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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-04-13 |
Tubulointerstitial inflammation in glomerular diseases: mechanistic pathways, prognostic value, and translational therapeutic targets
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2646426
PMID:41876962
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综述 | 本文系统综述了肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病机制、预后意义及转化医学局限性,并探讨了新兴技术如何推动精准肾脏病学发展 | 提出从以肾小球为中心的框架转向肾小球-间质系统视角的概念性转变,并整合了AI增强数字病理、空间转录组学等新兴技术用于间质免疫-纤维化微环境的精细化空间定量表征 | 肾小管间质炎症的独立预后意义在不同疾病和人群中仍不一致,且现有以肾小球为中心的治疗策略对部分患者无效 | 阐明肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病机制、预后价值及转化治疗靶点,推动精准肾脏病学发展 | 肾小球疾病中的肾小管间质炎症 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 病理图像、转录组数据、生物标志物、影像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2026-04-13 |
IGHG1+ malignant epithelial Cell-myCAF crosstalk via MIF-CD74/APP-CD74 drives early brain metastasis in NSCLC: Delineated via primary tumor-brain metastasis single-cell and spatial transcriptomics
2026-Jun-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218451
PMID:41881335
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,揭示了非小细胞肺癌早期脑转移的机制,并识别了CD74作为潜在治疗靶点 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了IGHG1+恶性上皮细胞与肌成纤维样癌症相关成纤维细胞通过MIF-CD74/APP-CD74轴相互作用,驱动非小细胞肺癌早期脑转移的新机制 | 研究为回顾性分析,样本量相对有限(53例患者),且体外和体内验证仍需进一步扩展 | 探究非小细胞肺癌早期脑转移的机制,开发预测模型并识别潜在治疗靶点 | 53例非小细胞肺癌患者的石蜡样本,包括正常肺组织、原发肿瘤(有/无脑转移)、脑转移灶和正常脑组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学, GeoMx DSP, CosMx SMI | Augur, 伪时间分析, 空间通讯分析, ROC分析 | 转录组数据, 空间表达数据 | 53例非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2026-04-13 |
Circulating Ly6Chigh monocyte-derived S100A4+ macrophages exacerbate neuroinflammation and impede recovery of traumatic brain injury
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106472
PMID:41605306
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了创伤性脑损伤后循环Ly6C单核细胞来源的S100A4+巨噬细胞通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织,加剧神经炎症并阻碍恢复的分子机制 | 首次在TBI模型中识别出源自循环Ly6C单核细胞的S100A4+巨噬细胞亚群,阐明了其通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织、通过SPP1-CD44轴激活小胶质细胞加剧神经炎症的机制,并发现IRF7作为关键转录因子驱动该过程,且FDA批准的药物熊去氧胆酸可作为IRF7拮抗剂改善TBI预后 | 研究基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性需进一步验证;单细胞测序仅针对急性期样本,长期动态变化未涉及;药物干预机制虽被提出,但具体分子靶点及临床转化潜力需深入探索 | 阐明创伤性脑损伤后系统性免疫反应的细胞与分子机制,并探索潜在治疗靶点 | 创伤性脑损伤小鼠的脑组织及外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及TBI小鼠的脑和PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2026-04-13 |
Depression-related chronic stress promotes ovarian cancer progression via metabolic dysfunction and IRF1-mediated immune suppression
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106471
PMID:41605304
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研究论文 | 本研究探讨了抑郁症相关的慢性应激通过代谢失调和IRF1介导的免疫抑制促进卵巢癌进展的机制 | 首次揭示了抑郁症通过下调肿瘤细胞IRF1表达,重塑免疫-代谢微环境促进卵巢癌进展,并验证了抗抑郁药联合化疗的治疗潜力 | 动物模型可能无法完全模拟人类抑郁症的复杂性,临床验证样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行 | 探究抑郁症与卵巢癌进展的关系及潜在机制,评估抗抑郁药物的治疗价值 | 卵巢癌患者临床数据、慢性应激模型小鼠、肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、代谢组学 | 慢性束缚应激模型、慢性不可预知温和应激模型 | 临床数据、单细胞RNA测序数据、代谢组学数据 | 卵巢癌患者临床队列、应激模型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2026-04-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals HMGA2 involvement in neoplastic aggressiveness and endothelial cell senescence in chondrosarcoma
2026-Apr-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10188-x
PMID:41964890
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了HMGA2在软骨肉瘤肿瘤侵袭性和内皮细胞衰老中的作用 | 首次在软骨肉瘤中利用单细胞RNA测序解析肿瘤微环境异质性,并鉴定HMGA2作为恶性表型的关键调控因子及预后标志物 | 样本量相对有限,功能验证主要依赖体外和动物实验,临床转化需进一步验证 | 探究软骨肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性及恶性进展机制 | 高、低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤及瘤旁组织的临床样本 | 数字病理学 | 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床标本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2026-04-13 |
Characterization and regulatory mechanism evaluation of C8orf33 in hepatocellular carcinoma through multiomics profiling
2026-Apr-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04951-z
PMID:41965457
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析评估了C8orf33在肝细胞癌中的特征和调控机制 | 首次整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学来全面表征C8orf33在HCC中的表达景观,并揭示了其通过MIF信号通路与巨噬细胞相互作用的调控机制 | 研究主要基于体外细胞系和异种移植模型,缺乏临床患者样本的直接验证,且调控机制的具体分子细节仍需进一步探索 | 探究C8orf33在肝细胞癌中的生物学功能和调控机制 | 肝细胞癌细胞系(如Huh7)和异种移植模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,涉及多个癌症数据集和HCC细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2026-04-13 |
High-throughput strategy for targeting MDM2 in uveal melanoma to reverse radiation therapy resistance
2026-Apr-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02970-x
PMID:41965789
|
研究论文 | 本研究结合机器学习模型与高通量筛选平台,识别靶向MDM2的新型小分子抑制剂,以逆转葡萄膜黑色素瘤的放疗抵抗 | 首次将机器学习模型、高通量筛选与单细胞RNA测序数据整合,系统性地识别并验证了MDM2作为克服葡萄膜黑色素瘤放疗抵抗的关键靶点 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型或临床数据的验证 | 克服葡萄膜黑色素瘤对放射治疗的固有抵抗性 | 葡萄膜黑色素瘤细胞 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2026-04-13 |
Characterizing gene perturbations in single cells via network divergence analysis
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71507-8
PMID:41965857
|
研究论文 | 本文介绍了scDNS框架,用于通过测量条件特异性基因相互作用网络配置之间的信息论差异来量化单细胞中基因特异性功能扰动 | 提出了一种新的方法scDNS,专注于通过网络重连而非基因表达变化来推断基因功能扰动,并将其与特定细胞群体关联,这在现有scRNA-seq数据分析中较少涉及 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个工具来推断单细胞中动态基因功能扰动,并识别关键调控因子和受扰动的细胞群体 | 单细胞RNA测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | scRNA-seq | 网络分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2026-04-13 |
CBP/p300 is critical for the expansion and maintenance of functional pancreatic α cell mass
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71499-5
PMID:41965878
|
研究论文 | 本文通过小鼠模型揭示了CBP/p300在调控功能性胰腺α细胞质量中的核心作用,涉及氨基酸感知、细胞增殖和自噬过程 | 首次发现CBP/p300通过调控Slc7a2介导的氨基酸感知来维持α细胞身份和功能,揭示了新的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类α细胞中的相关性尚需验证 | 探究CBP/p300在胰腺α细胞功能和质量维持中的分子机制 | 小鼠胰腺α细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2026-04-13 |
A machine learning model integrating circulating Temra cell transcriptional profiles to predict immunotherapy efficacy
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101027
PMID:41747737
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研究论文 | 本研究开发了一种基于循环终末分化效应记忆CD8+ T细胞转录组特征的机器学习模型,用于预测免疫治疗疗效 | 整合了13个公开单细胞数据集构建全面的CD8+ T细胞转录组图谱,首次利用循环Temra细胞的转录特征建立预测模型,并在前瞻性多中心队列中验证 | 样本量相对有限(15例配对样本),模型需在更广泛癌种和更大队列中进一步验证 | 开发血液来源的转录组生物标志物以预测免疫检查点抑制剂疗效 | 癌症患者(特别是非小细胞肺癌患者)的循环CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 逻辑回归 | 转录组数据 | 15例配对外周血和肿瘤样本,整合748,082个CD8+ T细胞,前瞻性队列131例晚期NSCLC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2026-04-13 |
Single-cell profiling of immune reset in patients with refractory generalized myasthenia gravis receiving autologous CD19/BCMA CAR-T cell therapy
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101026
PMID:41747738
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研究论文 | 本研究评估了自体CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法在难治性全身型重症肌无力患者中的安全性、有效性及对系统性免疫的影响 | 首次在难治性全身型重症肌无力患者中应用无需淋巴细胞清除的自体CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法,并通过单细胞测序揭示了疗法诱导的系统性免疫重置机制 | 研究样本量较小(仅6名患者),且为单臂I期试验,缺乏对照组,长期疗效和安全性需更大规模临床试验验证 | 评估CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法在难治性全身型重症肌无力中的安全性、疗效及对免疫系统的影响 | 难治性全身型重症肌无力患者 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2026-04-13 |
Dissection of the T cell infiltrate in mouse pancreatic tumors reveals an extensive and diverse tumor-reactive T cell repertoire
2026-Apr-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr6132
PMID:41961941
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和功能性T细胞受体表征,探索了小鼠胰腺癌模型中的T细胞库,揭示了肿瘤反应性T细胞受体克隆型的广泛多样性 | 结合单细胞转录组学和功能性TCR表征,首次在小鼠胰腺癌模型中系统性地揭示了肿瘤反应性TCR克隆型的多样性,并鉴定了三种与人类癌症相关的T细胞表位 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类胰腺癌;样本规模可能有限,未详细说明具体样本数量 | 探索胰腺癌中肿瘤浸润T细胞的T细胞受体库多样性及其抗原特异性,以评估个性化免疫疗法的治疗潜力和安全性 | 小鼠胰腺癌模型中的肿瘤浸润T细胞 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学,免疫肽组分析,T细胞受体表征 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2026-04-13 |
Activated microglia contribute to paraquat neurotoxicity through neuroinflammation and regulation of phenotypic polarization of astrocytes
2026-Apr-10, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120120
PMID:41966020
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研究论文 | 本研究探讨了百草枯通过激活小胶质细胞导致神经炎症和星形胶质细胞表型极化,进而促进多巴胺能神经元退行性变的作用机制 | 首次结合网络毒理学和单细胞RNA测序技术,揭示了小胶质细胞通过PI3K/AKT通路调控星形胶质细胞表型转化在百草枯神经毒性中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人体中得到验证;神经免疫相互作用的分子机制仍需进一步探索 | 阐明百草枯诱导神经毒性的神经免疫机制 | 小胶质细胞、星形胶质细胞、多巴胺能神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、网络毒理学分析、体外细胞培养 | NA | 基因表达数据、实验观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-04-13 |
Demystifying Plasmodium development within the Anopheles mosquito
2026-Apr-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102751
PMID:41966627
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综述 | 本文总结了显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选等新技术如何革新了对疟原虫在按蚊体内发育阶段的研究 | 整合了最新的显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选技术,以揭示疟原虫在蚊媒中发育的复杂过程 | NA | 提高对疟原虫在按蚊体内发育阶段的理解,以支持新型疟疾传播控制工具的研发 | 疟原虫在按蚊体内的生命周期阶段 | 自然语言处理 | 疟疾 | 显微镜、单细胞RNA测序、遗传筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2026-04-13 |
Targeting ANXA1/TRKA axis enhances immunotherapy sensitivity in neural invasion-positive gastric cancer
2026-Apr-09, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00444-1
PMID:41954859
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了神经侵犯阳性胃癌(NIGC)中独特的免疫微环境特征,并阐明了ANXA1/TRKA轴通过抑制糖酵解代谢驱动CD8⁺T细胞耗竭的分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘NIGC的免疫景观,发现ANXA1⁺CD8⁺T细胞耗竭的关键亚群,并揭示ANXA1通过结合TRKA阻断其泛素化降解的新机制,提出靶向该轴联合免疫治疗的新策略 | 研究样本量有限,临床前模型需进一步验证,ANXA1肽段(A11)的临床转化潜力有待评估 | 阐明神经侵犯阳性胃癌的免疫微环境特征及其对免疫治疗敏感性的影响机制 | 神经侵犯阳性与阴性胃癌患者的肿瘤组织样本 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质互作数据 | 未明确患者数量(来自NIGC和神经侵犯阴性GC患者的肿瘤标本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2026-04-13 |
Single-cell transcriptomics and RNAi screening define a hierarchical program of planarian eye regeneration
2026-Apr-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117245
PMID:41964952
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和RNA干扰筛选,定义了涡虫眼再生的层级程序及其调控基因 | 首次结合单细胞转录组学和RNA干扰筛选,系统解析涡虫眼再生的层级步骤和关键基因调控网络 | 研究主要基于涡虫模型,其发现向哺乳动物或人类眼病的直接转化仍需进一步验证 | 研究眼生物学和再生的基本属性,特别是涡虫眼再生的分子机制 | 涡虫(扁形动物) | 数字病理学 | 眼病 | 单细胞RNA-seq, RNA干扰筛选 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2026-04-13 |
TIMP1 and PKM drive immunosuppression and metabolic remodeling to promote colorectal cancer progression through integrated multi-omics analysis
2026-Apr-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151944
PMID:41966374
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了TIMP1促进免疫抑制和PKM-LDHA驱动代谢重编程在结直肠癌进展中的关键作用 | 通过整合转录组、单细胞RNA测序和翻译后修饰分析,首次系统性地识别了驱动结直肠癌免疫逃逸和代谢重塑的核心转录因子(HDAC2、E2F1)、效应分子(TIMP1)及调控节点(PKM),并利用AlphaFold3预测和实验验证了PKM-LDHA复合物的相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内模型(如小鼠模型)的进一步功能验证,以确认这些靶点在活体肿瘤微环境中的具体作用机制 | 旨在通过整合多组学分析,识别结直肠癌免疫逃逸的关键靶点和机制,以克服其免疫治疗疗效有限的难题 | 结直肠癌 | 生物信息学, 多组学分析 | 结直肠癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 翻译后修饰分析, AlphaFold3结构预测, Co-IP实验, T细胞杀伤实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质修饰数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 198 | 2026-04-13 |
Comprehensive multi-omics analyses reveal small intestinal genetic mechanisms regulating milk protein trait in yak
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2026-28364
PMID:41966396
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研究论文 | 本研究通过构建首个牦牛小肠单细胞转录组图谱,并结合多组学分析,揭示了小肠功能特化及其相关基因调控牦牛乳高蛋白含量的遗传机制 | 首次构建了牦牛小肠的单细胞转录组图谱,并开发了一个整合基因组学和scRNA-seq数据的多策略GWAS框架来鉴定与乳蛋白含量相关的候选基因 | NA | 探究牦牛乳高蛋白含量的生物学基础,特别是小肠的调控机制 | 牦牛、犏牛和奶牛的生乳营养成分、氨基酸组成,以及牦牛小肠细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | 转录组数据,基因组数据 | 从小肠组织中共获得27,026个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2026-04-13 |
Efferocytosis-related biomarkers and immune infiltration in pancreatic ductal adenocarcinoma based on single-cell sequencing and machine learning: a comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2026-Apr-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153751
PMID:41966742
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和机器学习,系统分析了胰腺导管腺癌中胞葬作用相关基因的表达模式、功能及其与免疫浸润的关系,构建并验证了一个六基因预后风险模型 | 首次在单细胞水平揭示了胰腺导管腺癌中巨噬细胞胞葬作用的异质性,并构建了一个基于六基因(CD36, ITGAV, PANX1, PPARG, S100A4, THBS1)的预后风险预测模型,通过实验验证了关键基因THBS1的功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型或大规模临床队列的进一步验证 | 阐明胞葬作用相关基因在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的功能、异质性及其预后预测价值 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的细胞(特别是巨噬细胞)及胞葬作用相关基因 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序,机器学习(Cox和LASSO回归),分子对接,RT-qPCR,Western blotting,功能实验 | 预后风险模型(基于Cox和LASSO回归构建) | 转录组数据(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq),基因表达数据 | 整合了TCGA-PDAC、GTEx和GEO数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-04-13 |
GEfetch2R: fetching single-cell/bulk RNA-seq data from public repositories to R and benchmarking the subsequent format conversion tools
2026-Apr-08, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag039
PMID:41964930
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研究论文 | 本文介绍了GEfetch2R,一个用于从公共存储库获取单细胞/批量RNA-seq数据到R环境,并评估后续格式转换工具的R包 | GEfetch2R是首个能够从多个公共存储库获取多样化的单细胞RNA-seq数据类型(原始数据、计数矩阵和处理对象),处理并加载数据到R,转换单细胞RNA-seq对象之间的格式,并评估格式转换工具的工具 | NA | 开发一个工具,以促进研究人员从各种公共存储库访问和探索现有的基因表达数据 | 单细胞RNA-seq数据和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |