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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20061 | 2024-08-07 |
Nasopharyngeal neutrophilic-retention signatures could predict disease progression in early SARS-CoV-2 infection
2024-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29328
PMID:38146903
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了COVID-19患者鼻咽拭子中的中性粒细胞相关基因表达,并发现与疾病严重程度相关的四个基因组成的NSAP可以作为早期诊断严重COVID-19的标志物 | 首次揭示了鼻咽部中性粒细胞的功能特征及其在预测COVID-19疾病进展中的作用,并识别出与疾病进展相关的四个基因组成的NSAP | NA | 探究鼻咽部中性粒细胞在COVID-19早期感染中的动态变化及其预测疾病进展的作用 | COVID-19患者的鼻咽拭子样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 包括轻度、中度、重度COVID-19患者及健康对照的鼻咽拭子样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20062 | 2024-08-07 |
Ivabradine Alleviates Experimental Autoimmune Myocarditis-Mediated Myocardial Injury
2024, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-330
PMID:38296563
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研究论文 | 研究伊伐布雷定在实验性自身免疫性心肌炎模型中对心肌损伤的影响及其机制 | 首次探讨伊伐布雷定通过抑制HCNs通道在心肌炎中的抗炎作用 | 研究仅在动物模型中进行,需进一步在人体中验证 | 探究伊伐布雷定在心肌炎中的作用及其机制 | 实验性自身免疫性心肌炎大鼠模型 | 心血管疾病 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 32只Lewis大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 20063 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk data develops a promising prognostic signature for improving immunotherapy responses in ovarian cancer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298125
PMID:38346070
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量数据集成的优势,分析卵巢癌的肿瘤异质性,并开发了一种新的预后标志物,以改善卵巢癌患者的免疫治疗反应 | 首次综合利用单细胞和批量数据来解码卵巢癌的肿瘤异质性,并开发了一种稳定的细胞特征基因相关预后标志物(CCIS) | 研究基于公开数据集,可能存在样本选择偏倚;预后标志物的临床应用需要进一步的验证 | 探索卵巢癌的肿瘤异质性,并开发新的预后标志物以改善患者的免疫治疗反应 | 卵巢癌患者的肿瘤异质性及预后标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 包括E-MTAB-8107、TCGA-OV、GSE63885和GSE26193四个队列的公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20064 | 2024-08-04 |
FXYD3 functionally demarcates an ancestral breast cancer stem cell subpopulation with features of drug-tolerant persisters
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166666
PMID:37966117
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研究论文 | 该文章研究了FXYD3在三阴性乳腺癌干细胞亚群体中的功能及其耐药特征 | 发现了以FXYD3为标志的乳腺癌干细胞亚群,并揭示了其与药物耐受性持久存活者的关系 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌,可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨肿瘤中癌症干细胞的异质性及其在化疗中的敏感性 | 三阴性乳腺癌(TNBC)中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20065 | 2024-08-07 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of cinobufagin in treating melanoma based on network pharmacology, single-cell RNA sequencing data, molecular docking, and molecular dynamics simulation
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1315965
PMID:38348352
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研究论文 | 本研究旨在预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点,通过网络药理学、单细胞RNA测序数据、分子对接和分子动力学模拟等方法进行分析 | 本研究结合多种先进技术,如单细胞RNA测序和分子动力学模拟,以揭示蟾毒灵治疗黑色素瘤的新机制 | 研究结论缺乏相关实验数据支持,需要进一步实验验证 | 预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点 | 蟾毒灵在黑色素瘤中的作用机制 | 分子生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE46517和GSE215120数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20066 | 2024-08-07 |
Scrutinizing the human TEX genes in the context of human male infertility
2024-Mar, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13511
PMID:37594251
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研究论文 | 本文通过筛选1305名男性的外显子测序数据,包括1056名隐匿性和无精子症患者,以及分析睾丸特异性单细胞RNA测序数据,研究了人类TEX基因在男性不育中的作用,并验证了先前描述的疾病关联。 | 本文发现了TEX10、ZFAND3(TEX27)和TEX33作为新的潜在候选基因,这些基因可能与非阻塞性无精子症相关。 | NA | 旨在筛选人类TEX基因中的新型潜在候选基因,并验证先前描述的疾病关联。 | 人类TEX基因及其在男性不育中的作用。 | NA | 男性不育 | 外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1305名男性,包括1056名隐匿性和无精子症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20067 | 2024-08-05 |
Type I interferon signature and cycling lymphocytes in macrophage activation syndrome
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165616
PMID:37751296
|
研究论文 | 本文研究了与Still病相关的巨噬细胞激活综合征(MAS)中的I型干扰素特征和循环淋巴细胞。 | 该研究揭示了MAS患者中I型干扰素过量产生与IL-15的协同作用,导致CD38+HLA-DR+循环淋巴细胞的生成,这为理解MAS的免疫机制提供了新见解。 | 该研究主要基于对外周血单核细胞的分析,尚需进一步验证其在不同患者群体中的普遍性。 | 旨在更深入地理解Still病和巨噬细胞激活综合征的免疫学特征。 | 研究对象为健康对照组与有或没有MAS的Still病患者。 | 数字病理学 | Still病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq, 质量细胞术, 流式细胞术 | NA | RNA数据 | 超过65,000个PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20068 | 2024-08-05 |
SnapATAC2: a fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2023-Sep-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557221
PMID:37745443
|
研究论文 | 本文介绍了一种新算法SnapATAC2,用于单细胞组学数据的分析。 | 提出了一种快速非线性降维算法,能够高效捕捉单细胞组学数据的异质性,同时运行时间和内存使用与细胞数量线性相关。 | 未提及具体的限制 | 旨在提高对复杂组织中动态基因调控的理解。 | 分析单细胞组学数据,包括单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq等。 | 单细胞组学 | NA | NA | NA | 单细胞组学数据 | 使用了多种单细胞组学数据类型 | NA | NA | NA | NA |
| 20069 | 2024-08-05 |
New technologies to study helminth development and host-parasite interactions
2023-07, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2022.11.012
PMID:36931423
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在研究多细胞蠕虫和探讨宿主免疫细胞类型中的应用 | 引入了单细胞RNA测序技术,以更细致的方式分析寄生虫生物学和宿主免疫 | 在体内研究宿主与寄生虫的相互作用具挑战性 | 理解寄生虫的发展及其与宿主免疫反应的相互作用 | 多细胞蠕虫及其与宿主细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20070 | 2024-08-07 |
Imipridones affect tumor bioenergetics and promote cell lineage differentiation in diffuse midline gliomas
2022-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac041
PMID:35157764
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research paper | 研究伊米普利酮类药物对弥漫中线胶质瘤的肿瘤生物能量学和细胞谱系分化的影响 | 首次详细描述了ONC201及其衍生物ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制,包括对肿瘤细胞代谢和线粒体损伤的影响,以及诱导细胞谱系分化的能力 | NA | 探究伊米普利酮类药物ONC201和ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制 | 弥漫中线胶质瘤的细胞和动物模型,以及患者样本 | digital pathology | 脑癌 | Seahorse XF Cell Mito Stress Test, MitoSOX, TMRM assay, 电子显微镜成像, bulk和单细胞RNA-seq | NA | 细胞, 动物模型, 患者样本 | 体外模型18个, 体内模型包括小鼠和斑马鱼, 患者样本20个 | NA | NA | NA | NA |
| 20071 | 2024-08-07 |
Targeting macrophages for enhancing CD47 blockade-elicited lymphoma clearance and overcoming tumor-induced immunosuppression
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021013901
PMID:35134139
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研究论文 | 本研究通过高通量筛选发现紫杉醇能增强巨噬细胞对非霍奇金淋巴瘤的吞噬能力,从而提高CD47阻断疗法的疗效 | 首次发现紫杉醇能直接增强巨噬细胞的吞噬能力,并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制 | 研究主要基于实验模型,尚未在临床试验中验证 | 探索通过调节肿瘤微环境增强淋巴瘤治疗效果的新策略 | 非霍奇金淋巴瘤及其相关巨噬细胞 | 肿瘤学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 20072 | 2024-08-07 |
Müller Glial Expression of REDD1 Is Required for Retinal Neurodegeneration and Visual Dysfunction in Diabetic Mice
2022-05-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-0853
PMID:35167652
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研究论文 | 研究探讨了REDD1蛋白在糖尿病小鼠视网膜病变中的作用,特别是在Müller胶质细胞中的表达。 | 首次揭示了Müller胶质细胞中REDD1的表达对糖尿病引起的视网膜病变、神经退行性和视觉功能障碍的关键作用。 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探究REDD1在糖尿病视网膜病变中的作用及其机制。 | 糖尿病小鼠的视网膜和人类Müller细胞在高糖条件下的反应。 | NA | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质表达数据 | 包括糖尿病控制小鼠和REDD1-mgKO小鼠的视网膜样本,以及暴露于高糖条件下的人类Müller细胞培养物。 | NA | NA | NA | NA |
| 20073 | 2024-08-07 |
Cellular heterogeneity of human fallopian tubes in normal and hydrosalpinx disease states identified using scRNA-seq
2022-04-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.02.017
PMID:35320732
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了来自正常和输卵管积水疾病状态的人类输卵管细胞的异质性 | 首次构建了包含12种主要细胞类型的输卵管细胞图谱,并识别出四种纤毛和六种非纤毛分泌上皮亚型 | 仅分析了四名健康和两名输卵管积水患者的样本,样本量有限 | 探究输卵管稳态在正常发育和疾病中的细胞异质性 | 人类输卵管细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 59,738个细胞来自四名健康受试者,17,798个细胞来自两名输卵管积水患者 | NA | NA | NA | NA |
| 20074 | 2024-08-07 |
Neuroinflammation creates an immune regulatory niche at the meningeal lymphatic vasculature near the cribriform plate
2022-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01158-6
PMID:35347285
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研究论文 | 研究发现在神经炎症期间,筛板附近的脑膜淋巴管通过淋巴管生成来排出多余液体,并可能获得改变的表型以调节免疫。 | 首次报道了神经炎症期间,筛板附近的脑膜淋巴管上调与抗原呈递相关的基因,如主要组织相容性复合体II类、粘附分子和免疫调节分子,形成一个免疫调节微环境。 | NA | 探讨神经炎症期间脑膜淋巴管在免疫调节中的作用。 | 健康和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中筛板附近的脑膜淋巴管。 | NA | 神经炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和EAE小鼠模型的脑膜淋巴管样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20075 | 2024-08-07 |
NGF-p75 signaling coordinates skeletal cell migration during bone repair
2022-03-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5716
PMID:35302859
|
研究论文 | 本文研究了神经生长因子(NGF)通过p75信号通路在颅骨损伤后调节骨再生中的作用 | 首次揭示了NGF通过p75信号通路在骨修复过程中协调骨骼细胞迁移的机制 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨骨损伤后神经信号与骨再生之间的关系 | 神经生长因子(NGF)及其p75受体在骨修复中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 20076 | 2024-08-07 |
Clonal lineage tracing reveals shared origin of conventional and plasmacytoid dendritic cells
2022-03-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.01.016
PMID:35180378
|
研究论文 | 本研究使用诱导性谱系追踪结合克隆DNA条形码和单细胞转录组及表型分析(CITE-seq),在未经处理的成年小鼠中研究树突状细胞(DCs)的发育过程 | 揭示了常规DCs(cDCs)和浆细胞样DCs(pDCs)的共同起源,并提出了DC发育的新模式 | NA | 阐明树突状细胞的发育起源 | 树突状细胞(包括常规DCs和浆细胞样DCs)的发育过程 | NA | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组 | 成年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 20077 | 2024-08-07 |
Cell type-specific mechanism of Setd1a heterozygosity in schizophrenia pathogenesis
2022-03-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm1077
PMID:35245111
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研究论文 | 本研究通过生成Setd1a半合子不足的小鼠模型,探讨了这一与精神分裂症相关的表观遗传因子如何在高度相关的脑区影响基因表达 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Setd1a半合子不足在不同细胞类型中的高度可变的转录适应性,并发现这些变化与神经元形态发生和突触功能相关的基因失调有关 | NA | 理解Setd1a半合子不足在精神分裂症发病机制中的细胞特异性机制 | Setd1a半合子不足的小鼠模型及其在精神分裂症相关脑区的基因表达变化 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20078 | 2024-08-07 |
Widespread choroid plexus contamination in sampling and profiling of brain tissue
2022-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01416-3
PMID:34983929
|
研究论文 | 本研究探讨了脑组织样本中脉络丛污染的问题,并提出了相应的解决方案 | 首次系统性地识别和分析了脑组织样本中的脉络丛污染,并提出了预防措施 | 无法完全确定某些差异表达的基因或蛋白质是否仅由脉络丛污染引起 | 揭示脑组织样本中脉络丛污染的问题及其对数据分析的影响 | 脑组织样本中的脉络丛污染 | 数字病理学 | NA | RNA测序, 基因表达谱分析, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 转录组数据 | 多个研究中的脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20079 | 2024-08-07 |
Systems-based approaches to study immunometabolism
2022-03, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00783-9
PMID:35121805
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综述 | 本文综述了利用系统生物学方法研究免疫细胞代谢的现状和挑战 | 介绍了数学建模方法用于系统性分析免疫细胞代谢变化 | 讨论了代谢建模技术的应用和不足 | 定义免疫代谢的系统性质,总结细胞和系统层面的研究方法 | 免疫细胞的代谢 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 数学模型 | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20080 | 2024-08-07 |
Identification of kidney injury released circulating osteopontin as causal agent of respiratory failure
2022-02-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm5900
PMID:35213222
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和配体-受体分析,识别了急性肾损伤(AKI)引起的急性肺损伤(ALI)中,肾脏释放的循环骨桥蛋白(OPN)作为关键介质的作用 | 首次揭示了肾脏释放的OPN在AKI-ALI中的因果作用,并证明了OPN抑制剂在预防AKI-ALI中的有效性 | 研究主要在动物模型中进行,需要在人类中进一步验证 | 识别并验证介导组织损伤间相互作用的分子 | 急性肾损伤和急性肺损伤 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型和人类患者样本 | NA | NA | NA | NA |