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当前共找到 40705 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2026-06-19
Prostaglandin E2-driven dedifferentiation of Schwann cells leads to perineural invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-07, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 该研究通过整合RNA测序、空间转录组学和临床样本单细胞分析,发现神经侵犯区域显著富集去分化雪旺细胞并上调关键标志物,证明胰腺癌细胞通过PGE₂驱动雪旺细胞去分化并分泌促侵袭因子(LIF和ADAMTS-1),形成有利于神经侵犯的微环境 首次揭示肿瘤来源的PGE₂通过PTGES-SC轴驱动雪旺细胞去分化,并识别LIF和ADAMTS-1作为关键促侵袭因子,为胰腺癌神经侵犯提供了全新治疗靶点 NA 阐明胰腺导管腺癌中雪旺细胞去分化促进神经侵犯的分子机制及潜在治疗靶点 胰腺癌临床标本及PANC-1和BxPC-3细胞系 数字病理学 胰腺导管腺癌 RNA测序, 空间转录组学, 单细胞分析 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 临床样本(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
182 2026-06-19
A comprehensive benchmarking study on computational tools for cross-omics label transfer from single-cell RNA to ATAC data
2026-04-01, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 对27种从单细胞RNA数据向ATAC数据进行跨组学标签转移的计算工具进行了全面基准测试 首次系统地评估了27种跨组学标签转移工具,涵盖多种人类和小鼠组织数据,并揭示了数据平衡性、跨组学差异等影响模型性能的关键因素 研究主要依赖于公开数据集,可能未覆盖所有可能的生物学场景;方法性能受数据质量和预处理方式影响较大 系统评估和比较计算工具在单细胞RNA到ATAC数据标签转移中的表现,为未来方法开发提供建议 来自多种人类和小鼠组织的单细胞RNA和ATAC数据 机器学习 NA 单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) Bridge、GLUE、bindSC等深度学习模型 单细胞基因表达数据(scRNA-seq)和染色质可及性数据(scATAC-seq) 使用多种人类和小鼠组织数据集,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA NA
183 2026-06-19
Topological Data Analysis for Unsupervised Feature Selection in Large Scale Spatial Omics Data Sets
2026-Mar-04, Bulletin of mathematical biology IF:2.0Q3
研究论文 应用持续同调(一种拓扑数据分析方法)进行大规模空间组学数据的无监督特征选择,并展示其在空间可变基因识别等下游任务中的应用 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组学特征选择,提供连续的基因空间结构量化指标,并证明其在不同空间组学模态(如空间代谢组学)中的自然扩展性 未提及具体局限性 开发一种基于拓扑数据分析的无监督特征选择方法,用于大规模空间组学数据集中空间结构量化与空间可变基因识别 公共空间转录组学数据中的肾脏疾病和心肌梗死样本,以及空间代谢组学样本 计算机视觉, 机器学习 肾脏疾病, 心血管疾病 空间转录组学, 空间代谢组学 持续同调 空间转录组数据, 空间代谢组数据 未明确提及具体样本数量 NA 空间转录组学, 空间代谢组学 NA NA
184 2026-06-19
EMP1-driven ferroptosis in liver sinusoidal endothelial cells exacerbates hepatic ischemia-reperfusion injury via P38 MAPK
2026-02-16, Free radical biology & medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序发现EMP1通过P38 MAPK通路驱动肝窦内皮细胞铁死亡,加剧肝缺血再灌注损伤 首次揭示肝窦内皮细胞铁死亡在肝缺血再灌注损伤中的直接致病作用,并建立EMP1/p38信号轴为核心机制 信息未提供,暂按NA处理 阐明肝窦内皮细胞铁死亡在肝缺血再灌注损伤中的分子机制及EMP1的致病作用 人体肝脏移植组织、肝窦内皮细胞和BRL3A肝细胞 数字病理学 肝缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序, siRNA沉默, 铁死亡调控, p38信号干预 NA 单细胞转录组数据 正常对照与移植诱导的缺血再灌注损伤人体肝脏样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
185 2026-06-19
Single-cell characterization of the gastrointestinal HIV reservoir reveals heterogeneous cellular phenotypes
2026-02-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序表征胃肠道HIV储库,揭示其异质性细胞表型和区室特异性基因表达模式 首次在单细胞水平系统描述胃肠道组织HIV储库的细胞异质性,发现vRNA+细胞在Th17和Treg17表型中富集,并鉴定出116个与HIV感染相关的差异表达基因 样本量较小(10人),缺乏功能性验证实验,未明确区分潜伏感染与活跃复制的病毒 阐明胃肠道组织中HIV-1病毒储库的细胞特征及其与血液样本的差异 来自10名接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者的胃肠道组织和外周血单核细胞 机器学习 艾滋病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10名HIV感染者 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
186 2026-06-19
Joint modeling of cellular heterogeneity and condition effects with scPCA in single-cell RNA-seq
2026-Feb-04, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出scPCA框架,联合建模单细胞RNA-seq中的细胞异质性和条件效应 在传统线性降维方法中整合研究协变量,实现细胞异质性与条件效应的联合建模,揭示跨条件和成分的转录变化 方法主要针对scRNA-seq数据验证,在互作效应复杂或多条件下的扩展性需进一步评估 开发灵活降维框架,同时分析细胞异质性和处理效应 单细胞RNA-seq数据中多种实验条件下的细胞群体 机器学习 NA 单细胞RNA测序 PCA(主成分分析) 基因表达数据 多条件实验:包括未刺激和IFNβ处理的PBMC、啮齿类肺细胞、去极化视觉皮层神经元、CRISPR-Cas9敲除斑马鱼单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
187 2026-06-19
CD8+ T cells in the tumor microenvironment modulate the response to endocrine therapy in breast cancer
2026-02-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究分析了肿瘤免疫微环境中CD8+ T细胞如何调节激素受体阳性乳腺癌对内分泌治疗的反应 首次揭示CD8+ T细胞及其相关趋化因子CXCL11在调控HR+乳腺癌对雌激素剥夺治疗耐药中的具体机制 研究主要基于体外细胞共培养模型和临床样本分析,缺乏体内动物模型验证 阐明肿瘤免疫微环境在调节HR+乳腺癌对芳香化酶抑制剂治疗反应中的作用机制 HR+乳腺癌患者治疗前后的活检组织样本、MCF7和T47D乳腺癌细胞系 肿瘤免疫学 乳腺癌 RNA-Seq, 循环免疫荧光, 空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 HR+乳腺癌患者治疗前后配对活检样本(具体数量未在摘要中提供) NA 空间转录组学 NA NA
188 2026-06-19
Diabetes exacerbates destructive inflammation by activating the CD137L-CD137 axis in dendritic and IL-17+ T cells
2026-02-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病通过激活树突状细胞中的CD137L和IL-17+ T细胞中的CD137轴,加剧牙周炎中的破坏性炎症 首次发现高血糖通过CD137L-CD137轴驱动树突状细胞与IL-17+ T细胞相互作用,加剧炎症性组织破坏,并鉴定该通路为潜在治疗靶点 NA 探究糖尿病如何加剧牙周炎中对细菌的炎症反应,并揭示其分子机制 小鼠模型和人类样本中的牙周炎与糖尿病相互作用 机器学习和单细胞组学 牙周炎、糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
189 2026-06-19
Spatial multi-omics in precision medicine: Integrating biological insights through multidisciplinary collaboration
2026-02, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1
综述 本文综述了空间多组学技术在精准医学中的应用,涵盖数据获取、质量管理及多模态整合策略 系统整合了空间转录组学作为框架的多组学数据与组织细胞架构对齐方法,并聚焦肿瘤微环境中的异质性、免疫-基质相互作用及代谢表观遗传动态 面临技术噪声、批次效应及高维数据整合复杂性等挑战,临床转化中需解决数据隐私和AI伦理问题 阐述空间多组学在肿瘤生物学中的应用潜力,促进精准医学发展 空间多组学技术及其在肿瘤微环境研究中的应用 生物医学 肿瘤 NA NA NA NA NA 空间多组学技术, 空间转录组学, 空间基因组学, 空间表观组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 NA NA
190 2026-06-19
Integrative spatial omics and artificial intelligence: transforming cancer research with omics data and AI
2026-02, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1
综述 本文探讨了整合空间组学与人工智能在癌症研究中的应用,特别是空间转录组学和空间蛋白组学与AI驱动的计算模型如何推动癌症精准医疗的发展 系统性地综述了空间组学(包括空间转录组学和空间蛋白组学)与AI计算模型的整合应用,重点强调了空间图理论、拓扑数据分析和基于智能体的建模等先进数学框架在解决数据整合和生物学洞察中的关键作用 高维数据复杂性、计算约束和分析流程标准化不足是主要挑战,同时空间分辨率和跨平台数据协调也有待提升 探索空间组学与AI在癌症研究中的整合应用,推动精准肿瘤学发展 肿瘤微环境中的空间组学数据和AI计算模型 数字病理学 癌症 空间组学, 空间转录组学, 空间蛋白组学 深度学习模型, 空间图分析, 拓扑数据分析, 基于智能体建模 图像, 文本 NA 10x Genomics, Illumina 空间转录组学, 空间蛋白组学 10x Visium, Illumina NovaSeq 空间条形码、原位测序、数字空间分析平台
191 2026-06-19
Stereo-cell deciphers the spatial and functional heterogeneity of polyploid hepatocytes
2026-Jan-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 利用Stereo-cell技术解析多倍体肝细胞的空间和功能异质性 开发了基于成像的倍性识别(SCIPI)技术流程,整合明场细胞轮廓识别、DAPI核面积与数量量化以及UMI标记单细胞转录组学,实现六种核心肝细胞亚型的精确鉴定 未提及明显局限性 探索二倍体、四倍体和八倍体肝细胞之间的功能差异,揭示多倍体肝细胞的转录组和功能异质性 多倍体肝细胞(包括二倍体、四倍体、八倍体及其单核与双核亚型) 数字病理学 NA 空间分辨单细胞测序 NA 图像与转录组数据 NA NA 单细胞转录组学 Stereo-cell Stereo-cell成像倍性识别技术(SCIPI)
192 2026-06-19
Targeting the N-acetyltransferase 10/DKK2 axis enhances CD8+ T cell antitumor activity in colorectal cancer models
2026-01-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 揭示NAT10通过ac4C依赖性mRNA稳定促进结直肠癌免疫逃逸,靶向NAT10/DKK2轴增强CD8+ T细胞抗肿瘤活性 首次阐明NAT10通过ac4C修饰稳定DKK2 mRNA调控CD8+ T细胞功能障碍的分子机制,并验证其与抗PD-1治疗的协同作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证NAT10抑制剂的治疗效果 研究NAT10在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫调节作用及其作为治疗靶点的潜力 结直肠癌细胞、小鼠模型(MC38/CT-26)、肠上皮细胞特异性Nat10敲除小鼠、患者来源类器官和临床标本 机器学学 结直肠癌 单细胞RNA测序、多组学整合分析 NA 图像、文本 使用MC38/CT-26同源小鼠模型、Nat10cKO小鼠、患者来源类器官和临床标本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
193 2026-06-19
Non-invasive radiogenomic mapping of the SMARCAL1-driven ferroptotic niche is associated with longitudinal MRD-negative surveillance in early-stage NSCLC
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过术前CT影像组学特征构建Rad-Score,非侵入性捕捉SMARCAL1驱动的铁死亡免疫微环境,并与早期非小细胞肺癌术后持续MRD阴性监测相关 首次将术前CT影像组学特征与SMARCAL1驱动的铁死亡免疫微环境空间组织相关联,建立非侵入性预测术后持续MRD阴性的放射组学评分,并通过空间转录组学、CRISPR-Cas9敲除和功能验证确认机制 单中心回顾性队列研究,样本量有限(71例患者),需前瞻性验证;Rad-Score在外部验证中性能略有下降(C-index从0.812降至0.741-0.783) 探讨术前CT影像组学特征能否非侵入性捕捉与术后持续MRD阴性相关的铁死亡富集、免疫活跃的肿瘤微环境空间组织 完全切除的IB-IIIA期非小细胞肺癌患者(71例),术后两个时间点MRD阴性 计算机视觉 非小细胞肺癌 CT成像, 全外显子测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 免疫组化, CRISPR-Cas9敲除 NA 图像, 文本 71例患者(14例用于空间转录组学,40例用于多重免疫荧光,60例用于免疫组化) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学
194 2026-06-19
Multisite Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single-Cell RNA Sequencing
2026, Journal of biomolecular techniques : JBT
研究论文 通过跨平台、多中心研究评估三种细胞保存方法(10x Genomics FLEX、Parse Biosciences Evercode WT v2、Honeycomb Bio HIVE)在上游单细胞RNA测序中的性能和可重复性 首次进行多平台、多中心的系统性比较,评估不同细胞保存方法对单细胞RNA测序结果的影响,并为研究者提供选择最合适保存工作流程的资源 平台特异性的表达特征存在于部分基因亚组,且FLEX工作流程在站点样本处理中表现出更高的技术变异性 评估和比较不同商业细胞保存方法在单细胞RNA测序中的性能、可重复性和适用性 从单一健康个体分离的总白细胞和外周血单核细胞(PBMCs) 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1位健康个体的细胞样本,包括总白细胞和PBMCs,由2名技术人员并行制备 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Bio 单细胞RNA测序 10x Chromium, Parse Biosciences Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE 10x Chromium Single Cell 3' v3.1 (3pGEX) 化学试剂作为参考,FLEX和HIVE为保存方法
195 2026-06-19
Metabolic Reprogramming in Recurrent Spontaneous Abortion: Key Biomarkers Identification and Diagnostic Model Development
2026 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 本研究整合多个数据集,通过生物信息学方法鉴定与复发性流产相关的代谢重编程关键生物标志物,并构建诊断模型 首次从代谢重编程角度系统识别复发性流产的诊断生物标志物,结合多种机器学习算法构建诊断模型,并通过单细胞测序和体外实验验证免疫-代谢互作关系 未提及具体局限性 探究复发性流产中的代谢重编程机制,鉴定诊断生物标志物并构建诊断模型 复发性流产患者及其蜕膜组织样本 机器学习 复发性流产 RNA测序, 单细胞RNA测序, PCR, 蛋白质印迹, CCK-8, Transwell实验 逻辑回归, 支持向量机递归特征消除, 最小绝对收缩和选择算子 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 GSE26787和GSE165004数据集(具体样本数未提供),GSE214607单细胞RNA测序数据集 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
196 2026-06-19
The "Three-Tier Regulatory Network" of Orthokeratology in Myopia Control: Evidence Weight of Underlying Mechanisms, Controversies, and New Perspectives for Clinical Translation--A Review
2026, Clinical ophthalmology (Auckland, N.Z.)
综述 本文系统综述了角膜塑形镜控制近视的机制,并提出基于证据权重的“初始驱动-中间信号整合-终端效应”三级调控网络模型 创新性地提出了基于证据权重的三级调控网络模型,整合了光学离焦、角膜生物力学、神经血管调节和分子信号通路等多途径协同调控机制 文中指出当前领域存在关键争议(如个体反应差异),但未详细讨论自身研究方法的局限性 系统梳理角膜塑形镜延缓近视进展的核心机制,并为临床转化和个性化治疗策略提供可行建议 角膜塑形镜及其控制近视的机制 NA 近视 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
197 2026-06-19
Metabolic reprogramming of glutamine is associated with M2 macrophage polarization in allergic rhinitis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 结合人类鼻黏膜代谢组学、动物模型、单细胞转录组学和蛋白质分析,探究谷氨酰胺在过敏性鼻炎病理生理中的作用 首次发现谷氨酰胺与过敏性鼻炎中M2型巨噬细胞极化及FGFR1的非经典修饰相关联,提出免疫代谢调控鼻黏膜微环境的新机制 研究结果仅为假设生成性质,关联模型需进一步验证因果关系 探究代谢信号如何整合到过敏性鼻炎的免疫信号中 过敏性鼻炎患者鼻黏膜组织、小鼠模型、巨噬细胞 数字病理学 过敏性鼻炎 代谢组学分析、单细胞转录组测序、批量RNA测序、蛋白质检测 NA 代谢组数据、单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 人类鼻黏膜样本(数量未明确)、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
198 2026-06-19
Swimming ameliorates intervertebral disc degeneration accompanied by Rpl23a downregulation and changes in its immune-inflammatory pathway
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了核糖体蛋白L23a在椎间盘退变中调控免疫相互作用的机制,并评估了游泳运动干预对该信号轴的影响 首次揭示了Rpl23a在椎间盘免疫微环境中的作用及其通过NF-κB通路介导的炎症机制,并证实游泳运动可通过下调Rpl23a改善椎间盘退变 未提及具体局限性 研究Rpl23a在椎间盘退变免疫相互作用中的机制,并评估运动干预的调控效果 大鼠椎间盘退变模型及体外细胞实验 机器学习 椎间盘退变 RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 两个公开数据集(GSE189551, GSE153066)及大鼠体内实验 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
199 2026-06-19
Pan-Cancer Analysis of a Depression-Related Gene Signature Identifies an Immunosuppressive Tumor Microenvironment and Links to Immunotherapy Response in Breast Cancer
2026, Breast cancer (Dove Medical Press)
研究论文 通过泛癌分析抑郁相关基因特征,发现其与免疫抑制性肿瘤微环境及乳腺癌免疫治疗反应相关 首次系统探讨抑郁相关基因特征在33种癌症中的表达模式及其与肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应的关系,并识别出CACNA1H作为重要候选基因 基于公共数据库的分析需进一步实验验证;抑郁相关基因特征的临床转化价值需更多前瞻性研究 探究抑郁相关基因特征在不同癌症中的分子和免疫相关性,特别是其与肿瘤微环境、免疫治疗反应的关系 TCGA中33种癌症类型的超过10,000个肿瘤样本 机器学习 乳腺癌 单样本基因集富集分析 NA 基因表达数据 超过10,000个肿瘤样本,来自33种癌症类型 NA NA NA NA
200 2026-06-19
Intrinsic elaboration of prefrontal modularity: a dual-control model of axon bundling and synaptic docking
2026, Frontiers in neuroanatomy IF:2.1Q3
综述 本文综合经典神经解剖学框架与空间转录组学和连接组学的最新进展,提出了前额叶皮质模块化内在精细化的双控制模型 提出了前额叶皮质通过轴突束化和突触对接的双控制模型实现内在精细化的新框架,强调共享分子工具包的组合逻辑而非新基因的作用 主要基于经典神经解剖学数据与组学数据的整合推断,缺乏直接的实验验证该模型的具体机制 揭示前额叶皮质在缺乏直接感觉模板的情况下如何实现高度有序模块化架构的机制 前额叶皮质的模块化架构及其与视觉系统、嗅觉系统、海马体的对比分析 数字病理学 NA 空间转录组学, 连接组学, 轴突束化成像 NA 转录组数据, 连接组数据 NA NA 空间转录组学, 连接组学 NA NA
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