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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-06-02 |
PI3Kδ inhibition alters CD8 T cell differentiation and reprograms the tumor microenvironment following adoptive immunotherapy
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag108
PMID:42215073
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研究论文 | 揭示PI3Kδ抑制剂CAL-101如何改变CD8 T细胞分化并重编程肿瘤微环境,从而提升过继免疫治疗效果 | 首次揭示PI3Kδ抑制在体外处理T细胞可增强其干性和代谢适应性,并在慢性抗原刺激下抵抗终末耗竭,维持干细胞样特性 | 未提及具体限制 | 探究PI3Kδ抑制对T细胞分化及肿瘤微环境的影响,以改善实体瘤过继细胞治疗 | CAL-101处理的和未处理的T细胞,包括人T细胞,以及B16黑色素瘤肿瘤模型 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | B16黑色素瘤肿瘤样本(未明确数量) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2026-06-02 |
Scalable genotyping in fixed transcriptomes resolves clonal heterogeneity via single-cell sequencing
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.11.717967
PMID:41993258
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研究论文 | 提出GIFT技术,用于在固定转录组中同时检测大量靶向遗传变异和全转录组图谱,实现单细胞水平的克隆异质性分析 | 创新性地设计了一种基于相邻ssDNA探针的间隙填充反应,通过条码化天然转录序列实现高特异性靶向突变检测,并可在福尔马林固定石蜡包埋组织中进行克隆谱系追踪 | 未提及具体局限性 | 开发一种可扩展的基因分型方法,用于在单细胞水平同时解析转录状态和体细胞突变,以研究克隆异质性 | 来自35名骨髓增殖性肿瘤(MPN)供体的超过70万个人类细胞 | 单细胞基因组学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序、靶向突变检测 | NA | 单细胞转录组数据、突变数据 | 超过70万个来自35名MPN供体的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2026-06-02 |
Myeloid compartment reprogramming through nanoparticle-delivered resiquimod blocks paracrine growth support and activates phagocytosis to slow tumor progression in endogenous mouse medulloblastoma and diffuse midline glioma models
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.714454
PMID:41993485
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研究论文 | 通过纳米颗粒递送的瑞西奎莫德(ResiPOx)重新编程髓系区室,阻断旁分泌生长支持并激活吞噬作用,从而在小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型中减缓肿瘤进展 | 首次利用脑渗透性聚噁唑啉纳米颗粒制剂ResiPOx靶向TAMs的TLR7/8受体,逆转其促肿瘤表型,并在非人灵长类中验证了转化潜力 | NA | 研究通过刺激TAMs病原体受体以逆转肿瘤支持性表型的潜力,评估ResiPOx的抗肿瘤疗效和免疫重塑机制 | 肿瘤相关髓系细胞(TAMs)、小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型、恒河猴 | 机器学习 | 髓母细胞瘤, 弥漫性中线胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型样本、恒河猴脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq分析 |
| 184 | 2026-06-02 |
A diagnostic plasma omics-biomarker for Alzheimer's disease informed by microglial single-cell transcriptomics: A pilot study
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.721959
PMID:42146366
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研究论文 | 基于小胶质细胞单细胞转录组学数据开发阿尔茨海默病血浆组学生物标志物的初步研究 | 利用单细胞核RNA测序数据中的小胶质细胞基因表达,通过多种统计方法筛选基因面板,并结合图基映射方法将基因面板从脑组织转录组转移到血液单核细胞转录组,创新性地建立了从早期阶段诊断阿尔茨海默病的血浆组学生物标志物框架 | 300基因面板在预测认知正常患者时准确性较低(53%),且整体AUC值仅为0.7,表明诊断性能仍有提升空间 | 开发基于组学信息的血液诊断生物标志物,用于阿尔茨海默病的早期诊断 | 小胶质细胞(来自单细胞核RNA测序数据)和血液单核细胞(来自活体受试者) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核RNA测序,RNA测序 | 图基映射方法,最优传输统计 | 转录组数据 | NA(摘要未明确样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2026-06-02 |
T-cell distribution in the dorsal root ganglion across species, sex, and age
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.722027
PMID:42146464
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研究论文 | 通过比较生物学方法,研究T细胞在哺乳动物背根神经节中的分布,涵盖人类、非人灵长类、猪和啮齿类,并分析性别和年龄的影响 | 首次系统比较多个物种间背根神经节T细胞的分布差异,并揭示人类绝经前女性T细胞增多现象及Trm表型 | 未深入探讨DRG驻留T细胞的功能机制及物种差异的进化原因 | 阐明不同物种、性别和年龄下背根神经节T细胞的分布特征及其进化意义 | 人类、非人灵长类、猪、大鼠和小鼠的背根神经节组织 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 空间转录组学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、免疫荧光图像 | 人类样本包括不同性别和年龄组,非人灵长类、猪、大鼠和小鼠各物种样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于人类DRG组织分析 |
| 186 | 2026-06-02 |
Cross-assay RNA modeling reveals cancer biomarkers
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.722009
PMID:42146664
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研究论文 | 跨平台RNA数据分析揭示了癌症生物标志物 | 系统评估了四种转录组学平台(bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、NanoString和微阵列)的整合方法,提出了结合RNA-seq和NanoString的预测模型,并验证了外部微阵列队列 | 微阵列和单细胞RNA-seq数据存在系统性偏差,仅靠基因表达倍数变化无法完全消除平台特异性偏差 | 研究如何整合不同转录组学平台的数据以改进癌症预测建模 | 高级别浆液性癌(HGSC)肿瘤样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString, 微阵列 | 预测模型(未具体说明,如CNN等) | 基因表达数据(RNA) | 包含匹配新辅助化疗前后样本的HGSC患者队列 | Illumina, NanoString Technologies | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString, 微阵列 | Illumina NovaSeq, NanoString nCounter | 研究使用RNA-seq和NanoString平台对HGSC肿瘤样本进行联合分析 |
| 187 | 2026-06-02 |
Deciphering the glioblastoma microenvironmental landscape with multi-modal radiogenomics to guide prognosis and personalized therapy
2026-May-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08226-7
PMID:42087207
|
研究论文 | 开发一种基于多模态放射基因组学的非侵入性框架,用于解析胶质母细胞瘤的肿瘤微环境异质性并指导个性化治疗 | 首次将MRI影像组学特征与单细胞转录组数据整合,建立非侵入性方法捕获肿瘤微环境异质性,并筛选靶向药物以实现个性化治疗 | 未提及 | 建立非侵入性框架表征胶质母细胞瘤异质性,连接影像组学特征与微环境组成,识别可靶向的脆弱点以用于个性化治疗 | 胶质母细胞瘤患者及肿瘤微环境中的细胞状态(如NPC-like/OPC-like亚类、巨噬细胞、髓源性抑制细胞) | 计算机视觉, 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 磁共振成像(MRI), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 功能富集分析 | NA | 图像(MRI), 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2026-06-02 |
Sinonasal biphasic seromucinous adenocarcinomas: a report of two morphologically distinct cases with multimodal omics characterization
2026-May-04, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-026-04562-7
PMID:42080922
|
研究论文 | 报告两例形态不同的双相型鼻窦浆液黏液腺癌,并通过多组学分析揭示其分子异质性 | 首次对双相型鼻窦腺癌进行多模态组学表征(包括空间转录组学),揭示肿瘤内和肿瘤间的转录组异质性 | 仅报告两例病例,样本量有限,无法全面代表该类肿瘤的遗传多样性 | 阐明双相型鼻窦浆液黏液腺癌的分子特征和生物学复杂性 | 两例双相型鼻窦腺癌(嗜酸性细胞型和基底样细胞型) | 数字病理学 | 鼻窦腺癌 | 空间转录组学, 多组学分析(如HRAS/AKT1突变检测和FGFR2::SORB3融合检测) | 不适用 | 转录组数据, 基因突变数据 | 2例患者肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学平台用于分析肿瘤样本的转录组异质性 |
| 189 | 2026-06-02 |
Integration of Single-Cell and Spatial Transcriptomics With Experimental Validation Uncovers Macrophage Diversity and Spatial Landscape in Carotid Atherosclerosis
2026-05, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70105
PMID:42052790
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学与实验验证,揭示巨噬细胞多样性和空间景观在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次整合单细胞RNA测序、体外模型和空间转录组学,系统揭示颈动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的功能特征、分化轨迹及空间信号通路网络 | 未提及 | 研究颈动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的功能特征和调控机制 | 颈动脉粥样硬化组织中的巨噬细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 空间转录组学, 体外模型 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组, 体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 190 | 2026-06-02 |
Single-Cell Dissection of Malignant Cell Heterogeneity Reveals Functional Programs and Clinically Relevant Subtypes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-05, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70104
PMID:42068156
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研究论文 | 通过整合58例头颈部鳞状细胞癌患者的单细胞RNA测序数据,揭示恶性细胞异质性、功能程序及临床相关亚型 | 首次系统性解析HNSCC恶性细胞异质性,鉴定12个恶性细胞亚群及其分化状态、发育轨迹和空间定位,并通过hdWGCNA和NMF识别共表达基因模块和元程序,定义三种具有不同临床预后的分子亚型(MS-1/2/3),开发了能预测预后和免疫治疗反应的25基因恶性细胞评分(MCScore) | 基于公共数据整合,缺乏独立外部验证队列;单细胞数据可能遗漏稀有细胞亚群;细胞间相互作用分析基于配体-受体预测,需实验验证 | 解析HNSCC恶性细胞异质性,构建临床相关分子亚型,开发预后和免疫治疗预测标志物 | 58例HNSCC患者的181,003个恶性细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | hdWGCNA, NMF | 单细胞转录组数据, bulk RNA-seq数据 | 58例HNSCC患者(181,003个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-06-02 |
Single-cell RNAseq identifies persistent epithelial and immune dysfunction in PwCF by mitigating inter-individual sampling heterogeneity
2026-May, Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society
IF:5.4Q1
DOI:10.1016/j.jcf.2026.01.009
PMID:41807181
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者鼻腔上皮的细胞类型特异性基因表达和免疫功能障碍 | 通过单细胞转录组学揭示囊性纤维化患者鼻腔上皮的细胞类型特异性差异表达基因,并发现伴侣蛋白表达下调在低CFTR表达细胞类型中的调节作用 | 样本量较小,仅9名患者和7名健康志愿者,且未涉及下气道直接比较 | 探究囊性纤维化患者鼻腔上皮组织的细胞类型异质性及其在疾病中的影响 | 囊性纤维化患者和健康志愿者的鼻腔刮取样本 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 9名囊性纤维化患者和7名健康志愿者的鼻腔刮取样本,其中5名患者和5名健康志愿者有配对批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2026-06-02 |
Multi-organ single-cell analysis of preferential expression of CAKUT genes
2026-04-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05003-y
PMID:42045859
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研究论文 | 通过多器官单细胞分析揭示CAKUT相关基因优先表达模式 | 首次系统分析91个CAKUT相关基因在多个发育组织和成人组织中的单细胞表达,发现共享的基质-间充质基因表达特征 | 基于公开数据集,可能缺乏特定发育阶段的完整覆盖 | 探究CAKUT相关基因在肾脏及泌尿道发育中的细胞类型特异性表达模式 | 人类胎儿和成体肾脏、输尿管、膀胱的单细胞RNA测序数据,以及早期胚胎转录组数据 | 单细胞组学 | 先天性肾脏和泌尿道畸形(CAKUT) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集的整合分析,具体样本量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 193 | 2026-06-02 |
Zinc ions attenuates iridovirus infection through regulation of ferroptosis pathways
2026-Apr-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03114-x
PMID:42009668
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研究论文 | 探究锌离子通过调节铁死亡途径抑制虹彩病毒复制的机制 | 揭示了锌离子通过激活铁死亡通路抑制病毒复制的新机制,重新定义了锌的免疫机制和铁死亡在病毒感染中的双重作用 | 未提及具体局限性 | 研究锌离子如何通过铁死亡途径抑制传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)的复制 | 斑鳢及其感染ISKNV的细胞 | 机器学习 | 鱼类病毒感染 | RNA-seq, 单细胞测序, 酶活性测定, 透射电子显微镜 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 酶活性数据, 图像数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-06-02 |
Unveiling DEFB1 as a novel driver and promising therapeutic target in lung adenocarcinoma
2026-Apr-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08748-4
PMID:42009648
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研究论文 | 通过全基因组CRISPR/Cas9筛选、单细胞测序及功能实验,揭示DEFB1是肺腺癌的新驱动因子,并开发出靶向DEFB1的单克隆抗体mAb-5作为潜在治疗策略 | 首次鉴定DEFB1为肺腺癌驱动因子,并开发出有效抑制其功能的单克隆抗体mAb-5,同时在多种模型中验证其抗肿瘤效果 | 未提及具体局限性 | 探索肺腺癌增殖相关基因并开发靶向治疗 | DEFB1基因及其在肺腺癌中的作用 | 机器学习 | 肺癌 | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞测序, 多重免疫组化, 免疫共沉淀, 质谱分析 | NA | 基因表达数据, 细胞图像, 蛋白质组学数据 | 涉及体外细胞系、类器官、异种移植模型和自发肺癌小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq批量测序 |
| 195 | 2026-06-02 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal divergent immunological and stromal programs in peritoneal versus ovarian endometriosis
2026-Apr-20, BMC women's health
DOI:10.1186/s12905-026-04456-5
PMID:42010552
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2026-06-02 |
The B7 family subgroup reflects tumor cell heterogeneity and patient post-operative prognosis in gallbladder cancer
2026-Apr-18, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00802-7
PMID:42001193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B7家族亚群在胆囊癌中反映肿瘤细胞异质性并影响患者术后预后 | 首次在单细胞分辨率下系统研究B7家族免疫检查点分子CD276、VTCN1和HHLA2在胆囊癌中的表达及其下游信号机制,并构建整合表达的梯度提升机模型用于术后风险分层 | 样本量有限(7个原发肿瘤用于scRNA-seq,188例患者用于生存模型),且未进行独立外部验证 | 阐明胆囊癌细胞生物异质性并改善术后风险分层 | 胆囊癌患者肿瘤细胞及术后预后 | 机器学习和数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序和NMF分析 | 梯度提升机 | 基因表达数据 | 7个原发肿瘤用于单细胞RNA测序,188例胆囊癌术后患者用于生存模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2026-06-02 |
Autophagy related 7 dysfunction in senescent melanocytes and hypopigmented skin: reversal by metformin
2026-04-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf529
PMID:41453137
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研究论文 | 该文研究了自噬相关7功能异常在衰老黑素细胞和色素减退皮肤中的作用,并评估了二甲双胍作为逆转策略的效果 | 首次确定自噬失调为紫外线诱导黑素细胞衰老过程中的早期事件,早于糖酵解重编程,并提出通过维持ATG7延缓衰老的干预策略 | 未明确说明 | 识别黑素细胞衰老前的早期分子事件,并评估预防衰老的治疗策略 | 紫外线诱导的衰老黑素细胞及特发性点状色素减退皮肤样本 | 机器学习 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、时间序列批量转录组分析、基因和蛋白检测、免疫组化、基因敲低/过表达 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 198 | 2026-06-02 |
Single-cell transcriptomics identifies regulatory T cell heterogeneity in gestational diabetes mellitus
2026-Apr-03, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01563-0
PMID:41933176
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research paper | 通过单细胞转录组学分析揭示了妊娠期糖尿病中调节性T细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上系统解析妊娠期糖尿病中调节性T细胞亚群的转录组变化,发现TXNIP等基因可作为GDM状态的重要判别标志 | 未能观察到Treg细胞亚群比例在疾病状态下的显著差异,样本量有限(仅13名健康孕妇和10名GDM患者) | 探究妊娠期糖尿病中调节性T细胞亚群的转录失调机制 | 13名健康孕妇和10名女性GDM患者血液中的调节性T细胞和CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23名受试者(13名健康孕妇+10名GDM患者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2026-06-02 |
Fibroblast-Driven Fibroblast Growth Factor and Fibronectin 1 Signaling Orchestrates Extracellular Matrix Remodeling for Ovine Mammary Lactation Decline
2026-04, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70150
PMID:41998868
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研究论文 | 该研究整合绵羊泌乳高峰和后期乳腺的单细胞RNA测序数据,揭示了成纤维细胞通过FGF和FN1信号通路驱动细胞外基质重塑的调控网络 | 首次在绵羊泌乳衰退过程中建立成纤维细胞驱动的ECM重塑调控网络,并通过跨物种比较发现成纤维细胞和内皮细胞的保守转录程序 | 未提及 | 阐明绵羊泌乳后期乳腺组织中细胞外基质重塑的细胞和分子机制 | 绵羊泌乳高峰期和后期乳腺组织样本 | 单细胞转录组学 | 正常生理过程 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 绵羊泌乳高峰期和后期乳腺组织样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2026-06-02 |
Harnessing arginase 2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive cutaneous T-cell lymphoma
2026-03-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf450
PMID:41208405
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研究论文 | 探讨精氨酸酶2特异性CD8+ T细胞靶向免疫抑制性皮肤T细胞淋巴瘤的潜力 | 首次证明恶性皮肤T细胞淋巴瘤细胞可被ARG2特异性CD8+ T细胞靶向识别,揭示ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的可能性 | 仅在体外细胞系和公共单细胞数据集中验证,缺乏体内动物模型和临床试验证据 | 评估恶性CTCL细胞是否高表达ARG2并可作为ARG2特异性CD8+ T细胞的免疫治疗靶点 | 八种CTCL细胞系及患者病变组织中的恶性T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,CRISPR-Cas9基因编辑,酶联免疫斑点检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 8种CTCL细胞系,多名供体的CD8+ T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用公开的单细胞RNA测序数据集分析患者病变组织 |