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当前共找到 34750 篇文献，本页显示第 1981 - 2000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1981 | 2025-12-04 |
Partial Reprogramming in Senescent Schwann Cells Enhances Peripheral Nerve Regeneration via Restoration of Stress Granule Homeostasis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511019
PMID:40899516
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了衰老过程中雪旺细胞应激颗粒稳态失衡是导致周围神经再生受损的关键机制，并证明部分重编程可通过恢复该稳态来促进神经再生 | 首次发现Runx2雪旺细胞群在神经再生中的病理积累与应激颗粒稳态失衡相关，并证明部分重编程可通过恢复该稳态来逆转衰老相关的神经再生缺陷 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人类样本中得到验证；部分重编程的长期安全性和具体分子调控网络仍需进一步探索 | 探究部分重编程对衰老过程中周围神经再生的影响及其分子机制 | 年轻和衰老大鼠的坐骨神经损伤模型中的雪旺细胞 | 单细胞转录组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和衰老大鼠的坐骨神经样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1982 | 2025-12-04 |
Enhancer Reprogramming Reveals the Tumorigenic Role of PTPRZ1 in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509344
PMID:40899632
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了肺鳞状细胞癌中增强子驱动的转录网络，并识别出PTPRZ1-MDK轴作为关键的可靶向通路 | 首次通过整合ChIP-seq、bulk RNA-seq、单细胞ATAC/RNA-seq和空间转录组学等多组学数据，系统描绘了LUSC中的肿瘤特异性致癌增强子网络，并发现PTPRZ1-MDK轴在肿瘤发生中的关键作用 | 研究样本量相对有限（59对匹配样本），且主要基于体外和体内功能验证，临床转化应用仍需进一步探索 | 识别肺鳞状细胞癌的新型致癌驱动因子并解析其表观遗传调控机制 | 59对匹配的肺鳞状细胞癌肿瘤组织和邻近正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因组学数据、表观基因组学数据、转录组学数据、空间转录组数据 | 59对匹配的LUSC肿瘤和邻近正常组织 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 1983 | 2025-12-04 |
Spatial Transcriptomics Reveals Transcriptomic and Immune Microenvironment Reprogramming during Thyroid Carcinoma Dedifferentiation
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202506925
PMID:40908584
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了甲状腺癌去分化过程中的转录组和免疫微环境重编程机制 | 首次在共存的不同分化程度甲状腺癌区域进行空间转录组测序，揭示了从分化型甲状腺癌向未分化型甲状腺癌逐步重编程的轨迹，并鉴定出PDCD4和TYMP等关键调控因子及其在诱导免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞形成中的作用 | 样本量较小（7例），且为回顾性研究，需要更大样本的前瞻性研究验证 | 阐明甲状腺癌去分化过程的分子机制和免疫微环境变化 | 甲状腺癌组织样本（包含未分化型、低分化型和分化型甲状腺癌共存区域） | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组测序、全外显子组测序、inferCNV分析、轨迹分析 | NA | 空间转录组数据、基因组数据 | 7个包含共存区域的样本 | NA | 空间转录组测序 | NA | NA |
| 1984 | 2025-12-04 |
Inhibition of Macrophage ARID3A Alleviates Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury After Heart Transplantation by Reducing THBS1/CD47 Signaling-Mediated Neutrophil Extracellular Traps Formation
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509952
PMID:40913516
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞ARID3A在心脏移植后心肌缺血再灌注损伤中的作用，发现通过THBS1/CD47信号通路减少中性粒细胞胞外陷阱形成可缓解损伤 | 首次揭示了M1巨噬细胞通过THBS1/CD47轴促进NETs形成，并发现4-OI能特异性抑制巨噬细胞ARID3A，为治疗心肌缺血再灌注损伤提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证，且具体信号通路的详细机制有待深入探索 | 探究心脏移植后心肌缺血再灌注损伤的分子机制，并寻找潜在治疗策略 | 巨噬细胞、中性粒细胞及其相互作用在心肌缺血再灌注损伤中的角色 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子对接分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用髓系特异性ARID3A敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1985 | 2025-12-04 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and cystic fibrosis disease
2025-Nov-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00082.2025
PMID:41005986
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质免疫定位，首次将大鼠小肠中的CFTR高表达细胞鉴定为能够感知和响应管腔pH的神经足细胞，并确认BEST4+细胞在近端小肠中即为CHEs，为肠道生理和囊性纤维化疾病提供了新见解 | 首次将大鼠小肠中的CFTR高表达细胞鉴定为神经足细胞，并揭示其在管腔pH调节中的关键作用，同时首次在CF大鼠模型中表征了CHEs中CFTR及相关mRNA和蛋白质的变化 | 研究主要基于大鼠模型，人类数据验证有限；样本量未明确说明；未探讨CHEs在其他肠道疾病中的潜在作用 | 探究肠道中BEST4+细胞的身份、功能及其在囊性纤维化疾病中的作用机制 | 人类和大鼠肠道上皮细胞，特别是BEST4+细胞和CFTR高表达细胞（CHEs） | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），蛋白质免疫定位 | NA | RNA序列数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1986 | 2025-12-04 |
Intrinsic changes in cell differentiation and identity drive impaired wound healing in aged female murine skin
2025-Nov-01, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10340-w
PMID:41175301
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了老年雌性小鼠皮肤中细胞内在变化如何导致伤口愈合受损的机制 | 首次在老年雌性小鼠皮肤和伤口中应用单细胞RNA测序，全面解析了细胞内在变化对伤口微环境的影响 | 研究仅针对雌性小鼠，且伤口观察时间点限于损伤后3天，未涵盖其他性别或更长时间窗口 | 探究老年皮肤中细胞内在变化如何影响伤口愈合的早期反应 | 年轻和老年雌性小鼠的完整皮肤及损伤后3天的伤口组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 年轻和老年雌性小鼠的皮肤及伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1987 | 2025-12-04 |
SpaBatch: Deep Learning-Based Cross-Slice Integration and 3D Spatial Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509090
PMID:40953305
|
研究论文 | 本研究提出了一个名为SpaBatch的深度学习框架，用于整合和分析多切片空间转录组数据，以进行跨切片的3D空间域识别 | SpaBatch是首个能够有效校正批次效应并实现跨切片3D空间域识别的框架，克服了现有方法仅关注单一切片内2D空间域识别且忽略切片间空间相关性的局限 | 论文未明确提及该方法的计算复杂度或对大规模数据集的可扩展性限制 | 开发一个鲁棒可靠的多切片空间转录组数据整合框架，以实现准确的3D空间域识别 | 人类皮层切片、小鼠脑切片、小鼠胚胎切片、人类胚胎心脏切片、HER2+乳腺癌组织和小鼠下丘脑切片 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 八个真实空间转录组数据集 | MERFISH | 空间转录组学 | MERFISH平台 | 使用MERFISH平台分析的小鼠下丘脑切片和HER2+乳腺癌组织 |
| 1988 | 2025-12-04 |
Spatial Transcriptional Dynamics of CD74⁺ B Cells in Tertiary Lymphoid Structures Drive Immune Evolution in Penile Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509742
PMID:41111459
|
研究论文 | 本研究整合空间转录组学、单细胞测序和免疫组化技术，揭示了阴茎鳞状细胞癌中三级淋巴结构内CD74⁺ B细胞的空间转录动态及其驱动免疫演化的机制 | 首次在PSCC中系统阐明了三级淋巴结构内CD74⁺ B细胞的空间分布动态、与初始T细胞的相互作用机制及其通过HLA-DRA激活NF-κB等转录因子的免疫调控网络 | 研究样本量有限，未在独立队列中验证CD74⁺ B细胞的预后价值，机制研究主要基于转录组数据缺乏功能实验验证 | 解析阴茎鳞状细胞癌三级淋巴结构的免疫架构与功能机制 | 阴茎鳞状细胞癌组织样本及其中的三级淋巴结构、CD74⁺ B细胞、初始T细胞 | 空间转录组学 | 阴茎鳞状细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、bulk RNA-seq数据、组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1989 | 2025-12-04 |
Role of Mitophagy in Ischemia-Reperfusion Renal Injury: New Insights from Bioinformatics Analysis
2025-Oct-30, Nephron
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000548962
PMID:41166509
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析结合单细胞测序，探讨了线粒体自噬在缺血再灌注肾损伤中的作用，并识别了关键基因SLC3A2作为潜在治疗靶点 | 结合转录组测序、单细胞测序和机器学习算法，筛选出与线粒体自噬相关的差异表达基因SLC3A2和TXN，并通过多层面实验验证了SLC3A2在缺血再灌注肾损伤中的关键作用 | 研究中TXN在细胞实验中的结果与先前分析相反，表明可能存在未考虑的调控机制或实验条件差异 | 阐明线粒体自噬在急性肾损伤（AKI）发病机制中的分子相互作用，以开发新的治疗策略 | 缺血再灌注损伤（IRI）相关的急性肾损伤（AKI） | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 转录组测序，单细胞测序，生物信息学分析，机器学习算法 | 机器学习算法（未指定具体类型） | 转录组数据，单细胞数据 | 未明确指定样本数量，但涉及体外实验、体内大鼠实验和临床AKI病例 | NA | 单细胞测序，转录组测序 | NA | NA |
| 1990 | 2025-12-04 |
Coxiella burnetii Strains Elicit Distinct Inflammatory Responses in Human Macrophages
2025-Oct-29, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens14111101
PMID:41305339
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了不同毒力的贝氏柯克斯体菌株在人巨噬细胞中引发差异化的炎症反应和极化状态 | 首次系统比较了不同毒力贝氏柯克斯体菌株在人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞中引发的宿主转录组反应异质性，并揭示了菌株特异性和细胞特异性因素在塑造宿主免疫中的重要性 | 研究主要基于体外细胞模型，未在动物模型或临床样本中验证；单细胞RNA测序仅针对NMII菌株感染的THP-1细胞 | 阐明贝氏柯克斯体不同菌株与宿主巨噬细胞相互作用的分子机制，为Q热的靶向治疗提供依据 | 人肺泡巨噬细胞(hAMs)和THP-1巨噬细胞系 | 感染免疫学 | Q热 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 细胞因子检测 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞系进行感染实验 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1991 | 2025-12-04 |
Decoding the human PBMC isonome: Isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.16.682832
PMID:41279381
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研究论文 | 本研究利用单细胞长读长转录组学技术，解码了人类外周血单个核细胞的异构体组，实现了异构体水平的分辨率 | 通过改进的PIPseq工作流程和计算管道，生成了迄今为止最大的人类PBMC长读长单细胞数据集，并发现了128个新异构体，其中一些具有细胞类型特异性模式 | NA | 理解人类健康和疾病在异构体水平上的细胞多样性和疾病机制 | 人类外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞长读长RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | Oxford Nanopore | 单细胞RNA-seq | NA | Oxford Nanopore长读长测序 |
| 1992 | 2025-09-18 |
Author Correction: Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2025-Oct, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02077-z
PMID:40958041
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1993 | 2025-12-04 |
Identification of novel biomarkers and drug targets for frailty-related skeletal muscle aging: a multi-omics study
2025-Sep-01, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcaf108
PMID:40343466
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别了与衰弱相关骨骼肌衰老的新型生物标志物和药物靶点 | 首次发现24个生物标志物基因，并利用单细胞RNA测序数据集揭示内皮细胞在肌肉退化中的关键作用 | NA | 早期检测和治疗干预衰弱相关骨骼肌衰老 | 人类骨骼肌 | 机器学习 | 老年疾病 | 转录组学，单细胞RNA测序 | 机器学习预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1994 | 2025-12-04 |
APOBEC3B Promotes SARS-CoV-2 Through Activation of PKR/eIF2⍺ and AMPD2 Dysregulation
2025-Aug-28, Viruses
DOI:10.3390/v17091176
PMID:41012606
|
研究论文 | 本研究揭示了APOBEC3B通过激活PKR/eIF2α通路和调控AMPD2表达，在SARS-CoV-2感染中发挥促病毒作用 | 首次发现A3B在重症COVID-19患者中过表达，并通过整合应激反应和嘌呤代谢调控网络促进SARS-CoV-2感染 | 研究主要基于细胞模型和测序数据，缺乏体内实验验证；不同细胞系中A3B的作用机制存在差异 | 阐明APOBEC3B在SARS-CoV-2感染中的分子机制及其与COVID-19严重程度的关联 | 支气管肺泡灌洗液细胞、Caco-2细胞、A549-ACE2细胞、重症与轻症COVID-19患者样本 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、基因敲降、机器学习预测 | Transformer（Geneformer） | RNA测序数据、临床样本数据 | 未明确样本数量，包括重症与轻症COVID-19患者的BALF细胞及多种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1995 | 2025-12-04 |
Enhanced M2 Polarization of Retinal Microglia in Streptozotocin-Induced Diabetic Mice upon Autoimmune Stimulation
2025-Aug-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13092049
PMID:41007615
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病环境对实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎（EAU）发展的影响以及眼内小胶质细胞的激活状态 | 首次在链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型中，结合单细胞RNA测序技术，揭示了糖尿病环境下小胶质细胞向抗炎M2表型极化的转变及其对EAU的抑制作用 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且糖尿病模型的特定诱导方式可能影响结果的普适性 | 探究糖尿病环境如何影响自身免疫性疾病EAU的发病机制及小胶质细胞的激活状态 | 野生型小鼠和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫组织化学、眼底镜检查、光学相干断层扫描（OCT） | NA | 基因表达数据、图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及野生型和糖尿病小鼠组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1996 | 2025-12-04 |
Immune cell type divergence in a basal chordate
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.655184
PMID:40661343
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序等技术，定义了基础脊索动物血细胞状态的身份，揭示了其分化层次和免疫细胞类型的多样性 | 首次在基础脊索动物中应用单细胞RNA测序结合杂交和活体报告基因技术，系统性地定义了血细胞状态，并扩展了脊索动物免疫细胞的已知谱系 | 研究主要基于单一物种，且无脊椎动物免疫细胞的分子特征描述有限，与脊椎动物免疫细胞类型的同源性仍不明确 | 探究基础脊索动物免疫细胞类型的进化与分化，以理解细胞类型在进化中的适应性变化 | 基础脊索动物的循环血细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 杂交, 活体报告基因 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1997 | 2025-12-04 |
Neural signaling contributes to heart formation and growth in the invertebrate chordate, Ciona robusta
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651085
PMID:40654768
|
研究论文 | 本研究揭示了神经肽速激肽与经典Wnt信号通路共同调控海鞘心肌祖细胞增殖的机制 | 首次在海鞘模型中阐明神经信号（速激肽）与Wnt信号协同调控心脏发育，并发现神经元细胞直接支配心肌祖细胞 | 研究主要基于无脊椎脊索动物模型，结论在脊椎动物中的普适性需进一步验证 | 探究神经信号在心脏发育与生长调控中的作用机制 | 海鞘（Ciona robusta）成体心脏组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR-Cas9基因敲除、药理学抑制 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1998 | 2025-12-04 |
CXCL6 Orchestrates Macrophage-Driven Inflammation in Diabetic Kidney Disease and Represents a Druggable Target
2025 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000548806
PMID:41321788
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研究论文 | 本研究通过整合分析转录组数据，发现CXCL6是糖尿病肾病中驱动肾小管间质炎症的关键介质，并筛选出潜在抑制剂水溶性丹酚酸B | 首次将CXCL6确立为糖尿病肾病中连接肾小管损伤与巨噬细胞驱动炎症的核心枢纽基因，并通过虚拟筛选发现其新型抑制剂 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；虚拟筛选发现的抑制剂需更多实验确认其特异性 | 阐明糖尿病肾病肾小管间质损伤的分子机制并寻找治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织、HK-2和THP-1细胞系、糖尿病肾病小鼠模型 | 生物信息学与分子生物学 | 糖尿病肾病 | 加权基因共表达网络分析、差异表达分析、单细胞RNA测序、虚拟筛选 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 三个糖尿病肾病转录组数据集、患者肾脏组织、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1999 | 2025-12-04 |
CancerTrace: Multi-stage single-cell analysis of networked cancer evolution for driver and modulator gene identification
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.014
PMID:41322005
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CancerTrace的时间感知计算框架，用于从单细胞RNA测序数据中识别癌症驱动基因及其上游调控因子 | 该框架结合转移熵和稀疏条件结构于变分贝叶斯模型中，能够直接从scRNA-seq数据中恢复动态、患者特异性的调控机制，无需匹配DNA或外部扰动数据 | 研究仅基于三名肺腺癌患者的九个纵向scRNA-seq文库，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 识别患者特异性癌症驱动基因及其上游调控因子，以推进机制理解和精准肿瘤学 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 变分贝叶斯模型 | 单细胞RNA测序数据 | 三名肺腺癌患者的九个纵向scRNA-seq文库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2000 | 2025-12-04 |
HeartMAP: A multi-chamber spatial framework for cardiac cell-cell communication
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.015
PMID:41322007
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研究论文 | 本研究提出了一个名为HeartMAP的计算框架，用于在心脏腔室分辨率下推断细胞间通讯网络 | 开发了首个能够整合单细胞RNA-seq共表达模式和配体-受体相互作用数据库，以解析心脏四个不同腔室特异性细胞通讯网络的计算平台 | 研究基于七名健康供体的数据，未包含疾病状态样本，且框架的性能依赖于现有配体-受体数据库的完整性 | 阐明心脏四个不同腔室内及腔室间的细胞通讯网络，为精准心脏病学提供分子基础 | 人类心脏细胞 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 计算框架（包含基础流程分析、高级通讯建模和多腔室图谱构建的三层分析方法） | 单细胞RNA-seq数据 | 来自7名健康人类心脏供体的287,269个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |