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当前共找到 31938 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-29 |
scooby: Modeling multi-modal genomic profiles from DNA sequence at single-cell resolution
2025-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.613754
PMID:39345504
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研究论文 | 开发了首个从DNA序列建模单细胞多组学数据的框架scooby | 首个在单细胞分辨率下从序列建模scRNA-seq覆盖度和scATAC-seq插入谱的框架，利用预训练模型Borzoi作为基础模型并配备细胞特异性解码器 | NA | 理解调控DNA元件如何塑造单个细胞中的基因表达，构建跨基因表达步骤的统一基因调控模型 | 造血作用数据集中的单细胞多组学数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 深度学习, 基础模型, 序列嵌入 | 基因组序列, 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-29 |
Single-cell RNA sequencing identifies accumulation of Fcgr2b+ virtual memory like CD8 T cells with cytotoxic and inflammatory potential in aged mouse white adipose tissue
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661935
PMID:40631318
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现老年小鼠白色脂肪组织中积累具有细胞毒性和炎症潜能的Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞 | 首次识别出老年小鼠脂肪组织中特定的Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞亚群，并证明其具有细胞毒性和炎症潜能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类组织中验证 | 比较衰老和高脂饮食诱导的肥胖对脂肪组织免疫细胞组成的差异影响 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织基质血管组分 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻正常饮食小鼠、年轻高脂饮食小鼠和老年正常饮食小鼠的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-29 |
Thymic DC2 are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2025-Jun-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659520
PMID:40666966
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺DC2细胞的异质性并鉴定出新型过渡性树突状细胞群体 | 发现传统认为的'DC2'实际上包含4个不同细胞谱系，并首次鉴定出CX3CR1过渡性树突状细胞这一新型胸腺细胞群体 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺中这些细胞群体的存在和功能需要进一步验证 | 解析胸腺髓系细胞的起源、发育和稳态维持机制 | 胸腺髓系细胞，特别是树突状细胞DC2亚群 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组测序，谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-29 |
Mapping satellite glial cell heterogeneity reveals distinct spatial organization and signifies functional diversity in the dorsal root ganglion
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654813
PMID:40475507
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性，并通过整合单细胞RNA测序与免疫组化等技术识别了四个不同的SGC亚群 | 首次系统揭示背根神经节中卫星胶质细胞的异质性，发现四种具有不同空间分布和功能特征的SGC亚型，并在人类DRG中验证了分层结构 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚属初步探索 | 探究背根神经节中卫星胶质细胞的异质性及其功能多样性 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-29 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542774
PMID:37398280
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研究论文 | 开发了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法，用于研究胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控 | 首次将人血浆样培养基与稳定同位素示踪技术结合，在保留完整肿瘤微环境的情况下研究胶质瘤代谢 | 体外模型仍无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究胶质母细胞瘤在生理营养水平和完整肿瘤微环境下的代谢特征 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 癌症代谢研究 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪,空间转录组学 | NA | 代谢数据,转录组数据 | 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-29 |
Whole-Genome Sequencing Reveals Individual and Cohort Level Insights into Chromosome 9p Syndromes
2025-Mar-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.28.25324850
PMID:40196253
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研究论文 | 通过全基因组测序对100名9p相关综合征患者进行基因组分析，揭示了染色体9p综合征的个体和队列水平特征 | 首个大规模全基因组测序研究9p相关综合征，识别了两个新的晚复制区域，建立了基于机器学习的9p缺失综合征预测模型 | 样本量相对有限，需要进一步扩大研究队列 | 深入理解染色体9p缺失和重复综合征的基因组结构和发病机制 | 100名来自9p相关综合征家庭的个体，包括85名无关先证者 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序，空间转录组学，机器学习 | 机器学习模型 | 基因组序列数据，基因表达数据 | 100名个体（85名无关先证者） | NA | 全基因组测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-29 |
Altered immune landscape of cervical lymph nodes reveals Epstein-Barr virus signature in multiple sclerosis
2025-02-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adl3604
PMID:39982975
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研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化症患者颈深淋巴结的免疫景观，揭示EB病毒在疾病发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和细胞转录组与表位索引技术，发现多发性硬化症患者颈深淋巴结中EB病毒特征性B细胞异常 | 样本量有限，仅针对新诊断未治疗患者，需要更大规模研究验证 | 探究EB病毒感染与多发性硬化症发病机制的关联 | 多发性硬化症患者的颈深淋巴结组织和唾液样本 | 单细胞测序分析 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 细胞转录组与表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表位数据, DNA数据 | 新诊断未治疗的多发性硬化症患者（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 188 | 2025-01-23 |
Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000632
PMID:39836482
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2025-10-29 |
Identification of a distinctive gene signature in granulomatous myositis
2025-Jan-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.12.27.24319708
PMID:40568658
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的特异性基因特征 | 首次系统识别了肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征，发现CHIT1基因表达与疾病严重程度密切相关 | 样本量相对有限（38例GM患者），需要更大规模研究验证 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本，包括肉芽肿性肌炎患者、其他肌病患者和健康对照 | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA测序数据，空间转录组数据，蛋白质表达数据 | 722例肌肉活检（包括38例GM患者） | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-29 |
Proteome-wide and network pharmacology integration identifies sunitinib as a potential therapeutic for type 2 diabetes targets
2025, Therapeutic advances in endocrinology and metabolism
IF:3.9Q2
DOI:10.1177/20420188251376325
PMID:41146943
|
研究论文 | 通过蛋白质组范围孟德尔随机化分析和网络药理学整合，识别出舒尼替尼作为2型糖尿病的潜在治疗药物 | 首次将蛋白质组范围MR分析与网络药理学整合，识别出TPST2和CHRDL1作为新型T2D治疗靶点，并发现已上市药物舒尼替尼的多靶点作用 | 需要未来临床试验验证舒尼替尼对T2D的治疗效果 | 识别2型糖尿病的潜在生物标志物和治疗靶点 | 人类蛋白质组和2型糖尿病相关蛋白 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 孟德尔随机化分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 通路富集分析, 单细胞RNA测序 | 逆方差加权MR, 贝叶斯加权MR | 蛋白质组数据, 基因组数据 | deCODE Genetics: 35,559个体, 4,907种蛋白质; FinnGen研究: 65,085例T2D病例, 335,112例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-29 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学分析，发现白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的关键驱动作用 | 首次在ACM中识别出炎症-纤维化空间生态位，并证明抗IL-1β治疗可改善疾病表型 | 研究样本量有限，主要基于动物模型验证 | 探索致心律失常性心肌病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | ACM患者和对照供体的心肌样本，Desmoglein-2突变小鼠 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590125
PMID:38712088
|
研究论文 | 本研究通过构建结肠的细胞和空间图谱，揭示了结肠组织在衰老过程中的时空动态变化 | 开发了新的计算框架cSplotch，利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息，建立了与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型，人类结肠衰老的直接适用性需要进一步验证 | 探究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织进行空间转录组分析，约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-28 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
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研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变嘌呤代谢微环境促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床效果需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效应及其作用机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析、单细胞RNA测序、核RNA测序 | 动物模型 | 代谢组数据、单细胞测序数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序、核RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-28 |
EpiFoundation: A Foundation Model for Single-Cell ATAC-seq via Peak-to-Gene Alignment
2025-Sep-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636688
PMID:39975086
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研究论文 | 本文提出了首个专门针对单细胞ATAC-seq数据的预训练基础模型EpiFoundation，通过峰值到基因对齐解决数据稀疏性问题 | 开发了创新的跨模态预训练方法，专门处理非零峰值集以提高信息密度，并利用基因表达信息监督预训练过程 | NA | 开发专门针对单细胞ATAC-seq数据的基础模型，解决高维稀疏数据的表示学习问题 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞表示学习 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 基础模型 | 表观基因组数据, 基因表达数据 | 超过100,000个单细胞，包含配对的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-28 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals unique transcription patterns, immune responses and early morphological alterations
2025-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型研究HIV和结核分枝杆菌共感染的早期空间转录组特征 | 首次在HIV和结核分枝杆菌共感染模型中应用空间转录组技术揭示早期免疫细胞浸润模式和转录特征 | 研究仅观察感染后三周的早期变化，未涵盖疾病全程发展 | 理解HIV和结核分枝杆菌共感染早期免疫细胞浸润的表型和功能变化 | 人源化小鼠模型的肺组织 | 空间转录组学 | HIV和结核分枝杆菌共感染 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 人源化小鼠感染模型（单感染和共感染组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-28 |
STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.027
PMID:40532697
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研究论文 | 开发了一种名为STAMP的新型单细胞分析方法，通过成像平台实现转录组和蛋白质组的多模态分析 | 通过成像而非测序进行单细胞分析，消除了测序成本，支持RNA、蛋白质和H&E的多模态分析，同时保留细胞结构和形态 | NA | 克服单细胞RNA测序在可扩展性、高成本和细胞破坏方面的限制 | 外周血单核细胞、细胞系和干细胞 | 数字病理学 | NA | 转录组成像、蛋白质组成像、多模态分析 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 10,962,092个高质量细胞/细胞核和6,030,429,954个转录本 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 成像平台，支持多模态（RNA、蛋白质和H&E）分析 |
| 197 | 2025-10-28 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
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研究论文 | 提出一种结合深度学习和统计原理的空间分子数据分析方法VIMA，用于识别与疾病相关的空间特征 | 将变分自编码器与多重检验控制相结合，通过定义数据依赖的'微生态位'来发现传统方法难以识别的疾病相关空间结构 | NA | 开发更灵活精确的空间分子数据分析方法，识别与疾病相关的关键空间结构 | 空间分子数据中的组织斑块和微生态位 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎,溃疡性结肠炎,痴呆 | 免疫荧光显微镜,CODEX,空间转录组学 | 变分自编码器 | 空间分子数据 | NA | NA | 空间转录组学,免疫荧光,CODEX | NA | NA |
| 198 | 2025-10-28 |
CROPseq-multi: a universal solution for multiplexed perturbation in high-content pooled CRISPR screens
2025-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585235
PMID:38558968
|
研究论文 | 开发了一种名为CROPseq-multi的多重CRISPR筛选系统，用于在高质量集合筛选中实现通用多重扰动 | 开发了具有多功能读出兼容性的CROPseq-inspired慢病毒系统，支持单个和组合扰动，在条形码识别和扰动性能方面表现优异 | NA | 开发兼容多种筛选方法的多重CRISPR扰动系统 | CRISPR筛选系统和遗传扰动技术 | 基因编辑技术 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序，光学集合筛选 | NA | 基因表达数据，条形码序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，光学集合筛选 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-28 |
Specific cell states underlie complex tissue regeneration in spiny mice
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637521
PMID:39990382
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研究论文 | 本研究通过细胞增殖动力学分析揭示多刺小鼠复杂组织再生的特定细胞状态机制 | 首次发现基质细胞在损伤后快速重新进入细胞周期并维持严格的时空控制，识别出CRABP1+和αSMA+等与再生特异性相关的关键细胞类型 | 未明确说明样本规模，且对年轻小鼠中类似成纤维细胞无法促进再生的机制解释有限 | 探索哺乳动物复杂组织再生过程中的细胞增殖动力学和特定细胞状态 | 多刺小鼠(Acomys spp.)和实验室小鼠的耳组织再生过程 | 发育生物学 | 组织损伤修复 | 时间脉冲追踪实验、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据、免疫染色图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |