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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-05-31 |
Single-cell proteomics by mass spectrometry: Advances and implications in cancer research
2024-06, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300210
PMID:38727198
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研究论文 | 本文综述了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并揭示了该技术的最新发展进展 | 本文重点介绍了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的新兴应用,并分析了该领域的研究空白和未来方向 | 本文未明确指出局限性,但可能受限于单细胞蛋白质组学技术的当前发展水平和数据复杂性 | 总结单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并推动该技术在癌症研究中的进一步发展 | 单细胞蛋白质组学技术及癌症研究领域 | 机器学习 | 癌症 | 质谱法 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2026-05-31 |
Advancing skeletal health and disease research with single-cell RNA sequencing
2024-05-30, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00538-3
PMID:38816888
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综述 | 全面介绍了单细胞RNA测序技术在骨骼健康与疾病研究中的应用,包括细胞获取方法、技术概述和生物信息学分析流程 | 提出了一种从骨骼组织中获取高质量单细胞的简化方法,并系统总结了scRNA-seq在脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱疾病中的最新研究进展 | 高度矿化的骨骼组织在单细胞水平上研究机制仍面临技术挑战 | 推动对骨骼疾病细胞和分子水平病理过程的理解,发现新的治疗靶点 | 骨骼组织中的细胞,包括脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱相关细胞 | 单细胞转录组学 | 退行性椎间盘疾病, 骨关节炎, 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2026-05-31 |
Interferon-α stimulates DExH-box helicase 58 to prevent hepatocyte ferroptosis
2024-04-15, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00524-9
PMID:38622688
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研究论文 | 本研究揭示干扰素-α通过刺激DExH盒螺旋酶58防止肝细胞铁死亡,为肝缺血再灌注损伤提供潜在治疗策略 | 首次发现DHX58作为RNA结合蛋白,通过招募m6A读取器YTHDC2促进GPX4 mRNA翻译,以m6A依赖方式抑制铁死亡,并揭示IFN-α在其中的调控作用 | 未提及具体局限性 | 探究DEAD/DExH盒螺旋酶家族成员在肝缺血再灌注损伤中调控肝细胞铁死亡的机制 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠和肝脏I/R损伤模型 | 数字病理学 | 其他疾病(肝缺血再灌注损伤) | 转录组分析、单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀质谱 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠;肝脏I/R损伤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2026-05-31 |
The implications of single-cell RNA-seq analysis in prostate cancer: unraveling tumor heterogeneity, therapeutic implications and pathways towards personalized therapy
2024-04-11, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00526-7
PMID:38605399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示前列腺癌肿瘤异质性、治疗意义及个性化治疗路径中的应用 | 系统总结了单细胞RNA测序与其他单细胞技术在前列腺癌研究中的综合应用,特别是小鼠与人类前列腺癌差异及多组学整合分析 | 单细胞技术在前列腺癌中的应用仍有限,现有研究多集中于特定亚型,未来需扩大样本和数据类型 | 探讨单细胞RNA测序在前列腺癌基础与临床研究中的意义,并为个性化医疗提供新见解 | 前列腺癌肿瘤细胞及微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 185 | 2026-05-31 |
FOXO1 reshapes neutrophils to aggravate acute brain damage and promote late depression after traumatic brain injury
2024-03-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00523-w
PMID:38556884
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研究论文 | 通过单细胞转录组学、代谢组学和蛋白质组学分析,发现FOXO1高表达的中性粒细胞在创伤性脑损伤急性和慢性阶段的作用 | 首次揭示了FOXO1高表达中性粒细胞作为一种新型中性粒细胞表型,在创伤性脑损伤急性和慢性阶段通过不同机制促进脑损伤和晚期抑郁 | 未提及明显局限性,但可能需进一步验证机制在人体的普适性 | 探究中性粒细胞在创伤性脑损伤后的异质性、多功能性和时间依赖性调控,以及FOXO1在其中介导的脑损伤和行为结局 | 创伤性脑损伤患者和小鼠模型的中性粒细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、代谢组学、蛋白质组学、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | 创伤性脑损伤患者和FOXO1条件性基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-05-31 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582044
PMID:38463969
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建小鼠胰腺导管树图谱,发现新的导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘从小叶中心细胞到主导管的整个小鼠胰腺导管上皮图谱,鉴定出15个导管细胞群体及其器官形成和内分泌分化能力 | 未提供具体限制信息 | 探究胰腺导管细胞在单细胞水平上的异质性及其在胰腺再生和外分泌发病机制中的作用 | 小鼠胰腺导管上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 健康小鼠胰腺样本、慢性胰腺炎和胰腺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2026-05-31 |
Targeting PLCG2 Suppresses Tumor Progression, Orchestrates the Tumor Immune Microenvironment and Potentiates Immune Checkpoint Blockade Therapy for Colorectal Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.98200
PMID:39494327
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研究论文 | 本文探究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤免疫微环境和增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 首次发现PLCG2可作为结直肠癌精准生物标志物和治疗靶点,逆转免疫逃逸及免疫检查点阻断治疗耐药 | 未提及 | 研究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境及增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 结直肠癌患者及临床样本、细胞和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq、单细胞转录组、空间转录组、蛋白印迹、定量逆转录PCR、多色免疫荧光、多重免疫组化、流式细胞术、动物模型 | NA | 基因表达数据、图像 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2026-05-31 |
Reconstruction of the Hepatic Microenvironment and Pathological Changes Underlying Type II Diabetes through Single-Cell RNA Sequencing
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99176
PMID:39494341
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序重建II型糖尿病肝脏微环境及病理变化 | 首次利用单细胞RNA-seq技术系统性地探索了两种T2DM小鼠模型中肝脏微环境的变化,揭示了肝星状细胞活化、Kupffer细胞新亚群及细胞间相互作用在糖尿病性MAFLD进展中的动态作用 | 研究对象仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;对某些基因(如Tgfb1i1、Txnip)的功能机制仍需进一步探索 | 阐明II型糖尿病并发代谢相关脂肪性肝病在不同阶段的肝脏微环境变化和病理机制 | II型糖尿病小鼠模型(两种)的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | II型糖尿病、代谢相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两种T2DM小鼠模型肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2026-05-31 |
Complement C1q is a key player in tumor-associated macrophage-mediated CD8+ T cell and NK cell dysfunction in malignant pleural effusion
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.100607
PMID:39664577
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研究论文 | 本研究揭示了补体C1q在恶性胸腔积液中通过肿瘤相关巨噬细胞介导CD8+ T细胞和NK细胞功能障碍的关键作用 | 首次通过全基因和巨噬细胞特异性敲除小鼠模型提供C1q介导巨噬细胞促进肿瘤的直接证据,并阐明C1q通过CCR2-CCL2信号轴调控免疫抑制的机制 | 未明确说明研究局限性 | 探究C1q在恶性胸腔积液中巨噬细胞介导的免疫抑制机制 | 小鼠恶性胸腔积液模型及C1q缺陷巨噬细胞 | 机器学习 | 恶性胸腔积液 | scRNA-seq, 代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | C1qa小鼠MPE模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 190 | 2026-05-31 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 通过单核RNA测序解析创伤后应激障碍和重性抑郁障碍中背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组机制 | 首次在创伤后应激障碍中开展死后脑组织的单核RNA测序研究,以细胞类型分辨率揭示疾病转录组病理,并发现17q21.31位点基因在应激反应中的新作用 | 研究样本量相对有限(32个样本用于发现,15个用于复制),可能影响统计效力;此外,死后脑组织研究无法直接观察活体动态过程 | 阐明创伤后应激障碍和重性抑郁障碍背外侧前前额叶皮层的细胞类型特异性转录组病理及其在应激反应中的作用机制 | 背外侧前额叶皮层样本,包括创伤后应激障碍患者、重性抑郁障碍患者和对照个体 | 自然语言处理 | 创伤后应激障碍, 重性抑郁障碍 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 发现阶段:32个样本(约415K细胞核,每样本>13K细胞);复制阶段:15个样本(约160K细胞核,每样本>11K细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2026-05-31 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
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研究论文 | 以猪、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞为对象,发现扰动血流激活JAG1-NOTCH4信号通路驱动动脉粥样硬化,并揭示内皮细胞异质性的调控机制 | 首次揭示Notch通路(JAG1-NOTCH4)在扰动血流感知中的功能,并阐明其通过调控内皮细胞异质性增强动脉粥样硬化易感性的机制 | 未明确说明,但从标题和摘要推断可能包括:研究主要集中在动物模型和体外培养细胞,人类动脉粥样硬化的直接证据有限 | 探究扰动血流如何通过Notch通路驱动动脉粥样硬化 | 猪动脉、小鼠动脉、培养的人冠状动脉内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、光片成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 猪动脉、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2026-05-31 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
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研究论文 | 该研究通过病毒示踪、单细胞测序、电生理和体内钙成像等方法,系统比较了外侧下丘脑(LHA)中投射至外侧缰核(LHb)和腹侧被盖区(VTA)的谷氨酸能神经元的转录组和功能差异 | 首次系统揭示了LHA中投射至不同脑区(LHb和VTA)的谷氨酸能神经元在解剖、转录、电生理和功能上的显著差异,并发现投射至LHb的神经元对饱腹状态和进食激素特别敏感 | 未明确提及局限性 | 解析LHA中不同投射特异性神经元群体的功能异质性 | 小鼠LHA中投射至LHb和VTA的谷氨酸能神经元 | 神经科学 | NA | 病毒示踪, 单细胞测序, 电生理记录, 体内钙成像 | NA | 神经元投射数据, 单细胞转录组数据, 电生理数据, 钙成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2026-05-31 |
Multiomic Analysis of Subtype Evolution and Heterogeneity in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2020-10-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0521
PMID:32747365
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研究论文 | 通过多组学分析揭示高级别浆液性卵巢癌亚型进化与异质性 | 采用绝对拷贝数分析与基因表达的新型整合分析方法,并结合单细胞测序,挑战了传统离散转录组亚型分类,提出连续肿瘤发展模型 | 未明确提及研究局限性 | 解析高级别浆液性卵巢癌亚型进化时序及其与肿瘤纯度、倍性、亚克隆性的关系,评估亚型作为治疗靶点的适用性 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本及六例独立肿瘤的单细胞数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | 绝对拷贝数分析、基因表达分析、单细胞测序 | 连续肿瘤发展模型 | 基因表达数据、拷贝数数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集及六例独立肿瘤的42,000个肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-05-31 |
Resolving medulloblastoma cellular architecture by single-cell genomics
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1434-6
PMID:31341285
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研究论文 | 利用单细胞转录组学研究25例髓母细胞瘤的瘤内和瘤间异质性,揭示其细胞结构及亚型特异性生物学 | 首次通过单细胞基因组学解析髓母细胞瘤各分子亚型的细胞组成和发育状态差异,并跨物种定义SHH和Group 4亚型的潜在起源细胞 | 样本量有限(仅25例),可能未涵盖所有亚型的完整细胞多样性;研究主要依赖转录组数据,缺乏蛋白质或表观遗传学层面的验证 | 探究髓母细胞瘤各分子亚型的细胞异质性及其在生物学和临床行为中的作用 | 25例髓母细胞瘤样本,涵盖WNT、SHH、Group 3和Group 4所有分子亚型 | 单细胞基因组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 195 | 2026-05-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of chromosomal instability on glioblastoma cancer stem cells
2019-05-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-019-0532-5
PMID:31151460
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示染色体不稳定性对胶质母细胞瘤癌症干细胞基因表达的影响 | 首次证明染色体不稳定性直接导致基因表达变化,并区分了拷贝数依赖和非依赖的差异表达基因,发现一个与肿瘤分级和患者生存预后相关的基因特征 | 使用细胞系而非原代肿瘤样本,可能无法完全反映体内肿瘤异质性;仅分析了单个CSC和NSC细胞系 | 研究染色体不稳定性引起的拷贝数变异如何影响胶质母细胞瘤癌症干细胞的单细胞基因表达 | 染色体不稳定的胶质母细胞瘤癌症干细胞系和正常二倍体神经干细胞系 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq | NA | 文本 | 两个细胞系(胶质母细胞瘤CSC系和正常NSC系) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2026-05-31 |
LC3-Associated Phagocytosis in Myeloid Cells Promotes Tumor Immune Tolerance
2018-10-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.08.061
PMID:30245008
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研究论文 | 该论文揭示了骨髓细胞中LC3相关吞噬作用(LAP)促进肿瘤免疫耐受机制,并指出针对LAP而非典型自噬途径进行干预能有效控制肿瘤生长 | 首次证明骨髓系细胞中非典型自噬功能(LAP)在肿瘤微环境中比经典自噬更具免疫抑制作用,并通过单细胞RNA测序揭示其通过STING和I型干扰素信号轴发挥作用 | 未说明 | 探究骨髓细胞中LC3相关吞噬作用(LAP)对肿瘤免疫耐受的影响及其分子机制 | 骨髓系细胞(特别是肿瘤相关巨噬细胞)及肿瘤浸润T细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 未说明 | 基因表达数据 | 未说明 | 未说明 | 单细胞RNA测序 | 未说明 | 未说明 |
| 197 | 2026-05-31 |
High-resolution transcriptional dissection of in vivo Atoh1-mediated hair cell conversion in mature cochleae identifies Isl1 as a co-reprogramming factor
2018-07, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1007552
PMID:30063705
|
研究论文 | 通过对小鼠成熟耳蜗中Atoh1介导的毛细胞体内转化进行高分辨率转录组分析,发现Isl1可作为共重编程因子 | 首次利用单细胞RNA测序技术高分辨率解析Atoh1诱导毛细胞转化的动态转录过程,并识别出Isl1作为关键共重编程因子,显著提高了转化效率 | 研究中转化效率虽有提升,但产生的功能性目标细胞(毛细胞)仍存在一定局限性,且具体机制需进一步验证 | 探究体内直接细胞转化的分子机制,优化毛细胞再生效率,为听力修复提供潜在策略 | 小鼠成熟耳蜗中的非感觉支持细胞及其向毛细胞的转化过程 | 自然语言处理 | 耳科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点采集的全小鼠感觉上皮细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序系统 |
| 198 | 2026-05-30 |
Exploring the key functions of T cells and the regulation of the immune microenvironment in prostate cancer using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2026-12-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2596700
PMID:41474172
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和批量RNA测序探索前列腺癌中T细胞的关键功能及免疫微环境调控 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,系统分析T细胞亚群在前列腺癌肿瘤微环境中的分布模式及其与临床病理参数的相关性,并构建基于T细胞标志基因的预后风险模型 | 未明确说明 | 系统阐明前列腺癌肿瘤微环境中T细胞亚群的分布及其功能,并构建预后模型以评估免疫治疗相关性 | 前列腺癌患者肿瘤微环境中的T细胞 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 16,999个单细胞(质量控制后) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2026-05-30 |
The shared mechanisms and potential diagnostic markers for IgA nephropathy and celiac disease
2026-12-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2026.2635179
PMID:41714845
|
研究论文 | 通过整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,识别共享机制和潜在诊断标志物 | 首次整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,通过多种方法(差异表达分析、WGCNA、机器学习)共享诊断标志物,并利用单细胞RNA测序探索细胞定位 | 部分验证数据来自独立队列,但未进一步探讨这些标志物在临床实践中的具体应用 | 揭示IgA肾病和乳糜泻共病的分子机制并发现潜在诊断标志物 | IgA肾病和乳糜泻患者的转录组数据 | 机器学习 | 肾病, 乳糜泻 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型(如特征选择模型) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列的转录组数据,具体样本数量未在摘要中说明 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-05-30 |
Exploring the molecular mechanisms underlying the inflammation-cancer transformation in Hashimoto thyroiditis using single-cell transcriptomics
2026-12-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2026.2639801
PMID:41808291
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学探究桥本甲状腺炎炎症-癌变转化的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示桥本甲状腺炎向甲状腺乳头状癌转化过程中IL1B阳性滤泡上皮细胞通过FN1/CD44轴招募肥大细胞,后者分泌IL-8激活PI3K/AKT通路促进恶性表型的创新机制 | 仅基于公共数据库和体外细胞模型验证,缺乏体内实验和更大样本量的临床验证 | 阐明桥本甲状腺炎相关甲状腺乳头状癌中炎症向癌症转化的分子机制 | 桥本甲状腺炎和甲状腺乳头状癌组织中的单细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,差异基因表达筛选,功能富集分析,细胞间通讯分析,Transwell共培养模型 | NA | 单细胞转录组数据,体外实验数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括HT相关和PTC组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |