单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 19981 - 20000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19981 | 2024-08-08 |
Scavenger: A pipeline for recovery of unaligned reads utilising similarity with aligned reads
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.19426.2
PMID:32913631
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Scavenger的生物信息学管道，用于利用对齐读取与未对齐读取之间的序列相似性来恢复未对齐的读取 | Scavenger采用了一种新颖的机制，通过序列相似性发现潜在的对齐位置来恢复未对齐的读取 | 尽管恢复的读取数量相对于总读取数量较少，但这些恢复的读取对下游分析（尤其是低表达基因的表达和差异表达估计）有影响 | 解决RNA-seq分析中的假阴性非对齐问题，提高对齐工具的映射敏感性 | 模拟和真实RNA-seq数据集，包括单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 序列数据 | 包括模拟和真实的RNA-seq数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 19982 | 2024-08-08 |
Tm4sf1-marked Endothelial Subpopulation Is Dysregulated in Pulmonary Arterial Hypertension
2023-04, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0020OC
PMID:36252184
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研究论文 | 本研究通过单细胞组学分析，探讨了标记为Tm4sf1的肺动脉高压（PAH）中内皮细胞亚群的失调情况 | 发现了一个新的标记为Tm4sf1的肺动脉内皮细胞亚群，该亚群可能具有干细胞/祖细胞潜能，并与PAH相关 | 需要进一步研究以阐明EA2和Tm4sf1在PAH中的具体作用 | 旨在识别可能具有干细胞/祖细胞潜能的肺动脉内皮细胞，并评估其与肺动脉高压的相关性 | 肺动脉内皮细胞及其在肺动脉高压中的作用 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Sugen-低氧、野百合碱和对照大鼠的肺动脉内皮细胞样本，以及来自多个独立的人类PAH模型和患者的血液和肺部转录组数据集 |
| 19983 | 2024-08-05 |
Adenovirus-mediated Overexpression of FcγRIIB Attenuates Pulmonary Inflammation and Fibrosis
2023-02, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0056OC
PMID:36227848
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研究论文 | 该文章研究了FcγRIIB在促进肺炎和纤维化中的保护作用。 | 该研究首次揭示了FcγRIIB在PF-ILDs中的重要作用，并通过腺病毒过表达提供了潜在的治疗策略。 | 研究中未明确探讨FcγRIIB在其他类型肺病中的角色。 | 探讨FcγRIIB在进行性纤维间质肺病中的作用及其作为治疗靶点的潜力。 | 研究对象为人类和小鼠肺中的FcγRIIB的表达及其功能。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学、腺病毒介导的基因过表达 | 小鼠模型 | 生物样本（肺组织） | 包括三种遗传模型和一个治疗模型的小鼠 |
| 19984 | 2024-08-08 |
Immunomodulatory Biomaterials and Emerging Analytical Techniques for Probing the Immune Micro-Environment
2023-02, Tissue engineering and regenerative medicine
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s13770-022-00491-z
PMID:36241939
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综述 | 本文综述了生物材料植入后对局部免疫微环境的影响及其在组织修复或再生中的应用，特别讨论了单细胞RNA测序技术在软组织再生领域的应用潜力 | 本文首次全面讨论了单细胞RNA测序技术在生物材料诱导的免疫微环境中的应用，为设计免疫调节生物材料提供了参考 | 单细胞RNA测序技术在软组织再生领域的应用尚未得到充分开发 | 探讨生物材料对局部免疫微环境的影响及其在组织修复或再生中的应用 | 生物材料及其诱导的免疫微环境 | 生物材料 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 19985 | 2024-08-08 |
Cntnap2-dependent molecular networks in autism spectrum disorder revealed through an integrative multi-omics analysis
2023-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01822-1
PMID:36253443
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，揭示了自闭症谱系障碍中Cntnap2依赖的分子网络 | 首次通过结合Cntnap2敲除小鼠的定量蛋白质组代谢组数据与自闭症患者的多种组学数据，构建了Cntnap2相关的自闭症网络模型 | 研究主要集中在Cntnap2基因上，可能无法全面代表所有自闭症谱系障碍的分子机制 | 阐明自闭症谱系障碍中Cntnap2依赖的分子网络 | Cntnap2敲除小鼠、自闭症患者及前脑类器官 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍 | 质谱分析 | NA | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学 | Cntnap2敲除小鼠、自闭症患者及前脑类器官样本 |
| 19986 | 2024-08-05 |
Microfluidic chip with reversible interface for noninvasive remission status monitoring and prognosis prediction of acute myeloid leukemia
2023-Jan-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114803
PMID:36252315
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研究论文 | 本文设计了一种非侵入性的白血病干细胞特异性捕获芯片用于急性髓性白血病的缓解状态监测和预后预测 | 创新点在于设计了一种具有可逆识别界面的芯片，能够高效捕获和释放外周血中的白血病干细胞 | 本研究仅限于32名急性髓性白血病患者的样本，样本量相对较小 | 研究目的在于开发非侵入性的监测工具，以评估急性髓性白血病的缓解状态和预后 | 研究对象为急性髓性白血病患者及健康供体的外周血样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 液体活检 | NA | 外周血样本 | 32名急性髓性白血病患者和10名健康供体 |
| 19987 | 2024-08-08 |
Caspase-Mediated Regulation and Cellular Heterogeneity of the cGAS/STING Pathway in Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus Infection
2022-12-20, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02446-22
PMID:36255240
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研究论文 | 本文研究了Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染中caspase介导的cGAS/STING通路调控及其细胞异质性 | 发现caspase活性在KSHV裂解复制期间抑制DNA传感器cGAS，从而阻断I型IFN的诱导，并通过单细胞RNA测序揭示了IFN-β产生细胞的极小比例足以赋予强大的抗病毒状态 | 对caspase如何拮抗IFN信号传导的具体机制了解不足 | 揭示病毒如何利用细胞I型IFN调控机制进行免疫逃避，并为病毒感染和慢性炎症疾病的治疗提供靶向策略 | Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染中的caspase活性及其对cGAS/STING通路的调控 | NA | Kaposi肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 感染细胞中小于5%的细胞产生IFN |
| 19988 | 2024-08-08 |
Recent advances in high-throughput single-cell transcriptomics and spatial transcriptomics
2022-12-06, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00633b
PMID:36254761
|
review | 本文综述了高吞吐量单细胞转录组学和空间转录组学的最新进展 | 介绍了微流控技术和微孔平台在高吞吐量单细胞转录组学中的应用，以及空间转录组学在解码细胞组成、异质性和细胞间通讯中的作用 | 未明确提及具体限制 | 探讨高吞吐量单细胞转录组学和空间转录组学技术的优势、局限性及从这些新技术中获得的新生物学知识 | 单细胞转录组学和空间转录组学技术 | digital pathology | NA | scRNA-seq, spatial transcriptomics | NA | transcriptome | 数千个单个细胞 |
| 19989 | 2024-08-08 |
The development of the amnion in mice and other amniotes
2022-12-05, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2021.0258
PMID:36252226
|
综述 | 本文综述了羊膜在羊膜动物中的发育过程，特别关注了小鼠中羊膜的非典型发育及其分子特征 | 整合了谱系追踪数据以更好地理解羊膜上皮的时空起源，并利用单细胞转录组数据分析了羊膜上皮和羊膜中胚层的分子特征 | NA | 探讨羊膜的形成及其分子特性 | 羊膜在不同羊膜动物中的发育过程 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19990 | 2024-08-08 |
Research progress of single-cell transcriptome sequencing in autoimmune diseases and autoinflammatory disease: A review
2022-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102919
PMID:36242821
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在自身免疫性疾病和自身炎症性疾病中的研究进展 | 单细胞转录组测序技术能够提供无偏倚的结果，通过独立分析组织中的细胞，为识别细胞亚群提供更多mRNA信息，为研究免疫耐受破坏和促炎途径的细胞基础提供了新方法 | NA | 探讨单细胞转录组测序技术在自身免疫性疾病和自身炎症性疾病中的应用，揭示疾病发生发展的机制 | 41种自身免疫性疾病，包括9种系统性自身免疫性疾病和自身炎症性疾病以及32种器官特异性自身免疫性疾病 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 涉及多种组织和细胞类型 |
| 19991 | 2024-08-08 |
The characteristics of cerebrospinal fluid anaplastic large cells in a patient with primary leptomeningeal anaplastic large cell lymphoma
2022-Dec-01, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2022.09.029
PMID:36243040
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研究论文 | 本文报道了一例原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤患者的病例，并通过单细胞RNA测序分析了脑脊液中间变性大细胞的转录组特征。 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析脑脊液中间变性大细胞的转录组特征。 | NA | 研究原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤的诊断和机制。 | 一例26岁中国男性原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤患者。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一例患者 |
| 19992 | 2024-08-08 |
Transcriptional noise adjusted for expression levels reveals genes with high transcriptional noise that are highly expressed, functionally related, and co-regulated in yeast
2022-Dec, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-022-01255-x
PMID:36245041
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研究论文 | 本文研究了酵母中基因表达变异与单细胞和非单细胞基因表达研究之间的关系，发现调整表达水平后的转录噪声可以识别出高表达、功能相关且共同调控的基因 | 本文采用线性/自然对数多项式和局部拟合方法调整表达水平后的转录噪声，并分析多个非单细胞RNA-seq数据集，识别出与高CV基因不同的具有高中值转录噪声的基因 | NA | 理解单细胞和非单细胞基因表达研究中变异性的关系及其在生物系统中的作用和机制 | 酵母中的基因表达变异 | 分子生物学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个非单细胞RNA-seq数据集 |
| 19993 | 2024-08-08 |
Small cell carcinoma of the ovary hypercalcemic type (SCCOHT): A review and novel case with dual germline SMARCA4 and BRCA2 mutations
2022-Dec, Gynecologic oncology reports
IF:1.2Q3
DOI:10.1016/j.gore.2022.101077
PMID:36249907
|
综述 | 本文综述了卵巢高钙型小细胞癌（SCCOHT）的罕见性和侵袭性，并描述了一例同时携带SMARCA4和BRCA2胚系突变的病例 | 描述了一例罕见的双重胚系突变病例，并分享了原始肿瘤的空间转录组学数据 | NA | 综述SCCOHT的特征并介绍一例新型病例 | 卵巢高钙型小细胞癌及其病例 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 单个病例 |
| 19994 | 2024-08-08 |
Anatomical Evidence for Parasympathetic Innervation of the Renal Vasculature and Pelvis
2022-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021111518
PMID:36253054
|
研究论文 | 本文通过解剖学研究方法，包括转基因小鼠模型和免疫染色技术，以及单细胞RNA测序，探讨了肾脏血管和肾盂的副交感神经支配 | 首次提供了肾脏血管和肾盂副交感神经支配的解剖学证据 | NA | 验证肾脏血管和肾盂的副交感神经支配 | 肾脏血管和肾盂的副交感神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用转基因小鼠模型进行研究 |
| 19995 | 2024-08-08 |
Differential plasticity and fate of brain-resident and recruited macrophages during the onset and resolution of neuroinflammation
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.09.005
PMID:36228615
|
研究论文 | 本研究探讨了神经炎症发生和消退过程中，大脑常驻和招募的巨噬细胞的命运和可塑性 | 揭示了大脑常驻巨噬细胞和招募巨噬细胞在感染和疾病消退过程中的不同反应和动态变化 | NA | 研究神经炎症过程中大脑常驻和招募巨噬细胞的命运和可塑性 | 大脑常驻的微胶质细胞、边界相关巨噬细胞（BAMs）和招募的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 19996 | 2024-08-08 |
Molecular pathology of Usher 1B patient-derived retinal organoids at single cell resolution
2022-11-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.006
PMID:36240775
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研究论文 | 本研究分析了从Usher 1B患者诱导的多能干细胞生成的3D视网膜类器官，以单细胞分辨率揭示了MYO7A突变相关的视网膜色素变性的分子病理机制。 | 首次使用患者来源的视网膜类器官模型，揭示了Usher 1B相关视网膜色素变性的分子机制，特别是MYO7A在杆状光感受器和Müller胶质细胞中的表达及其对细胞死亡的防御机制。 | 研究仅限于单一患者来源的类器官，可能需要更多样本以验证结果的普遍性。 | 揭示Usher 1B相关视网膜色素变性的分子病理机制，为开发治疗策略提供基础。 | 从Usher 1B患者诱导的多能干细胞生成的3D视网膜类器官。 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单一患者来源的视网膜类器官 |
| 19997 | 2024-08-08 |
CCR2 is expressed by tendon resident macrophage and T cells, while CCR2 deficiency impairs tendon healing via blunted involvement of tendon-resident and circulating monocytes/macrophages
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201162R
PMID:36250393
|
研究论文 | 本研究探讨了趋化因子受体2（CCR2）在肌腱愈合中的作用，特别是在肌腱驻留巨噬细胞和T细胞中的表达及其缺乏对肌腱愈合的影响 | 首次揭示了CCR2在成年稳态和愈合过程中在肌腱中的存在，并通过单细胞RNA测序确定了这些细胞为肌腱驻留巨噬细胞和T细胞 | NA | 阐明肌腱驻留与循环来源巨噬细胞的功能差异 | CCR2报告和敲除小鼠的肌腱愈合表型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | CCR2报告和敲除小鼠 |
| 19998 | 2024-08-08 |
Integrative transcriptome analysis reveals TEKT2 and PIAS2 involvement in diabetic nephropathy
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200740RR
PMID:36251411
|
研究论文 | 本文通过整合大量和单细胞转录组数据集，揭示了与糖尿病肾病（DN）发展相关的TEKT2和PIAS2基因的作用机制 | 首次通过整合大量和单细胞转录组数据，发现并验证了TEKT2和PIAS2基因在糖尿病肾病中的作用 | NA | 揭示糖尿病肾病的新机制，特别是在足细胞中的作用 | 糖尿病肾病患者和糖尿病小鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 4个肾小球和4个肾小管数据集 |
| 19999 | 2024-08-08 |
SCOTv2: Single-Cell Multiomic Alignment with Disproportionate Cell-Type Representation
2022-Nov, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0270
PMID:36251763
|
研究论文 | 本文介绍了SCOTv2方法，用于处理单细胞多组学数据中细胞类型不均衡的问题，通过使用不平衡的Gromov-Wasserstein最优传输进行单细胞对齐 | SCOTv2方法通过使用不平衡的Gromov-Wasserstein最优传输，有效处理了单细胞实验中细胞类型不均衡和样本大小差异的问题 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据对齐方法，以解决现有算法在非共测序单细胞实验中表现不佳的问题 | 单细胞多组学数据的对齐 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 最优传输 | 单细胞数据 | 五个非共测序数据集（模拟和真实世界） |
| 20000 | 2024-08-08 |
GM-CSF-activated human dendritic cells promote type 1 T follicular helper cell polarization in a CD40-dependent manner
2022-11-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.260298
PMID:36254574
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和蛋白质验证，发现GM-CSF激活的人类树突状细胞能够促进幼稚CD4+ T细胞向Tfh1细胞分化 | 首次揭示了GM-CSF激活的树突状细胞通过CD40依赖性方式促进Tfh1细胞分化的细胞和分子机制 | NA | 探究人类Tfh1细胞分化的细胞和分子要求 | 人类血液中的CD1c+树突状细胞和幼稚CD4+ T细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及COVID-19轻症患者和潜伏性结核感染患者的血液样本 |