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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-06-05 |
DMC-BrainMap is an open-source, end-to-end tool for multi-feature brain mapping in different species
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101302
PMID:41666930
|
研究论文 | DMC-BrainMap 是一款开源端到端工具,用于跨物种的多特征脑图谱绘制 | 提供无需编程的完整端到端流程,支持多物种、多发育阶段、多种脑解剖特征的映射与量化 | 未提及具体限制 | 为神经科学研究开发一个用户友好的开源工具,用于解剖数据的全自动处理与分析 | 小鼠、大鼠和斑马鱼的脑组织图像数据 | 计算机视觉 | NA | 组织学图像分析、染色、空间转录组学 | NA | 图像 | 涵盖小鼠、大鼠和斑马鱼的多品种样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2026-06-05 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 提出Gloss预测模型框架,系统分析LIPSTIC与scRNA-seq联合数据中的细胞间分子交互特征 | 首次将群组套索回归应用于scRNA-seq数据,建立可解释的预测模型以量化细胞间物理交互的分子活性 | 未提及具体局限性 | 建立系统性预测框架,链接基因与通路活性至细胞间物理交互强度 | 小鼠肿瘤中的髓系-T细胞互作与病毒感染中的T细胞亚群互作 | 机器学习 | 肿瘤学 | scRNA-seq | 群组套索回归 | 单细胞转录组测序数据 | 多数据集基准测试 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2026-06-05 |
ETV2-ECSCR-mTOR pathways regulate reprogramming to the endothelial lineage
2026-Feb-23, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf075
PMID:41652899
|
研究论文 | 本研究揭示了ETV2-ECSCR-mTOR通路在重编程至内皮细胞谱系中的调控机制 | 首次发现ECSCR是ETV2的直接转录靶点,并通过mTORC1信号通路调控ETV2介导的细胞重编程速率 | 未明确提及样本量和临床转化验证 | 阐明ETV2下游靶点在调控内皮细胞重编程中的作用机制 | 小鼠胚胎体细胞和胚胎成纤维细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq、凝胶迁移实验、转录活性分析 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、转录因子结合数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析ETV2过表达的胚状体分化和胚胎成纤维细胞重编程 |
| 184 | 2026-06-05 |
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525673123
PMID:41665992
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研究论文 | 结合组织病理学分析、空间转录组学和单核RNA测序,绘制人类小脑伯格曼胶质细胞的发育图谱,揭示其时空组织动态及分子特征 | 首次揭示人类小脑伯格曼胶质细胞在11孕周出现,并发现其与浦肯野细胞形成独特的三层结构(含层间分离层),该结构可能为人类特有 | 研究主要基于组织样本的转录组分析,未进行功能验证实验 | 解析人类小脑发育过程中伯格曼胶质细胞的时空起源、分子身份及细胞谱系 | 人类小脑发育过程中的伯格曼胶质细胞及其前体细胞 | 数字病理学, 单细胞组学 | 神经发育疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 组织病理学, 伪时间分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 多个发育时间点的人类小脑组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学平台, 10x Chromium 单核RNA测序平台 |
| 185 | 2026-06-05 |
TNF-⍺-mediated myeloid-instructed CD14+CD4+ T cells are associated with poor survival in lung adenocarcinoma
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102593
PMID:41666923
|
研究论文 | 本文通过空间多组学分析非小细胞肺癌,发现TNF-α介导的CD14+CD4+ T细胞与患者生存率低相关 | 首次发现髓系细胞通过吞噬作用诱导形成CD14+CD4+ T细胞,并揭示TNF-α信号在此过程中的关键作用 | 未明确描述局限性 | 探究髓系驱动的免疫抑制机制,为改善肺癌免疫治疗提供新靶点 | 非小细胞肺癌组织及邻近非恶性肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、空间多组学 | NA | 图像、文本 | 非小细胞肺癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 186 | 2026-06-05 |
RMzyme: regulations of RNA-modifying enzymes in humans
2026-Feb-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02568-2
PMID:41672979
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研究论文 | 通过378个多组学数据集对人类RNA修饰酶进行大规模表征,并开发了RMzyme平台 | 首次整合多组学数据(基因组学、转录组学、表观转录组学、蛋白质组学和翻译后修饰)对人类RNA修饰蛋白进行系统性大规模分析,并开发了综合性资源平台RMzyme | 未明确指出具体局限性,但可能涉及数据覆盖范围和验证的深入程度 | 系统研究人类RNA修饰酶的调控机制和功能 | 人类63种组织中的RNA修饰蛋白 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 多组学分析、非负矩阵分解 | 非负矩阵分解 | 多组学数据(基因组学、转录组学、表观转录组学、蛋白质组学、翻译后修饰) | 63种人类组织的378个多组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2026-06-05 |
A dual-action nanoparticle approach for spinal cord injury treatment: ferroptosis inhibition, inflammation control, and Myelin preservation
2026-Feb-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04114-w
PMID:41673859
|
研究论文 | 一种新型双作用纳米颗粒通过抑制铁死亡、控制炎症和保护髓鞘来治疗脊髓损伤 | 首次使用从黄精提取的新型果聚糖包被硒纳米颗粒,并通过绿色抗坏血酸介导还原法合成PRP@SeNPs,实现对铁死亡和神经炎症的双重调控 | 该研究主要基于小鼠模型,未在大型动物或人体中进行验证,且未探讨长期安全性和生物降解性 | 开发一种无药物、生物相容性好的纳米治疗策略,通过补充硒来减轻脊髓损伤后的继发性损伤,促进神经保护和功能恢复 | 脊髓损伤小鼠模型及相关的神经元、少突胶质细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脊髓损伤小鼠模型(具体样本量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2026-06-05 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03994-3
PMID:41673899
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研究论文 | 提出一种名为PreTSA的计算方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 | PreTSA在保持与最先进方法一致结果的同时,显著降低计算时间,为极大型数据集中的基因表达模式研究提供独特解决方案 | 未提及 | 开发一种计算高效的方法,用于建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 | 大规模单细胞和空间转录组数据,包含数百万个细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 189 | 2026-06-05 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
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研究论文 | 本研究利用急性LCMV感染的小鼠模型,揭示WAS蛋白缺乏会破坏记忆B细胞的形成,尤其在经典IgG2c MBCs比例下降和异常CD21low MBCs增加方面 | 首次在急性病毒感染的WASp基因敲除小鼠模型中,利用单细胞RNA测序技术阐明WASp缺乏如何促进异常记忆B细胞的形成,并发现WASp在异常MBCs中表达显著降低 | 未提及可能存在的局限性,例如研究仅在急性LCMV感染模型中进行,或缺乏对人类样本的直接验证 | 探究WAS蛋白缺乏对记忆B细胞分化的影响及其机制 | WASp基因敲除小鼠及其在急性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)感染后的记忆B细胞分化 | 机器学习 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及WASp敲除小鼠和对照小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 190 | 2026-06-05 |
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104978
PMID:41671045
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研究论文 | 通过对已发表单细胞RNA测序数据集的大规模整合,创建了急性髓系白血病(AML)的单细胞转录组图谱,并揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络 | 构建了迄今为止最大的人类AML单细胞数据资源(含748,679个细胞),并通过多组学数据验证,首次揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络特征,发现BCLAF1作为儿科AML的潜在预后指标 | NA | 研究急性髓系白血病中t(8;21)亚型与年龄相关的基因调控网络机制 | 159名AML患者和51名健康供者的单细胞数据,重点分析20名t(8;21) AML患者 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据 | 748,679个细胞,来自159名AML患者和51名健康供者(20项研究整合) | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-06-05 |
KLHDC4 serves as a novel prognostic biomarker and drives tumor progression via PI3K/AKT signaling in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39061-x
PMID:41673210
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研究论文 | 整合多组学数据系统评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床意义和功能作用,并实验验证其作为预后标志物和通过PI3K/AKT信号促进肿瘤进展 | 首次系统揭示KLHDC4在肾透明细胞癌中的预后价值及通过PI3K/AKT信号的致癌机制,并发现潜在的抑制剂来迪派韦 | KLHDC4在恶性肿瘤中的临床意义和分子机制仍不清楚,尤其是肾透明细胞癌 | 评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床相关性和功能作用 | KLHDC4基因在多种癌症类型中的表达及肾透明细胞癌中的功能 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 多组学数据分析(转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序)、RNA测序、Western blot、分子对接 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 多个癌症类型的数据集,含肾透明细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2026-06-05 |
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity in sepsis and down-regulation of SNHG5/miR-324-5p/CDK16 axis in T cells
2026-Feb-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10136-9
PMID:41673232
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示脓毒症中转录异质性及SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在T细胞中的下调 | 首次通过单细胞RNA-seq绘制脓毒症患者外周血单个核细胞图谱,并发现SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在炎症T细胞凋亡中的作用 | 样本量较小(仅3例脓毒症患者和3例健康志愿者),需要更多样本验证 | 研究脓毒症诱导的T淋巴细胞减少的分子机制 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例脓毒症患者和3例健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveal mechanisms of skeletal muscle differentiation across duck embryonic development
2026-Feb-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09665-0
PMID:41673320
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示鸭胚胎发育过程中骨骼肌分化的机制 | 首次鉴定出慢肌纤维可通过LEF1+(I)亚型转分化为快肌纤维的机制,并证明该纤维类型转换程序在脊椎动物中系统发育保守 | 未提及明显局限性 | 探究脊椎动物肌肉纤维类型多样性的发育起源和调控通路 | 鸭胚胎发育过程中的骨骼肌 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含鸭胚胎发育多个阶段的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-06-05 |
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08453-2
PMID:41673397
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研究论文 | 该研究首次绘制了宫颈癌中RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)甲基化组图谱,揭示了m5C驱动的SERPINB5稳定性增强促进宫颈癌进展和化疗耐药的新机制 | 首次在碱基分辨率水平构建宫颈癌m5C转录组图谱,并整合空间转录组学和单细胞RNA测序,发现m5C-SERPINB5轴作为宫颈癌恶性进展和化疗耐药的核心驱动机制 | 未提及 | 阐明RNA m5C修饰在宫颈癌进展和化疗耐药中的功能机制及治疗靶点 | 宫颈癌组织和细胞系 | 机器学习和数字病理学 | 宫颈癌 | RNA甲基化测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、单细胞测序数据 | 未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台、10x Visium空间转录组学平台 |
| 195 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07256-w
PMID:41673792
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 | 首次利用单细胞转录组测序技术结合实验方法,系统阐明rEg.P29通过调节T细胞亚群(如Th1、Th2、Th17和Treg)缓解过敏性哮喘的免疫机制,并发现Lag3+Tnfrsf9+ Treg细胞及其免疫抑制作用 | 未明确说明,但基于摘要可能限于小鼠模型及特定蛋白rEg.P29,需在临床样本中进一步验证 | 探讨重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的效果及潜在免疫机制 | 过敏性哮喘小鼠模型(OVA诱导)及其肺组织细胞 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肺组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2026-06-05 |
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-Feb-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07835-6
PMID:41673874
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示了TCF21-WNT5A轴在结直肠癌肝转移中通过基质-肿瘤细胞通信驱动转移的作用 | 首次发现TCF21高表达的基质细胞在转移组织中富集,并阐明TCF21通过调控WNT5A表达促进结直肠癌肝转移的分子机制 | NA | 探索结直肠癌肝转移的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌组织样本(正常、原发肿瘤、转移灶)及HCT116细胞系 | 生物信息学, 癌症研究 | 结直肠癌, 肝转移 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | NA | 基因表达数据, 临床样本数据 | 从GEO数据库收集的scRNA-seq和Bulk RNA-seq数据及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2026-06-05 |
GPR35 protects against reperfusion injury in ischemic stroke by binding with the CR2 domain of Raf1
2026-Feb-10, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03726-1
PMID:41664072
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研究论文 | 研究发现GPR35通过与Raf1的CR2结构域结合,在缺血性脑卒中中保护免受再灌注损伤 | 首次揭示GPR35通过与Raf1的CR2结构域直接结合来调节Raf1/ERK1/2/MAPK信号通路,从而减轻缺血再灌注损伤和神经炎症 | 该研究主要基于小鼠模型,有待在人体中验证;且未完全阐明GPR35活化的下游分子机制细节 | 探究GPR35在缺血性脑卒中小鼠模型再灌注损伤中的作用及其分子机制 | 缺血性脑卒中小鼠模型中的小胶质细胞 | 生物医学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞测序,共免疫沉淀 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2026-06-05 |
Integration of Multi-Omics and Machine Learning Identifies TGFB1 and SERPINE1 as Biomarkers of Vascular Smooth Muscle Cell Senescence in Intracranial Aneurysms
2026-Feb-10, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01419-8
PMID:41665703
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research paper | 通过整合多组学数据和机器学习,识别出TGFB1和SERPINE1作为颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的生物标志物 | 首次探究血管平滑肌细胞衰老在颅内动脉瘤发病机制中的作用,并利用多组学整合和机器学习方法鉴定出关键衰老相关基因TGFB1和SERPINE1 | TGFB1和SERPINE1的具体机制仍需进一步研究和验证 | 识别颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的关键调控基因及潜在生物标志物 | 颅内动脉瘤患者和弹性蛋白酶诱导的小鼠动脉瘤模型 | machine learning | cerebrovascular disease | RNA-seq | NA | single-cell RNA sequencing data, bulk RNA sequencing data, microarray data | 小鼠颅内动脉瘤模型(GSE193533)和人类组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2026-06-05 |
Combining Spatial Transcriptomics and Machine Learning Unravels Fibroblast-Related Biomarkers in Ulcerative Colitis
2026-Feb-10, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02387-1
PMID:41665828
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研究论文 | 结合空间转录组学和机器学习揭示溃疡性结肠炎中成纤维细胞相关的生物标志物 | 首次将空间转录组学与机器学习联合分析,鉴定出成纤维细胞相关生物标志物ANGPTL2,并通过体内外实验验证其作为非侵入性诊断指标和治疗靶点的潜力 | 未提供明确的局限性说明 | 探索成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的作用并鉴定诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者和DSS诱导的UC小鼠模型 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 机器学习, IF, ELISA, WB | 机器学习模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 多个数据集(GSE114374, GSE231993, GSE189184)及UC患者血清样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 200 | 2026-06-05 |
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68802-9
PMID:41667466
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研究论文 | 通过报告基因追踪和单细胞转录组学,揭示了海葵中成年神经发生的两种不同机制 | 首次在海葵中发现两种不同的成年神经发生模式:多能祖细胞直接分化为肽能神经元,以及刺细胞(特化的刺胞动物神经细胞)的逐步成熟过程 | 对神经命运决定过程中转录调控机制的详细解析仍有待深入 | 阐明刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录程序 | 海葵(Nematostella vectensis) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年海葵样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |