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当前共找到 32540 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-11-14 |
CellSP: Module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.12.632553
PMID:39868198
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研究论文 | 提出CellSP计算框架，用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 | 引入“基因-细胞模块”新概念，能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布模式的基因集 | NA | 开发用于亚细胞空间转录组数据分析的计算工具 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2025-11-14 |
TransST: Transfer Learning Embedded Spatial Factor Modeling of Spatial Transcriptomics Data
2025-Apr-15, ArXiv
PMID:40321945
|
研究论文 | 提出一种名为TransST的新型迁移学习框架，用于改善空间转录组数据的细胞水平异质性推断 | 开发了自适应利用外部细胞标记信息的迁移学习框架，显著提升细胞亚群识别能力 | 未在摘要中明确说明 | 提高空间转录组数据中细胞水平异质性的推断准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | 迁移学习框架 | 空间转录组数据 | 多个真实研究和模拟设置 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2025-11-14 |
Efficient count-based models improve power and robustness for large-scale single-cell eQTL mapping
2025-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.01.18.25320755
PMID:40093202
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研究论文 | 提出了一种基于计数模型的高效单细胞eQTL定位框架jaxQTL，用于大规模单细胞转录组数据分析 | 开发了首个专门针对单细胞RNA-seq稀疏计数数据的高效eQTL定位框架，能够识别低表达eGenes和远端eQTLs | NA | 提高大规模单细胞eQTL定位的效率和准确性 | 单细胞转录组数据中的表达数量性状位点 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 负二项模型 | 单细胞转录组计数数据 | 982个样本（OneK1K数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-11-14 |
Screening of Candidate Inflammatory Markers of Epithelial Cells in Hepatocellular Carcinoma based on Integration Analysis of TCGA/ICGC Databases and Single-cell Sequencing
2025, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究通过整合分析TCGA/ICGC数据库和单细胞测序数据，筛选肝细胞癌中上皮细胞的炎症标志物并探索潜在治疗药物 | 首次结合TCGA/ICGC数据库和单细胞测序数据系统分析肝细胞癌上皮细胞炎症标志物，并通过虚拟筛选发现NADH和Deferoxamine可与炎症蛋白VIP稳定结合 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步体内实验确认药物疗效 | 研究肝细胞癌中上皮细胞在炎症刺激下的表达谱，识别潜在治疗药物 | 肝细胞癌患者样本数据、上皮细胞、HCC细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、转录组分析、虚拟筛选、分子动力学模拟、体外细胞实验 | 预后模型、分子对接模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、化合物数据库 | TCGA、ICGC和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-11-14 |
Repetitive Trans-spinal Magnetic Stimulation Suppresses Microglia to Engulf Synapse and Promotes Nerve Repairment via cGAS-STING Signaling Pathway after Spinal Cord Injury
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.114428
PMID:41208875
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研究论文 | 本研究探讨重复经脊髓磁刺激通过cGAS-STING信号通路调控小胶质细胞突触吞噬功能促进脊髓损伤后神经修复的机制 | 首次揭示rTSMS通过抑制cGAS-STING通路调控小胶质细胞突触吞噬功能促进神经修复的新机制 | 研究仅使用大鼠模型，未在更高阶物种中验证；机制研究主要聚焦cGAS-STING通路，可能存在其他调控途径 | 探究重复经脊髓磁刺激在脊髓损伤修复中的作用机制 | 脊髓损伤模型大鼠 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,蛋白质印迹,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 研究使用大鼠脊髓损伤模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-11-14 |
DPP7 promotes fatty acid β-oxidation in tumor-associated macrophages and determines immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.117909
PMID:41208881
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研究论文 | 本研究揭示DPP7通过增强脂肪酸β-氧化促进肿瘤相关巨噬细胞的M2极化，从而塑造结直肠癌免疫抑制微环境 | 首次发现DPP7通过结合CPT1A减少其泛素化降解，增强脂肪酸氧化代谢重编程，驱动免疫抑制表型 | 研究主要基于临床队列和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的治疗潜力 | 探索肿瘤相关巨噬细胞中调控免疫抑制微环境的关键基因及其机制 | 结直肠癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,飞行时间流式细胞术,液相色谱-串联质谱,靶向脂质代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,免疫荧光图像 | 华东医院和TCGA数据库的多个临床队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 187 | 2025-11-14 |
TTC36-Mediated Tumor Suppression via YBX3/SPRED1 Axis Paradoxically Reduces Sorafenib Sensitivity in Hepatocellular Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115727
PMID:41208883
|
研究论文 | 本研究揭示了TTC36通过YBX3/SPRED1轴抑制肝细胞癌增殖但意外导致索拉非尼耐药的机制 | 首次发现TTC36通过稳定YBX3上调SPRED1抑制Ras/MAPK信号通路，同时揭示TTC36高表达通过PI3K/Akt过度激活导致索拉非尼耐药的新机制 | 未明确说明样本量具体数值，动物模型细节描述有限 | 探究TTC36在肝细胞癌中的肿瘤抑制功能及其对靶向治疗反应的影响 | 肝细胞癌组织、细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 质谱分析, 分子对接, RNA pulldown, 双荧光素酶报告基因检测, IHC染色, TUNEL染色 | 动物模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1646849
PMID:41208961
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较犬类和人类肉瘤中肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征，并分析犬类NK免疫疗法临床试验中的候选生物标志物 | 首次在犬类模型中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析，建立犬类肉瘤浸润NK细胞特征，并将犬类组织特征用于解析首批犬类免疫疗法临床试验中的NK细胞变化 | 研究样本量有限，主要聚焦于肉瘤类型，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 改善自然杀伤细胞在实体癌中的免疫治疗效果，并识别潜在的生物标志物 | 犬类和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 犬类和人类捐赠者的多组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-11-14 |
Identification of CAF signature genes and construction of CAF-based risk signature in hepatocellular carcinoma by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690174
PMID:41208981
|
研究论文 | 通过多组学分析识别肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞特征基因并构建基于CAF的风险预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学识别CAF特征基因，并构建具有预后预测价值的CAF风险模型 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 开发基于CAF的风险特征模型用于预测肝细胞癌预后和识别潜在治疗靶点 | 肝细胞癌组织和HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学,多变量Cox回归 | 多变量Cox回归模型 | 基因表达数据,空间分布数据,蛋白质表达数据 | 使用数据集GSE242889的样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 190 | 2025-11-14 |
Identification of sex- and inflammation-associated heterogeneity in the mouse omentum
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1670112
PMID:41208978
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统解析小鼠大网膜在生理和激活状态下的细胞异质性 | 首次建立按性别和激活状态分层的大网膜细胞图谱，发现未表征的免疫和基质细胞亚群及性别二态性基因表达 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 系统定义大网膜的细胞组成异质性及其在炎症和免疫调节中的作用 | 小鼠大网膜组织（包括雄性和雌性） | 单细胞组学 | 炎症性疾病，卵巢癌转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠大网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-11-14 |
Single-cell and machine learning-based pyroptosis-related gene signature predicts prognosis and immunotherapy response in glioblastoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1693940
PMID:41208987
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，开发了一个焦亡相关基因特征(PRGS)，用于预测胶质母细胞瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次系统性地将单细胞分析与机器学习相结合，构建胶质母细胞瘤焦亡相关基因特征，并验证其在预后预测和免疫治疗反应评估中的价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 开发胶质母细胞瘤预后预测和免疫治疗反应评估的生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习算法 | StepCox[both]+Ridge, 十种机器学习算法组合 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA-GBM、CGGA、GEO、GSE141383和GSE223063等多个数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-11-14 |
Dysregulated arginine metabolism is associated with pro-tumor neutrophil polarization in liver cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1673665
PMID:41208994
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了精氨酸代谢在肝癌肿瘤微环境中调控中性粒细胞极化的机制 | 首次系统性地揭示了精氨酸代谢驱动的中性粒细胞功能异质性及其在肝癌进展中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证；样本来源有限 | 探究精氨酸代谢在肝癌肿瘤微环境中调控中性粒细胞极化的机制 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 机器学习 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-11-14 |
Monocyte-driven IFN and TNF programs orchestrate inflammatory networks in antisynthetase syndrome-associated interstitial lung disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652999
PMID:41209011
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了抗合成酶综合征相关间质性肺病中单核细胞驱动的干扰素和肿瘤坏死因子信号网络 | 首次在ASS-ILD中识别单核细胞特异性干扰素刺激基因活性，发现单核细胞亚群在炎症轨迹和免疫失调中的核心作用 | 样本量较小（仅3名患者），需更大队列验证发现 | 阐明ASS-ILD的免疫致病机制和细胞特异性干扰素特征 | 治疗初治ASS-ILD患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | AUCell, Seurat, Monocle, CellChat, decoupleR | 单细胞转录组数据 | 3名ASS-ILD患者和3名健康对照（共67,421个细胞），扩展队列126,026个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-11-14 |
Integrated bioinformatic analysis and machine learning developed a prognostic model based on mitochondrial function for acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1597633
PMID:41209008
|
研究论文 | 本研究通过整合线粒体基因表达数据和机器学习算法，开发了基于线粒体功能的急性髓系白血病预后模型MitoScore | 首次整合14种机器学习算法构建线粒体功能评分系统，并结合单细胞测序分析线粒体基因在免疫细胞中的表达模式 | 未明确说明样本来源和验证队列的具体信息 | 开发基于线粒体功能的AML预后评估工具 | 急性髓系白血病患者样本 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | 机器学习集成算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-11-14 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the critical role of fibroblasts in aortic progeria-associated vascular remodeling in Hutchinson-Gilford progeria syndrome mice
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638083
PMID:41209003
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了成纤维细胞在Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠主动脉早衰相关血管重塑中的关键作用 | 首次在HGPS小鼠模型中系统揭示了主动脉成纤维细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络，并鉴定出Lgals3bp作为潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究成纤维细胞在早衰综合征主动脉血管重塑中的作用机制 | HGPS小鼠主动脉组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HGPS小鼠主动脉组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2025-11-14 |
HOXA5-mediated spatial remodeling of tumor-immune interfaces across cancers promotes AML pathogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1677713
PMID:41209012
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了HOXA5在多种癌症中的空间免疫调控功能及其在AML发病机制中的关键作用 | 首次系统揭示HOXA5在泛癌水平上的空间免疫调控功能，发现其在AML中通过胆固醇生物合成和ECM重塑维持疾病进展，并识别巯嘌呤作为潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，功能验证仅限于AML细胞系，缺乏体内实验验证 | 探究HOXA5在多种癌症中的空间免疫调控功能和治疗潜力 | 33种癌症类型的多组学数据和AML细胞系（U937、KG-1） | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 多组学整合分析、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据 | TCGA数据集11,096例、GTEx数据集7,469例、AML细胞系3个生物学重复 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 197 | 2025-11-14 |
Elevated KNSTRN as a potential indicator for triple-negative breast cancer progression and immune infiltration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572359
PMID:41209020
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研究论文 | 本研究探讨KNSTRN在三阴性乳腺癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 首次确认KNSTRN在三阴性乳腺癌中的过表达与不良预后和免疫抑制微环境相关，并验证其促进肿瘤细胞增殖和迁移的功能 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 确定KNSTRN在三阴性乳腺癌预后、免疫浸润和进展中的潜在作用 | 三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231和BT549)和患者组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序, siRNA敲低, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 细胞实验数据 | 来自TCGA、GEO和METABRIC数据库的多个数据集，以及TNBC细胞系和患者组织样本 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-11-14 |
Profiling Shared Cytotoxic Immune Signatures in SLE-Associated Coronary Injury Through Transcriptomics and Machine Learning
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S539756
PMID:41209049
|
研究论文 | 通过转录组学和机器学习分析系统性红斑狼疮相关冠状动脉损伤中的共享细胞毒性免疫特征 | 首次发现SLE和CAD共享细胞毒性淋巴细胞驱动的分子轴，识别GZMK和KLRK1作为核心生物标志物 | 冠状动脉微血管功能障碍亚组样本量较小(n=4)，需要在扩大队列中进一步验证 | 揭示系统性红斑狼疮与冠状动脉疾病之间的共享分子机制 | 系统性红斑狼疮患者、冠状动脉疾病患者、外周血单个核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qPCR | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE45291,GSE61145等)和验证队列，包括4例SLE冠状动脉微血管功能障碍患者 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-11-14 |
Mathematical strategies for predicting resistant subpopulations from scRNAseq data of a PANC-1 3D tissue model: Insight into gemcitabine resistance and TGFB1-induced invasion and EMT
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.032
PMID:41209344
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析3D培养的PANC-1细胞模型，开发数学策略预测吉西他滨耐药亚群并研究TGFB1诱导的侵袭和上皮间质转化 | 开发了基于互信息的机器学习框架(gSELECT)和新型数学方法，能够从看似相似的细胞群体中预测耐药亚群 | 研究仅基于PANC-1细胞系，需要进一步的功能验证和临床前模型验证 | 研究胰腺导管腺癌的化疗耐药机制和侵袭表型 | 3D培养的PANC-1胰腺癌细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 数学建模 | 基于互信息的机器学习框架(gSELECT) | 单细胞RNA测序数据 | PANC-1细胞3D培养模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-11-14 |
Single-cell analysis decodes cellular dynamics in clear cell renal cell carcinoma with tumor thrombus
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.019
PMID:41209347
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析透明细胞肾细胞癌中肿瘤血栓形成的细胞动态和分子特征 | 首次对原发性ccRCC肿瘤及其匹配静脉肿瘤血栓进行系统性单细胞分析，揭示了血栓内独特的免疫抑制微环境和细胞间通讯网络 | 研究样本量有限，未包含不同临床分期的系统比较 | 阐明透明细胞肾细胞癌中肿瘤血栓形成的细胞和分子机制 | 原发性透明细胞肾细胞癌肿瘤组织及匹配的静脉肿瘤血栓 | 单细胞组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 匹配的原发肿瘤和肿瘤血栓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |