单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
19981 2024-08-08
A novel necroptosis-related gene signature for predict prognosis of glioma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2022, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据,建立了一种与坏死性凋亡相关基因特征,用于预测胶质瘤患者的预后 首次揭示了坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的作用,并建立了一个新的基因特征模型用于预测胶质瘤的预后 NA 研究坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的作用,并开发一个预测胶质瘤患者预后的基因特征模型 胶质瘤患者的预后预测 数字病理学 脑瘤 单细胞和批量RNA测序 NA RNA测序数据 多个胶质瘤细胞系和人类星形胶质细胞
19982 2024-08-08
Single-cell analysis of gene expression in the substantia nigra pars compacta of a pesticide-induced mouse model of Parkinson's disease
2022-Jan-01, Translational neuroscience IF:1.8Q4
research paper 本研究通过单细胞RNA测序分析了农药诱导的帕金森病小鼠模型中黑质致密部的基因表达 研究强调了支持细胞在农药诱导的帕金森病中的重要性,并重新关注这些细胞在疾病中的作用,而不仅仅是神经元 NA 阐明农药暴露导致帕金森病的机制 C57BL/6J小鼠的黑质致密部细胞 digital pathology 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
19983 2024-08-08
High-throughput sequencing unravels the cell heterogeneity of cerebrospinal fluid in the bacterial meningitis of children
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组测序,揭示了儿童细菌性脑膜炎中脑脊液细胞的异质性及其在疾病进展中的动态变化 发现了两种新型细胞亚型:FFAR2TNFAIP6中性粒细胞和THBS1IL1B单核细胞,并揭示了它们与脑脊液炎症反应强度的正相关性 NA 深入探索儿童细菌性脑膜炎进展中脑脊液细胞的特征,为急性中枢神经系统感染中的免疫细胞作用提供新见解 儿童细菌性脑膜炎患者的脑脊液样本 数字病理学 儿童疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 多个细菌性脑膜炎患者在疾病进展不同阶段的脑脊液样本
19984 2024-08-08
Integrated multi-omics reveals the activated retinal microglia with intracellular metabolic reprogramming contributes to inflammation in STZ-induced early diabetic retinopathy
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序和多组学分析,揭示了链脲佐菌素诱导的早期糖尿病视网膜病变中,激活的视网膜小胶质细胞通过细胞内代谢重编程促进炎症的机制。 首次识别出在糖尿病视网膜病变中,具有代谢途径改变的小胶质细胞是IL-1β的主要来源,并通过多组学分析揭示了这些细胞的代谢特征。 NA 探究糖尿病视网膜病变中,视网膜特异性细胞类型产生促炎细胞因子的机制。 链脲佐菌素诱导的糖尿病视网膜病变小鼠模型中的小胶质细胞。 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞测序, 代谢组学, 脂质组学, RNA分析 NA 细胞样本 代表糖尿病视网膜病变微环境的微胶质细胞系样本
19985 2024-08-08
MS4A6A is a new prognostic biomarker produced by macrophages in glioma patients
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文研究了MS4A6A在胶质瘤中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 首次揭示了MS4A6A在胶质瘤生物学和预后中的作用,并通过蛋白质相互作用网络和单细胞RNA测序分析了其表达特征 NA 探讨MS4A6A在胶质瘤中的作用及其作为预后生物标志物的可能性 MS4A6A在胶质瘤中的表达及其与临床结果的关系 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个数据集(CGGA1, CGGA2, TCGA, Rembrandt, Gravendeel)中的胶质瘤样本
19986 2024-08-08
Single-cell analysis of the adaptive immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞多组学技术在分析SARS-CoV-2感染和疫苗接种后适应性免疫反应中的应用 利用单细胞多组学技术深入研究SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的免疫反应机制 NA 探讨SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的适应性免疫反应,为疫苗和治疗策略的开发提供支持 SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的适应性免疫反应,包括T细胞和B细胞 NA COVID-19 单细胞多组学技术,包括流式细胞术、单细胞转录组学、单细胞TCR和BCR分析 NA 单细胞数据 NA
19987 2024-08-08
Identification of a novel histone phosphorylation prognostic signature in hepatocellular carcinoma based on bulk and single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究构建了与肝细胞癌(HCC)预后相关的组蛋白磷酸化调控(HPR)基因签名,并探讨了HPR基因是否能预测HCC患者的总体生存 首次构建了与HCC预后相关的组蛋白磷酸化调控基因签名,并验证了其在预测HCC患者生存中的作用 NA 探讨组蛋白磷酸化调控基因在肝细胞癌中的预后价值 肝细胞癌患者及其组蛋白磷酸化调控基因 数字病理学 肝细胞癌 RNA测序 Cox回归分析,Lasso回归分析 RNA测序数据 使用TCGA、ICGC和GEO数据库中的差异表达基因数据,以及从Gene Expression Omnibus(GEO)下载的HCC单细胞RNA测序数据
19988 2024-08-08
Systematic Characterization of Expression Patterns and Immunocorrelations of Formin-Like Genes in Breast Cancer
2022, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本文系统分析了乳腺癌中formin-like基因(FMNL)的表达模式及其与免疫相关性 首次全面阐述了FMNL基因在乳腺癌中的表达模式及其在临床应用中的可变预后意义 NA 研究FMNL基因在乳腺癌中的表达及其与免疫浸润的关系 乳腺癌组织中的FMNL基因表达及其与免疫细胞浸润的相关性 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学(IHC) NA mRNA NA
19989 2024-08-08
RAB20 deficiency promotes the development of silicosis via NLRP3 inflammasome
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究通过单细胞测序分析硅肺病患者的支气管肺泡灌洗液,发现RAB20缺乏与硅肺病的发展密切相关,并通过小鼠模型验证了RAB20缺失加剧硅晶体诱导的肺间质纤维化和呼吸功能障碍,主要通过NLRP3炎症小体的激活和IL-1β的释放。 首次揭示了RAB20在硅肺病发病机制中的关键作用,为理解环境刺激介导的先天免疫提供了新的分子见解。 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,需要在人体中进一步验证。 探究RAB20在硅肺病发病机制中的作用及其分子机制。 硅肺病患者和小鼠模型的单细胞测序数据。 数字病理学 职业病 单细胞测序 NA 单细胞数据 包括硅肺病患者和未发病矿工的支气管肺泡灌洗液样本
19990 2024-08-08
Single-cell transcriptome landscape and antigen receptor dynamic during SARS-CoV-2 vaccination
2023-Jul, Genes & diseases IF:6.9Q1
研究论文 本研究系统地描绘了接种前后单细胞转录组、TCR和BCR表达谱,并分析了COVID-19患者的TCR序列 首次详细描述了接种SARS-CoV-2疫苗后的单细胞分子免疫反应,并发现了特定的克隆CD8 T细胞群 NA 揭示SARS-CoV-2疫苗接种和感染期间的详细免疫反应 接种疫苗的候选者的单细胞转录组、TCR和BCR表达谱,以及COVID-19患者的TCR序列 免疫学 COVID-19 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
19991 2024-08-08
SLE stratification based on BAFF and IFN-I bioactivity for biologics and implications of BAFF produced by glomeruli in lupus nephritis
2023-05-02, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过分析系统性红斑狼疮(SLE)患者中B细胞激活因子(BAFF)和I型干扰素(IFN-I)的生物活性,探讨了BAFF信号阻断疗法的临床应用及其在狼疮性肾炎(LN)中的作用。 首次通过单细胞RNA测序和免疫组化分析,揭示了LN患者肾脏样本中BAFF的表达细胞类型,并提出了基于BAFF和IFN-I生物活性的SLE患者分层方法。 研究主要集中在BAFF和IFN-I的生物活性分析,未涉及其他可能影响SLE病程的因素。 旨在探索SLE患者中BAFF和IFN-I的生物活性,以及这些活性在临床治疗中的应用。 SLE患者,特别是LN患者,以及健康对照组和非LN患者。 数字病理学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 免疫组化分析 NA 生物样本 包括LN患者、非LN患者和健康对照组的肾脏样本
19992 2024-08-08
CD11b + CD43 hi Ly6C lo splenocyte-derived macrophages exacerbate liver fibrosis via spleen-liver axis
2023-05-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
research paper 本文研究了脾脏来源的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞衍生的巨噬细胞通过脾-肝轴加剧肝纤维化的机制 首次揭示了脾脏中的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞迁移至肝脏并转化为巨噬细胞,加剧肝纤维化的具体机制 NA 探讨脾脏在肝纤维化发病机制中的具体作用 脾脏来源的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞及其在肝纤维化中的作用 NA 肝纤维化 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型
19993 2024-08-08
Growth and differentiation of human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived kidney organoids using fully synthetic peptide hydrogels
2023-Mar, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 研究使用全合成自组装肽水凝胶(SAPHs)调控人诱导多能干细胞(hiPSCs)衍生的肾脏类器官的生长和分化 首次使用具有可调节刚度的全合成自组装肽水凝胶作为微环境,促进肾脏类器官的分化和成熟,减少非目标细胞类型的产生 研究中未提及具体的局限性 改进肾脏类器官的形成参数,提高其可重复性和成熟度 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 生物技术 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 共分析了13,179个细胞
19994 2024-08-08
Single-cell landscape and clinical outcomes of infiltrating B cells in colorectal cancer
2023-01, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色实验,揭示了结直肠癌中浸润B细胞的五种不同亚型及其在肿瘤微环境中的分布模式和功能特性 首次详细描述了结直肠癌中浸润B细胞的亚型及其在肿瘤微环境中的功能,并发现B细胞和三级淋巴结构在免疫治疗中的潜在临床意义 NA 探究结直肠癌中浸润B细胞的特征及其临床意义 结直肠癌中的浸润B细胞及其在肿瘤微环境中的作用 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
19995 2024-08-08
The role of goblet cells and mucus in intestinal homeostasis
2022-12, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
综述 本文综述了杯状细胞和黏液层在维持肠道稳态中的作用及其在炎症和感染性疾病中的变化 通过单细胞RNA测序识别出新的杯状细胞亚群,加深了对它们在肠道稳态中多种贡献的理解 NA 探讨杯状细胞和黏液层在维持肠道健康中的作用及其在疾病中的变化 杯状细胞和黏液层 NA 炎症和感染性疾病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
19996 2024-08-08
Single-cell RNA analysis of chemokine expression in heterogeneous CD14+ monocytes with lipopolysaccharide-induced bone resorption
2022-11-15, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 研究探讨了脂多糖(LPS)诱导的骨吸收中,CD14+单核细胞的异质性及其在表达趋化因子中的作用 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了LPS处理后CD14+单核细胞的异质性及其在骨吸收过程中的趋化因子表达模式 研究主要基于体外实验和动物模型,可能与人体内实际情况存在差异 探究LPS诱导的骨吸收过程中CD14+单核细胞的响应机制 CD14+单核细胞及其在LPS处理后的反应 数字病理学 炎症性骨疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 从人外周血单个核细胞(PBMCs)中分离的CD14+单核细胞
19997 2024-08-08
The druggable transcription factor Fli-1 regulates T cell immunity and tolerance in graft-versus-host disease
2022-11-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究了转录因子Fli-1在移植物抗宿主病(GVHD)发病机制中的作用,并验证了Fli-1作为治疗靶点的潜力 首次揭示了Fli-1在调节T细胞免疫和耐受中的作用,并发现低剂量的喜树碱类药物可以作为有效的Fli-1抑制剂,减轻GVHD的严重程度 NA 探讨Fli-1在GVHD中的作用及作为治疗靶点的可能性 Fli-1在GVHD中的作用及治疗潜力 NA 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
19998 2024-08-08
Single-cell transcriptome study in forensic medicine: prospective applications
2022-Nov, International journal of legal medicine IF:2.2Q1
review 本文综述了单细胞转录组学在法医学中的应用前景 探讨了单细胞转录组学在法医学领域的潜在应用,为法医学研究提供了新的视角 目前该技术在法医学相关研究中尚未得到充分关注 旨在通过审查和回顾单细胞转录组学的最新发展和应用,探讨其在法医学研究中的未来方向 单细胞转录组学技术及其在法医学中的应用 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
19999 2024-08-08
Decoding the associations between cell functional states in head and neck cancer based on single-cell transcriptome
2022-11, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 本研究基于单细胞转录组测序技术,系统识别了头颈鳞状细胞癌中的六种癌症相关状态及其关联模式 首次定义了头颈鳞状细胞癌中功能状态之间的关联模式,并发现这些模式与状态活性相关 NA 旨在理解癌症发病机制中癌细胞功能状态及其关联 头颈鳞状细胞癌中的癌细胞功能状态及其关联 数字病理学 头颈癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包括免疫细胞和四个独立头颈鳞状细胞癌队列的单细胞RNA测序数据
20000 2024-08-08
MSR1 characterized by chromatin accessibility mediates M2 macrophage polarization to promote gastric cancer progression
2022-Nov, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文通过分析TCIA数据库和综合ATAC-seq、RNA-seq及单细胞RNA测序数据,研究了M2巨噬细胞在胃癌进展中的作用及机制 首次揭示了MSR1基因通过染色质可及性介导M2巨噬细胞极化,从而促进胃癌进展的机制 NA 探究M2巨噬细胞在胃癌进展中的作用及其潜在的肿瘤促进机制 胃癌样本中的M2巨噬细胞及其相关基因 数字病理学 胃癌 ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序 CIBERSORTx算法 基因表达数据 17,334个具有染色质可及性的基因,2,714个同时具有染色质可及性和差异表达的基因,171个与生存相关的差异表达基因
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