单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 20021 - 20040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20021 | 2024-08-08 |
scHiCPTR: unsupervised pseudotime inference through dual graph refinement for single-cell Hi-C data
2022-11-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac670
PMID:36205615
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研究论文 | 本文介绍了scHiCPTR，一种基于图的无监督流程，用于从单细胞Hi-C接触矩阵中推断伪时间 | scHiCPTR通过双图优化过程优化图结构，有助于减少噪声导致的虚假细胞连接，并确定全局发育方向性 | NA | 研究如何利用单细胞Hi-C接触矩阵构建伪时间路径，以沿着发育轨迹对细胞进行排序 | 单细胞Hi-C接触矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞Hi-C技术 | 图模型 | 矩阵数据 | NA |
| 20022 | 2024-08-08 |
PPMS: A framework to Profile Primary MicroRNAs from Single-cell RNA-sequencing datasets
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac419
PMID:36209413
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PPMS的计算框架，用于从单细胞RNA测序数据中分析初级微小RNA（pri-miRNA） | PPMS框架能够以细胞类型分辨率对pri-miRNA进行分析和定量，这是目前其他计算方法所不具备的 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在单细胞水平上分析和定量pri-miRNA | pri-miRNA在不同细胞类型和细胞状态中的分布及其与细胞/读取序列数量的关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | RNA序列数据 | 包括人类心脏的不同腔室、人类多能干细胞分化为心肌细胞以及感染了严重急性呼吸综合征冠状病毒2的hiPSCs衍生心肌细胞的公开单细胞RNA测序数据 |
| 20023 | 2024-08-08 |
Subclones of bone marrow CD34+ cells in acute myeloid leukemia at diagnosis confer responses of patients to induction chemotherapy
2022-11-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.34481
PMID:36197314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了新诊断急性髓系白血病（AML）患者骨髓CD34+细胞的异质性，并根据患者对诱导化疗的反应将其分为敏感组和耐药组 | 本研究首次揭示了CD34+细胞亚群与AML患者对诱导化疗反应的关系，并提供了预测患者反应的生物标志物 | NA | 研究AML患者骨髓CD34+细胞的异质性与对诱导化疗反应的关系 | 急性髓系白血病患者的骨髓CD34+细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 新诊断的AML患者骨髓CD34+细胞样本 |
| 20024 | 2024-08-08 |
Angiotensin-converting Enzyme-2 (ACE2) Expression in Pediatric Liver Disease
2022 Nov-Dec 01, Applied immunohistochemistry & molecular morphology : AIMM
IF:1.3Q3
DOI:10.1097/PAI.0000000000001068
PMID:36222506
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研究论文 | 本文研究了儿童免疫介导性肝病中血管紧张素转换酶2（ACE2）的表达情况 | 采用了新的方法学来评估ACE2在儿童肝病中的表达，并使用计算深度学习分割模型和空间转录组学进行分析 | 需要进一步研究ACE2在慢性疾病和急性感染中的作用 | 更好地理解ACE2在肝病中的存在及其在感染如COVID-19中的作用 | 儿童免疫介导性肝病中的ACE2表达 | NA | 肝病 | 免疫荧光染色、共聚焦显微镜、酶联免疫吸附试验、空间转录组学 | 深度学习模型 | 组织、血液 | 儿童和成人肝病及对照组织样本 |
| 20025 | 2024-08-08 |
BATF epigenetically and transcriptionally controls the activation program of regulatory T cells in human tumors
2022-10-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abk0957
PMID:36206353
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研究论文 | 本文研究了BATF在人肺肿瘤微环境中对调节性T细胞的表观遗传和转录调控作用 | 首次揭示了BATF通过表观遗传调控激活相关基因表达，从而影响T细胞在肿瘤微环境中的分化和功能 | NA | 探讨BATF在肿瘤微环境中对调节性T细胞分化和功能的调控机制 | 人肺肿瘤中的调节性T细胞及其表观遗传和转录调控 | 数字病理学 | 肺癌 | ATAC测序、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20026 | 2024-08-08 |
Upper cortical layer-driven network impairment in schizophrenia
2022-10-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn8367
PMID:36223459
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和免疫组织化学分析，探讨了精神分裂症患者大脑皮质上层的神经网络损伤 | 首次通过单核RNA测序和空间转录组学技术，详细分析了精神分裂症患者大脑皮质上层神经元的转录组变化 | 研究样本仅限于精神分裂症患者和匹配的控制组，可能需要更多样化的样本以验证结果的普遍性 | 揭示精神分裂症对大脑皮质上层神经网络的影响 | 精神分裂症患者和匹配的控制组的大脑皮质上层神经元 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 超过220,000个神经元样本 |
| 20027 | 2024-08-08 |
Pro-inflammatory megakaryocyte gene expression in murine models of breast cancer
2022-10-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo5224
PMID:36223471
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research paper | 本研究使用自发性的乳腺癌小鼠模型，发现肿瘤负荷减少了巨核细胞的数量和大小，并干扰了多倍体化。单细胞RNA测序显示，肿瘤小鼠的巨核细胞表现出促炎性表型，蛋白质S100A8/A9和脂质运载蛋白-2水平在血小板中也增加，表明肿瘤诱导的巨核细胞改变传递给了血小板后代，促进了体外肿瘤细胞侵袭和肿瘤细胞肺部定植。 | 首次证明乳腺癌诱导的巨核细胞改变，导致血小板成分的质变，可能反馈促进肿瘤转移。 | NA | 研究乳腺癌对血小板产生巨核细胞的影响。 | 乳腺癌小鼠模型的巨核细胞和血小板。 | NA | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 肿瘤小鼠和野生型小鼠的巨核细胞和血小板。 |
| 20028 | 2024-08-08 |
Decoding the transcriptome of calcified atherosclerotic plaque at single-cell resolution
2022-10-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04056-7
PMID:36224302
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和系统生物学方法分析了钙化动脉粥样硬化斑块中血管平滑肌细胞和内皮细胞的转录组特征 | 揭示了动脉粥样硬化斑块中细胞表达的炎症介质和基质分泌基因的解剖学区分，并识别了可能驱动细胞转分化的新候选基因 | NA | 探索动脉粥样硬化斑块的病理生理机制，并建立针对疾病进展的特定部位干预策略 | 钙化动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自接受颈动脉内膜切除术患者的钙化动脉粥样硬化斑块和匹配的近端邻近颈动脉组织 |
| 20029 | 2024-08-08 |
A single cell transcriptional roadmap of human pacemaker cell differentiation
2022-10-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76781
PMID:36217819
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和轨迹推断，构建了人类诱导多能干细胞向窦房结样心肌细胞分化的转录变化和谱系决策路线图 | 首次揭示了人类起搏细胞分化过程中的分子机制，特别是SANCM和前心外膜细胞谱系的分离由WNT信号决定，以及TGFβ和WNT信号在过渡型和头部SANCM亚型分支中的作用 | NA | 揭示人类起搏细胞分化的分子过程 | 人类诱导多能干细胞向窦房结样心肌细胞的分化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 20030 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals the role of Macrophage-Naïve CD4 + T cell interaction in the immunosuppressive microenvironment of primary liver carcinoma
2022-10-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03675-2
PMID:36221095
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量转录组数据，探讨了肝癌中免疫细胞间的重要相互作用及其靶向药物 | 揭示了巨噬细胞与幼稚CD4+ T细胞相互作用在肝癌免疫抑制微环境中的关键作用，并预测了相关药物 | 相关机制需要在实验和队列研究中进一步验证 | 研究肝癌中免疫细胞间的相互作用及其靶向药物 | 肝癌中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 31名处于健康、肝炎、肝硬化和癌症四种不同状态的患者 |
| 20031 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profiling for inferring tumor origin and mechanisms of therapeutic resistance
2022-Oct-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-022-00314-3
PMID:36210388
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤样本，以推断肿瘤起源和治疗抵抗机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了HNSCC对检查点抑制剂治疗抵抗的机制，并证实了肿瘤的转移性质 | 研究样本仅来自单一患者，可能限制了结果的普遍性 | 识别HNSCC对检查点抑制剂治疗的反应和抵抗驱动因素 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两个反应性病变和一个进展性病变 |
| 20032 | 2024-08-08 |
Combination of oral STING agonist MSA-2 and anti-TGF-β/PD-L1 bispecific antibody YM101: a novel immune cocktail therapy for non-inflamed tumors
2022-10-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-022-01363-8
PMID:36209176
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研究论文 | 本文研究了口服STING激动剂MSA-2与抗TGF-β/PD-L1双特异性抗体YM101联合治疗非炎症性肿瘤的新型免疫鸡尾酒疗法 | MSA-2与YM101联合使用在增强天然和适应性免疫、促进抗原呈递、改善T细胞迁移和趋化性以及上调肿瘤浸润淋巴细胞数量和活性方面显示出协同效应 | NA | 探索MSA-2与YM101联合使用在非炎症性肿瘤模型中的抗肿瘤免疫增强效果 | 非炎症性肿瘤模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 流式细胞术, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞, 基因表达数据 | NA |
| 20033 | 2024-08-08 |
Characterization of placental and decidual cell development in early pregnancy loss by single-cell RNA sequencing
2022-Oct-08, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00904-5
PMID:36209198
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了早期妊娠丢失中绒毛和蜕膜细胞的发育情况 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了不同形式的早期妊娠丢失中绒毛和蜕膜细胞的独特基因表达特征 | NA | 旨在更好地理解早期妊娠丢失的病理机制 | 早期妊娠丢失中的绒毛和蜕膜细胞 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同形式的早期妊娠丢失及正常妊娠的绒毛和蜕膜组织 |
| 20034 | 2024-08-08 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
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research paper | 本文通过元分析单细胞RNA测序数据、转录因子调控网络分析、高分辨率共聚焦显微镜和胰岛素分泌测量，研究了衰老对人类胰岛β细胞功能和身份的影响。 | 揭示了β细胞衰老过程中的分子和功能变化，包括转录调控失调、β细胞转录因子网络重组、基因转录率增加和葡萄糖刺激的胰岛素释放减少，以及内质网应激和自噬途径的激活。 | NA | 理解衰老对β细胞的影响。 | 人类胰岛β细胞。 | digital pathology | type 2 diabetes | single-cell RNA sequencing | NA | RNA sequencing data | 非糖尿病捐赠者，涵盖了人类生命周期的绝大部分。 |
| 20035 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of the cycling murine ovary
2022-10-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77239
PMID:36205477
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，分析了成年小鼠卵巢中超过34,000个细胞的转录组，描述了在正常动情周期和其他生殖状态下发生的转录变化，构建了一个全面的小鼠卵巢细胞类型和状态的动态图谱 | 首次构建了小鼠卵巢在动情周期中的单细胞转录组图谱，揭示了细胞状态的动态变化和旁分泌因子在此过程中的作用 | NA | 研究小鼠卵巢在动情周期中的细胞状态动态变化及其调控机制 | 小鼠卵巢中的细胞类型及其在动情周期中的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过34,000个细胞 |
| 20036 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers a neuron-like macrophage subset associated with cancer pain
2022-10-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5535
PMID:36206343
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了与癌症疼痛相关的一种神经样巨噬细胞亚群，并探讨了其在肿瘤神经发生中的作用机制 | 首次发现巨噬细胞向神经样细胞转化的现象（MNT），并证实其直接促进肿瘤神经发生 | NA | 探索肿瘤相关巨噬细胞在促进肿瘤神经发生中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在癌症疼痛中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 涉及肺腺癌模型中的巨噬细胞 |
| 20037 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of shrimp immune cells identifies macrophage-like phagocytes
2022-Oct-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80127
PMID:36200862
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了虾的免疫细胞，识别出一种新的巨噬细胞样吞噬细胞亚型 | 本研究首次在虾的血液中发现了一种新的巨噬细胞样细胞亚型，称为单核细胞血细胞2（MH2），该亚型具有吞噬功能并表达与哺乳动物巨噬细胞相似的标记基因 | NA | 揭示无脊椎动物先天免疫细胞的多样性和功能 | 虾的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种主要的细胞类型：前血细胞、单核血细胞和粒细胞 |
| 20038 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals functionally specialized vascular endothelium in brain
2022-10-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57520
PMID:36197007
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠大脑皮层在发育、成年、衰老和神经炎症过程中的非神经细胞群体，揭示了大脑血管内皮细胞的功能特化 | 发现了反应性内皮小静脉，这是一种特化的后毛细血管内皮细胞隔室，具有一致表达的细胞粘附分子、优先的白细胞迁移、与血管周围巨噬细胞群体的关联以及启动中枢神经系统免疫反应的内皮激活等特征 | NA | 研究大脑血管内皮细胞的异质性及其在神经炎症和衰老中的分子改变 | 小鼠大脑皮层的非神经细胞群体 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20039 | 2024-08-08 |
Single-cell dissection of remodeled inflammatory ecosystem in primary and metastatic gallbladder carcinoma
2022-Oct-05, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00445-8
PMID:36198671
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了慢性胆囊炎、原发性胆囊癌及其转移病灶的细胞生态系统重塑情况 | 首次全面揭示了从炎症到癌症再到转移过程中，胆囊癌的细胞和微环境的重编程机制 | NA | 旨在更好地表征从炎症到癌症再到转移的进展过程 | 慢性胆囊炎、原发性胆囊癌及其匹配的转移病灶 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6例慢性胆囊炎、12例未经治疗的胆囊癌和6例匹配的转移病灶 |
| 20040 | 2024-08-08 |
Helicobacter pylori shows tropism to gastric differentiated pit cells dependent on urea chemotaxis
2022-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33165-4
PMID:36198679
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研究论文 | 本文研究了致癌细菌幽门螺杆菌（H. pylori）对胃分化沟细胞的趋向性，发现其偏好附着于胃单位沟区域的分化细胞 | 首次揭示了幽门螺杆菌对胃分化沟细胞的偏好附着性，并发现这种附着依赖于细菌对宿主细胞释放的尿素的趋化性 | NA | 探究幽门螺杆菌对胃分化沟细胞的趋向性及其机制 | 幽门螺杆菌、胃分化沟细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |