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当前共找到 39702 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-05-27 |
Intrinsic changes in cell differentiation and identity drive impaired wound healing in aged female murine skin
2025-11-01, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10340-w
PMID:41175301
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析衰老小鼠皮肤伤口愈合障碍的细胞内在机制 | 首次在单细胞水平系统揭示衰老导致皮肤驻留细胞（角质形成细胞、成纤维细胞、巨噬细胞）分化异常、身份丧失及炎症信号改变的级联机制 | 仅使用雌性小鼠模型，未包含雄性性别或人类样本的验证 | 阐明衰老引起的细胞内在变化对皮肤伤口愈合早期反应的分子和细胞影响 | 年轻和老年雌性小鼠的完整皮肤及伤后3天的伤口组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年雌性小鼠皮肤及伤口样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 182 | 2026-05-27 |
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-11, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02734-z
PMID:40817406
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序对B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的骨髓微环境进行异质性分析，鉴定出不同的间充质基质细胞群并揭示其功能 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出B-ALL骨髓微环境中的早期间充质祖细胞和脂肪生成祖细胞两种基质细胞群，并发现脂肪生成祖细胞通过IL-7和VCAM1信号促进白血病细胞存活和耐药，且在复发样本中富集 | 未说明 | 解析B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）骨髓微环境中的细胞异质性及其对白血病进展的影响 | 儿童B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 | 单细胞组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2026-05-27 |
The evolving nosology of myeloid neoplasms: the semi-centennial of the 1976 French-American-British classification
2025-11, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02746-9
PMID:40858808
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综述 | 回顾了骨髓系肿瘤分类法从1976年FAB分类至今50年的演变历程，探讨了下一代测序技术、单细胞测序和多组学等新技术对分类法的影响 | 从历史视角系统分析了骨髓系肿瘤分类法的演变，强调了克隆性造血不确定潜能（CHIP）作为前驱病变的概念框架，并展望了单细胞测序和多组学在未来分类中的整合可能 | 作为综述文章，未提供新实验数据或验证；对新兴技术的讨论基于已有文献，其实际应用效果有待验证 | 分析骨髓系肿瘤分类法在过去50年的演变，并探讨新兴技术对未来分类的影响 | 骨髓系肿瘤的分类系统及诊断标准 | 机器学习 | 骨髓系肿瘤 | 下一代测序, 单细胞测序, 多组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2026-05-27 |
Macrophage EHD1 promotes inflammation and stabilizes sortilin to accelerate atherosclerosis
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684958
PMID:41279772
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研究论文 | 研究巨噬细胞EHD1通过促进炎症和稳定sortilin加速动脉粥样硬化的机制 | 首次揭示内吞调节因子EHD1在巨噬细胞免疫反应和动脉粥样硬化进展中的新作用 | 未提及具体限制 | 探索EHD1在巨噬细胞免疫反应中的作用及其对动脉粥样硬化进展的贡献 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 185 | 2026-05-27 |
Supervised machine learning identifies impaired mitochondrial quality control in β cells with development of type 2 diabetes
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.683335
PMID:41278904
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研究论文 | 开发一个可解释的有监督机器学习框架，通过单细胞RNA测序分析β细胞线粒体质量控制在2型糖尿病发展中的作用 | 结合稀疏规则分类、路径约束建模和线粒体适应性分层三种机器学习方法，首次在单细胞水平识别出与2型糖尿病相关的β细胞亚型和关键调节因子 | NA | 解析2型糖尿病中β细胞衰竭的分子机制 | 来自52名人类供体的β细胞的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | SnakeClassifier, BlackSwanClassifier, Kolmogorov-Arnold神经网络 | 基因表达数据 | 52名人类供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-05-27 |
CagA-dependent Hobit+ gastric tissue-resident memory T cells confer full protection from Helicobacter pylori reinfection
2025-10-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-334781
PMID:40473399
|
研究论文 | 本研究揭示依赖CagA的Hobit+胃组织驻留记忆T细胞能完全保护宿主免受幽门螺杆菌再感染 | 首次证明胃组织驻留记忆T细胞（TRM）是幽门螺杆菌免疫保护的相关指标，并揭示其依赖于毒力因子CagA和转录因子Hobit的诱导机制 | 研究主要基于小鼠模型和少量人体样本，对胃TRM细胞在人类长期保护中的具体功能验证尚不充分 | 探究胃TRM细胞在幽门螺杆菌初次感染和再感染过程中的诱导、发育和功能 | 小鼠和人类胃组织中的幽门螺杆菌特异性TRM细胞 | 机器学习 | 幽门螺杆菌感染 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、免疫荧光、ChipCytometry染色 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 187 | 2026-05-27 |
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.03.680242
PMID:41278680
|
研究论文 | 提出一种名为SpaGene的深度学习框架，用于整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，以填补空间转录组中的缺失基因表达 | 利用两个编码器-解码器对、两个翻译器和两个判别器的对抗学习框架，实现空间转录组数据中缺失基因的高精度推断 | 未明确说明，可能包括对特定组织类型或平台泛化性的潜在限制 | 开发一种深度学习方法，整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，以增强空间基因表达推断 | 多种数据集上的空间转录组和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | 多种数据集 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2026-05-27 |
The bone marrow immune ecosystem shapes daratumumab acquired resistance in plasma cell myeloma
2025-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02712-5
PMID:40750676
|
研究论文 | 本研究探讨了骨髓免疫生态系统在多发性骨髓瘤获得性达雷妥尤单抗耐药中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和数字空间分析技术，鉴定了与获得性耐药相关的免疫细胞变化和MYC调控机制 | 样本量有限，且主要基于配对样本分析，外部验证队列的异质性可能影响结论的普适性 | 揭示获得性达雷妥尤单抗耐药的免疫生态系统机制 | 多发性骨髓瘤患者治疗前后配对样本 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 单细胞调控网络推理 | 基因表达数据 | 来自多个队列的样本，包括GSE24080、GSE136337、GSE57317和coMMpass | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 数字空间分析 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序和数字空间分析平台 |
| 189 | 2026-05-27 |
Single-cell transcriptome analysis suggests cells of the tumor microenvironment as a major discriminator between brain and extracranial melanoma metastases
2025-09-16, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00691-2
PMID:40954493
|
研究论文 | 对黑色素瘤脑转移和颅外转移的单细胞转录组数据进行了计算再分析，发现肿瘤细胞高度同质而微环境存在显著差异 | 采用细胞类型特异性伪批量分析和省略插补的患者整合策略，揭示了脑转移与颅外转移微环境差异是主要区分因素，而非肿瘤细胞本身 | 基于公开数据的再分析，未提供新的实验验证；样本量有限（15例脑转移和10例颅外转移） | 探究黑色素瘤脑转移与颅外转移在肿瘤细胞和微环境层面的分子差异 | 黑色素瘤脑转移和颅外转移样本 | 自然语言处理 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例黑色素瘤脑转移和10例颅外转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2026-05-27 |
Long-chain sulfatide enrichment is an actionable metabolic vulnerability in intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN)-associated pancreatic cancers
2025-09-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335220
PMID:40268349
|
研究论文 | 通过跨物种空间分析揭示长链硫苷脂富集是导管内乳头状黏液性肿瘤相关胰腺癌的可干预代谢脆弱性 | 首次通过整合空间转录组和代谢组学技术，发现长链羟基硫苷脂在IPMN/PDAC肿瘤上皮中选择性富集，并验证UGT8抑制通过神经酰胺介导的补偿性线粒体自噬和内在凋亡通路发挥抗癌作用 | 未明确提及限制性 | 揭示IPMN恶性进展为PDAC的生化和分子驱动因素 | 人类IPMN/PDAC组织样本及突变Kras;Gnas小鼠模型的胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | MALDI质谱成像、空间转录组学、CRISPR/cas9技术、小干扰RNA、药理学抑制 | NA | 图像、转录组数据、代谢组数据 | 23例人类IPMN/PDAC组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学技术 |
| 191 | 2026-05-27 |
Transcription factors that define the epigenome structures and transcriptomes in microglia
2025-Sep, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104814
PMID:40425139
|
研究论文 | 本文通过ATAC-seq、ChIP-seq/CUT&RUN和单细胞RNA-seq等全基因组分析，揭示了决定小胶质细胞表观基因组结构和转录组的转录因子 | 首次确认PU.1、Irf8、Sall1和Smad4四个转录因子作为谱系决定因子形成增强子复合物，共同塑造小胶质细胞身份，并阐明TGF-β在维持小胶质细胞稳态中的关键作用 | NA | 研究定义小胶质细胞表观基因组结构和转录组的转录因子 | 小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | ATAC-seq,ChIP-seq,CUT&RUN,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 批量ChIP-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞测序平台，Illumina NovaSeq高通量测序系统 |
| 192 | 2026-05-27 |
Ontogeny-specific induction of the KMT2A::AFF1-fusion drives development of a distinct CD24 positive pre-leukemic state
2025-09, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02665-9
PMID:40646135
|
研究论文 | 本研究通过新型小鼠KMT2A::AFF1融合基因模型，揭示了胚胎期特异性诱导该融合基因驱动CD24阳性前白血病状态形成的机制 | 首次建立精确诱导KMT2A::AFF1致癌融合的胚胎小鼠模型，发现CD24PreProB细胞亚群在胚胎期特异性扩增，并证明其前白血病干细胞特征，且该特征在人类患者中具有可转移性 | 未明确说明 | 探究KMT2A::AFF1融合基因在胚胎期启动白血病发生的早期机制 | KMT2A::AFF1融合基因驱动的婴儿急性淋巴细胞白血病（ALL）的胚胎前白血病状态 | 机器学习 | 淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2026-05-27 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672469
PMID:40909566
|
研究论文 | 利用来自19项研究的近50万个高质量单细胞核转录组图谱，量化了皮层细胞类型标记物的表达保真度和背景表达，并开发统计框架识别出具有更高保真度和跨区域一致表达的标记物集 | 首次系统量化了经典皮层细胞类型标记物在不同皮层区域的表达保真度和背景表达，开发了将注释条形码汇总为伪批量图谱的统计框架，并扩展了六大主要脑细胞类型的经典标记物集 | 未明确说明局限性，但可能包括现有数据来源的批次效应、组织样本的偏好性以及亚型特异性标记物在特定区域的验证不足 | 评估和优化人类皮层细胞类型标记物的表达特性，为单细胞转录组数据中的细胞类型注释和验证研究提供更可靠的标记物资源 | 人类皮层细胞类型标记物，涵盖神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞等六种主要脑细胞类型及其亚型 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约500,000个单细胞核转录组图谱来自19项研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于单细胞核转录组测序平台 |
| 194 | 2026-05-27 |
Endothelial-like cancer-associated fibroblasts facilitate pancreatic cancer metastasis via vasculogenic mimicry and paracrine signalling
2025-08-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333638
PMID:40122596
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重免疫组化鉴定出一种新型内皮样癌相关成纤维细胞（endoCAFs），并揭示其通过血管生成拟态和旁分泌信号促进胰腺癌转移的机制 | 首次发现并鉴定FAPα+CD144+内皮样癌相关成纤维细胞亚型，阐明其通过CD144-β-catenin-STAT3信号轴同时发挥血管生成拟态和旁分泌双重功能，并开发靶向该亚型的siRNA递送纳米系统 | 基于动物模型和体外实验，尚需在更大规模临床样本中验证endoCAFs的预后价值，且纳米系统的长期安全性与有效性需进一步评估 | 探索胰腺导管腺癌中肿瘤微环境内癌相关成纤维细胞的异质性及其在血管生成拟态中的作用 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织、细胞系、类器官、原位肿瘤模型及KPC基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化、细胞因子阵列、RNA测序、免疫沉淀-质谱、染色质免疫沉淀、荧光素酶分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 包含前瞻性和回顾性临床队列分析，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2026-05-27 |
Concurrent genetic and non-genetic resistance mechanisms to KRAS inhibition in CRC
2025-Aug-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.05.668666
PMID:40799551
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研究论文 | 本研究通过靶向外显子测序和单细胞空间转录组学分析结直肠癌患者对KRAS抑制剂的急性反应及耐药机制 | 首次揭示结直肠癌中KRAS抑制剂耐药的遗传与非遗传机制共存，并发现TBK1可作为克服早期炎症适应阶段的潜在靶点 | 样本量有限，且主要基于患者活检和类器官模型，可能无法完全反映体内肿瘤微环境的复杂性 | 探索结直肠癌对KRAS抑制剂耐药的急性反应及分子机制 | 结直肠癌患者配对活检样本（治疗前、治疗中、进展期）及人类和小鼠类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 靶向外显子测序、单细胞空间转录组学 | NA | 基因测序数据、空间基因表达数据 | 多名结直肠癌患者的配对活检样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2026-05-27 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析有毒物质暴露后的细胞应激状态及应激反应通路 | 首次使用TempO-LINC平台在单细胞水平系统解码化学物质诱导的适应性应激反应与终端应激状态之间的转换 | 未提及具体局限性 | 探索单细胞转录组学在毒理学中揭示细胞应激状态动态变化的潜力 | 经依托泊苷、布雷菲德菌素A、放线菌酮、鱼藤酮、叔丁基氢醌、曲格列酮和衣霉素处理的HepaRG细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 广义Jaccard度量聚类 | 单细胞转录组数据 | 约40000个HepaRG细胞 | BioSpyder | 单细胞转录组学 | TempO-LINC | TempO-LINC单细胞转录组分析平台 |
| 197 | 2026-05-27 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mechanisms of radioresistance and immune escape in recurrent nasopharyngeal carcinoma
2025-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02253-8
PMID:40691404
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research paper | 通过单细胞和空间转录组学分析，揭示复发性鼻咽癌中放疗抵抗和免疫逃逸的机制 | 首次在复发性鼻咽癌中鉴定出MCAM癌症相关成纤维细胞通过胶原IV-ITGA2-FAK-AKT轴促进肿瘤放疗抵抗，并发现CD8 ZNF683细胞在复发性鼻咽癌中功能降低且细胞毒性较弱，以及B细胞和三级淋巴结构显著减少 | 未提及具体局限性 | 探究复发性鼻咽癌放疗抵抗和免疫逃逸的机制 | 来自24名患者的39个鼻咽癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | NA | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 24名患者的39个肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组分析 |
| 198 | 2026-05-27 |
ETS1 Orchestrates a Hybrid EMT Program Driving in vivo Metastasis and Immune Evasion
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665404
PMID:40777467
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了ETS1转录因子在头颈鳞癌中驱动混合上皮-间充质转化程序，促进体内转移和免疫逃逸 | 首次发现ETS1作为双重驱动因子，同时调控肿瘤远端转移和免疫逃逸，并确定HSP90抑制剂可作为针对性治疗策略 | 未明确说明局限性 | 研究转录组瘤内异质性如何驱动上气道消化道鳞状细胞癌的转移和免疫逃逸 | 上气道消化道鳞状细胞癌细胞系和患者肿瘤样本 | 机器学习和单细胞转录组学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序 | 转录因子调控网络模型 | 单细胞基因表达数据 | 多个患者队列的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 199 | 2026-05-27 |
DGAT: A Dual-Graph Attention Network for Inferring Spatial Protein Landscapes from Transcriptomics
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.05.662121
PMID:40672156
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研究论文 | 提出双图注意力网络DGAT，从转录组数据推断空间蛋白景观，弥合空间组学中转录组与蛋白质组之间的鸿沟 | 首次利用双图注意力网络从纯转录组空间数据中学习RNA-蛋白质关系，实现空间蛋白质表达推断，无需直接测量蛋白质 | 未提及明确的局限性 | 通过空间转录组数据推断空间蛋白质表达，增强对组织功能环境和细胞状态的理解 | 扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的空间转录组数据集 | 机器学习 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤, 恶性间皮瘤 | 空间转录组学, 空间CITE-seq | 双图注意力网络（DGAT） | 空间转录组数据 | 包含扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的多个数据集 | NA | 空间转录组学, 空间CITE-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-05-27 |
Single-cell omics in inflammatory bowel disease: recent insights and future clinical applications
2025-07-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334165
PMID:39904604
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综述 | 本综述总结了单细胞组学技术在炎症性肠病研究中的应用，涵盖溃疡性结肠炎和克罗恩病，并探讨了其在治疗靶点识别、药物反应机制及临床诊断中的潜在价值 | 全面梳理了单细胞组学（尤其是单细胞RNA测序）在揭示IBD相关新细胞类型、细胞功能及并发症机制中的最新进展，并前瞻性地讨论了其向临床实践转化的可能性 | 单细胞组学在临床实施中仍处于早期阶段，存在技术成本高、数据分析复杂及样本量限制等挑战 | 系统综述单细胞组学在IBD研究中的应用成果，并展望其在临床诊断、监测和预后预测中的未来发展 | 炎症性肠病（IBD患者） | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |