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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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20061 | 2024-08-08 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
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research paper | 本文通过元分析单细胞RNA测序数据、转录因子调控网络分析、高分辨率共聚焦显微镜和胰岛素分泌测量,研究了衰老对人类胰岛β细胞功能和身份的影响。 | 揭示了β细胞衰老过程中的分子和功能变化,包括转录调控失调、β细胞转录因子网络重组、基因转录率增加和葡萄糖刺激的胰岛素释放减少,以及内质网应激和自噬途径的激活。 | NA | 理解衰老对β细胞的影响。 | 人类胰岛β细胞。 | digital pathology | type 2 diabetes | single-cell RNA sequencing | NA | RNA sequencing data | 非糖尿病捐赠者,涵盖了人类生命周期的绝大部分。 |
20062 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of the cycling murine ovary
2022-10-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77239
PMID:36205477
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术,分析了成年小鼠卵巢中超过34,000个细胞的转录组,描述了在正常动情周期和其他生殖状态下发生的转录变化,构建了一个全面的小鼠卵巢细胞类型和状态的动态图谱 | 首次构建了小鼠卵巢在动情周期中的单细胞转录组图谱,揭示了细胞状态的动态变化和旁分泌因子在此过程中的作用 | NA | 研究小鼠卵巢在动情周期中的细胞状态动态变化及其调控机制 | 小鼠卵巢中的细胞类型及其在动情周期中的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过34,000个细胞 |
20063 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers a neuron-like macrophage subset associated with cancer pain
2022-10-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5535
PMID:36206343
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了与癌症疼痛相关的一种神经样巨噬细胞亚群,并探讨了其在肿瘤神经发生中的作用机制 | 首次发现巨噬细胞向神经样细胞转化的现象(MNT),并证实其直接促进肿瘤神经发生 | NA | 探索肿瘤相关巨噬细胞在促进肿瘤神经发生中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在癌症疼痛中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 涉及肺腺癌模型中的巨噬细胞 |
20064 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of shrimp immune cells identifies macrophage-like phagocytes
2022-Oct-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80127
PMID:36200862
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了虾的免疫细胞,识别出一种新的巨噬细胞样吞噬细胞亚型 | 本研究首次在虾的血液中发现了一种新的巨噬细胞样细胞亚型,称为单核细胞血细胞2(MH2),该亚型具有吞噬功能并表达与哺乳动物巨噬细胞相似的标记基因 | NA | 揭示无脊椎动物先天免疫细胞的多样性和功能 | 虾的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种主要的细胞类型:前血细胞、单核血细胞和粒细胞 |
20065 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals functionally specialized vascular endothelium in brain
2022-10-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57520
PMID:36197007
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠大脑皮层在发育、成年、衰老和神经炎症过程中的非神经细胞群体,揭示了大脑血管内皮细胞的功能特化 | 发现了反应性内皮小静脉,这是一种特化的后毛细血管内皮细胞隔室,具有一致表达的细胞粘附分子、优先的白细胞迁移、与血管周围巨噬细胞群体的关联以及启动中枢神经系统免疫反应的内皮激活等特征 | NA | 研究大脑血管内皮细胞的异质性及其在神经炎症和衰老中的分子改变 | 小鼠大脑皮层的非神经细胞群体 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
20066 | 2024-08-08 |
Single-cell dissection of remodeled inflammatory ecosystem in primary and metastatic gallbladder carcinoma
2022-Oct-05, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00445-8
PMID:36198671
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了慢性胆囊炎、原发性胆囊癌及其转移病灶的细胞生态系统重塑情况 | 首次全面揭示了从炎症到癌症再到转移过程中,胆囊癌的细胞和微环境的重编程机制 | NA | 旨在更好地表征从炎症到癌症再到转移的进展过程 | 慢性胆囊炎、原发性胆囊癌及其匹配的转移病灶 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6例慢性胆囊炎、12例未经治疗的胆囊癌和6例匹配的转移病灶 |
20067 | 2024-08-08 |
Helicobacter pylori shows tropism to gastric differentiated pit cells dependent on urea chemotaxis
2022-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33165-4
PMID:36198679
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研究论文 | 本文研究了致癌细菌幽门螺杆菌(H. pylori)对胃分化沟细胞的趋向性,发现其偏好附着于胃单位沟区域的分化细胞 | 首次揭示了幽门螺杆菌对胃分化沟细胞的偏好附着性,并发现这种附着依赖于细菌对宿主细胞释放的尿素的趋化性 | NA | 探究幽门螺杆菌对胃分化沟细胞的趋向性及其机制 | 幽门螺杆菌、胃分化沟细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
20068 | 2024-08-08 |
SLAMF7 modulates B cells and adaptive immunity to regulate susceptibility to CNS autoimmunity
2022-Oct-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02594-9
PMID:36199066
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研究论文 | 研究探讨了SLAMF7基因在调节中枢神经系统(CNS)自身免疫和B细胞功能中的作用 | 发现了SLAMF7在CNS免疫调节和B细胞功能中的新角色,揭示了SLAMF7与多发性硬化症(MS)遗传关联的基础 | NA | 探究SLAMF7基因如何影响多发性硬化症的易感性和免疫功能 | SLAMF7基因、B细胞、T细胞和CNS免疫细胞 | NA | 多发性硬化症 | 光谱细胞仪、BioPlex分析、单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞数据 | WT和SLAMF7-/-小鼠模型,以及人类脑脊液(CSF)免疫细胞 |
20069 | 2024-08-08 |
A model-based constrained deep learning clustering approach for spatially resolved single-cell data
2022-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276477.121
PMID:36198490
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Deep Spatially constrained Single-cell Clustering (DSSC)的深度学习方法,用于对空间解析单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSSC是首个能够利用空间坐标和标记基因信息指导细胞/位点聚类的模型 | NA | 开发一种新的计算方法来充分利用空间解析单细胞RNA测序技术的潜力 | 空间解析单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 图形神经网络模型 | 深度嵌入聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 不同数据集,包括模拟数据和真实数据,涵盖多种细胞类型/组织结构和/或细胞类型/组织空间依赖性 |
20070 | 2024-08-08 |
Revealing the heterogeneity of CD4+ T cells through single-cell transcriptomics
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.08.010
PMID:36205449
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在分析CD4 T细胞表型和克隆型中的应用 | scRNA-seq能够从单个T细胞中获取配对的T细胞受体和转录组信息,并阐明CD4 T细胞与其环境中的其他细胞之间的相互作用 | scRNA-seq在分析CD4 T细胞时存在固有的挑战,尽管已有技术解决方案出现 | 探讨scRNA-seq在健康和疾病中对CD4 T细胞作用的进一步理解 | CD4 T细胞的表型和克隆型 | 基因表达研究 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 单个细胞 |
20071 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq keeps cells alive
2022-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01515-8
PMID:36207601
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
20072 | 2024-08-08 |
SLC7A5 is a lung adenocarcinoma-specific prognostic biomarker and participates in forming immunosuppressive tumor microenvironment
2022-Oct, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e10866
PMID:36217463
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研究论文 | 研究确定了SLC7A5作为肺腺癌特异性预后氨基酸转运蛋白,并探讨了其在形成免疫抑制性肿瘤微环境中的作用 | 首次揭示SLC7A5在肺腺癌中的特异性预后价值及其在免疫抑制性肿瘤微环境形成中的作用 | NA | 探讨SLC7A5作为肺腺癌特异性预后生物标志物的潜力及其在肿瘤微环境中的作用 | SLC7A5在肺腺癌中的表达、预后价值及其对免疫细胞浸润和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习, 单细胞测序, 甲基化测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞测序数据 | NA |
20073 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics Analysis Reveals that CCL17 and CCL22 are Robust Indicators of a Suppressive Immune Environment in Angioimmunoblastic T Cell Lymphoma (AITL)
2022-09-29, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2709270
PMID:36224014
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研究论文 | 本研究首次使用空间转录组学方法分析了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)的免疫微环境,发现CCL17和CCL22是抑制性免疫环境的强指标 | 首次应用空间转录组学技术研究AITL的肿瘤免疫微环境,揭示了CCL17和CCL22在AITL中的上调现象 | 化疗方案CHOP诱导的完全缓解持续时间仍是一个问题 | 研究AITL的免疫微环境并探索潜在的治疗方法 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)的免疫微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
20074 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2022-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.09.25.509426
PMID:36203548
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研究论文 | 本文利用数字空间转录组学技术研究了严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的转录组特征 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染引起的独特心肌转录组编程,且这种编程独立于局部病毒负荷 | 研究样本量较小,且未涉及更大冠状动脉血管的转录组分析 | 探讨严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的转录组变化 | 严重COVID-19患者的冠状动脉内皮细胞和心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 4例对照组和8例COVID-19患者的心脏组织 |
20075 | 2024-08-08 |
Analysis of antitumor immunity in mouse glioma microenvironment through intercellular communication
2022-Sep, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_852_22
PMID:36204889
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研究论文 | 本研究通过分析细胞间通讯,描绘了小鼠胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 描述了之前被低估的浸润性T细胞与脑细胞群之间的复杂通讯 | NA | 旨在通过分析细胞间通讯,描绘胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 小鼠胶质瘤微环境中的细胞间通讯 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因组数据 | 新鲜的小鼠胶质瘤样本 |
20076 | 2024-08-08 |
Spotlight on liver macrophages for halting injury and progression in nonalcoholic fatty liver disease
2022-08, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2132145
PMID:36205054
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中巨噬细胞的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 探讨了未来研究可能涉及的领域,如肠道微生物组、损伤相关分子模式(DAMPS)及其相关分子和通路,以及单细胞测序等高级分子生物学研究 | NA | 更新关于直接或间接影响NAFLD中巨噬细胞的药物研究,并讨论巨噬细胞生物标志物在监测疾病阶段和进展/逆转中的意义 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中的巨噬细胞及其相关药物和生物标志物 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
20077 | 2024-08-08 |
[scRNA-sequencing uncovers metabolism and CD52 as new targets in ibrutinib-surviving mantle cell lymphoma cells]
2022-Aug, Pathologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00292-022-01136-7
PMID:36222922
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后存活的外套细胞淋巴瘤细胞中的代谢变化和新靶点CD52 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后外套细胞淋巴瘤细胞的基因表达趋势和新的治疗靶点 | 研究仅使用了REC-1细胞系,可能无法完全代表所有外套细胞淋巴瘤细胞的反应 | 探索伊布替尼治疗外套细胞淋巴瘤后的细胞适应性和新的治疗靶点 | 外套细胞淋巴瘤细胞及其对伊布替尼治疗的反应 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用REC-1细胞系进行实验 |
20078 | 2024-08-08 |
[New insights into the bone marrow niche in multiple myeloma revealed by single-cell profiling technologies]
2022, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.63.1188
PMID:36198544
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术揭示的多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 利用单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术深入研究了多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | NA | 探讨多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 多发性骨髓瘤骨髓微环境中的非造血细胞和成熟造血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
20079 | 2024-08-08 |
Identification of Diagnostic Genes and Effective Drugs Associated with Osteoporosis Treatment by Single-Cell RNA-Seq Analysis and Network Pharmacology
2022, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2022/6830635
PMID:36199280
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析和网络药理学方法,识别与骨质疏松治疗相关的诊断基因和有效药物 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法,识别出与骨质疏松特定细胞亚群相关的关键基因和潜在药物 | 研究仅基于特定数据集和计算方法,实际临床应用的有效性和安全性需进一步验证 | 探索骨质疏松的诊断和治疗方法 | 骨质疏松相关的诊断基因和有效药物 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15,577个细胞,识别出12个细胞亚群 |
20080 | 2024-08-08 |
Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Revealed That the Pyroptosis of Glioma-Associated Macrophages Participates in Tumor Progression and Immunosuppression
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1803544
PMID:36199426
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡参与肿瘤进展和免疫抑制 | 首次阐明了胶质瘤中细胞焦亡与临床预后及免疫细胞浸润的关系,并发现了潜在的治疗靶点,如细胞焦亡抑制剂 | NA | 探索胶质瘤中细胞焦亡的作用及其对预后和免疫环境的影响 | 胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡及其在肿瘤进展和免疫抑制中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个数据集,包括TCGA和CGGA队列,以及三个独立的单细胞RNA测序数据集 |