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20117 | 2024-08-07 |
Cutting-Edge Skin Ageing Research on tissue stem cell
2024-Feb-26, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvae022
PMID:38408191
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综述 | 本文综述了干细胞衰老的机制及其对健康的影响,并探讨了干细胞疗法在皮肤领域的应用潜力 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在干细胞研究中的进展 | NA | 探讨干细胞衰老的机制及其对健康的影响 | 干细胞及其在组织修复和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20118 | 2024-08-07 |
Development of a CD8+ T cell associated signature for predicting the prognosis and immunological characteristics of gastric cancer by integrating single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-02-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54273-9
PMID:38402299
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,开发了一种与CD8+ T细胞相关的预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 本研究首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,开发了一种新的预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 本研究主要基于TCGA和GEO队列的数据,未来需要更多队列验证其普适性 | 开发一种能够预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 胃癌患者的预后和免疫特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 703个CD8+ T细胞特征基因,其中8个用于构建预测标志物 | NA | NA | NA | NA |
| 20119 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies the differentiation trajectory from inflammatory monocytes to pro-resolving macrophages in a mouse skin allergy model
2024-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46148-4
PMID:38396021
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了小鼠皮肤过敏模型中炎症单核细胞向促解析巨噬细胞的分化轨迹 | 本研究阐明了Ly6C经典单核细胞向Ly6C促解析巨噬细胞的逐步分化过程 | 本研究局限于小鼠模型,未验证在人类过敏反应中的适用性 | 研究炎症单核细胞在小鼠皮肤过敏中向巨噬细胞的分化过程 | 研究对象为Ly6C经典单核细胞及其向促解析巨噬细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq,流式细胞术分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20120 | 2024-08-04 |
Identifying PLAUR as a Pivotal Gene of Tumor Microenvironment and Regulating Mesenchymal Phenotype of Glioblastoma
2024-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16040840
PMID:38398231
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研究论文 | 本研究确定了PLAUR作为胶质母细胞瘤肿瘤微环境的关键基因,并调控其间质表型 | 识别PLAUR作为胶质母细胞瘤间质表型的中心基因,揭示其在肿瘤相关巨噬细胞和胶质瘤细胞之间的配体-受体相互作用 | 尚未详细探讨PLAUR在不同肿瘤微环境条件下的具体作用机制 | 识别能够通过肿瘤内在和外在机制调节胶质母细胞瘤间质表型的基因 | 胶质母细胞瘤及其相关的微环境组成部分 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序,功能富集分析,WGCNA | BALB/c裸鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及细胞系、原代胶质瘤细胞及BALB/c裸鼠的实验 | NA | NA | NA | NA |