单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32645 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-11-15 |
Single-cell transcriptional landscape of liver transplant rejection reveals tissue persistence of clonally expanded, treatment-resistant T cells
2025-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2025.08.004
PMID:40812614
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫组库分析揭示肝移植排斥中克隆扩增的CD8 T细胞在组织中的持续存在 | 首次在肝移植排斥中系统描绘了克隆扩增的CD8 T细胞的转录景观，发现这些细胞在组织学排斥缓解后仍持续存在 | 样本量相对有限（30例），仅针对儿科患者，需要进一步验证 | 研究肝移植排斥中CD8 T细胞的克隆扩增、组织持续性和基因表达特征 | 儿科肝移植患者的肝脏活检组织 | 单细胞组学 | 肝移植排斥 | 单细胞RNA测序，免疫组库分析 | MultiNicheNet分析 | 单细胞转录组数据，免疫组库数据 | 30例冷冻保存的肝脏活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-11-15 |
Immune cell dynamics and their role in cardiac injury: Mechanisms and therapeutic implications
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118608
PMID:41016152
|
综述 | 本文系统阐述了免疫细胞在心脏损伤中的动态变化机制及其治疗意义 | 整合单细胞转录组学、空间组学、免疫代谢和神经内分泌-免疫相互作用等多维度数据，提出精准免疫治疗框架 | NA | 阐明免疫细胞在心血管疾病中的动态作用机制及治疗策略 | 中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、T细胞等免疫细胞及其与心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞的相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2025-11-15 |
Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 2
2025-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02857-2
PMID:41145665
|
研究论文 | 本研究开发了CytoTRACE 2深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据预测细胞发育潜能 | 提出了可解释的深度学习框架CytoTRACE 2，在预测发育层次结构方面优于现有方法 | NA | 预测细胞的绝对发育潜能和分化能力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-11-15 |
Spatial immune landscapes of the human placenta: Biomarkers and therapeutic insights in pregnancy disorders
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118688
PMID:41160999
|
研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学技术揭示人类胎盘的免疫景观及其在妊娠疾病中的生物标志物和治疗潜力 | 首次利用空间分析技术解析胎盘微环境中免疫细胞与滋养细胞的相互作用空间组织 | 未整合多组学和纵向分析数据 | 研究胎盘微环境在妊娠疾病中的免疫调控机制 | 人类胎盘组织 | 空间转录组学 | 妊娠疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间基因表达数据, 空间蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 185 | 2025-11-15 |
Osteopontin inhibitor alleviates neuroinflammation after subarachnoid hemorrhage in rats via TLR4/NF-κB pathway
2025-Nov, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨骨桥蛋白抑制剂通过TLR4/NF-κB通路减轻大鼠蛛网膜下腔出血后神经炎症的作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现蛛网膜下腔出血大鼠颞叶组织中SPP1（OPN）显著增加，并验证OPN抑制剂通过TLR4/NF-κB通路发挥神经保护作用 | 研究仅使用大鼠模型，样本量未明确说明，缺乏临床验证 | 研究骨桥蛋白抑制剂对蛛网膜下腔出血后神经炎症的保护作用 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，脑立体定向注射，免疫荧光 | 动物模型 | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-11-15 |
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence by assessing the immunosuppressive properties of tumors
2025-Nov-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0326
PMID:41186269
|
研究论文 | 本研究开发了Sig27基因面板及其衍生面板Sig27IMG，用于评估前列腺癌复发风险并揭示肿瘤的免疫抑制特性 | 首次提出27基因面板Sig27及其衍生5基因面板Sig27IMG，能够通过评估肿瘤相关单核/巨噬细胞、树突状细胞和内皮细胞的免疫抑制特性来预测前列腺癌复发 | 研究基于回顾性数据集，需要前瞻性研究验证临床实用性 | 开发基因标志物面板用于前列腺癌复发风险分层和免疫抑制特性评估 | 前列腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 基因面板评分系统 | 基因表达数据 | 3,133个肿瘤样本（批量RNA-seq），53名患者（单细胞RNA-seq），后续扩展到5,672名患者（17种癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2025-11-15 |
The role of hypothyroidism in cirrhosis pathogenesis: A retrospective cohort study and multi-omics integration analysis
2025-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011947
PMID:41202080
|
研究论文 | 本研究通过回顾性队列分析和多组学整合分析揭示了甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系及潜在分子机制 | 首次揭示甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系，发现HLA-DQA1和CD27作为潜在治疗靶点，并鉴定甘草酸和左甲状腺素钠为候选药物 | 研究主要基于回顾性数据和遗传分析方法，需要进一步实验验证 | 探讨甲状腺功能减退在肝硬化发病机制中的作用 | 肝硬化患者和甲状腺功能减退患者 | 多组学整合分析 | 肝硬化 | 连锁不平衡评分回归，孟德尔随机化，转录组关联研究，加权基因共表达网络分析，单细胞RNA测序，分子对接 | 孟德尔随机化模型，基因共表达网络模型，分子对接模型 | 临床数据，遗传数据，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 基于Medical Information Mart for Intensive Care临床数据库的纵向数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-11-15 |
Monod: model-based discovery and integration through fitting stochastic transcriptional dynamics to single-cell sequencing data
2025-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02832-x
PMID:41203866
|
研究论文 | 提出一种基于物理模型的方法Monod，通过拟合随机转录动力学来分析单细胞RNA测序数据 | 利用单细胞RNA测序数据的随机性、规模和多模态特性，在生物物理转录模型下整合新生和成熟RNA计数 | NA | 揭示基础调控过程并区分数据的生物学和技术层面 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机转录动力学模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-11-15 |
Curcumin-chitosan microspheres inhibit epithelial cell PANoptosis: analysis of key PANoptosis gene distribution via single-cell RNA sequencing and in vivo validation in ulcerative colitis mice
2025-Nov, General physiology and biophysics
IF:1.3Q4
DOI:10.4149/gpb_2025030
PMID:41217223
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内实验验证姜黄素-壳聚糖微球通过抑制上皮细胞PANoptosis改善溃疡性结肠炎 | 首次揭示姜黄素-壳聚糖微球通过调控肠上皮细胞PANoptosis缓解溃疡性结肠炎的机制 | NA | 探究姜黄素-壳聚糖微球对溃疡性结肠炎的治疗作用机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和Caco-2细胞系 | 单细胞测序 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2025-11-15 |
Single-cell transcriptome atlas unveils transcriptional regulation networks of banana root tips in response to Fusarium oxysporum infection
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf220
PMID:41220693
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了香蕉根尖响应尖孢镰刀菌感染的转录调控网络 | 首次构建香蕉根尖单细胞转录图谱，发现周鞘细胞是TR4感染下的主要响应细胞类型，并鉴定出MaKAN4调控锌依赖性基因模块的关键作用 | NA | 解析香蕉根尖细胞类型对尖孢镰刀菌感染的转录响应机制 | 香蕉根尖细胞 | 单细胞生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 19个细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-11-14 |
Characteristics of ectopic alveolar basal cells relative to airway basal cells in fibrosis
2025-Nov, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.01259-2024
PMID:41220820
|
研究论文 | 本研究通过比较间质性肺病患者中异位肺泡基底细胞与气道基底细胞的特性，探索其起源和功能差异 | 首次在相同ILD患者中同时分离和比较肺泡与气道基底细胞，揭示两者在转录组和类器官形成能力上的差异 | 样本来源于活检组织，数量有限；动物模型使用博来霉素损伤小鼠，可能不完全反映人类疾病情况 | 阐明间质性肺病中异位肺泡基底细胞的起源和功能特性 | 间质性肺病患者的肺泡基底细胞和气道基底细胞 | 单细胞生物学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序，实时荧光定量PCR，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 来自ILD患者的经支气管和气道黏膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-11-15 |
Advancing Precision Medicine in Inflammatory Skin Disease
2025-Nov, American journal of clinical dermatology
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s40257-025-00963-7
PMID:40819342
|
观点文章 | 探讨精准医学在炎症性皮肤病治疗中的应用前景与挑战 | 提出将分子表型分析与传统临床病理诊断相结合的新型诊疗范式 | 生物标志物验证有限、成本高昂、研究队列广度不足 | 推动精准医学在皮肤病学领域的整合应用 | 慢性炎症性皮肤病患者 | 精准医学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 分子表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 193 | 2025-11-15 |
Enhancing Spatial Transcriptomics via Spatially Constrained Matrix Decomposition with EDGES
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508346
PMID:40842021
|
研究论文 | 开发了一种名为EDGES的空间约束矩阵分解框架，用于增强空间转录组学数据的分析和解释 | 提出结合空间信息的图拉普拉斯正则化方法，同时整合细胞表征和基因特异性表征，确保预测基因表达与真实ST分布紧密匹配 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 解决成像基空间转录组技术在基因检测能力和表达谱测量准确性方面的限制 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，非负矩阵分解 | 图拉普拉斯正则化，非负矩阵分解框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2025-11-15 |
Ubiquitous dysregulation of the Wnt pathway in immune thrombocytopenia genetic susceptibility
2025-Nov, Blood vessels, thrombosis & hemostasis
DOI:10.1016/j.bvth.2025.100107
PMID:41235340
|
研究论文 | 本研究通过功能基因组学和单细胞RNA测序分析，揭示了Wnt信号通路在免疫性血小板减少症中的广泛失调 | 首次通过单细胞水平分析证明Wnt信号通路在ITP中的多细胞类型特异性失调模式 | 研究主要基于遗传关联和表达分析，功能验证实验相对有限 | 探究Wnt信号通路在免疫性血小板减少症发病机制中的作用 | 免疫性血小板减少症患者和健康对照 | 基因组学 | 免疫性血小板减少症 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 功能基因组学 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-11-15 |
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study
2025-Nov, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251383288
PMID:41235474
|
研究论文 | 本研究应用机器学习技术分析结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的关联 | 首次结合机器学习与单细胞RNA测序技术系统揭示结直肠癌中基因表达特征与免疫细胞浸润的复杂关系 | NA | 探究结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的关联及其临床意义 | 结直肠癌患者的基因表达数据和免疫细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 聚类分析, 生存分析, 基因富集分析 | 预后模型, 聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2025-11-15 |
Specificity of brassinosteroid perception and its integration at signaling crossroads in vascular development
2025-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70570
PMID:41235729
|
综述 | 本文综述了油菜素甾醇信号感知的特异性及其在维管发育信号交叉点的整合机制 | 揭示了BR感知主要具有细胞自主性和强烈环境依赖性，并作为模块化局部调节器通过经典和非经典途径协调植物发育 | NA | 探讨BR信号感知特异性及其与其他信号通路的整合机制 | 植物维管发育过程中的BR信号通路 | 植物分子生物学 | NA | 组织特异性CRISPR、先进成像技术、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-11-15 |
Niche environment remodeling promotes long-term endometrium stromal stem cell engraftment and tissue regeneration in thin endometrium
2025-Oct-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.053
PMID:41176621
|
研究论文 | 通过改造干细胞微环境提高子宫内膜基质干细胞移植效率并促进薄型子宫内膜组织再生 | 提出通过免疫抑制和血管重建双重策略改造干细胞微环境，显著提高子宫内膜基质干细胞移植存活率 | 研究主要基于大鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 开发治疗薄型子宫内膜的新型干细胞疗法 | 大鼠薄型子宫内膜模型和人类子宫内膜基质干细胞 | 再生医学 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序，mRNA工程，异种移植模型 | 动物模型 | 基因表达数据，病理数据 | 大鼠模型和人类干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-11-15 |
YTHDF1 regulates YTHDF2 stability via m6A-dependent mechanisms in hepatocellular carcinoma: insights from in vitro, in vivo, and multi-cohort clinical studies
2025-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-2025-363
PMID:41220748
|
研究论文 | 本研究揭示YTHDF1通过m6A依赖性机制调控YTHDF2稳定性促进肝细胞癌进展 | 首次发现YTHDF1通过m6A依赖性方式增强YTHDF2的mRNA稳定性和翻译效率，并揭示两者在肝细胞癌中的空间共表达模式 | 未明确说明样本规模和研究人群的详细特征 | 探索YTHDF同源蛋白在肝细胞癌中的调控网络和临床相关性 | 肝细胞癌组织、YTHDF蛋白家族 | 分子生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学、空间转录组学、Western blot、实时定量PCR、RNA免疫沉淀、e-CLIP测序、双荧光报告基因检测、RNA稳定性实验 | NA | 蛋白质表达数据、RNA表达数据、空间转录组数据、临床预后数据 | 两个临床队列的肝细胞癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 199 | 2025-11-15 |
Deciphering the potential pathogeny of rare tracheal adenoid cystic carcinoma by single-cell RNA-sequencing
2025-Oct-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2025-832
PMID:41234575
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术深入分析罕见气管腺样囊性癌的分子特征和发病机制 | 首次对气管腺样囊性癌进行单细胞RNA测序分析，发现纤毛上皮细胞可能是肿瘤起源，并识别出MIF-CD74信号通路的关键作用 | 样本量较小（单细胞RNA测序仅1例患者，mIHC验证4例患者） | 阐明气管腺样囊性癌的分子特征和发病机制，为治疗策略提供依据 | 气管腺样囊性癌患者的外周血、肿瘤组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 气管腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序, 荧光多重免疫组化, 生物信息学分析 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据, 免疫组化图像数据 | 1例患者进行单细胞RNA测序，4例患者进行mIHC验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-11-15 |
Single-cell RNA profiling reveals an immunosuppressive microenvironment in EGFR double-mutant non-small cell lung cancer
2025-Oct-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2025-708
PMID:41234595
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示EGFR双突变非小细胞肺癌中的免疫抑制微环境特征 | 首次在单细胞水平系统描绘EGFR双突变NSCLC的免疫微环境景观，开发了scFocuSCOPE平台精准识别罕见突变癌细胞 | 样本量较小（25例），双突变病例罕见导致研究难度较大 | 阐明EGFR双突变非小细胞肺癌的免疫微环境特征及其治疗意义 | EGFR突变非小细胞肺癌患者样本和EGFR突变细胞系 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 25例EGFR突变NSCLC样本，2例DM患者进行时间序列分析 | NA | 单细胞RNA测序 | scFocuSCOPE | 用于单细胞水平精准识别和表征罕见突变癌细胞的分析平台 |