单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28751 篇文献，本页显示第 20001 - 20020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20001 | 2024-08-08 |
Identification of metabolic signatures related to metastasis and immunotherapy resistance in oral squamous cell carcinoma
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:36777871
|
研究论文 | 本研究旨在识别与口腔鳞状细胞癌（OSCC）转移和免疫治疗抵抗相关的代谢基因，并构建一个与OSCC预后相关的代谢基因预测模型 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，识别了与OSCC转移和免疫治疗抵抗相关的代谢基因，并构建了预测模型 | NA | 识别与口腔鳞状细胞癌转移和免疫治疗抵抗相关的代谢基因，并构建预测模型 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）的代谢基因及其与转移和免疫治疗抵抗的关系 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq | WGCNA, LASSO | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的RNA-seq和scRNA-seq数据 |
| 20002 | 2024-08-08 |
A Novel Prognostic Pyroptosis-Related Gene Signature Correlates to Oxidative Stress and Immune-Related Features in Gliomas
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/4256116
PMID:36778205
|
研究论文 | 本文构建并验证了一个与氧化应激和免疫特征相关的胶质瘤预后模型，该模型基于细胞焦亡相关基因 | 首次构建并验证了一个基于细胞焦亡相关基因的胶质瘤预后模型，并发现该模型与氧化应激和免疫相关通路有关 | NA | 构建并验证一个有效的胶质瘤预后模型，并探索其与氧化应激和免疫特征的关系 | 胶质瘤患者及其预后 | 数字病理学 | 脑癌 | LASSO-Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA和CGGA两个队列的数据 |
| 20003 | 2024-08-08 |
Physiological hypoxia improves growth and functional differentiation of human intestinal epithelial organoids
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1095812
PMID:36793710
|
研究论文 | 本文研究了生理性低氧环境对人类肠道上皮类器官生长和功能分化的影响 | 首次探讨了模拟体内生理性低氧环境对肠道上皮类器官作为临床前模型的转化价值的影响 | NA | 评估在生理性低氧环境下人类肠道类器官的建立和培养情况，并比较其在不同氧气浓度下的生长、分化和免疫反应 | 人类肠道上皮类器官 | NA | 炎症性肠病，结直肠癌 | 免疫荧光染色，单细胞RNA测序（scRNA-seq），ELISA | NA | 图像，基因表达数据 | NA |
| 20004 | 2024-08-08 |
Endothelial Indoleamine-2,3-Dioxygenase-1 is not Critically Involved in Regulating Antitumor Immunity in the Central Nervous System
2023, International journal of tryptophan research : IJTR
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/11786469231153111
PMID:36798537
|
研究论文 | 研究探讨了内皮细胞中的吲哚胺-2,3-双加氧酶-1（eIDO1）在调节中枢神经系统抗肿瘤免疫中的作用 | 通过单细胞RNA测序数据揭示了IDO1在人脑胶质瘤组织中主要由激活的内皮细胞表达，并显示出与JAK/STAT信号通路相关的CXCL11基因表达特征 | 实验仅在同基因实验性胶质瘤模型中进行，可能限制了结果的普遍性 | 研究eIDO1在脑肿瘤免疫中的作用 | 内皮细胞中的IDO1表达及其对肿瘤浸润T细胞频率和肿瘤生长的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人脑胶质瘤组织样本 |
| 20005 | 2024-08-08 |
Retinal ganglion cell-specific genetic regulation in primary open-angle glaucoma
2022-Jun-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100142
PMID:36778138
|
研究论文 | 研究通过将原发性开角型青光眼（POAG）患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞（iPSCs），并分化为视网膜类器官，与健康个体的细胞进行比较，评估疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 研究利用大规模iPSC研究揭示了遗传复杂疾病的上下文特异性特征，并通过单细胞RNA测序识别了簇特异性分子特征 | NA | 评估原发性开角型青光眼患者疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 原发性开角型青光眼患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞并分化为视网膜类器官 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共247,520个细胞 |
| 20006 | 2024-08-08 |
Genetic perturbations go spatial
2022-Apr-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100120
PMID:36776528
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用蛋白质条码（Pro-Codes）追踪CRISPR修饰细胞并测量其对肿瘤微环境影响的方法 | 首次采用蛋白质条码和空间转录组学技术，对完整组织中的CRISPR修饰细胞进行多重成像和空间转录组学分析 | NA | 研究细胞内在特征及其与环境的相互作用对组织-肿瘤交互作用的影响 | CRISPR修饰细胞及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | NA | CRISPR, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA |
| 20007 | 2024-08-08 |
Integration of multiple lineage measurements from the same cell reconstructs parallel tumor evolution
2022-Feb-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100096
PMID:36778661
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞全基因组测序技术和病毒谱系追踪，模拟结直肠癌肿瘤进化过程，构建高分辨率的克隆进化树 | 首次使用单细胞全基因组测序结合病毒谱系追踪技术，在结直肠癌肿瘤模型中重建肿瘤进化过程 | 研究仅限于结直肠癌肿瘤模型，可能需要进一步验证在其他类型肿瘤中的适用性 | 研究肿瘤内部异质性（ITH）和肿瘤进化过程 | 结直肠癌肿瘤模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞全基因组测序（WGS） | NA | 基因组数据 | 1,641个单细胞 |
| 20008 | 2024-08-08 |
Overexpression of PKMYT1 associated with poor prognosis and immune infiltration may serve as a target in triple-negative breast cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1002186
PMID:36793346
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合临床样本和实验，探讨了蛋白激酶PKMYT1在乳腺癌中的功能作用 | 首次研究了PKMYT1在乳腺癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | NA | 探索PKMYT1在乳腺癌中的表达及其对预后和免疫浸润的影响 | 乳腺癌组织，特别是三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 生物信息学分析，单细胞测序 | NA | RNA序列 | 涉及乳腺癌组织和细胞系 |
| 20009 | 2024-08-08 |
satuRn: Scalable analysis of differential transcript usage for bulk and single-cell RNA-sequencing applications
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.51749.2
PMID:36762203
|
research paper | 介绍了一种名为satuRn的快速灵活的准二项式广义线性建模框架，用于分析差异转录本使用情况 | satuRn框架在性能上与最佳的差异转录本使用分析方法相当，同时提供了良好的错误发现率控制，能够处理复杂的实验设计，并适用于大规模单细胞转录组测序数据 | NA | 开发一种能够分析差异转录本使用情况的新工具，适用于批量和单细胞RNA测序应用 | 差异转录本使用分析工具的性能、复杂实验设计的处理能力以及大规模单细胞转录组测序数据的适用性 | RNA-seq | NA | RNA-seq | 准二项式广义线性模型 | 转录组数据 | NA |
| 20010 | 2024-08-05 |
Lineage Tracing by Single-Cell Transcriptomics Decoding Dynamics of Lineage Commitment
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_476
PMID:36749487
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过单细胞转录组学进行谱系追踪的方法，以澄清谱系承诺的动态变化 | 提出了一种详细的协议，通过单细胞转录组学实现谱系追踪，填补了细胞命运追踪的研究空白 | 未提及具体的限制因素 | 探讨干细胞和癌症研究中的细胞命运追踪 | 个体细胞及其后代 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20011 | 2024-08-08 |
Cross-species transcriptomic analysis identifies mitochondrial dysregulation as a functional consequence of the schizophrenia-associated 3q29 deletion
2023-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.27.525748
PMID:36747819
|
研究论文 | 本研究通过跨物种转录组分析，探讨了与精神分裂症相关的3q29缺失对线粒体功能的影响 | 首次在人类前脑皮质类器官和3q29缺失小鼠模型中进行跨物种单细胞转录组分析，揭示了线粒体功能失调与精神分裂症的关联 | 研究主要集中在转录组水平，蛋白质水平的验证较少，且未涉及所有可能的细胞类型 | 探究3q29缺失对中枢神经系统发育的影响及其在精神分裂症病理生物学中的作用 | 人类前脑皮质类器官和3q29缺失小鼠模型的皮质区域 | 遗传学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括2个月和12个月的人类皮质类器官以及出生后7天的小鼠皮质 |
| 20012 | 2024-08-05 |
Dynamic changes of 3'UTR length during oocyte-to-zygote transition of in vitro pig embryos
2023-May, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14327
PMID:36755113
|
研究论文 | 本文研究了体外猪胚胎中卵母细胞到受精卵转变过程中的3'UTR动态变化 | 首次系统性分析了在卵母细胞到受精卵转变过程中3'UTR长度变化及其对基因表达的影响 | 本文仅基于特定阶段的scRNA-seq数据，可能无法全面反映所有动态变化 | 探讨3'UTR在猪胚胎卵母细胞转变中的分子机制 | 体外成熟的II期卵母细胞、体外受精的受精卵和单细胞胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 139种mRNA和105种mRNA |
| 20013 | 2024-08-08 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing reveals changes in glioma-associated macrophage polarization and cellular states of malignant gliomas with high AQP4 expression
2023-May, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00592-4
PMID:36755124
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20014 | 2024-08-08 |
Identificaiton and characterization of a novel hemoglobin gene (Tgr-HbIII) from blood clam Tegillarca granosa
2023-Apr-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147256
PMID:36754178
|
研究论文 | 本研究鉴定并描述了来自血蛤Tegillarca granosa的新型血红蛋白基因Tgr-HbIII，并通过系统发育分析、序列比对和三维结构建模等方法探讨了其功能和表达情况 | 首次鉴定并描述了Tgr-HbIII基因，并探讨了其在血蛤中的表达和功能 | Tgr-HbIII基因是否表达功能性蛋白的问题尚未完全解决 | 研究血蛤Tegillarca granosa中新型血红蛋白基因Tgr-HbIII的起源、进化和功能 | 血蛤Tegillarca granosa中的血红蛋白基因Tgr-HbIII | NA | NA | 系统发育分析、序列比对、三维结构建模、单细胞RNA测序 | NA | 基因序列、蛋白质结构 | 8978个成年血蛤的单细胞RNA测序数据 |
| 20015 | 2024-08-08 |
Vsig4+ resident single-Kupffer cells improve hepatic inflammation and fibrosis in NASH
2023-Apr, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-023-01696-1
PMID:36745210
|
研究论文 | 研究探讨了非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中巨噬细胞的作用，特别是Vsig4+驻留单个Kupffer细胞在改善肝脏炎症和纤维化中的作用。 | 本研究首次识别出两种主要的单个巨噬细胞亚群，并发现Vsig4+驻留单个Kupffer细胞在NASH中具有保护作用。 | NA | 研究非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中巨噬细胞的作用及其在疾病发展中的机制。 | 非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的巨噬细胞和Kupffer细胞。 | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NASH和对照小鼠的非实质细胞 |
| 20016 | 2024-08-08 |
ICOS costimulation is indispensable for the differentiation of T follicular regulatory cells
2023-04, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201615
PMID:36754569
|
研究论文 | 本研究探讨了ICOS共刺激在T滤泡调节细胞（Tfr细胞）分化中的作用 | 首次揭示了ICOS共刺激对Tfr细胞分化的关键作用，并阐明了其分子机制 | NA | 探究ICOS在Tfr细胞分化中的作用及其对免疫耐受的影响 | T滤泡调节细胞（Tfr细胞）和Treg细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用Foxp3-Cre介导的ICOS敲除小鼠进行研究 |
| 20017 | 2024-08-05 |
Time has come to address the spatiotemporal combinatorial model for CCN proteins biological activitites by spatial transcriptomics and genome wide association studies
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-023-00729-y
PMID:36752900
|
评论 | 本文提出了通过空间转录组学和全基因组关联研究来解决CCN蛋白生物活性的时空组合模型。 | 文章强调了需要通过广泛的协作方法来研究CCN3生物学状态中的开放问题 | 未提供具体的实验数据或研究结果 | 探讨CCN3生物学中的未解问题 | CCN蛋白，特别是CCN3的生物学方向 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，基因组关联研究 | NA | NA | NA |
| 20018 | 2024-08-08 |
Revealing EXPH5 as a potential diagnostic gene biomarker of the late stage of COPD based on machine learning analysis
2023-03, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106621
PMID:36746116
|
研究论文 | 本研究通过机器学习分析揭示EXPH5基因作为慢性阻塞性肺病（COPD）晚期潜在的诊断基因生物标志物 | 首次识别EXPH5基因作为COPD晚期的诊断生物标志物，并分析了其在不同COPD阶段与免疫细胞浸润的关系 | 研究仅基于两个GEO数据集，样本量和数据多样性可能有限 | 寻找用于早期诊断COPD的关键基因，并分析COPD早期和晚期阶段之间的免疫细胞浸润 | EXPH5基因在COPD诊断中的作用及其与免疫细胞浸润的关系 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺病 | GSEA分析 | LASSO和SVM-RFE | 基因表达数据 | 157个差异表达基因（DEGs） |
| 20019 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals cellular heterogeneity and lineage-specific regulatory changes of fibroblasts in post-traumatic urethral stricture
2023-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2023.101431
PMID:36748064
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了创伤后尿道狭窄组织中的成纤维细胞异质性和细胞间通讯 | 首次揭示了创伤后尿道狭窄组织中成纤维细胞的亚群及其在纤维化过程中的分子类型，并识别了成纤维细胞与血管内皮细胞间的通讯 | NA | 探索创伤后尿道狭窄组织中成纤维细胞的异质性和细胞间通讯 | 创伤后尿道狭窄组织及其邻近正常组织的成纤维细胞 | 数字病理学 | 尿道狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13,411个细胞 |
| 20020 | 2024-08-08 |
Cytohesin-4 Upregulation in Glioma-Associated M2 Macrophages Is Correlated with Pyroptosis and Poor Prognosis
2023-Mar, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-023-02104-3
PMID:36749492
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞质素-4（CYTH4）在胶质瘤相关M2巨噬细胞中的上调与焦亡及不良预后的关系 | 首次揭示了CYTH4在胶质瘤中的表达与M2巨噬细胞及焦亡的关联 | NA | 研究CYTH4在胶质瘤中的表达及其与预后的关系 | CYTH4在胶质瘤M2巨噬细胞中的表达及其生物标志物潜力 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个胶质瘤单细胞RNA测序数据集及TCGA和CGGA的批量数据 |