单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1981	2025-03-26	Potential Molecular Mechanisms of Alzheimer's Disease from Genetic Studies 2023-04-15, Biology DOI:10.3390/biology12040602 PMID:37106802	综述	本文综述了阿尔茨海默病（AD）的潜在分子机制，特别关注了遗传学研究中的发现	通过单细胞测序（scRNA-seq）和空间基因组学技术，将AD的分子机制差异归纳为四个关键类别，并探讨了与先前研究结果的对比	研究基于已有文献的叙述性综合，未进行新的实验验证	识别AD中分子失衡的共同原因及其潜在机制，为后续研究提供方向	阿尔茨海默病（AD）的分子机制	遗传学	阿尔茨海默病	scRNA-seq, 空间基因组学	NA	基因组数据	NA
1982	2025-03-26	Epigenetic and transcriptomic characterization reveals progression markers and essential pathways in clear cell renal cell carcinoma 2023-03-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-37211-7 PMID:36973268	research paper	该研究通过单核RNA测序和单核ATAC测序技术，结合大量蛋白质组学数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤特异性标志物及其表观遗传调控机制	通过多组学分层方法鉴定了20个肿瘤特异性标志物，揭示了铜蓝蛋白（CP）表达与生存率降低的关联，并探讨了CP在调节透明细胞肾细胞癌间质和肿瘤-间质相互作用中的角色	样本量相对较小（34例snRNA-seq和28例snATAC-seq样本），可能限制了结果的普遍性	揭示透明细胞肾细胞癌的肿瘤特异性标志物及其表观遗传调控机制，以增进对该癌症发病机理的理解	人类透明细胞肾细胞癌（ccRCC）标本	digital pathology	renal cell carcinoma	snRNA-seq, snATAC-seq, bulk proteogenomics, spatial transcriptomics	NA	genomic, transcriptomic, proteomic, epigenomic data	34例snRNA-seq和28例snATAC-seq的人类ccRCC标本
1983	2025-03-26	Single-cell RNA-seq identified novel genes involved in primordial follicle formation 2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2023.1285667 PMID:38149096	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，识别了参与原始卵泡形成的新基因和新配体-受体相互作用	发现了ANXA7和GTF2F1在生殖细胞中促进原始卵泡形成的新功能，以及配体Mdk与受体Sdc1在原始卵泡形成中的关键作用	研究主要基于小鼠和人类卵巢的公共单细胞RNA测序数据，样本量有限	探索原始卵泡形成的分子机制及其与早发性卵巢功能不全的关系	小鼠和人类卵巢中的生殖细胞和颗粒细胞	生殖生物学	早发性卵巢功能不全	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全外显子测序(WES)、全基因组测序(WGS)	NA	基因表达数据、测序数据	93例POI患者和465例对照的测序数据，25周人类胎儿卵巢样本
1984	2024-08-08	Using advanced spatial and single-cell transcriptomics to characterize the human endometrium 2021-12, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-021-00982-0 PMID:34857955	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1985	2025-03-25	Integrated bioinformatics analysis identifies neutrophils and villous cytotrophoblasts infiltration characterized by BLC6 upregulation as associated with the co-occurrence of gestational diabetes mellitus and pre-eclampsia 2025-Dec, Hypertension in pregnancy IF:1.5Q4 DOI:10.1080/10641955.2025.2475814 PMID:40122115	研究论文	通过整合生物信息学分析，识别出与妊娠期糖尿病(GDM)和先兆子痫(PE)共发相关的关键基因和通路	首次发现BCL6在GDM和PE共发患者的中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞(VCTs)中高表达，并可能作为诊断和治疗的新靶点	研究主要基于公开数据集分析，缺乏实验验证	探究GDM和PE共发的分子机制和潜在诊断标志物	GDM和PE患者的基因表达数据	生物信息学	妊娠期糖尿病和先兆子痫	基因表达分析、GO和KEGG通路分析、蛋白质互作网络分析、ROC分析、单细胞测序数据分析	回归模型	基因表达数据	来自GEO数据库的多个GDM和PE数据集
1986	2025-03-25	Xin-Fu-Kang oral liquid mitigates chronic heart failure through NR4A1-Dependent regulation of endoplasmic reticulum-mitochondrial crosstalk in Cardiomyocytes 2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156467 PMID:40036990	研究论文	研究探讨了心复康口服液通过调节NR4A1依赖的内质网-线粒体交互作用，改善慢性心力衰竭的机制	首次揭示了心复康口服液通过NR4A1介导的内质网-线粒体交互作用改善心肌细胞功能的分子机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化需要进一步验证	探究心复康口服液治疗慢性心力衰竭的分子机制	心肌细胞	心血管疾病研究	慢性心力衰竭	单细胞测序(scRNA-seq)、UPLC-QE MS、分子对接	小鼠横向主动脉缩窄(TAC)模型、苯肾上腺素诱导的心脏压力超负荷模型	基因表达数据、质谱数据	小鼠模型和体外培养的H9C2细胞
1987	2025-03-25	Targeting p53 for immune modulation: Exploring its functions in tumor immunity and inflammation 2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217614 PMID:40054656	综述	本文综述了p53在肿瘤免疫和炎症中的双重作用，探讨其对免疫动态的影响及其在癌症免疫治疗中的潜在应用	详细阐述了p53在免疫调节中的新功能，包括其在免疫原性细胞死亡(ICD)中的作用以及与NF-κB信号通路的相互作用	NA	探讨p53在免疫调节和肿瘤免疫逃逸中的作用，及其在癌症免疫治疗中的潜在应用	p53蛋白及其在免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞、T细胞和B细胞)中的功能	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序、CRISPR筛选	NA	NA	NA
1988	2025-03-25	Huoxue Tongluo tablet enhances atherosclerosis efferocytosis by promoting the differentiation of Trem2+ macrophages via PPARγ signaling pathway 2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156579 PMID:40068297	研究论文	本研究探讨了活血通络片通过PPARγ信号通路促进Trem2+巨噬细胞分化，从而增强动脉粥样硬化中巨噬细胞的胞葬作用	首次揭示了活血通络片对巨噬细胞亚群的调控作用及其促进胞葬活性的机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	评估活血通络片在单细胞水平上治疗动脉粥样硬化的效果和机制	ApoE⁻/⁻小鼠	心血管疾病	动脉粥样硬化	UPLC-MS/MS, 单细胞测序, qPCR, 免疫组化, 流式细胞术, 免疫荧光染色, Western blotting	动物模型	转录组数据, 蛋白质表达数据	ApoE⁻/⁻小鼠（具体数量未明确说明）
1989	2025-03-25	Irreversible electroporation combined with PD-L1/IL-6 dual blockade promotes anti-tumor immunity via cDC2/CD4+T cell axis in MHC-I deficient pancreatic cancer 2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217620 PMID:40068706	research paper	研究探讨了不可逆电穿孔（IRE）联合PD-L1/IL-6双阻断如何通过cDC2/CD4+T细胞轴在MHC-I缺陷型胰腺癌中促进抗肿瘤免疫	揭示了IRE疗法后PD-L1阻断激活cDC2-CD4T细胞轴的补偿性抗肿瘤机制，并提出了PD-L1/IL-6双阻断联合消融治疗的新策略	研究主要基于临床样本和小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索MHC-I缺陷型胰腺癌的免疫治疗新方法	胰腺导管腺癌（PDAC）患者和小鼠模型	肿瘤免疫学	胰腺癌	scRNA-seq, 流式细胞术	NA	基因表达数据, 细胞表型数据	临床样本和小鼠模型（具体数量未明确说明）
1990	2025-03-25	UBE2C mediates follicular thyroid carcinoma invasion and metastasis via K29-Specific vimentin ubiquitination 2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217624 PMID:40074069	研究论文	本研究揭示了UBE2C通过K29特异性波形蛋白泛素化调控滤泡性甲状腺癌的侵袭和转移	首次发现UBE2C在滤泡性甲状腺癌中的双重功能，即促进细胞增殖同时抑制迁移和侵袭，并通过K29特异性泛素化降解波形蛋白	动物模型中UBE2C敲低导致原发肿瘤减小但促进转移的现象需要进一步机制研究	探究UBE2C在滤泡性甲状腺癌进展中的具体作用机制	滤泡性甲状腺癌(FTC)组织和细胞系	癌症生物学	甲状腺癌	单细胞RNA测序，动物模型	NA	基因表达数据，蛋白质相互作用数据	未明确说明样本数量，但包含临床标本和细胞系实验
1991	2025-03-25	Lysozyme modulates inflammatory responses to exacerbate the severity of rheumatoid arthritis 2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114427 PMID:40056513	研究论文	该研究探讨了溶菌酶（LYZ）在类风湿性关节炎（RA）中的作用及其作为早期RA诊断生物标志物或治疗靶点的潜力	首次揭示了LYZ在早期RA患者血浆和滑膜巨噬细胞中的高表达，并通过基因敲除和沉默实验验证了LYZ在RA炎症调控中的作用	研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在更大规模的人类临床样本中验证LYZ的临床应用价值	探索RA的新治疗靶点或生物标志物以改善治疗效果	早期RA患者、CAIA小鼠模型和MH7A细胞	NA	类风湿性关节炎	血浆蛋白质组学、滑膜液单细胞测序分析、RNA-Seq	CAIA小鼠模型	蛋白质表达数据、基因表达数据	未明确说明样本数量，涉及早期RA患者、CAIA小鼠和MH7A细胞
1992	2025-03-25	MultiOmics analysis of metabolic dysregulation and immune features in breast cancer 2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114376 PMID:40054322	研究论文	通过多组学分析乳腺癌中的代谢失调和免疫特征，构建代谢风险模型以预测患者预后	首次综合代谢和免疫因素评估乳腺癌患者预后，并构建代谢风险模型	样本量相对较小（247例），且仅基于TCGA和GEO数据库	评估和预测乳腺癌患者的预后	乳腺癌样本	多组学分析	乳腺癌	GSVA、单细胞测序分析、机器学习算法	代谢风险模型	基因表达数据、临床病理特征数据、免疫浸润数据	247例乳腺癌样本
1993	2025-03-25	Comprehensive pan-cancer single-cell analysis reveals glycolysis-related signatures as predictive biomarkers for immunotherapy response and their role in bladder cancer 2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114381 PMID:40058104	research paper	通过全面的泛癌单细胞分析，揭示了糖酵解相关特征作为免疫治疗反应的预测生物标志物及其在膀胱癌中的作用	发现了一个与免疫治疗反应强烈相关的糖酵解特征（Glycolysis.Sig），并证实其在预后和免疫反应预测中的优异性能	研究主要基于已有数据集的分析，需要进一步实验验证	探究糖酵解在泛癌尤其是膀胱癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系	泛癌及膀胱癌的单细胞和批量RNA测序数据	生物信息学	膀胱癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq）	NA	RNA测序数据	34个单细胞RNA测序队列，8个接受ICI治疗的批量RNA测序队列，以及TCGA泛癌批量RNA测序队列
1994	2025-03-25	A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus 2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466 PMID:40090085	research paper	研究发现了一组在青少年系统性红斑狼疮中高度激活的CD99- CD72+ B细胞亚群，这些细胞通过表达高水平的TLR7促进自身免疫反应	首次识别并描述了CD72 BCs这一关键过渡细胞群体，其在系统性红斑狼疮中连接了初始B细胞和浆细胞的分化过程	研究主要基于青少年系统性红斑狼疮患者，结果在成人患者中的适用性尚待验证	探究系统性红斑狼疮中自身抗体分泌细胞的起源和分化机制	CD99- CD72+ B细胞亚群	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(RNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，研究对象为青少年系统性红斑狼疮患者
1995	2025-03-25	Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection 2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416846 PMID:40123572	研究论文	该研究利用单细胞和空间转录组学技术，揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维响应	首次构建了水稻叶片的单细胞转录组图谱，揭示了细胞特异性和多维度的免疫响应机制	NA	研究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制	水稻叶片细胞和稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)	植物病理学	稻瘟病	单细胞转录组学、空间转录组学	NA	转录组数据	236,708个单细胞转录组
1996	2025-03-25	Exosomal PKM2: A Noninvasive Diagnostic Marker Linking Macrophage Metabolic Reprogramming to Gastric Cancer Pathogenesis 2025-Mar-24, Cancer science IF:4.5Q1 DOI:10.1111/cas.70056 PMID:40126044	research paper	该研究探讨了血浆外泌体PKM2作为胃癌诊断标志物的潜力及其在肿瘤微环境中通过调控巨噬细胞代谢重编程促进胃癌发展的机制	首次揭示外泌体PKM2通过抑制SCAP多聚泛素化激活SREBP1相关脂质合成通路促进胃癌发展的分子机制	样本量相对有限（216例），且机制研究主要在细胞水平进行	探究外泌体PKM2在胃癌诊断和发病机制中的作用	胃癌患者和健康供体的血浆样本（216例）及肿瘤相关巨噬细胞	肿瘤生物学	胃癌	单细胞转录组测序、Kaplan-Meier分析	NA	血液样本、单细胞转录组数据	216例血液样本（胃癌患者和健康对照）
1997	2025-03-25	Time, the final frontier 2025-Mar-24, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.70025 PMID:40126098	研究论文	本文主张将时间动态整合到癌症研究中，强调从传统的终点实验向数据驱动的连续方法的根本转变	提出将时间动态整合到癌症研究中，开发先进的活体成像技术、创新的时间组学方法和新型计算工具	未提及具体的技术实施细节或实验验证结果	探索肿瘤的时间动态变化，以更全面地理解肿瘤的异质性和进化	肿瘤及其微环境	数字病理学	癌症	活体成像技术、时间组学方法	NA	时间序列数据	NA
1998	2025-03-25	Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer 2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416523 PMID:40126173	研究论文	研究通过靶向胶原重塑细胞外基质（ECM）来增强卵巢癌化疗敏感性的策略	发现Halofuginone（HF）通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生，破坏胶原沉积并促进CD8+ T细胞浸润，从而增强化疗敏感性	NA	探索靶向ECM重塑以增强卵巢癌化疗敏感性的策略	卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和细胞外基质（ECM）	癌症研究	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
1999	2025-03-25	Single-Cell Analysis Clarifies Pathological Heterogeneity in Tenosynovial Giant Cell Tumor and Identifies Biomarkers for Predicting Disease Recurrence 2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415835 PMID:40126353	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析弥漫型和局限型腱鞘巨细胞瘤的转录差异，揭示疾病复发预测的生物标志物	发现D-TGCT中独特的肿瘤细胞簇及其通过COL6A3-(ITGAV+ITGB8)相互作用调控成纤维细胞分化的机制，并鉴定出预测疾病复发的生物标志物ROR1和PRKD1	NA	阐明弥漫型腱鞘巨细胞瘤的侵袭性行为机制并寻找疾病复发预测标志物	人类弥漫型(D-TGCT)和局限型(L-TGCT)腱鞘巨细胞瘤病变组织	单细胞组学	腱鞘巨细胞瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	NA
2000	2025-03-25	eNAMPT Is a Novel DAMP and Therapeutic Target in Human and Murine Pulmonary Fibrosis 2025-Mar-24, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2024-0342OC PMID:40126452	research paper	该研究探讨了eNAMPT作为人类和临床前IPF治疗靶点的潜力，并评估了ALT-100单克隆抗体的治疗效果	首次将eNAMPT鉴定为肺纤维化的新型DAMP和治疗靶点，并展示了ALT-100单抗的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模的临床试验验证	探索eNAMPT在肺纤维化中的作用并评估其作为治疗靶点的潜力	IPF患者和小鼠模型	NA	肺纤维化	bulk和单细胞RNA测序	NA	血液、PBMCs、肺组织样本	IPF患者样本和C57Bl6小鼠模型