单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
181	2025-06-19	Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization 2025-05-27, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110788 PMID:40497964	研究论文	通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了小鼠下丘脑室旁核在发育过程中内源性大麻素信号传导的分子指纹	首次描述了内源性大麻素信号在下丘脑室旁核神经元发育过程中的纳米级结构，并提供了2-AG和AEA信号传导的时空图谱	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证	探索下丘脑室旁核在发育过程中内源性大麻素信号传导的分子机制	小鼠下丘脑室旁核的神经元和星形胶质细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、原位杂交、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、图像数据	小鼠胎儿和出生后发育阶段的样本
182	2025-06-19	The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy 2025-05-25, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110778 PMID:40497954	综述	本文综述了cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的关键作用及其潜在治疗靶点	整合了人类单细胞RNA测序数据和系统文献综述，识别了现有的分子干预措施并突出了有前景的治疗靶点	cGAS/STING通路在心肌病相关炎症中的精确分子机制仍不清楚且存在争议，未来研究需验证这些发现并促进其临床转化	探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的作用及其潜在治疗策略	心肌病中的cGAS/STING信号通路	分子生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	scRNA-seq数据和临床样本	公开可用的人类scRNA-seq数据和临床样本
183	2025-06-19	Dynamic Expression and Functional Implications of the Cell Polarity Gene, Dchs1, During Cardiac Development 2025-05-24, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110774 PMID:40497950	研究论文	本研究探讨了细胞极性基因Dchs1在心脏发育过程中的动态表达及其功能意义	首次生成了Dchs1-HA敲入小鼠模型，揭示了Dchs1在非心肌细胞系中的动态表达模式及其在细胞间通讯中的潜在作用	Dchs1在心脏发育中的具体分子机制尚未完全阐明	阐明Dchs1在心脏发育过程中的表达模式和功能	Dchs1基因及其在心脏发育中的作用	发育生物学	心血管疾病	免疫组化、Western blotting、单细胞转录组学	Dchs1-HA敲入小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据	不同发育阶段的小鼠心脏组织样本
184	2025-06-19	A Multimodal Spatial and Epigenomic Atlas of Human Adult Lung Topography 2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.05.23.655666 PMID:40475598	研究论文	该研究构建了一个高分辨率的多模态人类成人肺部空间和表观基因组图谱，用于解析肺部疾病的易感空间区域	整合了单核RNA测序和染色质可及性测序技术，首次在单核分辨率下构建了人类肺部的高分辨率多模态图谱，并鉴定了新的转录调控因子	研究仅基于11名健康成年人的样本，可能无法完全代表肺部疾病的多样性	构建高分辨率的人类肺部参考图谱，以解析肺部疾病的发病机制	人类成人肺部组织	数字病理学	肺部疾病	snRNA-seq, SNARE-seq2, MERFISH, 多重免疫荧光	NA	单核RNA测序数据、染色质可及性数据、空间转录组数据、免疫荧光图像	49个肺部组织块，746,047个细胞核，来自11名健康成年人
185	2025-06-19	Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets 2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.04.30.651101 PMID:40475445	研究论文	本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提高胰腺胰岛中异构体的检测能力	优化了5'端文库制备协议，并展示了胰岛素转录本的靶向耗竭策略在提高信息读取检测中的效用	技术挑战包括读长不足和较高的错误率，以及高丰度转录本可能掩盖低丰度转录本的识别	优化单细胞长读长测序技术，以更准确地检测胰腺胰岛中的剪接变体	胰腺胰岛中的单细胞RNA	基因组学	糖尿病	单细胞长读长测序	NA	RNA序列数据	NA
186	2025-06-19	Tyrosinase in melanoma inhibits anti-tumor activity of PD-1 deficient T cells 2025-May-15, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-025-02237-4 PMID:40375241	研究论文	该研究探讨了黑色素瘤中酪氨酸酶如何抑制PD-1缺陷T细胞的抗肿瘤活性	首次发现酪氨酸酶在黑色素瘤中抑制T细胞的抗肿瘤活性，并通过CRISPR/Cas9技术敲除酪氨酸酶基因，揭示了其对肿瘤免疫微环境的影响	研究基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探究黑色素瘤抵抗免疫治疗的分子机制	B16黑色素瘤模型和PD-1缺陷小鼠	肿瘤免疫学	黑色素瘤	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序	B16黑色素瘤模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，使用小鼠模型进行研究
187	2025-06-19	CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis 2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202402024RRR PMID:40172996	研究论文	本研究揭示了CAF来源的外泌体通过传递lncRNA LINC01711，激活miR-4510/NELFE轴，从而增强乳腺癌细胞的糖酵解作用	发现CAF来源的外泌体中LINC01711通过miR-4510/NELFE轴激活TXN，促进糖酵解作用的新机制	研究未涉及LINC01711在其他类型癌症中的作用，且临床样本量有限	探索CAF来源的外泌体在乳腺癌进展中的作用机制	乳腺癌细胞及CAF来源的外泌体	肿瘤生物学	乳腺癌	单细胞测序、降维分析、聚类分析、细胞注释	NA	单细胞测序数据	GEO数据库中的乳腺癌单细胞测序数据
188	2025-06-19	RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition 2025-Apr, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-08542-2 PMID:39910313	研究论文	该研究揭示了RUNX2在肺纤维化中通过肺泡到病理性成纤维细胞的转变促进纤维化的机制	发现LEPR成纤维细胞中的SCUBE2肺泡成纤维细胞是病理性成纤维细胞的主要来源，并确定RUNX2是纤维化基因表达的关键调控因子	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足	探索肺纤维化中病理性成纤维细胞生成的关键调控机制	小鼠模型中的LEPR成纤维细胞和SCUBE2肺泡成纤维细胞	分子生物学	肺纤维化	scRNA-seq, scATAC-seq	NA	基因表达数据	两种小鼠肺纤维化模型
189	2025-06-19	An Improved, High-Yield Method for Isolating Nuclei from Individual Zebrafish Embryos for Single-Nucleus RNA Sequencing 2025-Apr, Zebrafish IF:1.4Q2 DOI:10.1089/zeb.2024.0175 PMID:40040474	研究论文	本文介绍了一种改进的高效方法，用于从斑马鱼胚胎中分离高质量细胞核，以进行单核RNA测序	通过珠磨均质化在裂解缓冲液中高效分离细胞核，相比酶解方法有显著改进，并适用于广泛的发育阶段	NA	开发一种高效的方法，用于从斑马鱼胚胎中分离高质量细胞核，以支持单细胞测序研究	斑马鱼胚胎	基因组学	NA	单核RNA测序(snRNA-seq)	NA	RNA序列数据	在96孔板格式中处理的斑马鱼胚胎
190	2025-06-19	Coordinated regulation of cortical astrocyte maturation by OLIG1 and OLIG2 through BMP7 signaling modulation 2025-Mar-24, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2025.03.008 PMID:40139307	研究论文	本研究揭示了转录因子OLIG1和OLIG2通过调控BMP7信号通路在皮质星形胶质细胞成熟中的协同作用	首次发现OLIG1和OLIG2通过直接结合Bmp7增强子抑制其表达来调控星形胶质细胞成熟	研究主要聚焦于皮质星形胶质细胞，其他脑区星形胶质细胞的成熟机制仍需进一步探索	阐明调控皮质星形胶质细胞成熟的分子机制	皮质星形胶质细胞	神经科学	神经系统疾病	单细胞RNA测序、基因敲除、体内过表达	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，使用基因工程小鼠模型
191	2025-06-19	A Potential Contribution of S100A11 to Skin Fibrosis and Pulmonary Involvement in Systemic Sclerosis 2025-Jan, Experimental dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/exd.70026 PMID:40525602	research paper	本研究探讨了S100A11在系统性硬化症（SSc）皮肤纤维化和肺部受累中的潜在作用	首次发现S100A11在SSc皮肤成纤维细胞中高表达，并与细胞衰老相关基因共表达，同时发现血清S100A11水平与SSc皮肤厚度评分和间质性肺病参数显著相关	研究样本量未明确说明，功能机制尚未完全阐明	探究S100A11在系统性硬化症纤维化过程中的病理生理作用	系统性硬化症患者皮肤样本和血清	医学研究	系统性硬化症	免疫组织化学染色（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、酶联免疫吸附试验（ELISA）	NA	组织样本、血清样本、基因表达数据	未明确说明患者和对照组的具体样本量
192	2025-06-19	Cellular origin and clonal evolution of human dedifferentiated liposarcoma 2024-09-12, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52067-1 PMID:39266532	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、DNA测序等技术，探索了人类去分化脂肪肉瘤（DDLPS）的细胞起源和克隆演化	首次鉴定了肿瘤脂肪干细胞（ASC）群体，并揭示了其与白色脂肪组织中脂肪基质祖细胞的相似性，以及这些祖细胞在DDLPS肿瘤克隆演化中的作用	研究样本仅限于原发性DDLPS肿瘤，未涉及转移性肿瘤或其他肉瘤亚型	阐明去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化机制	人类去分化脂肪肉瘤（DDLPS）的肿瘤细胞及其微环境	肿瘤生物学	脂肪肉瘤	单细胞RNA测序, DNA测序, 原位多重免疫荧光, 功能实验	NA	单细胞转录组数据, DNA序列数据, 免疫荧光图像数据	配对的WD和DD成分的原发性DDLPS肿瘤样本
193	2025-06-19	Maf expression in B cells restricts reactive plasmablast and germinal center B cell expansion 2024-09-12, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52224-6 PMID:39266537	研究论文	本研究探讨了Maf在B细胞中对浆母细胞和生发中心B细胞扩增的调控作用	揭示了Maf作为B细胞内在负调节因子，在浆母细胞增殖和生发中心B细胞形成中的新作用	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类B细胞	探究Maf在B细胞分化中的调控机制	B细胞（特别是边缘区B细胞、生发中心B细胞和浆母细胞）	免疫学	NA	单细胞RNA测序	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	野生型对照和Maf缺陷型小鼠
194	2025-06-19	3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification 2024-06-17, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028 PMID:38593801	研究论文	通过分析单细胞RNA测序数据，研究小鼠耳蜗从顶端到基底端的形态发生素调控机制	首次从小鼠耳蜗的单细胞RNA测序数据中重建3D模型，揭示了视黄酸和hedgehog信号通路在耳蜗纵向轴形成中的共同作用	研究仅基于E12.5和E14.5两个时间点的数据，未覆盖耳蜗发育全过程	探索小鼠耳蜗顶端到基底端特异性基因表达的分子调控机制	小鼠耳蜗发育过程中的细胞	发育生物学	NA	scRNA-seq	3D重建模型	单细胞RNA测序数据	E12.5和E14.5两个发育时间点的小鼠耳蜗细胞
195	2025-06-19	Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing 2024-04-05, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adm7506 PMID:38578993	research paper	该研究通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序技术，构建了人类卵巢的细胞图谱	结合空间转录组学和单细胞测序技术，首次全面描绘了人类卵巢中不同细胞类型的基因表达特征和空间分布	样本量较小(仅5名供体)，且均为绝经前女性，可能无法完全代表卵巢细胞的全貌	解析卵巢中不同细胞类型的空间分布和功能特征	人类卵巢组织	空间转录组学	生殖系统疾病	空间转录组学，单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	257个卵巢区域(来自2名供体)和21,198个单细胞(来自另外3名供体)
196	2025-06-19	col1a2+ fibroblasts/muscle progenitors finetune xanthophore countershading by differentially expressing csf1a/1b in embryonic zebrafish 2024-04-05, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adj9637 PMID:38578990	research paper	研究揭示了斑马鱼胚胎中调控黄色素细胞反阴影的机制，通过成纤维细胞和肌肉祖细胞差异表达csf1a/1b来调节黄色素细胞模式	首次发现成纤维细胞和肌肉祖细胞通过差异表达csf1a/1b调控黄色素细胞的反阴影模式	研究仅限于斑马鱼胚胎，未在其他生物或发育阶段验证	探索脊椎动物反阴影色素模式的调控机制	斑马鱼胚胎中的黄色素细胞	发育生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	斑马鱼胚胎
197	2025-06-19	Spatial transcriptomics identifies candidate stromal drivers of benign prostatic hyperplasia 2024-01-23, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.176479 PMID:37971878	研究论文	通过空间转录组学技术识别良性前列腺增生（BPH）中潜在的基质驱动因子	首次利用激光显微切割和转录组分析技术，识别出BPH基质中可能介导前列腺腺上皮诱导的分泌因子IGF1和CXCL13，并验证了它们在BPH成纤维细胞中的共表达	研究仅部分支持历史关于BPH病因的推测，且未全面验证所有潜在分子靶点的治疗潜力	探究良性前列腺增生（BPH）的基质驱动因子及其分子机制	良性前列腺增生（BPH）的基质组织及腺上皮	数字病理学	前列腺癌	激光显微切割、转录组分析、RNA原位杂交、3D培养	NA	转录组数据、组织样本	患者来源的BPH细胞类器官和BPH-1细胞球体
198	2025-06-19	Integrin β1-rich extracellular vesicles of kidney recruit Fn1+ macrophages to aggravate ischemia-reperfusion-induced inflammation 2024-01-23, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.169885 PMID:38258908	研究论文	本文研究了肾脏缺血再灌注损伤（IRI）中细胞外囊泡（EV）携带的蛋白质如何介导近端小管细胞（PTs）与单核吞噬细胞（MP）之间的细胞间通讯	通过多组学分析结合单细胞RNA测序和肾脏EV蛋白质谱，揭示了整合素β1富集的EV在招募Fn1+巨噬细胞并加剧炎症反应中的作用	缺乏对EV分泌阻断剂GW4869作用机制的详细探讨	阐明肾脏IRI中PTs与MP之间的细胞间通讯机制	近端小管细胞（PTs）和单核吞噬细胞（MP）	细胞生物学	急性肾损伤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、蛋白质谱分析	NA	RNA测序数据、蛋白质数据	NA
199	2025-06-19	Multiomics characterization of breast angiosarcoma from an Asian cohort reveals enrichment for angiogenesis signaling pathway and tumor-infiltrating macrophages 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1515935 PMID:39872529	研究论文	该研究通过多组学方法分析了亚洲人群中的乳腺血管肉瘤（AS-B），揭示了其与头颈部血管肉瘤（AS-HN）在分子和免疫特征上的差异	首次在亚洲人群中系统描述了AS-B的临床和分子特征，并发现其与血管生成信号通路和肿瘤浸润巨噬细胞的富集相关	样本量较小（AS-B仅16例），可能影响统计效力	阐明亚洲人群中AS-B的疾病特征及其潜在治疗靶点	176例血管肉瘤患者（其中AS-B 16例）	数字病理学	乳腺癌	全基因组测序（WGS）、NanoString基因表达谱分析、10x Genomics Visium空间转录组学	NA	基因组数据、基因表达数据、空间转录组数据	176例血管肉瘤患者（AS-B 16例，AS-HN 104例）
200	2025-06-18	Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system 2026-Mar-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986 PMID:39885670	综述	本文综述了脑屏障系统中巨噬细胞的起源、发育、重要分子及功能，重点关注小胶质细胞和边界相关巨噬细胞	强调了单细胞测序技术和重要细胞标志物的最新进展	未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有文献进行综述	探讨脑屏障系统中驻留和招募巨噬细胞的作用	脑屏障系统中的巨噬细胞（包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和招募的巨噬细胞）	神经免疫学	NA	单细胞测序	NA	NA	NA