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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-07-10 |
Genomic Exploration of Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights From Gene Expression and Variation in Morbidly Obese Individuals
2025, Journal of obesity
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/jobe/9245699
PMID:40365443
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研究论文 | 利用整合生物信息学分析,包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,探索非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的差异表达基因及其遗传变异,重点关注肥胖患者中NAFLD的发病机制 | 鉴定了与代谢、免疫和脂质功能相关的新基因(如和),并在肥胖患者肝细胞中过表达,同时发现这些基因的新型致病性变异可能与NAFLD相关 | 研究可能受限于样本代表性、验证范围或致病性变异的直接功能验证不足 | 通过基因表达和遗传变异分析,阐明NAFLD的疾病机制并识别潜在治疗靶点和生物标志物 | 肥胖患者的肝组织及相关基因(如和) | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据,遗传变异数据 | NA | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2026-07-10 |
Endoplasmic Reticulum Stress Induces ROS Production and Activates NLRP3 Inflammasome Via the PERK-CHOP Signaling Pathway in Dry Eye Disease
2024-12-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.34
PMID:39699913
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研究论文 | 本研究探讨内质网应激通过PERK-CHOP信号通路诱导ROS产生并激活NLRP3炎症小体在干眼症中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合体内外模型,揭示PERK-CHOP-TXNIP轴在干眼症中连接内质网应激与氧化应激及炎症的关键机制 | 未提及具体限制,如样本量较小或模型与人体差异等 | 研究内质网应激在干眼症发展中的潜在作用及其分子机制 | 干眼症小鼠模型、原代人角膜上皮细胞和永生化人角膜上皮细胞 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序、siRNA转染、免疫荧光、Western blotting、实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取干眼小鼠角膜组织scRNA-seq数据,以及东莨菪碱诱导的干眼小鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat R程序分析从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 183 | 2026-07-11 |
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-12, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976
PMID:39580061
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研究论文 | 本研究调查了甘氨酸受体亚基α1、α2、α4和β在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达谱 | 首次系统分析了甘氨酸受体四个亚基在不同性别小鼠中枢神经系统中的单细胞和整体表达模式 | RNAscope检测到Glra4的表达,但qRT-PCR未能检测到,表明低丰度转录本的检测方法存在局限性 | 明确甘氨酸受体亚基在成年小鼠中枢神经系统中的分布和性别差异 | 成年雌性和雄性小鼠的中枢神经系统组织及部分内脏器官 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNAscope | NA | 转录组表达数据 | 成年雌性和雄性小鼠多个脑区及脊髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2026-07-10 |
Whole brain alignment of spatial transcriptomics between humans and mice with BrainAlign
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50608-2
PMID:39080277
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研究论文 | 开发了一种名为BrainAlign的自监督学习方法,用于人类和小鼠全脑空间转录组学比对 | 提出了一种自监督学习方法,通过异构图形神经网络同时编码空间转录组学中的点和基因,实现跨物种全脑比对,并揭示了保守脑区和同源基因表达模式 | NA | 推动人类和啮齿动物全脑空间转录组学研究方法的跨物种比对 | 人类和小鼠的全脑空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 异构图形神经网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 185 | 2026-07-10 |
CRISPR-CasRx-mediated disruption of Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2 genes reduces intraocular pressure and retinal ganglion cell damage in mice
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50050-4
PMID:39080269
|
研究论文 | 利用CRISPR-CasRx技术靶向Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2基因,降低小鼠眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 首次利用CasRx RNA干扰工具结合shH10腺相关病毒,靶向调控房水循环相关基因,实现眼内压降低和视网膜神经节细胞保护,并通过单细胞测序阐明作用机制 | 研究仅限于雌性小鼠,未涉及其他性别或人类模型,且基因敲降效果的长期安全性未评估 | 探索基因治疗降低眼内压和延缓青光眼进展的新方法 | 雌性小鼠 | 基因治疗 | 青光眼 | CRISPR-CasRx, 腺相关病毒载体, 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 雌性小鼠,具体数量未指定 | 未指定 | 单细胞测序 | 未指定 | 未指定 |
| 186 | 2026-07-10 |
Mapping the molecular landscape of Lotus japonicus nodule organogenesis through spatiotemporal transcriptomics
2024-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50737-8
PMID:39080318
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研究论文 | 通过时空转录组学绘制百脉根根瘤器官发生的分子图谱 | 首次利用空间转录组学技术全面解析模式豆科植物百脉根根瘤发育过程中感染区和外围组织的发育轨迹,揭示了共生和物质交换的基因调控网络,并鉴定了转录因子LjNLP3在根瘤从分化到成熟转化中的关键作用 | 未提及具体限制 | 利用空间转录组学揭示百脉根根瘤器官发生的分子机制,为开发共生固氮作物提供数据支持 | 模式豆科植物百脉根(Lotus japonicus)的根瘤 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2026-07-10 |
Anoikis and SPP1 in idiopathic pulmonary fibrosis: integrating bioinformatics, cell, and animal studies to explore prognostic biomarkers and PI3K/AKT signaling regulation
2024-06, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2315218
PMID:38318669
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研究论文 | 整合生物信息学、细胞和动物实验,探索失巢凋亡和SPP1在特发性肺纤维化中的预后生物标志物及PI3K/AKT信号调控 | 首次通过失巢凋亡相关基因构建特发性肺纤维化的预后模型,并揭示SPP1通过PI3K/AKT通路调控肺纤维化的新机制 | 未提及具体样本量及外部验证队列 | 探究失巢凋亡在特发性肺纤维化中的相关性,识别相关生物标志物和信号通路 | 特发性肺纤维化患者及小鼠肺成纤维细胞 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | Lasso回归、多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 未指定 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2026-07-10 |
Protein phosphatases regulate the formation of Müller glia-derived progenitor cells in the chick retina
2024-06, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103932
PMID:38679247
|
研究论文 | 研究了蛋白磷酸酶在鸡视网膜中Müller胶质细胞转化为祖细胞过程中的调控作用 | 首次揭示了DUSP1/6和PP2C等蛋白磷酸酶在Müller胶质细胞重编程中的关键调控作用,并发现不同磷酸酶对细胞信号通路具有差异化调节 | 未对磷酸酶抑制在无损伤视网膜中的长期效果及分子机制进行深入探讨 | 探究蛋白磷酸酶对Müller胶质细胞来源祖细胞形成的调控机制 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞及其来源祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 正常和受损鸡视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2026-07-10 |
Intermittent fasting promotes type 3 innate lymphoid cells secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91060
PMID:38536726
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研究论文 | 间歇性禁食通过促进3型先天淋巴细胞分泌IL-22从而诱导白色脂肪组织褐变 | 首次揭示肠道3型先天淋巴细胞在间歇性禁食诱导白色脂肪组织褐变中的关键作用,阐明了ILC3/IL-22/IL-22R信号轴参与间歇性禁食代谢益处的机制 | 尚未明确间歇性禁食如何具体调节ILC3细胞的芳香烃受体信号通路,以及树突状细胞和巨噬细胞与ILC3相互作用的详细分子机制 | 探究间歇性禁食促进白色脂肪组织褐变的细胞和分子机制 | 饮食诱导肥胖小鼠模型及肠道免疫细胞 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对分选的肠道免疫细胞进行单细胞测序 |
| 190 | 2026-07-10 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
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研究论文 | 通过多组学和单细胞测序分析揭示昼夜节律通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次系统性地在泛癌水平上分析昼夜节律相关基因(CRGs)的表达、突变、甲基化及与免疫微环境的关系,并计算昼夜节律通路评分(CRS)以评估其作为免疫治疗标志物的潜力 | 仅依赖TCGA等公共数据库数据,缺乏大规模独立验证;未深入探讨CRGs调控肿瘤微环境的具体分子机制 | 探索昼夜节律相关基因在泛癌中的表达模式、预后价值及作为免疫治疗新靶点的可能性 | 泛癌(包括KIRC等多种肿瘤类型)的肿瘤样本及肿瘤微环境细胞 | 机器学习 | 泛癌(多类型肿瘤) | 多组学分析、单细胞测序、免疫组化(IHC)、单样本基因集富集分析(ssGSEA) | NA | 基因表达数据、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化数据、单细胞测序数据 | 使用TCGA数据库中多个肿瘤类型的大规模样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-07-10 |
The conserved wobble uridine tRNA thiolase Ctu1 is required for angiogenesis and embryonic development
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315854
PMID:39705244
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研究论文 | 研究发现保守性摆动尿苷tRNA硫醇酶Ctu1在血管生成和胚胎发育中起关键作用 | 首次在脊椎动物模型中揭示CTU1在血管生成和胚胎发育中的必要性 | 仅使用斑马鱼和人类内皮细胞模型,尚未涉及更复杂的哺乳动物模型或临床样本 | 确定Ctu1在血管生成和胚胎发育中的生物学功能 | 斑马鱼胚胎和人类内皮细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎样本和人类内皮细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达 |
| 192 | 2026-07-10 |
Protein phosphatases regulate the formation of Müller glia-derived progenitor cells in the chick retina
2023-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.11.570629
PMID:38168320
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研究论文 | 研究蛋白磷酸酶在鸡视网膜中Müller胶质细胞来源祖细胞形成中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示蛋白磷酸酶(DUSP1/6和PP2C/PP2B)在Müller胶质细胞重编程为祖细胞过程中的动态表达及差异化调控作用 | 未评估磷酸酶抑制对受损视网膜中细胞死亡数量的显著影响,且研究局限于鸡视网膜模型 | 探究蛋白磷酸酶在Müller胶质细胞重编程为祖细胞过程中的调控机制 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞及Müller胶质细胞来源的祖细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 通过单细胞RNA测序数据库分析,未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2026-07-10 |
Single-cell RNA sequencing analysis revealed malignant ductal cell heterogeneity and prognosis signatures in pancreatic cancer
2023-10, Clinics and research in hepatology and gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.clinre.2023.102200
PMID:37643692
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示胰腺癌恶性导管细胞异质性和预后特征 | 首次利用单细胞RNA测序结合Leiden算法对胰腺癌导管细胞亚群进行综合分析,鉴定出S100A6+和FXYD2+两种主要亚型,并整合批量RNA测序数据生成并验证了新的预后特征 | 未明确说明 | 通过多组学方法深入研究胰腺癌导管细胞的异质性并建立预后特征 | 胰腺癌导管细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2026-07-10 |
A single-cell transcriptome of mesenchymal stromal cells to fabricate bioactive hydroxyapatite materials for bone regeneration
2022-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.009
PMID:34820571
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研究论文 | 利用单细胞转录组技术绘制间充质干细胞在不同成骨微环境中的转录图谱,揭示羟基磷灰石支架和成骨培养基的成骨机制 | 首次在单细胞分辨率下系统比较三维羟基磷灰石支架和成骨培养基对间充质干细胞的成骨调控机制,发现两种条件通过不同信号通路(如ZBTB16、WNT)驱动成骨,并揭示间充质干细胞亚群(LRRC75A、PCDH10)的功能异质性 | 未明确提及具体限制,但可能包括样本量有限或仅基于体外模型,未在体内验证 | 通过单细胞转录组解析间充质干细胞在生物活性羟基磷灰石材料中的成骨微环境,为骨再生材料优化提供数据库参考 | 间充质干细胞(MSCs)及其亚群(如LRRC75A、PCDH10) | 数字病理学 | 骨再生相关疾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2026-07-10 |
Isolation of myeloid cells from mouse brain tumors for single-cell RNA-seq analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100957
PMID:34825218
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研究论文 | 描述了一种从小鼠脑肿瘤中快速分离髓系细胞用于单细胞RNA测序分析的方案 | 无需细胞分选即可快速分离髓系细胞,减少细胞损伤,提高稀有细胞类型的检测分辨率 | 当前scRNA-seq协议受限于可同时测序的细胞数量,限制了稀有细胞类型异质性的解析能力 | 开发一种高效分离小鼠脑肿瘤髓系细胞的方法,用于单细胞RNA测序分析 | 小鼠脑肿瘤中的髓系细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脑肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'试剂盒 |
| 196 | 2026-07-10 |
Optimized protocol for isolation of high-quality single cells from the female mouse reproductive tract tissues for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100970
PMID:34841281
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研究论文 | 描述了一种优化的方案,用于从雌性小鼠生殖道组织中分离高质量的单细胞,以进行单细胞RNA测序 | 针对雌性生殖道不同区域(子宫颈内口和外口)开发了专门的高活力单细胞制备方案,以构建完整的分子细胞图谱 | NA | 为单细胞RNA测序提供优化的细胞分离和制备方案,以研究正常生理和疾病状态下的分子细胞图谱 | 雌性小鼠生殖道组织(包括子宫颈内口和外口) | 单细胞测序, 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2026-07-10 |
Deletion of pancreas-specific miR-216a reduces beta-cell mass and inhibits pancreatic cancer progression in mice
2021-11-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100434
PMID:34841287
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研究论文 | 该研究揭示了胰腺特异性miR-216a在调节β细胞质量和胰腺癌进展中的关键作用 | 首次发现miR-216a作为胰腺特异性miRNA,同时调控胰岛和腺泡细胞功能,并揭示其在胰腺癌诊断中的潜在生物标志物价值 | 未说明 | 探究胰腺特异性miR-216a在β细胞质量和胰腺癌进展中的功能 | 胰腺miR-216a基因敲除小鼠和胰腺癌易感小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除小鼠和胰腺癌模型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 198 | 2026-07-10 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq揭示成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性,并发现Smad4调控成年星形胶质细胞生成 | 首次在单细胞水平揭示间脑星形胶质细胞的分子异质性,并发现成年间脑存在低水平星形胶质细胞生成,且由Smad4调控 | 未提及 | 探索星形胶质细胞在单细胞水平上的一般功能与区域特异性功能的协调机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq,ACSA-2介导的磁性活化细胞分选(MACS) | NA | 单细胞基因表达数据 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 199 | 2026-07-10 |
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13128
PMID:34558134
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析小鼠子宫接受性胚胎植入的细胞和分子机制 | 首次以单细胞分辨率揭示小鼠子宫接受期与非接受期的细胞类型多样性及基因表达变化,并预测细胞间信号互作 | 未提供具体局限性信息,可能包括单细胞数据验证范围有限、未涉及人类子宫直接比较等 | 在单细胞水平阐明小鼠子宫接受胚胎植入的分子机制 | 小鼠子宫(接受期和非接受期) | 机器学习 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠子宫样本(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 200 | 2026-07-10 |
Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13125
PMID:34546587
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示蜕膜基质微环境缺陷导致复发性流产 | 首次在单细胞水平揭示蜕膜基质细胞的异质性及其在复发性流产中的关键作用,发现TWEAK和FASLG信号通路过度激活与基质细胞死亡及妊娠失败密切相关 | 未明确说明研究限制 | 探究母体蜕膜细胞异质性在复发性流产中的作用机制 | 复发性流产患者和健康对照的蜕膜组织 | 计算机视觉 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 66,078个单细胞,来自复发性流产患者和健康对照的蜕膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |