单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
181	2025-05-10	Integrating HiTOP and RDoC frameworks part II: shared and distinct biological mechanisms of externalizing and internalizing psychopathology 2025-May-09, Psychological medicine IF:5.9Q1 DOI:10.1017/S0033291725000819 PMID:40340892	研究论文	本研究通过多组学方法探讨了HiTOP框架中的外化和内化精神病理学谱系如何映射到RDoC的分析单元	整合HiTOP和RDoC框架，揭示外化和内化精神病理学的共享和独特生物学机制	研究依赖于基因组关联研究和影像数据，可能未涵盖所有相关生物学机制	理解外化和内化精神病理学的生物学基础	外化(EXT)和内化(INT)精神病理学谱系	精神病理学	精神疾病	多组学方法、全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序、磁共振成像(MRI)	NA	基因组数据、表达数据、影像数据	NA
182	2025-05-10	Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease 2025-May-08, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025337 PMID:39977705	研究论文	该研究通过单细胞测序技术在小鼠血液中定义了慢性移植物抗宿主病（cGVHD）中IL-17和CSF-1的基因表达特征，并验证了这些特征在患者中的适用性	首次在小鼠血液单核细胞中定义了非直观的IL-17和CSF-1特征，并验证了这些特征在cGVHD患者中的存在	研究样本量有限，且特征仅在70%的确诊患者和50%的后续发展患者中检测到	开发能够识别cGVHD患者中可药物干预的免疫失调的生物标志物	慢性移植物抗宿主病（cGVHD）患者和小鼠模型	生物医学研究	慢性移植物抗宿主病	单细胞测序	小鼠模型	基因表达数据	小鼠模型和部分cGVHD患者
183	2025-05-10	Isoform-resolution single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional panorama of adult Baoshan pig testis cells 2025-May-08, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-025-11636-4 PMID:40340725	研究论文	本研究通过整合长读长（Nanopore）和短读长（Illumina）单细胞RNA测序技术，揭示了成年宝山猪睾丸细胞的转录全景	首次在猪睾丸中应用长读长和短读长单细胞RNA测序技术，全面解析了睾丸细胞的异质性和精子发生的分子调控机制	研究仅针对宝山猪，结果可能不适用于其他猪种或哺乳动物	阐明猪睾丸细胞的异质性和精子发生的分子机制	成年宝山猪睾丸细胞	生殖生物学	NA	Nanopore长读长测序, Illumina短读长测序, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	11,520个单细胞和23,402个基因
184	2025-05-10	Single-cell multi-omics delineates the dynamics of distinct epigenetic codes coordinating mouse gastrulation 2025-May-08, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-025-11619-5 PMID:40340740	研究论文	本研究通过单细胞多组学技术描绘了小鼠原肠胚形成过程中不同表观遗传编码的动态变化	揭示了H3K27ac和H3K4me1标记的增强子激活与基因表达之间的'时间滞后'过渡模式，并构建了以关键转录因子为中心的基因调控网络	研究仅关注小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探索表观遗传重编程在小鼠原肠胚形成过程中的分子协调机制	小鼠胚胎在六个连续时间点的表观遗传变化	表观遗传学	先天性疾病	单细胞ChIP-seq, scRNA-seq	NA	表观遗传组数据, 转录组数据	六个时间点的小鼠胚胎样本
185	2025-05-10	Transcriptome-wide analysis reveals potential roles of CFD and ANGPTL4 in fibroblasts regulating B cell lineage for extracellular matrix-driven clustering and novel avenues for immunotherapy in breast cancer 2025-May-08, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-025-01237-y PMID:40340806	研究论文	通过转录组和基因组数据分析乳腺癌中的细胞外基质（ECM）聚类及其对肿瘤微环境的影响，并探讨ANGPTL4+和CFD+成纤维细胞作为免疫治疗潜在生物标志物的作用	首次识别了乳腺癌中三种不同的ECM聚类，并发现ANGPTL4+和CFD+成纤维细胞通过不同信号通路调控B细胞谱系，为免疫治疗提供了新的生物标志物	研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证	探索乳腺癌中ECM的组成模式及其生物学功能，并寻找免疫治疗的潜在生物标志物	乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	转录组分析、单细胞RNA测序、机器学习	NMF、WGCNA	转录组数据、基因组数据	TCGA数据库患者数据及10个独立公共队列（总计n=6,736）
186	2025-05-10	Identification of the "Collagen-Macrophage" sub-category of patients with colorectal cancer as an extension of the CMS4 subtype with THBS2 as a therapeutic target 2025-May-08, BMC gastroenterology IF:2.5Q2 DOI:10.1186/s12876-025-03918-8 PMID:40340827	研究论文	本研究通过整合结肠癌转录组和单细胞转录组数据集，识别出一类富含'胶原-TAMs'的结直肠癌患者亚群，命名为CM类，并探讨了THBS2作为治疗靶点的潜力	提出了一种新的结直肠癌患者分类系统CM类，作为传统CMS分类系统的扩展，并发现THBS2可作为免疫治疗的新潜在联合靶点	研究结果主要基于转录组数据，需要进一步的临床验证	提高结直肠癌的分类准确性和治疗效果	结直肠癌患者及其肿瘤微环境	数字病理学	结直肠癌	转录组测序、单细胞转录组测序	NA	转录组数据、单细胞数据	大规模结肠癌数据集
187	2025-05-10	High-throughput strategies for monoclonal antibody screening: advances and challenges 2025-May-08, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-025-00513-z PMID:40340930	综述	本文综述了高通量单克隆抗体筛选策略的最新进展与挑战	介绍了抗体库展示、单B细胞抗体技术和单细胞测序等新技术，显著降低了抗体开发成本并提高了效率	未具体说明这些新技术在实际应用中可能遇到的具体问题或限制	探讨高通量抗体开发的最新进展及其相对于传统方法的优势	单克隆抗体的高通量筛选技术	生物医学工程	NA	抗体库展示、单B细胞抗体技术、单细胞测序	NA	NA	NA
188	2025-05-10	Impaired ketogenesis in Leydig Cells drives testicular aging 2025-May-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59591-8 PMID:40328805	研究论文	该研究揭示了睾丸衰老过程中Leydig细胞酮生成受损的关键作用及其机制	首次发现Leydig细胞中酮生成关键酶Hmgcs2表达随年龄下降，并阐明β-羟基丁酸通过Foxo3a延缓细胞衰老的分子机制	研究主要基于小鼠模型，人类睾丸衰老的类似机制仍需验证	探究睾丸衰老的分子机制并寻找潜在治疗靶点	年轻与老年小鼠的Leydig细胞	生殖生物学	睾丸功能障碍	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	小鼠衰老模型	基因表达数据、代谢物浓度数据	年轻与老年小鼠睾丸组织及Leydig细胞
189	2025-05-10	Exploring the Mechanisms of Microenergy Acoustic Pulse Therapy for the Treatment of Female Stress Urinary Incontinence-Part II 2025-May-07, Neurourology and urodynamics IF:1.8Q3 DOI:10.1002/nau.70048 PMID:40338807	research paper	本研究探讨了微能量声脉冲（MAP）疗法在阴道分娩损伤诱导的应激性尿失禁（SUI）大鼠模型中的治疗机制	首次在单细胞分辨率下研究MAP疗法对SUI的治疗效果，揭示了其对细胞衰老的调节和肌肉神经再生的促进作用	研究基于动物模型，结果可能无法直接推广到人类	探索MAP疗法在SUI治疗中的分子机制	阴道分娩损伤诱导的SUI大鼠模型	生物医学研究	应激性尿失禁	单细胞测序、漏尿点压力测量、肌电图、电生理学研究	动物模型	基因表达数据、生理测量数据	未明确说明，但使用了大鼠模型
190	2025-05-10	Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway 2025-May-07, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808 PMID:40339488	研究论文	本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制，发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖	首次揭示了CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞增殖的新机制	研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究CTSC在银屑病中的作用及其分子机制	银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、人永生化角质形成细胞(HaCaT)	分子生物学	银屑病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、siRNA敲降	IMQ诱导的小鼠银屑病样皮炎模型	基因表达数据、细胞增殖数据	银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞
191	2025-05-10	TGF-β1 induces autophagy and mediates the effect on macrophages differentiation in primary liver cancer 2025-May-07, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114799 PMID:40339499	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和实验验证，探讨了TGF-β1在原发性肝癌中介导巨噬细胞分化和自噬的作用	首次在原发性肝癌中鉴定了四种不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并揭示了TGFB1通过自噬信号驱动巨噬细胞表型转换的机制	样本量相对较小（19例单细胞测序数据），且主要基于转录组数据，需要进一步实验验证	探究原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其分化机制	原发性肝癌患者的肿瘤相关巨噬细胞	肿瘤免疫学	原发性肝癌	scRNA-seq, IPA通路分析	NA	单细胞转录组数据	19例原发性肝癌患者的单细胞数据，428例TCGA数据
192	2025-05-10	Spatial Multi-Omics Reveals the Potential Involvement of SPP1+ Fibroblasts in Determining Metabolic Heterogeneity and Promoting Metastatic Growth of Colorectal Cancer Liver Metastasis 2025-May-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.004 PMID:40340245	研究论文	本研究通过多组学方法探讨了结直肠癌肝转移（CRLM）中关键微观区域的作用，特别是癌症相关成纤维细胞（CAFs）在促进肿瘤进展中的关键角色	发现了SPP1+成纤维细胞在CRLM中的代谢重编程能力和免疫抑制特性，及其与肿瘤细胞的相互作用	样本量较小（12个新鲜手术样本来自2名未治疗患者），可能影响结果的普遍性	为CRLM的诊断和治疗提供分子和代谢水平的见解	结直肠癌肝转移患者的手术样本和冷冻组织样本	数字病理学	结直肠癌	空间转录组学（ST）、空间代谢组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、RT-qPCR、非靶向代谢组学	NA	转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA测序数据	12个新鲜手术样本（来自2名患者）和92个冷冻组织样本（来自40名患者）
193	2025-05-10	Integrative bioinformatics and machine learning identify key crosstalk genes and immune interactions in head and neck cancer and Hodgkin lymphoma 2025-May-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99017-5 PMID:40328901	research paper	该研究通过整合生物信息学和机器学习技术，识别头颈癌和霍奇金淋巴瘤中的关键交叉基因和免疫相互作用	首次探索头颈癌和霍奇金淋巴瘤之间的分子交叉作用，并利用机器学习算法筛选关键生物标志物	研究依赖于公开数据集，未进行实验验证	阐明头颈癌和霍奇金淋巴瘤的共享分子机制，识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点	头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和霍奇金淋巴瘤(HL)	生物信息学	头颈癌, 霍奇金淋巴瘤	RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA)	LASSO回归, 随机森林, SVM-RFE	RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据	NA
194	2025-05-10	Recurrence of acute allergic asthma depends on the role of ILC2 driven by Il1rl1 signaling 2025-May-06, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02220-0 PMID:40329299	研究论文	研究通过建立急性过敏性哮喘复发小鼠模型，揭示了ILC2s通过Il1rl1信号通路在哮喘复发中的关键作用	首次发现ILC2s通过Il1rl1信号通路驱动急性过敏性哮喘的复发，并验证了Il1rl1缺失可显著抑制哮喘复发	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	探索哮喘复发的细胞和分子机制，寻找预防哮喘恶化的新治疗策略	急性过敏性哮喘小鼠模型	免疫学	哮喘	单细胞转录组学、流式细胞术、基因敲除实验	小鼠模型	转录组数据、流式细胞数据	NA
195	2025-05-10	Investigating the mechanisms by which low NAT1 expression in tumor cells contributes to chemo-resistance in colorectal cancer 2025-May-06, Clinical epigenetics IF:4.8Q1 DOI:10.1186/s13148-025-01882-4 PMID:40329330	研究论文	研究低NAT1表达在结直肠癌细胞中如何导致化疗耐药性的机制	揭示了NAT1在调节化疗敏感性、细胞代谢和血管生成中的多方面作用，并提出了NAT1作为生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和生物信息学分析，临床前和临床验证仍需进一步研究	评估NAT1在介导结直肠癌化疗耐药性中的作用，寻找克服这一临床挑战的新策略	结直肠癌细胞系CaCO2和HCT116，以及肿瘤组织和邻近正常组织	癌症研究	结直肠癌	生物信息学分析、代谢组学、下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Cellchat检测、Western blot	NA	基因表达数据、代谢数据、蛋白质数据	结直肠癌细胞系和肿瘤组织样本
196	2025-05-10	Fenofibrate inhibits activation of cGAS-STING pathway by alleviating mitochondrial damage to attenuate inflammatory response in diabetic dry eye 2025-May-06, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.383 PMID:40339725	研究论文	本研究探讨了cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼病(DDE)中的作用，并研究了非诺贝特酸的治疗效果及其机制	首次揭示了cGAS-STING信号通路在DDE发病机制中的关键作用，并发现非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路，为DDE治疗提供了新策略	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未进行人体临床试验	探究cGAS-STING信号通路在DDE中的作用及非诺贝特酸的治疗机制	糖尿病干眼病(DDE)小鼠模型和永生化人角膜上皮细胞(HCE-T)	分子病理学	糖尿病干眼病	单细胞RNA测序	STZ诱导的DDE小鼠模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量，使用了GEO数据库数据和实验模型
197	2025-05-10	RNA research for drug discovery: Recent advances and critical insight 2025-May-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149342 PMID:39983851	综述	本文综述了RNA研究在药物发现领域的最新进展和关键见解	强调了RNA研究在开发新型治疗药物中的关键作用，包括ASOs、mRNA疗法和RNAi等重大发现	RNA稳定性、递送和脱靶效应等挑战仍然存在，需要持续创新和伦理考量	探讨RNA研究在药物发现中的现状和前景	RNA生物学及其在治疗应用中的复杂性	药物发现	多种疾病	高通量测序、单细胞RNA测序、表观转录组学	NA	RNA序列数据	NA
198	2025-05-10	Propionate alleviates diabetes-induced cardiac fibrosis in mice via regulating Serpinf1 2025-05-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151641 PMID:40203653	研究论文	本研究探讨了丙酸盐对糖尿病小鼠心脏纤维化的治疗作用及其机制	发现丙酸盐通过上调Serpinf1基因表达，抑制Wnt信号通路异常激活，改善糖尿病心脏纤维化	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究丙酸盐对糖尿病心脏纤维化的治疗效果及分子机制	链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型和原代小鼠心脏成纤维细胞	心血管疾病	糖尿病心肌病	单细胞RNA测序、shRNA敲低实验	小鼠糖尿病模型	RNA测序数据、生化检测数据	未明确说明小鼠数量
199	2025-05-10	Lipopolysaccharide alters cell communication at the maternal-fetal interface revealed by single-cell RNA-sequencing 2025-May-04, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143939 PMID:40328399	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了脂多糖（LPS）诱导的炎症对母胎界面细胞组成、细胞间相互作用及关键信号通路的影响	首次利用单细胞RNA测序技术揭示了LPS如何改变母胎界面的细胞通讯及信号通路	研究仅关注了LPS诱导的炎症效应，未涉及其他类型细菌感染的影响	探究LPS诱导的炎症对母胎界面细胞通讯的影响	母胎界面组织中的各类细胞	单细胞测序	妊娠相关疾病	scRNA-Seq	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，涉及多种细胞类型包括子宫内膜上皮细胞、基质细胞、成纤维细胞等
200	2025-05-10	Delivery of Itgb1-siRNA by triptolide-modified and anti-Flt1 peptide-guided ionizable cationic LNPs for targeted therapy of corneal neovascularization 2025-May-03, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113811 PMID:40324532	研究论文	本研究开发了一种新型的Itgb1-siRNA载药系统，用于治疗角膜新生血管	结合了抗Flt1肽引导和雷公藤甲素修饰的可离子化阳离子脂质纳米颗粒（icLNPs），提高了靶向性和抗炎效果	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	开发一种新型、非侵入性且有效的角膜新生血管治疗方法	角膜新生血管（CoNV）	生物医学工程	眼科疾病	单细胞测序、siRNA递送系统	小鼠模型	实验数据	小鼠模型