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当前共找到 41304 篇文献，本页显示第 1981 - 2000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1981 | 2026-06-15 |
Testis Molecular Pathways in CAIS Unveil Testosterone/Estradiol on Germ Cell Tumor Risk in Non-Obstructive Azoospermia
2026-01-21, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaf404
PMID:40658795
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析完全性雄激素不敏感综合征（CAIS）患者的睾丸体细胞分子通路，揭示睾酮/雌二醇比值对非梗阻性无精子症（NOA）患者生殖细胞肿瘤风险的预测作用 | 首次利用单细胞RNA测序整合分析CAIS、NOA、克氏综合征及正常睾丸组织数据，发现非遗传性NOA患者间质细胞中与精原细胞瘤微环境相关的转录特征，并证明血清睾酮/雌二醇比值对睾丸生殖细胞癌具有预后价值 | 研究仅基于单个CAIS患者的睾丸样本，可能无法完全代表该疾病的分子异质性；且未进行功能验证实验来确认关键分子通路的因果作用 | 建立非遗传性和遗传性NOA（如CAIS和克氏综合征）睾丸体细胞中共享或特异性的分子通路，并探索其与睾丸生殖细胞癌风险的关系 | 完全性雄激素不敏感综合征患者、非梗阻性无精子症患者、克氏综合征患者及正常生精功能男性的睾丸体细胞 | 数字病理学 | 男性不育症, 睾丸生殖细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 临床数据 | 1例CAIS患者睾丸样本；120名可育、155名不育、116名NOA、18名KS、343名TGCC男性的血清睾酮和雌二醇水平数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1982 | 2026-06-15 |
FKBP10 promotes M2 polarization of macrophage via MEK/ERK/CXCL8 axis and facilitates tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.117535
PMID:41694575
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研究论文 | 整合单细胞转录组数据构建透明细胞肾细胞癌免疫生态系统图谱，揭示FKBP10通过MEK/ERK/CXCL8轴促进巨噬细胞M2极化及肿瘤进展的机制 | 首次基于大规模单细胞RNA测序数据对ccRCC生态系统进行分型，识别出四种TIME亚型和六种肿瘤细胞功能状态，并揭示FKBP10介导的免疫抑制新机制 | 缺乏功能验证实验及前瞻性临床队列数据支持 | 解析透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境异质性及寻找新的免疫治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自118例ccRCC患者的194份样本共计1,172,154个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1983 | 2026-06-15 |
The immunopathological crosstalk of diabetic periodontitis: Single-cell insights into monocyte dysregulation
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341333
PMID:41701724
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病牙周炎患者外周血单核细胞的异质性和功能改变，揭示糖尿病加剧牙周炎症的免疫病理机制 | 首次系统描绘糖尿病牙周炎患者单核细胞亚群的功能重编程和信号通路失调，鉴定关键转录因子PBX1、TAL1、IRF9调控单核细胞分化缺陷和过度炎症表型 | 仅分析外周血单核细胞，未涉及牙周组织局部免疫微环境，且样本量较小可能限制单核细胞亚群多样性发现 | 阐明糖尿病如何通过单核细胞重编程和信号通路失调加剧牙周炎症的免疫病理机制 | 健康对照、牙周炎患者、糖尿病牙周炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 糖尿病, 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照组、牙周炎组、糖尿病牙周炎组共三组样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1984 | 2026-06-15 |
A multi-dimensional omics framework identifies GPR35 as a driver of M2 macrophage activation and poor prognosis in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1783260
PMID:41789103
|
研究论文 | 通过构建结直肠癌肿瘤微环境的多维单细胞组学图谱，鉴定GPR35为M2巨噬细胞活化和不良预后的驱动因子 | 首次整合多队列单细胞RNA测序数据构建CRC肿瘤微环境综合图谱，通过非负矩阵分解鉴定出与M2巨噬细胞活化相关的MP8元程序，并发现GPR35作为肿瘤细胞内在的免疫逃逸驱动因子和免疫治疗耐药的关键调节因子 | 研究主要基于公共数据库分析，缺乏大规模前瞻性临床队列验证；GPR35促进免疫逃逸的具体分子机制尚需进一步实验阐明；体外功能实验未在体内模型中进行验证 | 阐明结直肠癌肿瘤微环境中免疫逃逸的分子机制，鉴定新的治疗靶点以改善免疫治疗效果 | 结直肠癌肿瘤微环境中的单细胞转录组、肿瘤细胞功能与免疫细胞互作 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解、高维WGCNA | 单细胞转录组数据 | 多队列结直肠癌患者单细胞RNA测序数据（具体样本量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1985 | 2026-06-15 |
scCNMF: an integrated analysis model for paired single-cell RNA sequencing and assay for transposase-accessible chromatin sequencing data leveraging cell similarity and cis-regulatory potential
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20836
PMID:41800139
|
研究论文 | 提出scCNMF模型，整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据，利用细胞相似性和顺式调控潜力提升分析准确性 | 首次同时考虑scATAC-seq数据的高稀疏性和细胞水平的调控相互作用，并基于非负矩阵分解整合细胞相似结构和先验调控信息 | 未明确说明，但可能受限于先验调控信息的完整性和数据集规模 | 实现配对单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据的整合分析，提升细胞嵌入和聚类准确性 | 单细胞RNA-seq和scATAC-seq配对数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞基因表达数据, 单细胞染色质可及性数据 | 多个真实数据集（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1986 | 2026-06-15 |
Peripheral CD4+ naïve T cell remodeling and MMP1-associated inflammatory signatures in acute gouty arthritis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1828679
PMID:42273695
|
研究论文 | 结合孟德尔随机化、质谱流式细胞术、单细胞转录组分析和血浆蛋白质组学，研究了急性痛风性关节炎中外周CD4+初始T细胞重塑和MMP1相关炎症特征 | 首次整合双向孟德尔随机化、CyTOF免疫图谱、单细胞转录组分析、血浆蛋白质组学和前瞻性临床随访数据，揭示急性痛风性关节炎中CD4+初始T细胞重塑和MMP1相关炎症特征在复发风险分层中的探索潜力 | 未提及具体限制，但暗示MMP1的机制角色仍需进一步功能验证 | 探索急性痛风性关节炎中适应性免疫重塑及其与复发相关的炎症特征 | 急性痛风性关节炎患者（GA-A组、GA-R组）及健康对照 | 机器学习和生物信息学 | 痛风性关节炎 | CyTOF、单细胞RNA测序、Olink蛋白质组学、孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、免疫细胞表型数据 | PBMC样本：GA-A组25例、GA-R组22例、健康对照组9例；血浆蛋白质组学训练队列40例和验证队列64例 | Olink | 血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | Olink平台 | Olink平台用于血浆炎症蛋白定量 |
| 1987 | 2026-06-15 |
Integrative Multiomics and Network Pharmacology Exploration of Active Components and Mechanisms of Action of Qufu Shengxin Ointment in Treating Chronic Nonhealing Wounds
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/1280142
PMID:42287035
|
研究论文 | 通过整合多组学与网络药理学，揭示祛腐生新软膏治疗慢性难愈合伤口的活性成分与作用机制 | 首次结合多组学分析、孟德尔随机化、分子对接和体内实验，系统阐明祛腐生新软膏通过PI3K/Akt/mTOR通路调控自噬和炎症促进伤口愈合的机制，并识别AKR1B1和VCAM1为潜在治疗靶点 | 该研究主要基于生物信息学分析和动物实验验证，缺乏临床样本的直接验证机制研究 | 探究祛腐生新软膏治疗慢性难愈合伤口的药理学机制 | 慢性难愈合伤口（CNHWs）组织样本 | 自然语言处理 | 慢性难愈合伤口 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | WGCNA | 转录组学数据 | 来自GEO数据集的慢性难愈合伤口与正常伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1988 | 2026-06-15 |
Decoding anoikis-related genes in lung adenocarcinoma brainmetastasis via single-cell RNA sequencing: CD44-mediated functions
2025-Dec-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15485-y
PMID:41454310
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解码肺腺癌脑转移中失巢凋亡相关基因（特别是CD44）的功能 | 首次利用单细胞RNA测序数据系统分析失巢凋亡相关基因在肺腺癌脑转移中的作用机制，并构建基于CD44等基因的预后模型 | 未明确说明 | 探究失巢凋亡相关基因在肺腺癌脑转移进展中的作用及预后意义 | 肺腺癌患者原发肿瘤组织及脑转移组织样本 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据、批量RNA测序数据、生存数据 | 6例肺癌样本和6例脑转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1989 | 2026-06-15 |
Causality between Cholecystectomy, Blood Lipids, and Major Adverse Cardiac and Cerebrovascular Events: A Multimodal Approach Highlighting Lipid Regulation
2025-Nov, Bulletin of experimental biology and medicine
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s10517-026-06583-3
PMID:41706273
|
研究论文 | 采用多模态方法探究胆囊切除术、血脂与主要不良心脑血管事件之间的因果关系，强调脂质调节的作用 | 结合孟德尔随机化、多变量孟德尔随机化、表达数量性状基因座孟德尔随机化及单细胞测序等多种方法，系统评估胆囊切除术对血脂和心脑血管事件的因果效应，并识别关键中介因子ApoB/ApoA1比率和LPL基因 | NA | 评估胆囊切除术对血脂水平和主要不良心脑血管事件风险的因果效应 | 胆囊切除术、血脂（包括ApoB/ApoA1比率）、主要不良心脑血管事件（心绞痛、冠心病、心力衰竭、心肌梗死、中风） | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化、单细胞测序 | NA | 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1990 | 2026-06-15 |
Microarray and Single-Cell RNA Sequencing Reveals G-Protein Gene Expression Signatures of Spermatogonia Stem Cell
2025-10, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10942-4
PMID:40694278
|
研究论文 | 该论文通过微阵列和单细胞RNA测序技术，揭示了与精原干细胞发育相关的G蛋白基因表达特征 | 首次利用微阵列分析结合单细胞转录组学，系统鉴定了人类精原干细胞中G蛋白偶联受体基因的表达模式，并验证了多个新基因在精原干细胞发育中的调控作用 | 未详细说明样本量、验证实验及功能机制研究的局限性 | 探究人类精原干细胞发育的分子机制，为男性生育力基础研究和治疗应用提供依据 | 人类睾丸精原干细胞 | 单细胞转录组学 | 男性不育相关疾病 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫荧光标记 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 6个人类睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1991 | 2026-06-15 |
Mast Cells Drive Ferroptosis in Gastric Tumors as Key Players in the Tumor Immune Microenvironment
2025-09, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251366980
PMID:40831393
|
研究论文 | 通过整合转录组分析，探究肥大细胞在胃癌肿瘤微环境中驱动铁死亡的作用机制 | 首次揭示肥大细胞通过旁分泌信号（可能涉及膜联蛋白和亲环蛋白A）调控肿瘤微环境中铁死亡的新病理生理轴 | 基于公共数据库的转录组分析，缺乏实验验证；样本量有限（TCGA中412例，GSE66229中300例）；机制细节尚未完全阐明 | 阐明铁死亡与特定免疫细胞类型（尤其是肥大细胞）在胃癌中的功能联系 | 胃癌患者的肿瘤样本及成纤维细胞-肥大细胞共培养体系 | 机器学习 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | 单样本基因集富集分析 | 转录组数据 | 412例（TCGA数据）和300例（GSE66229数据）胃癌患者样本，以及成纤维细胞-肥大细胞共培养数据 | NA | 批量RNA-seq， 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1992 | 2026-06-15 |
Unraveling the oxidative stress landscape in diabetic foot ulcers: insights from bulk RNA and single-cell RNA sequencing data
2025-07-04, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00672-5
PMID:40616164
|
研究论文 | 利用批量RNA和单细胞RNA测序数据揭示糖尿病足溃疡中氧化应激的全局景观，并鉴定出BCL2和FOXP2作为诊断标志物 | 首次通过整合批量RNA和单细胞RNA测序数据，结合机器学习、伪时间轨迹分析和体外实验，系统揭示了糖尿病足溃疡中氧化应激的分子机制，特别是成纤维细胞的异质性和低分化潜力 | 研究依赖于公开数据库的原始数据，可能引入批次效应；体外实验仅验证了BCL2和FOXP2的表达变化，未深入探讨其功能机制 | 利用生物信息学和初步验证方法，揭示糖尿病足溃疡中氧化应激的全局景观，并识别潜在的诊断标志物 | 糖尿病足溃疡患者的样本（包括批量RNA和单细胞RNA测序数据），以及正常对照样本 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 支持向量机递归特征消除, 套索算法, 随机森林 | 基因表达数据 | 单细胞RNA测序数据包含31,787个细胞，来自10个不同聚类；批量RNA测序数据包括糖尿病足溃疡患者和对照样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1993 | 2026-06-15 |
Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics
2025-06, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10889-6
PMID:40366552
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学与批量蛋白质组学整合分析，鉴定脂肪基质血管组分中具有免疫调节活性的间充质干细胞亚群 | 首次通过多模态整合方法（Scissor算法结合单细胞RNA测序与批量蛋白质组学）在未培养的脂肪SVF中鉴定出与细胞因子处理的培养ASCs表型相似的免疫调节亚群，揭示其通过IL6和SEMA4信号通路发挥应激适应免疫调节功能 | 未提及明显局限性 | 阐明脂肪组织中基质血管组分来源的ASCs的异质性免疫调节潜力，为治疗策略提供依据 | 脂肪组织中的基质血管组分和脂肪来源的间充质干细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学, Scissor算法 | Scissor算法 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组学数据 | 培养至第二代（P2）的ASCs和未培养（P0）的SVF样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 1994 | 2026-06-15 |
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.025
PMID:40132593
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和B细胞受体库测序，分析了嵌合血凝素（cHA）疫苗接种后诱导的B细胞反应，发现其针对血凝素茎部区域的广泛中和表位产生持久且特异的B细胞应答 | 首次通过单细胞RNA测序与B细胞受体库联合分析，揭示了cHA疫苗诱导的B细胞对茎部广泛保护性表位的长期克隆汇聚和记忆B细胞池重塑 | 未提及样本量大小及长期随访中可能存在的个体间应答差异 | 阐明cHA疫苗接种后B细胞的特异性、功能及亚群变化，以验证其诱导针对HA茎部广谱保护性表位的持久抗体反应 | 受试者（临床试验参与者）的B细胞，尤其是浆母细胞（PB）和记忆B细胞（MBC） | 数字病理学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序, B细胞受体库测序 | NA | 单细胞转录组数据, BCR序列数据 | 一项I期临床试验的受试者样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1995 | 2026-06-15 |
Tumor-derived arachidonic acid reprograms neutrophils to promote immune suppression and therapy resistance in triple-negative breast cancer
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.002
PMID:40157359
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研究论文 | 发现三阴性乳腺癌细胞中积累的中性脂质通过花生四烯酸重编程中性粒细胞，导致免疫抑制和治疗抵抗 | 首次揭示脂滴形成在抗PD-1和化疗抵抗中的关键作用，并阐明肿瘤来源的花生四烯酸通过细胞外囊泡重编程中性粒细胞的机制 | NA | 探究三阴性乳腺癌对免疫检查点阻断和化疗联合治疗获得性抵抗的机制 | 三阴性乳腺癌细胞、中性粒细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1996 | 2026-06-15 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Human Pancreas with Focus on Type 2 Diabetes
2025-04, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1089/omi.2024.0211
PMID:40068171
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据与通用Human1模型整合，构建了非糖尿病和2型糖尿病状态下胰腺α、β、δ和PP细胞的特异性基因组规模代谢模型，并分析其代谢活动 | 首次在单细胞分辨率下构建了2型糖尿病胰岛细胞的基因组规模代谢模型，揭示了不同细胞类型中代谢活动的特异性变化 | 未提及 | 整合实验与计算生物学方法，深入理解2型糖尿病病理生理学并发现新的分子靶点 | 胰腺α、β、δ和PP细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 基因组规模代谢模型 | 单细胞转录组数据 | 未提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 1997 | 2026-06-15 |
Peptide amphiphiles alleviate myocardial endoplasmic reticulum stress to enhance cardiomyocyte-macrophage communication and promote macrophage M2 polarization
2025-02-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.042
PMID:39710208
|
研究论文 | 开发了一种级联响应药物递送系统CT-PA@Sal，靶向损伤心肌细胞并缓解内质网应激，促进心肌细胞-巨噬细胞通讯及M2型巨噬细胞极化，减轻心肌缺血再灌注损伤 | 首次利用肽两亲物构建级联响应药物递送系统，特异性靶向受损心肌细胞并控制释放内质网应激抑制剂Salubrinal，改善细胞间通讯并促进抗炎M2型巨噬细胞极化 | 缺乏有效靶向受损心肌细胞的内质网应激抑制剂是该研究面临的主要障碍，且体内外实验仍需进一步验证转化潜力 | 开发靶向心肌内质网应激的肽两亲物药物递送系统，为心肌缺血再灌注损伤提供新的治疗策略 | 心肌缺血再灌注损伤模型中的心肌细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1998 | 2026-06-15 |
Gut microbial production of lithocholic acid reprograms pro-resolutive macrophages to enhance vedolizumab responsiveness via the TGR5/FXR-NF-κB axis
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrag028
PMID:41697021
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research paper | 该研究揭示了肠道微生物代谢物石胆酸通过TGR5/FXR-NF-κB轴重编程促溶解巨噬细胞来增强维多珠单抗在克罗恩病中的疗效 | 首次发现肠道微生物代谢物石胆酸通过同时激活TGR5/FXR通路及下游NF-κB信号，将巨噬细胞极化为M2促溶解表型，从而增强维多珠单抗治疗反应性，并揭示了微生物组-免疫互作机制 | 研究主要基于人源化小鼠模型，尚需在更大规模临床队列中验证；未明确其他次级胆汁酸的作用及细胞类型特异性信号互作 | 阐明肠道微生物代谢物调节维多珠单抗治疗反应的分子机制，为开发克罗恩病个性化治疗策略提供依据 | 克罗恩病患者来源微生物群移植的小鼠模型及肠道巨噬细胞 | machine learning | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 宏基因组学, 代谢组学, 粪便微生物群移植 | 条件培养基共培养系统, 人源化小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 宏基因组数据, 代谢物数据 | 2,4,6-三硝基苯磺酸诱导结肠炎的人源化小鼠及伪无菌小鼠 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 宏基因组测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'端测序, Illumina NovaSeq宏基因组测序 |
| 1999 | 2026-06-15 |
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-12-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgae369
PMID:38820087
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者皮下脂肪中的促纤维化细胞，发现其与内脏脂肪组织体积相关 | 首次在HIV感染者中揭示了皮下脂肪组织特异性的细胞组成和转录程序与内脏脂肪组织体积的关联，特别是中间巨噬细胞、肌成纤维细胞和MYOC+成纤维细胞的比例升高 | 需要进一步的纵向研究来确定方向性和机制 | 表征HIV感染者皮下脂肪组织细胞类型特异性组成和转录程序，探索与内脏脂肪组织体积增大的关联 | 长期接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 | 机器学习 | 心血管疾病, 代谢性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 92名参与者进行批量RNA测序，43名进行单细胞RNA测序 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台 |
| 2000 | 2026-06-15 |
Dual decoding of cell types and gene expression in spatial transcriptomics with PANDA
2024-11-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae876
PMID:39404057
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研究论文 | 提出PANDA方法，同时从空间转录组学数据中解码细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达 | PANDA方法整合原型分析捕获细胞类型内异质性，并在解卷积过程中动态学习每个点的细胞类型特征，同时推断细胞类型比例和特异性基因表达，克服了现有方法忽略细胞内异质性的局限 | NA | 开发一种新方法以同时从空间转录组学数据中解码细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达，揭示组织内异质性 | 空间转录组学数据，包括肿瘤、大脑和发育中心脏等多种组织 | 机器学习和数字病理学 | 肿瘤和其他疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 概率模型和原型分析 | 空间转录组学数据 | 多种组织样本，包括肿瘤、大脑和发育中心脏 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |