单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2025-10-05
Longitudinal single-cell analysis of glucagon-like peptide-2 treatment in patients with short bowel syndrome
2025-Sep-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过纵向单细胞分析探讨了GLP-2类似物治疗对短肠综合征患者肠道上皮细胞和免疫细胞动态变化的影响 首次在短肠综合征患者中进行为期一年的纵向单细胞RNA测序分析,并结合微生物组组成分析 样本量较小(仅5名男性患者),缺乏对照组 阐明GLP-2类似物在短肠综合征患者中的治疗机制 短肠综合征患者 单细胞组学 短肠综合征 单细胞RNA测序,微生物组分析 NA 单细胞RNA测序数据,微生物组数据 5名男性短肠综合征患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
182 2025-10-05
A defined bacterial consortium and spatial transcriptomics highlight the complex interaction between Campylobacter jejuni and the murine intestine
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过建立确定的细菌群落并结合空间转录组学技术,揭示了空肠弯曲菌与小鼠肠道之间的复杂相互作用 首次使用确定的13种细菌群落结合空间转录组学技术,在单细胞分辨率水平解析病原体-宿主-微生物群的相互作用机制 研究仅使用小鼠模型,结果可能无法完全反映人类肠道环境的复杂性 阐明特定肠道细菌与空肠弯曲菌介导的宿主反应之间的相互作用机制 无菌小鼠及其肠道微生物群 空间转录组学 肠道感染 16S rRNA基因测序,荧光原位杂交,RNAscope,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 三组无菌小鼠:C13定植组、C13+空肠弯曲菌组、无菌对照组 NA 空间转录组学,16S rRNA测序 NA NA
183 2025-10-05
Reduced intestinal GLP-1 + cell numbers are associated with an inflammation-related epithelial metabolic signature
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与炎症相关上皮代谢特征的关系 首次系统证明GLP-1+细胞减少是肠道炎症的普遍特征,并揭示其与线粒体功能障碍和代谢重编程的因果关系 主要依赖动物模型和体外器官样培养,人类样本验证相对有限 阐明肠内分泌细胞在肠道炎症中的作用机制 小鼠模型、克罗恩病患者黏膜活检、肠道器官样 分子生物学 炎症性肠病 单细胞RNA测序、转录组分析、器官样培养 NA 基因表达数据、组织学数据 4种小鼠炎症模型、克罗恩病患者活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
184 2025-10-05
Defining the vascular niche of human adipose tissue across metabolic states
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞转录组图谱揭示人类皮下脂肪组织中血管生态位的细胞异质性和在代谢疾病中的作用 首次构建了包含近70,000个血管细胞的人类皮下脂肪组织单细胞转录组图谱,鉴定出一种新型异质性内皮细胞亚群(sub-AdECs)并证实其通过内皮-间质转化形成 研究主要关注皮下脂肪组织,其他脂肪库的血管生态位特征可能不同 阐明人类脂肪组织血管生态位在代谢状态下的细胞组成和功能特征 65名个体的皮下脂肪组织血管细胞 单细胞生物学 肥胖和糖尿病 单细胞RNA测序,全组织成像 NA 单细胞转录组数据,图像数据 65名个体,近70,000个血管细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
185 2025-10-05
Establishing a continuum of cell types in the visual cortex
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学技术揭示了小鼠视觉皮层L2/3层神经元连续体的发育机制及其在皮层连接中的作用 首次揭示视觉皮层神经元连续体通过遗传程序和视觉经验两阶段发育形成,并证明不同位置神经元优先投射到不同高级视觉区域 研究仅聚焦于小鼠视觉皮层L2/3层兴奋性神经元,未涉及其他皮层区域或神经元类型 理解视觉皮层神经元连续体的发育机制及其对皮层连接特异性的贡献 小鼠视觉皮层第2/3层兴奋性神经元 神经科学 NA 单核多组学测序(RNA-seq和ATAC-seq)、空间转录组学 NA 基因组学数据、表观基因组学数据、空间基因表达数据 NA NA 单核多组学测序, 空间转录组学 NA NA
186 2025-10-05
Constitutive Interferon Epsilon Expression Shapes Antiviral Epithelial States in the Female Reproductive Tract and Intestine
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了干扰素ε(IFNε)在女性生殖道和肠道黏膜中作为组成性表达的抗病毒防御调节剂的作用机制 首次系统阐明IFNε在生殖道外组织(特别是肠道)中的功能,发现其在肠道绒毛尖端肠细胞中的特异性表达模式及其对III型干扰素表达的维持作用 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证有限;IFNε在其他黏膜组织的功能仍需进一步探索 阐明IFNε在不同黏膜表面(女性生殖道和肠道)的抗病毒防御功能 小鼠模型和原代人类女性生殖道来源细胞 免疫学 病毒感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
187 2025-10-05
Inferring Personalized Cell-Cell Communication Networks in Colorectal Cancer with Individualized Causal Discovery
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一个整合计算框架,用于推断结直肠癌中个性化的细胞间通讯网络 结合嵌套层次狄利克雷过程模型和实例特异性贪婪快速因果推断方法,首次实现了患者特异性的细胞间通讯网络推断 方法依赖于单细胞RNA测序数据的质量和完整性,因果推断结果需要进一步实验验证 解决肿瘤异质性背景下个性化细胞间通讯网络推断的计算挑战 结直肠癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 计算生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 嵌套层次狄利克雷过程模型,贪婪快速因果推断 基因表达数据,生存数据 超过625,000个细胞的大规模单细胞RNA测序数据,TCGA批量RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
188 2025-10-05
Network dynamics underlying activity-timescale differences between cortical regions
2025-Sep-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合功能成像和空间转录组学数据,揭示了小鼠大脑皮层不同区域活动时间尺度的网络动力学差异 首次将功能成像与空间转录组学数据共同配准,并利用双光子成像和光遗传学技术比较了不同时间尺度皮层区域的网络响应特性 研究仅在小鼠模型中进行,结果是否适用于其他物种尚需验证 探究大脑皮层不同区域网络动力学的差异及其机制 小鼠大脑皮层,特别是短时间尺度的视觉区域VISp和长时间尺度的前额叶区域MOs 神经科学 NA 双光子成像,光遗传学,空间转录组学 NA 图像,转录组数据 小鼠大脑皮层样本 NA 空间转录组学 NA NA
189 2025-10-05
Spatial omics enters the microscopic realm: opportunities and challenges
2025-Sep, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1
综述 本文综述了微观分辨率空间转录组学(μST)的技术进展、当前挑战及未来发展方向 系统总结了微观分辨率空间转录组学的最新突破,强调了从组织水平到细胞和亚细胞水平的技术演进 面临每个微米级空间单元转录本发现稀疏、数据跨平台碎片化、缺乏可扩展且通用的分析方法等挑战 探讨微观分辨率空间转录组学领域的发展机遇和技术挑战 空间转录组学技术及其在微观尺度的应用 空间转录组学 NA 空间转录组学,测序和成像技术 人工智能(AI) 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA 微观分辨率空间转录组学(μST)
190 2025-10-05
Single-cell transcriptomics reveal oxidative phosphorylation and oxidative stress in the superior temporal plane of non-syndromic cleft lip and palate fetuses
2025-Aug-20, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞转录组学分析非综合征性唇腭裂胎儿颞上平面的氧化磷酸化和氧化应激变化 首次在NSCLP胎儿大脑中识别出氧化磷酸化和氧化应激异常增加,并发现特定抑制性神经元亚群InN6与此相关 样本量较小(仅3例NSCLP和3例正常胎儿),研究仅关注颞上平面区域 探究NSCLP胎儿大脑是否存在发育异常 非综合征性唇腭裂胎儿和正常胎儿的颞上平面组织 数字病理学 唇腭裂 单核RNA测序, RT-qPCR, 免疫荧光 NA 单细胞转录组数据 3个NSCLP胎儿和3个正常胎儿(孕17-23周) NA 单细胞RNA测序 NA 单核RNA测序
191 2025-10-05
Single-cell transcriptomic profiling reveals dysregulation of B-cell subset function in patients with chronic hepatitis B
2025-Aug, Hepatology international IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了慢性乙型肝炎患者B细胞亚群功能的失调 首次在HBV感染不同阶段对B细胞亚群进行单细胞转录组分析,发现肝脏组织中富集的特异性B细胞亚群及其功能特征 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 研究乙型肝炎病毒感染者不同阶段B细胞亚群的免疫学特征和临床意义 25名个体的肝脏和血液样本中的B细胞 单细胞转录组学 乙型肝炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 46个肝脏和血液样本,包含23,967个B细胞(其中1,677个浆细胞),来自25名个体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
192 2025-10-05
CXCL13 as a Prognostic Biomarker and Modulator of the Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer
2025 Jul-Aug, Journal of digestive diseases IF:2.3Q3
研究论文 本研究探讨CXCL13作为预后生物标志物在结直肠癌肿瘤微环境中的作用 首次系统评估CXCL13在结直肠癌中的预后价值及其与CD8+T细胞的相互作用机制 研究基于多个独立队列但需要进一步实验验证CXCL13调控CD8+T细胞功能的具体机制 探究CXCL13对结直肠癌患者预后和肿瘤免疫微环境的影响 结直肠癌患者和肿瘤微环境中的免疫细胞 肿瘤免疫学 结直肠癌 免疫组织化学,多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,组织切片图像,单细胞测序数据 四个独立队列(包括TCGA队列和Renji医院队列) NA 单细胞RNA测序 NA NA
193 2025-10-05
Endogenous CD4+ T Cells That Recognize ALK and the NPM1::ALK Fusion Protein Can Be Expanded from Human Peripheral Blood
2025-Apr-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究从人类外周血中成功扩增出识别ALK和NPM1::ALK融合蛋白的内源性CD4+ T细胞 首次在人类外周血中发现ALK特异性CD4+ T细胞,并鉴定出NPM1::ALK融合新表位特异性T细胞受体 样本量较小(10名患者和6名健康供者),仅针对ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤 探索ALK特异性CD4+ T细胞在癌症免疫治疗中的潜力 ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤患者和健康供者的外周血样本 免疫学 淋巴瘤 TCRαβ单细胞测序,树突状细胞刺激,肽池筛选 TCR报告细胞系(58α-β-) 细胞免疫应答数据,TCR序列数据 10名ALK阳性淋巴瘤患者和6名健康供者 NA 单细胞测序 NA NA
194 2025-10-05
Investigation of the mechanism of Xiaoyin Jiedu Yin in the treatment of psoriasis based on bioinformatics, machine learning
2025, Frontiers in chemistry IF:3.8Q2
研究论文 基于生物信息学和机器学习方法研究消银解毒饮治疗银屑病的机制 首次结合网络药理学、机器学习靶点筛选和单细胞测序技术系统揭示消银解毒饮的多组分协同作用机制 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步动物实验和临床验证 探索消银解毒饮治疗银屑病的药理作用机制 银屑病患者皮肤组织样本和IL-17A诱导的HaCaT细胞 机器学习 银屑病 单细胞RNA测序,空间转录组学,网络药理学 机器学习 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 未明确样本数量 NA single-cell RNA-seq,spatial transcriptomics NA NA
195 2025-10-05
Single-Cell RNA Sequencing Shows Exercise Protects db/db Mouse Pancreatic Injuries by Regulating Endothelial Cell Homeostasis
2025, Journal of diabetes research IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示运动通过调节内皮细胞稳态保护db/db小鼠胰腺损伤的机制 首次在单细胞水平系统研究运动对糖尿病胰腺中多种细胞类型的影响,特别是发现内皮细胞亚型在运动保护机制中的关键作用 研究仅使用db/db小鼠模型,样本量有限,且未深入验证具体分子机制 探究运动对糖尿病胰腺多种细胞类型的保护作用机制 6周龄雄性db/db小鼠 单细胞组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
196 2025-10-05
Spatial transcriptomics reveals distinct role of monocytes/macrophages with high FCGR3A expression in kidney transplant rejections
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过空间转录组学技术揭示高表达FCGR3A的单核细胞/巨噬细胞在肾移植排斥反应中的关键作用 首次在肾移植排斥反应中鉴定出高表达FCGR3A的单核细胞/巨噬细胞亚群,并揭示其空间分布与组织病理特征的对应关系 研究样本量有限,仅基于核心针活检样本,需要更大规模研究验证 探究先天免疫细胞特定亚群在肾移植排斥反应中的作用机制 人类肾移植同种异体移植物的石蜡包埋核心针活检样本 数字病理学 肾移植排斥反应 空间转录组学 NA 空间转录组数据 人类肾移植同种异体移植物核心针活检样本 NA 空间转录组学 NA 福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)核心针活检样本的空间转录组分析
197 2025-10-05
Cytotoxic CD4+ T-follicular cells may mediate killing against lymphoma cells
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了具有细胞毒性表型的CD4+ T滤泡细胞在淋巴瘤中的存在和功能作用 首次发现并命名了具有细胞毒性表型的CD4+ T滤泡辅助细胞(Tk细胞),并证实了它们在淋巴瘤中的直接杀伤能力 研究样本仅限于滤泡性淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤两种亚型,未涉及其他淋巴瘤类型 阐明Tk细胞在不同淋巴瘤亚型中的存在和功能相关性 滤泡性淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤患者样本 免疫学 淋巴瘤 流式细胞术,单细胞RNA测序,免疫荧光染色,细胞杀伤实验 NA 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像数据 滤泡性淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
198 2025-10-05
Characterization of MAIT cells in glioblastoma reveals a potential immunosuppressive role through a MAIT-neutrophil axis
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过多组学技术揭示了胶质母细胞瘤中MAIT细胞通过MAIT-中性粒细胞轴发挥免疫抑制作用的机制 首次系统表征胶质母细胞瘤中MAIT细胞的特征,发现MAIT-中性粒细胞轴在肿瘤免疫抑制微环境中的新作用 样本量相对有限(20例组织样本),需要进一步功能验证实验 探究MAIT细胞在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用机制 胶质母细胞瘤患者的外周血样本和肿瘤组织样本 免疫肿瘤学 胶质母细胞瘤 流式细胞术, bulk RNA-seq, scRNA-seq, 多重组织成像 NA 流式细胞数据, RNA测序数据, 单细胞测序数据, 组织成像数据 20例胶质母细胞瘤组织样本及对应外周血样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
199 2025-10-05
Exosome-based Sfrp2 inhibition in mesangial cells alleviates osteoporosis and promotes osteointegration in diabetic kidney disease
2025, Regenerative biomaterials IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过外泌体递送Sfrp2 siRNA靶向肾小球系膜细胞,揭示了SFRP2介导的肾-骨轴在糖尿病肾病和骨质疏松中的作用机制 首次发现肾小球系膜细胞分泌的SFRP2是连接肾脏损伤与骨丢失的关键分子桥梁,并利用外泌体成功实现靶向治疗 研究仅使用小鼠和大鼠模型,尚未在人类临床中得到验证 探究糖尿病肾病与骨质疏松之间的分子机制,并开发针对性的治疗策略 糖尿病肾病小鼠和大鼠模型 分子生物学 糖尿病肾病,骨质疏松 单细胞测序,外泌体递送,siRNA干扰 NA 基因表达数据,组织形态学数据 糖尿病小鼠和大鼠模型 NA 单细胞测序 NA NA
200 2025-10-05
Characterization of the phenotype and function of PRELP+ fibroblast subtype in liver metastatic colorectal cancer
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序鉴定并表征了结直肠癌肝转移中PRELP阳性癌症相关成纤维细胞亚型的表型和功能 首次在结直肠癌肝转移中鉴定出PRELP+ CAF这一独特的终末分化成纤维细胞亚型,并揭示其通过免疫抑制微环境促进肿瘤进展的机制 研究样本量有限,功能验证实验需要进一步扩展 探究结直肠癌肝转移中成纤维细胞的异质性和特定功能 结直肠癌原发灶伴肝转移(mCC)和肝转移灶(mLC)组织样本 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 转录组分析, 伪时间轨迹分析, 多重免疫荧光染色, 细胞间通讯分析 NA 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部